BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-265O11
Chromosome12 (Build37)
Map Location 22,511,548 - 22,593,089
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668656
Upstream geneLOC100042796, 6030426L16Rik, LOC434693, EG668645, EG668646, LOC100043416, LOC668650, EG668496, LOC668653, EG432637
Downstream geneEG629133, EG668660, EG668662, LOC668664, 2410018L13Rik, LOC77114, EG668669, EG668670, LOC668680, LOC100042895
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-265O11.bB6Ng01-265O11.g
ACCGA069433GA069434
length1,1891,042
definitionB6Ng01-265O11.b B6Ng01-265O11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,591,895 - 22,593,089)(22,511,548 - 22,512,585)
sequence
gaattccacaagtaatatttaccacaagttggctgtaaaaacaacttgtg
cccaatgactaaaatgcaattaaaagtaagatgtggttttacacacttgt
aacctcagaacccaacagacaaagcagaaacatggccaacagttattttc
ttgggatacaggaagaaagtcctctggggtctctgctaataaggtctcac
acacacacacacacacacacacacacacacacacacaaacacataccccc
acacaaacatgcacacacacacgtactaaatacattaattaatacatata
cacacacatcacgcacataaacatacatgcaccacacatacaccaaacac
acacacataaccatgcccccacaaaacacgcacatataccacatacttac
attcacacccatatacacccacatacaccacagatacacatgcacacaca
ccatgtacagtaacacacatacacacaccacaatacccccacacattcac
atacataccacatacatacattcacacatatacacaaacaccacacatac
acatgcacacataccacatacttacattcacacacatacactacacacat
acaccacacagcacatgcacacacacaccatatacatacattcacacgca
tacacacacacacactacacacacctccctttttgattctggttcatttt
gcttaacaatgatttctagttcattctgtttctgtgtaagtatcatgatt
tcacttttcttcctgattgcatgaaatcatgtcatgtgtactgtgtgatc
aattttgctaacaaggataaaagccaaaagcaggtcctgggctgaggaat
ttgcattgtgggtgtttcacatagccaagagtgacatggaatgtcccaga
gtctcttctccctcagtgagccccttgggaacatggcttcttgaccaatg
ttgtggggaaaggcaggatgaggaagtcagtagctgacattgtttgtata
cctacttgcctggtgatttctgctgcacaccaggtggtgttgtctgatga
ccttcacagttcacatctggctgcacttgacccatggagtgtcaatcaga
actcctgcagctaatggaatctgggggcctttgaacctggaaattgacaa
ggtggagccacggttatgcgagaggtctcagatgaagct
gaattcaaacccatgaccttcgacttggaagaatactccaacccctatta
agcatcctgtcccctaagcttgtacaattagggacactcccagttacctg
aagacagttttacagtgctaggccaggcttcaccctgagaaaatcataga
atgcagtgatgtgctgtgggaagtgggggatacccaagagaaccagaggt
acagatggtcctcagagagtactccaacccacagctgactgatcacagac
acaattaggccaataaatcatctgaattaggacattttcatctatatctc
attcagaaattctcagctgtattttaaaaatccagagattctgaagacac
tagtcaaaaatcataccctctaactccctaggcaagaggcatggttactg
ctgctgccaacaatacagcctagagaaactttacaaaaaccttttgtggg
tctgaaaagaagggaatgtgagggacattataagcccaacatgggaaata
aaagtggtctcttgctgccataggacagtagaccactccatctttttaag
gctcccatgtacaaatatgctgtatgaggtagcagctggggtcagacatt
atgtatggcttctggtattttaccagcactgcctgtgaataagttcagcc
ttcaaaaatagctgtgccagtgggtagcttttattccggcgcaaggcaat
aaactgcaatcctaaaactctgcaactctctgccactttccaccattgtg
aacatccttccatttagtgtctcaggacacaactatctcagcatgtataa
cttgagggtattgtgttatagcacaggatctccttcacaaggcaattttc
tgatccctctgcctctcttcccatctataagtccttttgttcttctctga
aattgaagaatattccctgtgacttttcaagggttttatttttgggataa
catggtctcttgttgatgccttgggaagtaaaaagaaaagaagtgttttt
catgacataatatagtacagtcaaactaattcatggtgtcta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_22591895_22593089
seq2: B6Ng01-265O11.b_48_1236 (reverse)

seq1  AGCTTCA-CTGA----CCTCGCATACCCTGTGCTCCACCTTGTCCATATT  45
      ||||||| ||||     |||||||| ||   |||||||||||||   | |
seq2  AGCTTCATCTGAGACCTCTCGCATAACCGTGGCTCCACCTTGTC---AAT  47

seq1  TTCTCAAAGTGTTTCAAA-GCCCCCAGATT-CAATAGCTTCCAGGAGTTC  93
      ||| ||    | |||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||
seq2  TTC-CA----GGTTCAAAGGCCCCCAGATTCCATTAGC-TGCAGGAGTTC  91

seq1  TGATTTGACACTCATGGGGTCAAAGTGCAGGCAGATGGTGGAACCTGTGG  143
      ||| |||||||||   ||||| |||||||| ||||| |||  | |||| |
seq2  TGA-TTGACACTCCATGGGTC-AAGTGCAGCCAGAT-GTG--AACTGT-G  135

seq1  AAGGTCATCAGAC-ACACAACCTGGTGGTTGCAGCAGAAATCACCAGGCA  192
      ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCATCAGACAACACCACCTGGTG--TGCAGCAGAAATCACCAGGCA  183

seq1  AGTAGGTATACAAACAATGTCAGCTACTGACTTCCTCATCCTGCC-TTCC  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AGTAGGTATACAAACAATGTCAGCTACTGACTTCCTCATCCTGCCTTTCC  233

seq1  CCACAACCTTGGTCAAG-AGCCATGTT-CCAAGGGGCTCACTGAGGGAGA  289
      ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAACATTGGTCAAGAAGCCATGTTCCCAAGGGGCTCACTGAGGGAGA  283

seq1  AGAGACTCTGGGACATTCCATGTCACTCTTGGCTATGTGAAACACCCACA  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACTCTGGGACATTCCATGTCACTCTTGGCTATGTGAAACACCCACA  333

seq1  ATGCAAATTCCTCAGCCCAGGACCTGCTTTTGGCTTTTATCCTTGTTAGC  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAATTCCTCAGCCCAGGACCTGCTTTTGGCTTTTATCCTTGTTAGC  383

seq1  AAAATTGATCACACAGTACACATGACATGATTTCATGCAATCAGGAAGAA  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTGATCACACAGTACACATGACATGATTTCATGCAATCAGGAAGAA  433

seq1  AAGTGAAATCATGATACTTACACAGAAACAGAATGAACTAGAAATCATTG  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGAAATCATGATACTTACACAGAAACAGAATGAACTAGAAATCATTG  483

seq1  TTAAGCAAAATGAACCAGAATCAAAAAGGGAGGTGTGTGTAGTGTGTGTG  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGCAAAATGAACCAGAATCAAAAAGGGAGGTGTGTGTAGTGTGTGTG  533

seq1  TGTGTATGCGTGTGAATGTATGTATATGGTGTGTGTGTGCATGTGCTGTG  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATGCGTGTGAATGTATGTATATGGTGTGTGTGTGCATGTGCTGTG  583

seq1  TGGTGTATGTGTGTAGTGTATGTGTGTGAATGTAAGTATGTGGTATGTGT  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTATGTGTGTAGTGTATGTGTGTGAATGTAAGTATGTGGTATGTGT  633

seq1  GCATGTGTATGTGTGGTGTTTGTGTATATGTGTGAATGTATGTATGTGGT  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTGTATGTGTGGTGTTTGTGTATATGTGTGAATGTATGTATGTGGT  683

seq1  ATGTATGTGAATGTGTGGGGGTATTGTGGTGTGTGTATGTGTGTTACTGT  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGTGAATGTGTGGGGGTATTGTGGTGTGTGTATGTGTGTTACTGT  733

seq1  ACATGGTGTGTGTGCATGTGTATCTGTGGTGTATGTGGGTGTATATGGGT  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGTGTGTGTGCATGTGTATCTGTGGTGTATGTGGGTGTATATGGGT  783

seq1  GTGAATGTAAGTATGTGGTATATGTGCGTGTTTTGTGGGGGCATGGTTAT  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATGTAAGTATGTGGTATATGTGCGTGTTTTGTGGGGGCATGGTTAT  833

seq1  GTGTGTGTGTTTGGTGTATGTGTGGTGCATGTATGTTTATGTGCGTGATG  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTTTGGTGTATGTGTGGTGCATGTATGTTTATGTGCGTGATG  883

seq1  TGTGTGTATATGTATTAATTAATGTATTTAGTACGTGTGTGTGTGCATGT  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTATATGTATTAATTAATGTATTTAGTACGTGTGTGTGTGCATGT  933

seq1  TTGTGTGGGGGTATGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTGGGGGTATGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  983

seq1  GTGTGTGTGAGACCTTATTAGCAGAGACCCCAGAGGACTTTCTTCCTGTA  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGAGACCTTATTAGCAGAGACCCCAGAGGACTTTCTTCCTGTA  1033

seq1  TCCCAAGAAAATAACTGTTGGCCATGTTTCTGCTTTGTCTGTTGGGTTCT  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAGAAAATAACTGTTGGCCATGTTTCTGCTTTGTCTGTTGGGTTCT  1083

seq1  GAGGTTACAAGTGTGTAAAACCACATCTTACTTTTAATTGCATTTTAGTC  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTTACAAGTGTGTAAAACCACATCTTACTTTTAATTGCATTTTAGTC  1133

seq1  ATTGGGCACAAGTTGTTTTTACAGCCAACTTGTGGTAAATATTACTTGTG  1189
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGGCACAAGTTGTTTTTACAGCCAACTTGTGGTAAATATTACTTGTG  1183

seq1  GAATTC  1195
      ||||||
seq2  GAATTC  1189

seq1: chr12_22511548_22512585
seq2: B6Ng01-265O11.g_66_1107

seq1  GAATTCAAACCCATGACCTTCGACTTGGAAGAATACTCCAACCCCTATTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAACCCATGACCTTCGACTTGGAAGAATACTCCAACCCCTATTA  50

seq1  AGCATCCTGTCCCCTAAGCTTGTACAATTAGGGACACTCCCAGTTACCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCCTGTCCCCTAAGCTTGTACAATTAGGGACACTCCCAGTTACCTG  100

seq1  AAGACAGTTTTACAGTGCTAGGCCAGGCTTCACCCTGAGAAAATCATAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAGTTTTACAGTGCTAGGCCAGGCTTCACCCTGAGAAAATCATAGA  150

seq1  ATGCAGTGATGTGCTGTGGGAAGTGGGGGATACCCAAGAGAACCAGAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGTGATGTGCTGTGGGAAGTGGGGGATACCCAAGAGAACCAGAGGT  200

seq1  ACAGATGGTCCTCAGAGAGTACTCCAACCCACAGCTGACTGATCACAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATGGTCCTCAGAGAGTACTCCAACCCACAGCTGACTGATCACAGAC  250

seq1  ACAATTAGGCCAATAAATCATCTGAATTAGGACATTTTCATCTATATCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTAGGCCAATAAATCATCTGAATTAGGACATTTTCATCTATATCTC  300

seq1  ATTCAGAAATTCTCAGCTGTATTTTAAAAATCCAGAGATTCTGAAGACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGAAATTCTCAGCTGTATTTTAAAAATCCAGAGATTCTGAAGACAC  350

seq1  TAGTCAAAAATCATACCCTCTAACTCCCTAGGCAAGAGGCATGGTTACTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCAAAAATCATACCCTCTAACTCCCTAGGCAAGAGGCATGGTTACTG  400

seq1  CTGCTGCCAACAATACAGCCTAGAGAAACTTTACAAAAACCTTTTGTGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGCCAACAATACAGCCTAGAGAAACTTTACAAAAACCTTTTGTGGG  450

seq1  TCTGAAAAGAAGGGAATGTGAGGGACATTATAAGCCCAACATGGGAAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAAAGAAGGGAATGTGAGGGACATTATAAGCCCAACATGGGAAATA  500

seq1  AAAGTGGTCTCTTGCTGCCATAGGACAGTAGACCACTCCATCTTTTTAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGGTCTCTTGCTGCCATAGGACAGTAGACCACTCCATCTTTTTAAG  550

seq1  GCTCCCATGTACAAATATGCTGTATGAGGTAGCAGCTGGGGTCAGACATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCATGTACAAATATGCTGTATGAGGTAGCAGCTGGGGTCAGACATT  600

seq1  ATGTATGGCTTCTGGTATTTTACCAGCACTGCCTGTGAATAAGTTCAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGGCTTCTGGTATTTTACCAGCACTGCCTGTGAATAAGTTCAGCC  650

seq1  TTCAAAAATAGCTGTGCCAGTGGGTAGCTTTTATTCCGGCGCAAGGCAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAAATAGCTGTGCCAGTGGGTAGCTTTTATTCCGGCGCAAGGCAAT  700

seq1  AAACTGCAATCCTAAAACTCTGCAACTCTCTGCCACTTTCCACCATTGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGCAATCCTAAAACTCTGCAACTCTCTGCCACTTTCCACCATTGTG  750

seq1  AACATCCTTCCATTTAGTGTCTCAGGGACACAACTATCTCAGCATGTATA  800
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCCTTCCATTTAGTGTCTCA-GGACACAACTATCTCAGCATGTATA  799

seq1  ACTTGAGGGTATTGTGTTATAGCACAGGATCTCCTTCACAAGGCAATTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGAGGGTATTGTGTTATAGCACAGGATCTCCTTCACAAGGCAATTTT  849

seq1  CTGATCCCTCTGCCTCTCTTCCCATCTATAAGTCCTTTTGTTCTTCTCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATCCCTCTGCCTCTCTTCCCATCTATAAGTCCTTTTGTTCTTCTCTG  899

seq1  AAATTGAAGAATATTCCCTGTGACTTTTCAA-GGTTTTATTTTT-GGAT-  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| 
seq2  AAATTGAAGAATATTCCCTGTGACTTTTCAAGGGTTTTATTTTTGGGATA  949

seq1  ACATGGTCTCT--GTGATGCCTTGGGAAGTTAAAAG-AAAGAAGTGTTTT  994
      |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
seq2  ACATGGTCTCTTGTTGATGCCTTGGGAAGTAAAAAGAAAAGAAGTGTTTT  999

seq1  TCCTTGACATAATATAGTACCAGTCAAACTAA-TCAATGTGTCTA  1038
      | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||
seq2  T-CATGACATAATATAGTA-CAGTCAAACTAATTCATGGTGTCTA  1042