BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-283G02
Chromosome12 (Build37)
Map Location 99,382,304 - 99,550,300
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGalc, Gpr65
Upstream geneLOC382626, LOC100039743, LOC667732, LOC628351, LOC100039770, LOC667746
Downstream geneKcnk10, Spata7, Ptpn21, Zc3h14, Eml5, LOC100039845, Ttc8, EG667779, Ches1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-283G02.bB6Ng01-283G02.g
ACCGA082356GA082357
length1,0891,141
definitionB6Ng01-283G02.b B6Ng01-283G02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,382,304 - 99,383,397)(99,549,150 - 99,550,300)
sequence
gaattcaataagtagtcactcactaaagttcagccagtgttctttgttct
gttttgttttgctttgcttctttgcttgtatgttataataagcagagcag
aacaaagcacccaccctatttgatcatgactgagcgatatttactcacaa
atgcatacatggggggttggagtaaaaaatttaatgggaaaagcaccaag
aatacagtattaacaaccccatttagagccgtgatttatttcactgattt
ggattttctgcccttttctaagggaaaaagttctaaatatagttgaaagc
gtttatcacctgagatacaccatttgggaaagaaaacaggagaacatatt
tttaaaccataaatttccaccatgttcaccccttgcataaataaacaggc
ccagactttgcaagaaatattaaagttcatttaaattgcaaatatgacct
tattaaaatggctctcccaacgtgccataaacaaatagagtgtgtgctgg
caatactgccaaacagcagaacacgttctccaccacttctataattaaac
tggaaggatgggaattttcacagctctgaatgagtcaaaggtggacaaag
aaaacatgtcacgtcaatgacttgaggtgaggacaatgtgtccatctgga
gggtccctttaataaatgcctcatcacaatttctctttgaaagtcaaaat
gggttcttatgaacagcttgtaaacgttattatattgctgctaaatttaa
tgtgttggaaattctttttttctatagctaccacattcctgcttaatgtt
agcacaacagccattaagatttactgtgtttggggtaagaataaaaatga
aacaattaggaatgagcttacacctgcaaatggctagaaagagctaataa
ctttcggaattaaaagcccaacagatatgctgggctgtttactgagttta
tgggaaaatccatactttaaggtatattgaaattagtggttgtcatcatg
ggcttccttttgctagaaaaataacccaaggtgctgtagaccacacggat
catgagctgagatgggtctggcctggttttagctgagtt
gaattcctgagaaagagcaggcctgacaaaattctgccagtgcagcacag
cattatatgtacaaagttctgagtcaacacattgtggcagttagaaacca
cccaccagatgaacaaattaaccccaggaaaataaaagggggctctggtc
aatggctgtttcctctctggttttctaaagaaactaagaggaaccccatc
acatgagagcatgtggaccctttacagaacgtttcatcttgccgactcat
ttctcaacaggacagccttgcttggatcagatgtctgatttgctttagat
gatggaaagtatcaagctcttcagggtgtgggcatatgtgtgcatgcatg
agtaagcgcatgcgcgtgctcctagttttacaacagttccaacattttag
agtgcagaaatcaaagcaaggacctacgtctcaaatttatttcccttgtt
tagatgtctttagccaccacagcatgaggcaaccatttttggggagattg
agctaagatgtacaaatccatatacttccccatcagacagctacagagca
agtggtcctgctgattaaccctcaggttcctgcattcatcagttccttca
tctccttaaactttgcatgctgctgatgcagatgcgaacagagtaccatc
ccaacttcatagttttttacattttccttctgtgaatcagaccacaatct
ccacaaaatgaaacctgagtgctccctccctccctcttccctcccttctt
cccctcctcctcttccattccactcccctcccctgttgtaaatgtagtgc
ctagtaaaatgactgccattactagttaaatatgttccctaagatactgt
tgaatgaaaaacaagatggggtctggggagaggactctgttgattaaagt
gattgccaagtgagtatgttgaccagaggactggactcccagtactcatg
taaaatctagacatgtgtcatgtgcttatgcttgccttgctgggaaagtg
gcagagacagcagcttccttacaggataactggacacaaccatctagtca
ttaggcaagctcagtgaggggagagactgtgttttaaaatatttaagtga
gaagttacgggaagaactctatgtgacgctgcatctacatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_99382304_99383397
seq2: B6Ng01-283G02.b_44_1132

seq1  GAATTCAATAAGTAGTCACTCACTAAAGTTCAGCCAGTGTTCTTTGTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATAAGTAGTCACTCACTAAAGTTCAGCCAGTGTTCTTTGTTCT  50

seq1  GTTTTGTTTTGCTTTGCTTCTTTGCTTGTATGTTATAATAAGCAGAGCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGTTTTGCTTTGCTTCTTTGCTTGTATGTTATAATAAGCAGAGCAG  100

seq1  AACAAAGCACCCACCCTATTTGATCATGACTGAGCGATATTTACTCACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGCACCCACCCTATTTGATCATGACTGAGCGATATTTACTCACAA  150

seq1  ATGCATACATGGGGGGTTGGAGTAAAAAATTTAATGGGAAAAGCACCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATACATGGGGGGTTGGAGTAAAAAATTTAATGGGAAAAGCACCAAG  200

seq1  AATACAGTATTAACAACCCCATTTAGAGCCGTGATTTATTTCACTGATTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAGTATTAACAACCCCATTTAGAGCCGTGATTTATTTCACTGATTT  250

seq1  GGATTTTCTGCCCTTTTCTAAGGGAAAAAGTTCTAAATATAGTTGAAAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTTCTGCCCTTTTCTAAGGGAAAAAGTTCTAAATATAGTTGAAAGC  300

seq1  GTTTATCACCTGAGATACACCATTTGGGAAAGAAAACAGGAGAACATATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATCACCTGAGATACACCATTTGGGAAAGAAAACAGGAGAACATATT  350

seq1  TTTAAACCATAAATTTCCACCATGTTCACCCCTTGCATAAATAAACAGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAACCATAAATTTCCACCATGTTCACCCCTTGCATAAATAAACAGGC  400

seq1  CCAGACTTTGCAAGAAATATTAAAGTTCATTTAAATTGCAAATATGACCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGACTTTGCAAGAAATATTAAAGTTCATTTAAATTGCAAATATGACCT  450

seq1  TATTAAAATGGCTCTCCCAACGTGCCATAAACAAATAGAGTGTGTGCTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAAATGGCTCTCCCAACGTGCCATAAACAAATAGAGTGTGTGCTGG  500

seq1  CAATACTGCCAAACAGCAGAACACGTTCTCCACCACTTCTATAATTAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATACTGCCAAACAGCAGAACACGTTCTCCACCACTTCTATAATTAAAC  550

seq1  TGGAAGGATGGGAATTTTCACAGCTCTGAATGAGTCAAAGGTGGACAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGGATGGGAATTTTCACAGCTCTGAATGAGTCAAAGGTGGACAAAG  600

seq1  AAAACATGTCACGTCAATGACTTGAGGTGAGGACAATGTGTCCATCTGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACATGTCACGTCAATGACTTGAGGTGAGGACAATGTGTCCATCTGGA  650

seq1  GGGTCCCTTTAATAAATGCCTCATCACAATTTCTCTTTGAAAGTCAAAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCCTTTAATAAATGCCTCATCACAATTTCTCTTTGAAAGTCAAAAT  700

seq1  GGGTTCTTATGAACAGCTTGTAAACGTTATTATATTGCTGCTAAATTTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTCTTATGAACAGCTTGTAAACGTTATTATATTGCTGCTAAATTTAA  750

seq1  TGTGTTGGAAATTC-TTTTTTCTATAGCTACCACATTCCTGCTTAATGTT  799
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTGGAAATTCTTTTTTTCTATAGCTACCACATTCCTGCTTAATGTT  800

seq1  AGCACAACAGCCATTAAGATTTACTGTGTTTGGGGTAAGAATAAAAATGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAACAGCCATTAAGATTTACTGTGTTTGGGGTAAGAATAAAAATGA  850

seq1  AACAATTAGGAATGAGCTTACACCTGCAAATGGCTAGAAAGAGCTAATAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATTAGGAATGAGCTTACACCTGCAAATGGCTAGAAAGAGCTAATAA  900

seq1  CTTTCGGAATTAAAAGCCAAACAGATATGCTGGGCTGTTTACTGAGTTTA  949
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCGGAATTAAAAGCCCAACAGATATGCTGGGCTGTTTACTGAGTTTA  950

seq1  TGGAAAAATCCATACTTTAAGGTATATTGAAATTAGTGGTTTGTCATCAA  999
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| 
seq2  TGGGAAAATCCATACTTTAAGGTATATTGAAATTAGTGG-TTGTCATCAT  999

seq1  TGGCTTCCTTTTGCTTAGAAAAATAACCCAAGGTGCTGTAGACCACACGA  1049
       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GGGCTTCCTTTTGC-TAGAAAAATAACCCAAGGTGCTGTAGACCACACGG  1048

seq1  ATTCAATGAGCTTGAGATGGGCCTTGGCTTGGTTTTAGCTGAGTT  1094
      ||   |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||
seq2  AT--CATGAGC-TGAGATGGGTC-TGGCCTGGTTTTAGCTGAGTT  1089

seq1: chr12_99549150_99550300
seq2: B6Ng01-283G02.g_62_1202 (reverse)

seq1  CATGTAGATGCCAGCTGTTCACATAGAGTGTCTTCTCCTTACTCTCTCAC  50
      |||||||||| ||||   ||||||||||| ||||| | | ||| ||||||
seq2  CATGTAGATG-CAGC--GTCACATAGAGT-TCTTCCCGTAACT-TCTCAC  45

seq1  TAAATATTTTTTAAAACACAGTCTCT-CCCTCAACCTGGAGCTTGCCTAA  99
      | || || |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||
seq2  TTAA-ATATTTTAAAACACAGTCTCTCCCCTCA--CT-GAGCTTGCCTAA  91

seq1  TGACTAGATGGGTTGGTTGGCCAGTTAT-CTGT-AGGGAGCTGGCTGTCT  147
      ||||||||| |||||  || |||||||| |||| ||| |||| |||||||
seq2  TGACTAGAT-GGTTG--TGTCCAGTTATCCTGTAAGGAAGCT-GCTGTCT  137

seq1  CTGCCACTTTCCCAGCAAGGCAAGCATAAGCACATGACACATGTCTAGAT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCACTTTCCCAGCAAGGCAAGCATAAGCACATGACACATGTCTAGAT  187

seq1  TTTACATGAGTACTGGGAGTCCAGTCCTCTGGTCAACATACTCACTTGGC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACATGAGTACTGGGAGTCCAGTCCTCTGGTCAACATACTCACTTGGC  237

seq1  AATCACTTTAATCAACAGAGTCCTCTCCCCAGACCCCATCTTGTTTTTCA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACTTTAATCAACAGAGTCCTCTCCCCAGACCCCATCTTGTTTTTCA  287

seq1  TTCAACAGTATCTTAGGGAACATATTTAACTAGTAATGGCAGTCATTTTA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACAGTATCTTAGGGAACATATTTAACTAGTAATGGCAGTCATTTTA  337

seq1  CTAGGCACTACATTTACAACAGGGGAGGGGAGTGGAATGGAAGAGGAGGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCACTACATTTACAACAGGGGAGGGGAGTGGAATGGAAGAGGAGGA  387

seq1  GGGGAAGAAGGGAGGGAAGAGGGAGGGAGGGAGCACTCAGGTTTCATTTT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAGAAGGGAGGGAAGAGGGAGGGAGGGAGCACTCAGGTTTCATTTT  437

seq1  GTGGAGATTGTGGTCTGATTCACAGAAGGAAAATGTAAAAAACTATGAAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAGATTGTGGTCTGATTCACAGAAGGAAAATGTAAAAAACTATGAAG  487

seq1  TTGGGATGGTACTCTGTTCGCATCTGCATCAGCAGCATGCAAAGTTTAAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGATGGTACTCTGTTCGCATCTGCATCAGCAGCATGCAAAGTTTAAG  537

seq1  GAGATGAAGGAACTGATGAATGCAGGAACCTGAGGGTTAATCAGCAGGAC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGAAGGAACTGATGAATGCAGGAACCTGAGGGTTAATCAGCAGGAC  587

seq1  CACTTGCTCTGTAGCTGTCTGATGGGGAAGTATATGGATTTGTACATCTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGCTCTGTAGCTGTCTGATGGGGAAGTATATGGATTTGTACATCTT  637

seq1  AGCTCAATCTCCCCAAAAATGGTTGCCTCATGCTGTGGTGGCTAAAGACA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAATCTCCCCAAAAATGGTTGCCTCATGCTGTGGTGGCTAAAGACA  687

seq1  TCTAAACAAGGGAAATAAATTTGAGACGTAGGTCCTTGCTTTGATTTCTG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAACAAGGGAAATAAATTTGAGACGTAGGTCCTTGCTTTGATTTCTG  737

seq1  CACTCTAAAATGTTGGAACTGTTGTAAAACTAGGAGCACGCGCATGCGCT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTAAAATGTTGGAACTGTTGTAAAACTAGGAGCACGCGCATGCGCT  787

seq1  TACTCATGCATGCACACATATGCCCACACCCTGAAGAGCTTGATACTTTC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCATGCATGCACACATATGCCCACACCCTGAAGAGCTTGATACTTTC  837

seq1  CATCATCTAAAGCAAATCAGACATCTGATCCAAGCAAGGCTGTCCTGTTG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATCTAAAGCAAATCAGACATCTGATCCAAGCAAGGCTGTCCTGTTG  887

seq1  AGAAATGAGTCGGCAAGATGAAACGTTCTGTAAAGGGTCCACATGCTCTC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGAGTCGGCAAGATGAAACGTTCTGTAAAGGGTCCACATGCTCTC  937

seq1  ATGTGATGGGGTTCCTCTTAGTTTCTTTAGAAAACCAGAGAGGAAACAGC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGATGGGGTTCCTCTTAGTTTCTTTAGAAAACCAGAGAGGAAACAGC  987

seq1  CATTGACCAGAGCCCCCTTTTATTTTCCTGGGGTTAATTTGTTCATCTGG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGACCAGAGCCCCCTTTTATTTTCCTGGGGTTAATTTGTTCATCTGG  1037

seq1  TGGGTGGTTTCTAACTGCCACAATGTGTTGACTCAGAACTTTGTACATAT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGGTTTCTAACTGCCACAATGTGTTGACTCAGAACTTTGTACATAT  1087

seq1  AATGCTGTGCTGCACTGGCAGAATTTTGTCAGGCCTGCTCTTTCTCAGGA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTGTGCTGCACTGGCAGAATTTTGTCAGGCCTGCTCTTTCTCAGGA  1137

seq1  ATTC  1151
      ||||
seq2  ATTC  1141