BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-218L22
Chromosome2 (Build37)12 (Build37)
Map Location 16,472,947 - 16,473,63186,198,832 - 86,199,763
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap genePlxdc2
Upstream geneLOC625457
Downstream gene4930515L03Rik, LOC383665, Nebl
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-218L22.bB6Ng01-218L22.g
ACCGA034792GA034793
length786933
definitionB6Ng01-218L22.b B6Ng01-218L22.g
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(16,472,947 - 16,473,631)(86,198,832 - 86,199,763)
sequence
gaattccaggtaccgatggacatgaccttataagggagaggaagcttgac
ctggctacttggctgtgtagcctcctccagggggcaaaggcggtgtgtgt
gtctagagtcactacaaaccttccccacattataataggagtgaaatgaa
gagcaccccaagcaatccattctgctgctacttctcaattaaacaatcaa
cattcacatcaatgaaaggagaaaagaaaaagtaagtcagagtatgttta
gttgggacaaaaatacatcacaattgctcagtaaaaggaagacagtaaca
taatgttgtagagatgcaacagttttgttatcatatgtatccatccattc
attgaccaggtatattctccatgtatctaccatttatccactataaatat
gtcagtcatttgggctgtctgtcttgctatctggtccccttgaaaaagga
catagacttctctaaggtgccttttgtcctgagcctcatctttatacttc
tgtatctttacataactcaattttaccctaaaacctgaatggttttagta
taagttccttccttgaccaaaattaaattaaaataaatgtaaaaagtaaa
atattctttgatcatgctctagtcattagtcatggttctgaatattttgc
tgggcccattcatgtactttcacaacaacgttaacaaaactttaggattt
gttttacttttaattatgtatatatgtgtgtatgatgtgctattattcat
atatgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gaattcctggttgagaaaagcccttccagcagcgtcaggaccccaccagg
tggggcttcctcagtagcctgctcacatttagctctgtatcctcattggt
gttgtcaagacagccttggcgaataaggcagaaccagaactgagtggtgg
aaagagatgcaggggcttagcttgccaggctgggcgtctcagatttccag
agagtgaaagatgttattgtttacaccaagggtgggtcatccttgggacg
cagagcaggaagggagggtagaagctaagcatcaaaagccacctttgagg
caggggtcagaggttgagctgcaagaccctcctctcatgcataccaggct
ttgggtctctgctggatggaaggggtgggtccacatgacttctccattcc
ttaagcgaaaaccagactcaagatgcgcccagggcgtgtctgccttcctc
agtgtttgtctgctgagctggccctagcagagagtgtctgtggctgagat
ggtgctggggtgggcctgggcaggtgctcatgtggtagctagttgtattt
ggacagacggacgatggctaggcattggccaaaatcttgtgcttggcagt
ttgtgcttgggaaagggtttgatttacaattctctggaattatctgctta
cgtggggatcaggcacctgaaagaaagggacactgaggcaccaaagaaga
taccctcaccttaggatctagctcgtggtcagaatccttcagttgttgtt
tgaataggtttgacccccatagattcatttctttgagtgctcagccatca
ggagtggcgctattaggaggtgtggccttattgagggaggtttggtcttg
tttggaagaagtgcttcactgtgtatgagggctttgaggtctctgggtac
tcaggctccacccagtgaaaaagagcgcttcct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_16472947_16473631
seq2: B6Ng01-218L22.b_141_825 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACATGCATATATGAATAATAGCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACATGCATATATGAATAATAGCAC  50

seq1  ATCATACACACATATATACATAATTAAAAGTAAAACAAATCCTAAAGTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATACACACATATATACATAATTAAAAGTAAAACAAATCCTAAAGTTT  100

seq1  TGTTAACGTTGTTGTGAAAGTACATGAATGGGCCCAGCAAAATATTCAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAACGTTGTTGTGAAAGTACATGAATGGGCCCAGCAAAATATTCAGA  150

seq1  ACCATGACTAATGACTAGAGCATGATCAAAGAATATTTTACTTTTTACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGACTAATGACTAGAGCATGATCAAAGAATATTTTACTTTTTACAT  200

seq1  TTATTTTAATTTAATTTTGGTCAAGGAAGGAACTTATACTAAAACCATTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTAATTTAATTTTGGTCAAGGAAGGAACTTATACTAAAACCATTC  250

seq1  AGGTTTTAGGGTAAAATTGAGTTATGTAAAGATACAGAAGTATAAAGATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTTAGGGTAAAATTGAGTTATGTAAAGATACAGAAGTATAAAGATG  300

seq1  AGGCTCAGGACAAAAGGCACCTTAGAGAAGTCTATGTCCTTTTTCAAGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCAGGACAAAAGGCACCTTAGAGAAGTCTATGTCCTTTTTCAAGGG  350

seq1  GACCAGATAGCAAGACAGACAGCCCAAATGACTGACATATTTATAGTGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGATAGCAAGACAGACAGCCCAAATGACTGACATATTTATAGTGGA  400

seq1  TAAATGGTAGATACATGGAGAATATACCTGGTCAATGAATGGATGGATAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGGTAGATACATGGAGAATATACCTGGTCAATGAATGGATGGATAC  450

seq1  ATATGATAACAAAACTGTTGCATCTCTACAACATTATGTTACTGTCTTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGATAACAAAACTGTTGCATCTCTACAACATTATGTTACTGTCTTCC  500

seq1  TTTTACTGAGCAATTGTGATGTATTTTTGTCCCAACTAAACATACTCTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACTGAGCAATTGTGATGTATTTTTGTCCCAACTAAACATACTCTGA  550

seq1  CTTACTTTTTCTTTTCTCCTTTCATTGATGTGAATGTTGATTGTTTAATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTTTTTCTTTTCTCCTTTCATTGATGTGAATGTTGATTGTTTAATT  600

seq1  GAGAAGTAGCAGCAGAATGGATTGCTTGGGGTGCTCTTCATTTCACTCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGTAGCAGCAGAATGGATTGCTTGGGGTGCTCTTCATTTCACTCCT  650

seq1  ATTATAATGTGGGGAAGGTTTGTAGTGACTCTAGA  685
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATAATGTGGGGAAGGTTTGTAGTGACTCTAGA  685

seq1: chr12_86198832_86199763
seq2: B6Ng01-218L22.g_62_994 (reverse)

seq1  AGGAGGCGCTCTTTCTCACTGGGTGGAGCCTGAGTACCAGGAGACCTCAA  50
      |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||
seq2  AGGAAGCGCTCTTTTTCACTGGGTGGAGCCTGAGTACCCAGAGACCTCAA  50

seq1  AGCCCTCCTACACAGTGAAGCACTTCCTCC-AACAAGACCAAACCTCCCT  99
      ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTCATACACAGTGAAGCACTTCTTCCAAACAAGACCAAACCTCCCT  100

seq1  CAATAAGGCCACACCTCCTAATAGCGCCACTCCTGATGGCTGAGCACTCA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAAGGCCACACCTCCTAATAGCGCCACTCCTGATGGCTGAGCACTCA  150

seq1  AAGAAATGAATCTATGGGGGTCAAACCTATTCAAACAACAACTGAAGGAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATGAATCTATGGGGGTCAAACCTATTCAAACAACAACTGAAGGAT  200

seq1  TCTGACCACGAGCTAGATCCTAAGGTGAGGGTATCTTCTTTGGTGCCTCA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACCACGAGCTAGATCCTAAGGTGAGGGTATCTTCTTTGGTGCCTCA  250

seq1  GTGTCCCTTTCTTTCAGGTGCCTGATCCCCACGTAAGCAGATAATTCCAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCCTTTCTTTCAGGTGCCTGATCCCCACGTAAGCAGATAATTCCAG  300

seq1  AGAATTGTAAATCAAACCCTTTCCCAAGCACAAACTGCCAAGCACAAGAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTGTAAATCAAACCCTTTCCCAAGCACAAACTGCCAAGCACAAGAT  350

seq1  TTTGGCCAATGCCTAGCCATCGTCCGTCTGTCCAAATACAACTAGCTACC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGCCAATGCCTAGCCATCGTCCGTCTGTCCAAATACAACTAGCTACC  400

seq1  ACATGAGCACCTGCCCAGGCCCACCCCAGCACCATCTCAGCCACAGACAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAGCACCTGCCCAGGCCCACCCCAGCACCATCTCAGCCACAGACAC  450

seq1  TCTCTGCTAGGGCCAGCTCAGCAGACAAACACTGAGGAAGGCAGACACGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGCTAGGGCCAGCTCAGCAGACAAACACTGAGGAAGGCAGACACGC  500

seq1  CCTGGGCGCATCTTGAGTCTGGTTTTCGCTTAAGGAATGGAGAAGTCATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGCGCATCTTGAGTCTGGTTTTCGCTTAAGGAATGGAGAAGTCATG  550

seq1  TGGACCCACCCCTTCCATCCAGCAGAGACCCAAAGCCTGGTATGCATGAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACCCACCCCTTCCATCCAGCAGAGACCCAAAGCCTGGTATGCATGAG  600

seq1  AGGAGGGTCTTGCAGCTCAACCTCTGACCCCTGCCTCAAAGGTGGCTTTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGGTCTTGCAGCTCAACCTCTGACCCCTGCCTCAAAGGTGGCTTTT  650

seq1  GATGCTTAGCTTCTACCCTCCCTTCCTGCTCTGCGTCCCAAGGATGACCC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTTAGCTTCTACCCTCCCTTCCTGCTCTGCGTCCCAAGGATGACCC  700

seq1  ACCCTTGGTGTAAACAATAACATCTTTCACTCTCTGGAAATCTGAGACGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTGGTGTAAACAATAACATCTTTCACTCTCTGGAAATCTGAGACGC  750

seq1  CCAGCCTGGCAAGCTAAGCCCCTGCATCTCTTTCCACCACTCAGTTCTGG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCTGGCAAGCTAAGCCCCTGCATCTCTTTCCACCACTCAGTTCTGG  800

seq1  TTCTGCCTTATTCGCCAAGGCTGTCTTGACAACACCAATGAGGATACAGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCCTTATTCGCCAAGGCTGTCTTGACAACACCAATGAGGATACAGA  850

seq1  GCTAAATGTGAGCAGGCTACTGAGGAAGCCCCACCTGGTGGGGTCCTGAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAATGTGAGCAGGCTACTGAGGAAGCCCCACCTGGTGGGGTCCTGAC  900

seq1  GCTGCTGGAAGGGCTTTTCTCAACCAGGAATTC  932
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTGGAAGGGCTTTTCTCAACCAGGAATTC  933