BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-284I04
Chromosome12 (Build37)
Map Location 25,531,078 - 25,664,896
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMboat2, EG629397, C330002I19Rik
Upstream geneLOC668703, LOC546534, 9030624G23Rik, EG668710, LOC100042945, EG668711, EG668714, LOC629364, Taf1b, Grhl1, EG629383, Klf11, Cys1, Rrm2, LOC668719
Downstream geneId2, LOC100042973, LOC100042974, LOC668726
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-284I04.bB6Ng01-284I04.g
ACCGA083192GA083193
length1,1761,128
definitionB6Ng01-284I04.b B6Ng01-284I04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(25,663,725 - 25,664,896)(25,531,078 - 25,532,175)
sequence
gaattctggggtccttgataggggtcatgctttatatgcaggaagtacct
ctaccttggggaccaagaggcagatattattattacactatatgagtcca
tgcaaatataatctcctggaacaagaaccacacagaccaaacaggaacac
attagggatttgctagggtataagaaaaaagatgagacactgcataggaa
tgcagaattggagagttagtggatattccctctcttgactgtgctggtgt
tacataatcacatggacctgtcaaaattcaaaaccatagcccaaaggtac
attctataacatatagattaattataccaatgtgctttatttttaaaaaa
gttaggtgatccaatactttcccacccaggaagcaattctagcagcagga
aaaccgtggacaaagatccacaagagcacagtctgaggaggaggaagagc
acttactgctcttcagaggacctgggtccaattccctgctcgctttcact
tacaactctagttccaggggagcctgcttcccagcgtacctacatgcaaa
tggtatacacaaactcaggcatacatattttaaacataggacaaactggg
gacaaatacgcacaggggattgatagactgtcatcaaatgtttaaaaaaa
aactgtactgactgaaaatgcttgtgctatatgaaaggaggggtctaaaa
accacataagcagcattacaactactcaaaatgctaacaggagccactgc
tgttctgttcaggaattttcccctgtgcccatatcttccaggcttttccc
ccactttctcctctataagtttcactgtctctggttttatgtggagttcc
ttgatccacttaaacttgacctttagtacaaggagataggaatgggatca
attcacattcttctacatgataactgccagttgtgccagcaccattttgt
tgaaaatgctgtcttttttccactggatggttttagctcccttgtcaaag
atcaagtgaccatagtgtatggttcatttctgggtcttcattctattcca
ttggttctactgtctgtcgctataccagtacatgcagtttttatcacatt
gctctggtgtacagcctttaggtcaggccatggtgtattccacgaaggtc
cttttatcattggaggagagagtttt
gaattcatcagtttgccttgctgtttactaaaaggcaccaaaaagaccaa
agttgttggtttagcactgggcacgttctcaaaactaattctgaggagat
gggccccaagcatctttcctgtagacttagcgggctcatatctgagctag
ctcacgtgagctaagaggtgtaagaagagtggactatgggaaaagcttgt
ataagtctgttaaaagagggactcaaccctgcaggggtccagtcttcacc
tggtgttaggatggtgttaaagccacacccaggcagatcaccggagaccc
tctcattattcctgcaaacagttgtttgtctttctcagatccatacaatg
taagattcatagaatgtcagaggagttctgactgttgacttccggactgt
tgacttccgggttaatgagaactgtggatgttagggtgcccccccccccc
atgcctcccctttcttcacattgcttacatggtttttgttactcatgtgt
ttgaggtttttttttttttttcttttgagagattgttctggcagagctac
cattttgcttttaacccacaagataagaagaattcaccaacagctttttc
acgaaggaccgtttttatgacaactgaaaccaacaatcagaggcagttct
cgaagttcatttaatgctagcacatgaaatggtttcacaaacgggaatat
tagggacagtaattttacaggaaaataagcgtgtcttaaaggatctaagg
tccttgctgaggtggtttgtgtgagtcctctctcgatagtcattttgttt
ttccattcatagcccctgtcttcattagctaccatggaaattttactctt
ggtagagaacaagtggacttgtaggttaaactgggtagctgggtgaatgt
atccagacaccagaggtgatttgcatgctgaatttgcatacataatgatt
atatgtatttgaggcttaatattttgttaacaataaaatatgccacgata
tgcataggttattattaacttattttttctgaatcagaaaatgtatggca
gctggactggtgtgtagaatgaactactgaatccactgtcgacctaaggc
cagctttgagtgacttaggagccaagta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_25663725_25664896
seq2: B6Ng01-284I04.b_48_1223 (reverse)

seq1  AAAACTCT-TC--TCAATGATAAAAGAACCTCTGGTGGAAT-CACCAT-G  45
      |||||||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |
seq2  AAAACTCTCTCCTCCAATGATAAAAGGACCT-TCGTGGAATACACCATGG  49

seq1  CCTGACCTAAA-GCTGTACA-CAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGT  93
      ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||
seq2  CCTGACCTAAAGGCTGTACACCAGAGCAA-TGTGATAAAAACTGCAT-GT  97

seq1  ACTGGTATAGCGACAGACAGGTAG-ACCAATGGAATAGAATTGAAGACCC  142
      ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACTGGTATAGCGACAGACA-GTAGAACCAATGGAATAGAA-TGAAGACCC  145

seq1  AGAAATGAACCCATACACCTATGGTCACTTGATCTTTGACAAGGGAGCTA  192
      ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGAA-CCATACA-CTATGGTCACTTGATCTTTGACAAGGGAGCTA  193

seq1  AAACCATCCAGTGGAAAAAAGACAGCATTTTCAAC-AAATGGTGCTGGCA  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AAACCATCCAGTGGAAAAAAGACAGCATTTTCAACAAAATGGTGCTGGCA  243

seq1  CAACTGGCAGTTATCATGTAGAAGAATGTGAATTGAT-CCATTCCTATCT  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CAACTGGCAGTTATCATGTAGAAGAATGTGAATTGATCCCATTCCTATCT  293

seq1  CCTTGTACT-AAGGTCAAGTTTAAGTGGATCAAGGAACTCCACATAAAAC  339
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTACTAAAGGTCAAGTTTAAGTGGATCAAGGAACTCCACATAAAAC  343

seq1  CAGAGACAGTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGGAAAAGCCTGGAAGA  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGACAGTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGGAAAAGCCTGGAAGA  393

seq1  TATGGGCACAGGGGAAAATTCCTGAACAGAACAGCAGTGGCTCCTGTTAG  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGGCACAGGGGAAAATTCCTGAACAGAACAGCAGTGGCTCCTGTTAG  443

seq1  CATTTTGAGTAGTTGTAATGCTGCTTATGTGGTTTTTAGACCCCTCCTTT  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTGAGTAGTTGTAATGCTGCTTATGTGGTTTTTAGACCCCTCCTTT  493

seq1  CATATAGCACAAGCATTTTCAGTCAGTACAGTTTTTTTTTAAACATTTGA  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATAGCACAAGCATTTTCAGTCAGTACAGTTTTTTTTTAAACATTTGA  543

seq1  TGACAGTCTATCAATCCCCTGTGCGTATTTGTCCCCAGTTTGTCCTATGT  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGTCTATCAATCCCCTGTGCGTATTTGTCCCCAGTTTGTCCTATGT  593

seq1  TTAAAATATGTATGCCTGAGTTTGTGTATACCATTTGCATGTAGGTACGC  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATATGTATGCCTGAGTTTGTGTATACCATTTGCATGTAGGTACGC  643

seq1  TGGGAAGCAGGCTCCCCTGGAACTAGAGTTGTAAGTGAAAGCGAGCAGGG  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAGCAGGCTCCCCTGGAACTAGAGTTGTAAGTGAAAGCGAGCAGGG  693

seq1  AATTGGACCCAGGTCCTCTGAAGAGCAGTAAGTGCTCTTCCTCCTCCTCA  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGACCCAGGTCCTCTGAAGAGCAGTAAGTGCTCTTCCTCCTCCTCA  743

seq1  GACTGTGCTCTTGTGGATCTTTGTCCACGGTTTTCCTGCTGCTAGAATTG  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTGCTCTTGTGGATCTTTGTCCACGGTTTTCCTGCTGCTAGAATTG  793

seq1  CTTCCTGGGTGGGAAAGTATTGGATCACCTAACTTTTTTAAAAATAAAGC  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGGGTGGGAAAGTATTGGATCACCTAACTTTTTTAAAAATAAAGC  843

seq1  ACATTGGTATAATTAATCTATATGTTATAGAATGTACCTTTGGGCTATGG  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGGTATAATTAATCTATATGTTATAGAATGTACCTTTGGGCTATGG  893

seq1  TTTTGAATTTTGACAGGTCCATGTGATTATGTAACACCAGCACAGTCAAG  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGAATTTTGACAGGTCCATGTGATTATGTAACACCAGCACAGTCAAG  943

seq1  AGAGGGAATATCCACTAACTCTCCAATTCTGCATTCCTATGCAGTGTCTC  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGAATATCCACTAACTCTCCAATTCTGCATTCCTATGCAGTGTCTC  993

seq1  ATCTTTTTTCTTATACCCTAGCAAATCCCTAATGTGTTCCTGTTTGGTCT  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTTTTCTTATACCCTAGCAAATCCCTAATGTGTTCCTGTTTGGTCT  1043

seq1  GTGTGGTTCTTGTTCCAGGAGATTATATTTGCATGGACTCATATAGTGTA  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGTTCTTGTTCCAGGAGATTATATTTGCATGGACTCATATAGTGTA  1093

seq1  ATAATAATATCTGCCTCTTGGTCCCCAAGGTAGAGGTACTTCCTGCATAT  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAATATCTGCCTCTTGGTCCCCAAGGTAGAGGTACTTCCTGCATAT  1143

seq1  AAAGCATGACCCCTATCAAGGACCCCAGAATTC  1172
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCATGACCCCTATCAAGGACCCCAGAATTC  1176

seq1: chr12_25531078_25532175
seq2: B6Ng01-284I04.g_66_1193

seq1  GAATTCATCAGTTTGCCTTGCTGTTTACTAAAAGGCACCAAAAAGACCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCAGTTTGCCTTGCTGTTTACTAAAAGGCACCAAAAAGACCAA  50

seq1  AGTTGTTGGTTTAGCACTGGGCACGTTCTCAAAACTAATTCTGAGGAGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTTGGTTTAGCACTGGGCACGTTCTCAAAACTAATTCTGAGGAGAT  100

seq1  GGGCCCCAAGCATCTTTCCTGTAGACTTAGCGGGCTCATATCTGAGCTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCCCAAGCATCTTTCCTGTAGACTTAGCGGGCTCATATCTGAGCTAG  150

seq1  CTCACGTGAGCTAAGAGGTGTAAGAAGAGTGGACTATGGGAAAAGCTTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACGTGAGCTAAGAGGTGTAAGAAGAGTGGACTATGGGAAAAGCTTGT  200

seq1  ATAAGTCTGTTAAAAGAGGGACTCAACCCTGCAGGGGTCCAGTCTTCACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTCTGTTAAAAGAGGGACTCAACCCTGCAGGGGTCCAGTCTTCACC  250

seq1  TGGTGTTAGGATGGTGTTAAAGCCACACCCAGGCAGATCACCGGAGACCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTTAGGATGGTGTTAAAGCCACACCCAGGCAGATCACCGGAGACCC  300

seq1  TCTCATTATTCCTGCAAACAGTTGTTTGTCTTTCTCAGATCCATACAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATTATTCCTGCAAACAGTTGTTTGTCTTTCTCAGATCCATACAATG  350

seq1  TAAGATTCATAGAATGTCAGAGGAGTTCTGACTGTTGACTTCCGGACTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATTCATAGAATGTCAGAGGAGTTCTGACTGTTGACTTCCGGACTGT  400

seq1  TGACTTCCGGGTTAATGAGAACTGTGGATGTTAGGGTGCCCCCCCCCCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTCCGGGTTAATGAGAACTGTGGATGTTAGGGTGCCCCCCCCCCCC  450

seq1  ATGCCTCCCCTTTCTTCACATTGCTTACATGGTTTTTGTTACTCATGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTCCCCTTTCTTCACATTGCTTACATGGTTTTTGTTACTCATGTGT  500

seq1  TTGAGGTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTGAGAGATTGTTCTGGCAGAGCTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTGAGAGATTGTTCTGGCAGAGCTAC  550

seq1  CATTTTGCTTTTAACCCACAAGATAAGAAGAATTCACCAACAGCTTTTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTGCTTTTAACCCACAAGATAAGAAGAATTCACCAACAGCTTTTTC  600

seq1  ACGAAGGACCGTTTTTATGACAACTGAAACCAACAATCAGAGGCAGTTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAAGGACCGTTTTTATGACAACTGAAACCAACAATCAGAGGCAGTTCT  650

seq1  CGAAGTTCATTTAATGCTAGCACATGAAATGGTTTCACAAACGGGAATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAGTTCATTTAATGCTAGCACATGAAATGGTTTCACAAACGGGAATAT  700

seq1  TAGGGACAGTAATTTTACAGGAAAATAAGCGTGTCTTAAAGGATCTAAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGACAGTAATTTTACAGGAAAATAAGCGTGTCTTAAAGGATCTAAGG  750

seq1  TCCTTGCTGAGGTGGTTTGTGTGAGTCCTCTCTCGATAGTCATTT--GTT  798
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
seq2  TCCTTGCTGAGGTGGTTTGTGTGAGTCCTCTCTCGATAGTCATTTTGTTT  800

seq1  TTCCATTCATAG-CCCTGTCTTCATTAGCTACCATGG-AATTTTACTCTT  846
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTCCATTCATAGCCCCTGTCTTCATTAGCTACCATGGAAATTTTACTCTT  850

seq1  -GTAGAG-ACAAGTGGACTTGTAGGTT-AACT-GGTAGCT-GGTGAATGT  891
       |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||
seq2  GGTAGAGAACAAGTGGACTTGTAGGTTAAACTGGGTAGCTGGGTGAATGT  900

seq1  AT-CAGACA-CAGAGGTGATTTGCATGCTGAA-TTGCATACATAATGATT  938
      || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ATCCAGACACCAGAGGTGATTTGCATGCTGAATTTGCATACATAATGATT  950

seq1  ATATGTATTTGAAGC-TAATA-TTTGTTAACAAT-AAATATG-CACGATA  984
      |||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||
seq2  ATATGTATTTGAGGCTTAATATTTTGTTAACAATAAAATATGCCACGATA  1000

seq1  TGCATAGTTTAT--ATAAC---TATTTTCTG-ATCAG-AAATG-ATGGCA  1026
      ||||||| ||||   ||||   | ||||||| ||||| ||||| ||||||
seq2  TGCATAGGTTATTATTAACTTATTTTTTCTGAATCAGAAAATGTATGGCA  1050

seq1  GCTTGGACT-GTGTGTAG-ATG-ACTACTGA--TCACTGTGGA-CTTAGG  1070
      || |||||| |||||||| ||| ||||||||   |||||| || || |||
seq2  GC-TGGACTGGTGTGTAGAATGAACTACTGAATCCACTGTCGACCTAAGG  1099

seq1  GCAGCTTTGAGTGAC-TAGGAGGCAAGTA  1098
       |||||||||||||| |||||| ||||||
seq2  CCAGCTTTGAGTGACTTAGGAGCCAAGTA  1128