BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-290K15
Chromosome12 (Build37)
Map Location 19,911,045 - 20,050,475
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG668600
Upstream geneLOC668568, LOC668570, EG668413, LOC671401, EG546524, EG668584, EG544848, EG627871, LOC100042698, LOC629055, EG668588, LOC100042706, EG668594
Downstream geneLOC100042727, LOC673301, EG668605, LOC668614, LOC100042751, LOC100043371, EG668455, LOC100042755, LOC100043377, LOC625810, 1700030C10Rik, 3110053B16Rik, LOC668698, LOC546752
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-290K15.bB6Ng01-290K15.g
ACCGA087750GA087751
length587910
definitionB6Ng01-290K15.b B6Ng01-290K15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(20,049,883 - 20,050,475)(19,911,045 - 19,911,949)
sequence
attcccacagttcaaaactcagcttccaagctttaaaattcaagagcact
ccttcccttgccatgttgagcatatcttcaacaattcccatgggaccttg
ttctgttatagcatgtggtagtttagatgtgaaatatctgccgaagacac
aagttttgaagaattgctcctctagttgtggcctgaggaagaaagttaga
tcattgggagcatgcctttgaggcactgttgggaccttgctccccttccc
ctccctgcttctctgccatggtaaacctgctacatgctgctaccatgatg
cactaagttgctagatgcccaaagctacagggccaagcaaccgtggactg
aaaccatgagccccaaactaactctttcctcctaaattgattctttcatt
tcaccacagtgatgtaaaagtgagtgacacacagcactctccactcacag
atgagtttgcagcagatcaggtatataatcctttcagctttatgtcccta
aaacccagcacttgatttaattgtattttttgaatggatacatttatact
ggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gaattcattcccacagttcaaaactcagcttgcaagctttaaaattcaag
agcactccttcccttcttcccttgccatgttgagcatatcttcaacattt
cccatgttaccttgttctgctatagcatgtggtagtttagatgtgaaatg
tctgccgaagacccaagttttgaagaattgctcctctagttgtggcctga
ggaagaaagttagaccattgggagcatgcctttgaggcactgttgggacc
ttgctccccttcccctccctgcttctctgccatggtaaacctgctacaag
ctgctaccatgaagttgctagatgcccaaagctacagggccaagcaacca
tggactgaaaccatgagccaaaaactaactctttcctcctaaattgattc
tttcattttgtcacagtgatgtaaaagtgagtgacacacagcactctcca
ctcacaggtatgtttttgtcactagatgagtttgcagcagatcaggtata
taatcctttcagctttatgtccctaaaacccagcacttgatttaattgta
tcctttgagtggatacatttatactggtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgt
ggtgagagtacagaaaggtcctcctttgaatcatagaaaatgcctttatt
cactatctttcactactggaggaccctgtccatctaagacccaaaaaaat
cttgtaagggataggtggaccatgtgtgttgctcaatattcacaaacagg
cttctagagggaacggggaaagagggcttattttaatgatttggttaggt
ttggctgttgctgttgttgtcctggggagttcaaaccccagggttcttaa
gcttgtcagacaagcactctgcctattgagctgttcctttgcccaaggac
ggggggtttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_20049883_20050475
seq2: B6Ng01-290K15.b_44_636 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACCAGTATAAATGTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACCAGTATAAATGTAT  50

seq1  CCATTCAAAAAATACAATTAAATCAAGTGCTGGGTTTTAGGGACATAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCAAAAAATACAATTAAATCAAGTGCTGGGTTTTAGGGACATAAAG  100

seq1  CTGAAAGGATTATATACCTGATCTGCTGCAAACTCATCTGTGAGTGGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAGGATTATATACCTGATCTGCTGCAAACTCATCTGTGAGTGGAGA  150

seq1  GTGCTGTGTGTCACTCACTTTTACATCACTGTGGTGAAATGAAAGAATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGTGTGTCACTCACTTTTACATCACTGTGGTGAAATGAAAGAATCA  200

seq1  ATTTAGGAGGAAAGAGTTAGTTTGGGGCTCATGGTTTCAGTCCACGGTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAGGAGGAAAGAGTTAGTTTGGGGCTCATGGTTTCAGTCCACGGTTG  250

seq1  CTTGGCCCTGTAGCTTTGGGCATCTAGCAACTTAGTGCATCATGGTAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCCCTGTAGCTTTGGGCATCTAGCAACTTAGTGCATCATGGTAGCA  300

seq1  GCATGTAGCAGGTTTACCATGGCAGAGAAGCAGGGAGGGGAAGGGGAGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTAGCAGGTTTACCATGGCAGAGAAGCAGGGAGGGGAAGGGGAGCA  350

seq1  AGGTCCCAACAGTGCCTCAAAGGCATGCTCCCAATGATCTAACTTTCTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCCCAACAGTGCCTCAAAGGCATGCTCCCAATGATCTAACTTTCTTC  400

seq1  CTCAGGCCACAACTAGAGGAGCAATTCTTCAAAACTTGTGTCTTCGGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGCCACAACTAGAGGAGCAATTCTTCAAAACTTGTGTCTTCGGCAG  450

seq1  ATATTTCACATCTAAACTACCACATGCTATAACAGAACAAGGTCCCATGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTCACATCTAAACTACCACATGCTATAACAGAACAAGGTCCCATGG  500

seq1  GAATTGTTGAAGATATGCTCAACATGGCAAGGGAAGGAGTGCTCTTGAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGTTGAAGATATGCTCAACATGGCAAGGGAAGGAGTGCTCTTGAAT  550

seq1  TTTAAAGCTTGGAAGCTGAGTTTTGAACTGTGGGAATGAATTC  593
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAGCTTGGAAGCTGAGTTTTGAACTGTGGGAATGAATTC  593

seq1: chr12_19911045_19911949
seq2: B6Ng01-290K15.g_67_976

seq1  GAATTCATTCCCACAGTTCAAAACTCAGCTTGCAAGCTTTAAAATTCAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCCCACAGTTCAAAACTCAGCTTGCAAGCTTTAAAATTCAAG  50

seq1  AGCACTCCTTCCCTTCTTCCCTTGCCATGTTGAGCATATCTTCAACATTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTCCTTCCCTTCTTCCCTTGCCATGTTGAGCATATCTTCAACATTT  100

seq1  CCCATGTTACCTTGTTCTGCTATAGCATGTGGTAGTTTAGATGTGAAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGTTACCTTGTTCTGCTATAGCATGTGGTAGTTTAGATGTGAAATG  150

seq1  TCTGCCGAAGACCCAAGTTTTGAAGAATTGCTCCTCTAGTTGTGGCCTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCGAAGACCCAAGTTTTGAAGAATTGCTCCTCTAGTTGTGGCCTGA  200

seq1  GGAAGAAAGTTAGACCATTGGGAGCATGCCTTTGAGGCACTGTTGGGACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAAAGTTAGACCATTGGGAGCATGCCTTTGAGGCACTGTTGGGACC  250

seq1  TTGCTCCCCTTCCCCTCCCTGCTTCTCTGCCATGGTAAACCTGCTACAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCCCCTTCCCCTCCCTGCTTCTCTGCCATGGTAAACCTGCTACAAG  300

seq1  CTGCTACCATGAAGTTGCTAGATGCCCAAAGCTACAGGGCCAAGCAACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTACCATGAAGTTGCTAGATGCCCAAAGCTACAGGGCCAAGCAACCA  350

seq1  TGGACTGAAACCATGAGCCAAAAACTAACTCTTTCCTCCTAAATTGATTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTGAAACCATGAGCCAAAAACTAACTCTTTCCTCCTAAATTGATTC  400

seq1  TTTCATTTTGTCACAGTGATGTAAAAGTGAGTGACACACAGCACTCTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTTTGTCACAGTGATGTAAAAGTGAGTGACACACAGCACTCTCCA  450

seq1  CTCACAGGTATGTTTTTGTCACTAGATGAGTTTGCAGCAGATCAGGTATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGGTATGTTTTTGTCACTAGATGAGTTTGCAGCAGATCAGGTATA  500

seq1  TAATCCTTTCAGCTTTATGTCCCTAAAACCCAGCACTTGATTTAATTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCCTTTCAGCTTTATGTCCCTAAAACCCAGCACTTGATTTAATTGTA  550

seq1  TCCTTTGAGTGGATACATTTATACTGGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTGAGTGGATACATTTATACTGGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  600

seq1  GGTGAGAGTACAGAAAGGTCCTCCTTTGAATCATAGAAAATGCCTTTATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGAGTACAGAAAGGTCCTCCTTTGAATCATAGAAAATGCCTTTATT  650

seq1  CACTATCTTTCACTACTGGAGGACCCTGTCCATCTAAGACCCAAAAAAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATCTTTCACTACTGGAGGACCCTGTCCATCTAAGACCCAAAAAAAT  700

seq1  CTTGTAAGGGATAGGTGGACCATGTGTGTTGCTCAATATTCCACAAACAG  750
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CTTGTAAGGGATAGGTGGACCATGTGTGTTGCTCAATATT-CACAAACAG  749

seq1  GCTTCTAGA-GGAAC-GGGAAAGAGGGCTTATTTTTAATGATTTGGTTAG  798
      ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTAGAGGGAACGGGGAAAGAGGGCTTA-TTTTAATGATTTGGTTAG  798

seq1  GTTTGGCTGTTGCTGTTGTTGTCCTGGGGAG-TCAAA-CCCAGGG-TCTT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||
seq2  GTTTGGCTGTTGCTGTTGTTGTCCTGGGGAGTTCAAACCCCAGGGTTCTT  848

seq1  AAGCTTGCCAGACAAGCACTCTGCC-ATTGAGCTGTTCCTTAGCCCAAGG  894
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
seq2  AAGCTTGTCAGACAAGCACTCTGCCTATTGAGCTGTTCCTTTGCCCAAGG  898

seq1  A-GGGGGGTTTT  905
      | ||||||||||
seq2  ACGGGGGGTTTT  910