BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-209P21
Chromosome12 (Build37)
Map Location 26,314,348 - 26,475,221
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042974
Upstream geneEG629383, Klf11, Cys1, Rrm2, LOC668719, Mboat2, EG629397, C330002I19Rik, Id2, LOC100042973
Downstream geneLOC668726, Rnf144, Rsad2, Tyki, LOC668731, 1700020D12Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-209P21.bB6Ng01-209P21.g
ACCGA028453GA028454
length949733
definitionB6Ng01-209P21.b B6Ng01-209P21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,314,348 - 26,315,291)(26,474,675 - 26,475,221)
sequence
gaattcaatttaagactgctgggtagaagaaatacacaaacacaaattgc
agcctgatctatgggaagtctacatttactatgaaaatagttatgaagaa
attgtattcatatgcagcatcgggacattttggtcaaggtcaaatgcgta
tacaaccagagtcccatgatactgtatcccttagtgatgtcatggtcatc
ttaatttgagcaagtgcaccctgcagtgctcccataaatgattatttcaa
ttaatgacatgattctgattagtatgactgcattaccttaatttactgat
tatgtcatctcatgctgaaagatgtaagaaatataacttagccctcaaga
gatttggagaaatggggtctggtggtgtaggtcagtttgaagagtgcttg
cttcccatatagaaatccctaggaacaatttctggcatcttatacctgag
gtgtgatagtgtacagctgtaaccccagcacttgggaggtggaggcagga
ggatcagagactcaagagcaccttcagctacataggcaagtgagaggcca
gcctgagctagatgagaccccatctcaaatataaaaacaagaacaaagtt
ataataaaataggtatatcttttcagttttgctgttgaagtcaagagaaa
tttattctgaacaagaactgggatggtgtgtatttattcacatgcatgaa
cctccacagctcagacaatgtagaacaatagctaaaggtgtttgagatta
gagaatacttttttgttccatatttaaatatttttctattaaaaaagaat
tttcccattcactatgcaattttaggaggaatgcctcaagtacaataatt
ttcctttccttttaaaaattagatatttcctttatttacatttcaaatga
aattctctttccctgtttcccttccgaaaaaccctctatcccatcccct
gaattcaccaattacaggattttgaaggggtgcatgttgtaacttccctt
agttatgtacttagaagtggattaatctacacatgataacttagtgatga
agatttgaggaatggttaaactgtcatccaaaggggctgatcccagtgca
gtcccactggcaatatctaagaggttgggtttctccacactgctagccat
gcttgctattgtgattattttaattaattgtctctcagcctggatttgat
gtgtgtttccctgatgactcatggtggtgagaatagtctgtgtttagtga
ctatttatcctcttgaagaaatatctattaaaatccatttatttatttgt
gtttgtgtgtgcatgtgtgtgcctgtgtttgagacacatggtcttctcct
attgtggagtttgtgggagatcatttgtaaatatcattcccccttgaacc
ttctcactacctcccagtgatcttattttttagagatatctttttatttt
atgtgcatgaatgtttgcctgcatgtatgcatgtgtaccacatgtgtgcc
tggtgcccagagcagcttgaagaggatgccatatcccctagaactagagt
tacacatagtgataagccaccatgtgagtgctggaagcaactcagagcaa
gtgctcttaactgctgagccacacctccatcccctcttgctcataatctt
aatagccttgaatcgcagcataatgctgtgcac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_26314348_26315291
seq2: B6Ng01-209P21.b_50_998

seq1  GAATTCAATTTAAGACTGCTGGGTAGAAGAAATACACAAACACAAATTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATTTAAGACTGCTGGGTAGAAGAAATACACAAACACAAATTGC  50

seq1  AGCCTGATCTATGGGAAGTCTACATTTACTATGAAAATAGTTATGAAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGATCTATGGGAAGTCTACATTTACTATGAAAATAGTTATGAAGAA  100

seq1  ATTGTATTCATATGCAGCATCGGGACATTTTGGTCAAGGTCAAATGCGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTATTCATATGCAGCATCGGGACATTTTGGTCAAGGTCAAATGCGTA  150

seq1  TACAACCAGAGTCCCATGATACTGTATCCCTTAGTGATGTCATGGTCATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAACCAGAGTCCCATGATACTGTATCCCTTAGTGATGTCATGGTCATC  200

seq1  TTAATTTGAGCAAGTGCACCCTGCAGTGCTCCCATAAATGATTATTTCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTGAGCAAGTGCACCCTGCAGTGCTCCCATAAATGATTATTTCAA  250

seq1  TTAATGACATGATTCTGATTAGTATGACTGCATTACCTTAATTTACTGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGACATGATTCTGATTAGTATGACTGCATTACCTTAATTTACTGAT  300

seq1  TATGTCATCTCATGCTGAAAGATGTAAGAAATATAACTTAGCCCTCAAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCATCTCATGCTGAAAGATGTAAGAAATATAACTTAGCCCTCAAGA  350

seq1  GATTTGGAGAAATGGGGTCTGGTGGTGTAGGTCAGTTTGAAGAGTGCTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGGAGAAATGGGGTCTGGTGGTGTAGGTCAGTTTGAAGAGTGCTTG  400

seq1  CTTCCCATATAGAAATCCCTAGGAACAATTTCTGGCATCTTATACCTGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCATATAGAAATCCCTAGGAACAATTTCTGGCATCTTATACCTGAG  450

seq1  GTGTGATAGTGTACAGCTGTAACCCCAGCACTTGGGAGGTGGAGGCAGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGATAGTGTACAGCTGTAACCCCAGCACTTGGGAGGTGGAGGCAGGA  500

seq1  GGATCAGAGACTCAAGAGCACCTTCAGCTACATAGGCAAGTGAGAGGCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCAGAGACTCAAGAGCACCTTCAGCTACATAGGCAAGTGAGAGGCCA  550

seq1  GCCTGAGCTAGATGAGACCCCATCTCAAATATAAAAACAAGAACAAAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGAGCTAGATGAGACCCCATCTCAAATATAAAAACAAGAACAAAGTT  600

seq1  ATAATAAAATAGGTATATCTTTTCAGTTTTGCTGTTGAAGTCAAGAGAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAAAATAGGTATATCTTTTCAGTTTTGCTGTTGAAGTCAAGAGAAA  650

seq1  TTTATTCTGAACAAGAACTGGGATGGTGTGTATTTATTCACATGCATGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTCTGAACAAGAACTGGGATGGTGTGTATTTATTCACATGCATGAA  700

seq1  CCTCCACAGCTCAGACAATGTAGAACAATAGCTAAAGGTGTTTGAGATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCACAGCTCAGACAATGTAGAACAATAGCTAAAGGTGTTTGAGATTA  750

seq1  GAGAATACTTTTTTGTTCCATATTTAAATA-TTTTCTATTAAAAAAGAA-  798
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| 
seq2  GAGAATACTTTTTTGTTCCATATTTAAATATTTTTCTATTAAAAAAGAAT  800

seq1  TTTCCCA-TCACTATGCAA-TTTAGGAGGAATGCCTCAAGTACAAATAAT  846
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTTCCCATTCACTATGCAATTTTAGGAGGAATGCCTCAAGTAC-AATAAT  849

seq1  TTT-CTTTCCTTTTAAAAATTAGATATTTTCTTTATTTACATTTCAAATG  895
      ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTTCCTTTTAAAAATTAGATATTTCCTTTATTTACATTTCAAATG  899

seq1  ATATCCTCTTTCCTGGTTTCCCTTCTG-AAAACCCCCTATCCCATCCCCT  944
      | || ||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||
seq2  AAATTCTCTTTCCCTGTTTCCCTTCCGAAAAACCCTCTATCCCATCCCCT  949

seq1: chr12_26474675_26475221
seq2: B6Ng01-209P21.g_252_798 (reverse)

seq1  GTGCACAGCATTATGCTGCGATTCAAGGCTATTAAGATTATGAGCAAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACAGCATTATGCTGCGATTCAAGGCTATTAAGATTATGAGCAAGAG  50

seq1  GGGATGGAGGTGTGGCTCAGCAGTTAAGAGCACTTGCTCTGAGTTGCTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGGAGGTGTGGCTCAGCAGTTAAGAGCACTTGCTCTGAGTTGCTTC  100

seq1  CAGCACTCACATGGTGGCTTATCACTATGTGTAACTCTAGTTCTAGGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACTCACATGGTGGCTTATCACTATGTGTAACTCTAGTTCTAGGGGA  150

seq1  TATGGCATCCTCTTCAAGCTGCTCTGGGCACCAGGCACACATGTGGTACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCATCCTCTTCAAGCTGCTCTGGGCACCAGGCACACATGTGGTACA  200

seq1  CATGCATACATGCAGGCAAACATTCATGCACATAAAATAAAAAGATATCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCATACATGCAGGCAAACATTCATGCACATAAAATAAAAAGATATCT  250

seq1  CTAAAAAATAAGATCACTGGGAGGTAGTGAGAAGGTTCAAGGGGGAATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAAATAAGATCACTGGGAGGTAGTGAGAAGGTTCAAGGGGGAATGA  300

seq1  TATTTACAAATGATCTCCCACAAACTCCACAATAGGAGAAGACCATGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTACAAATGATCTCCCACAAACTCCACAATAGGAGAAGACCATGTGT  350

seq1  CTCAAACACAGGCACACACATGCACACACAAACACAAATAAATAAATGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAACACAGGCACACACATGCACACACAAACACAAATAAATAAATGGA  400

seq1  TTTTAATAGATATTTCTTCAAGAGGATAAATAGTCACTAAACACAGACTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATAGATATTTCTTCAAGAGGATAAATAGTCACTAAACACAGACTA  450

seq1  TTCTCACCACCATGAGTCATCAGGGAAACACACATCAAATCCAGGCTGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCACCACCATGAGTCATCAGGGAAACACACATCAAATCCAGGCTGAG  500

seq1  AGACAATTAATTAAAATAATCACAATAGCAAGCATGGCTAGCAGTGT  547
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAATTAATTAAAATAATCACAATAGCAAGCATGGCTAGCAGTGT  547