BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302G10
Chromosome12 (Build37)
Map Location 67,617,234 - 67,768,554
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMdga2
Upstream geneLOC100040700, EG238217
Downstream geneLOC100040745
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302G10.bB6Ng01-302G10.g
ACCGA096457GA096458
length7521,102
definitionB6Ng01-302G10.b B6Ng01-302G10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,617,234 - 67,617,980)(67,767,450 - 67,768,554)
sequence
gaattccacttactaacatagattgccgtgcttcttcagatttcacatga
taatctctctctctctctctctcatttatctgtactcatgtatacacaaa
ttccttatatgtatgcatacgtgtacacatattatattagagtactatat
gtgtgtgcatatgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtttatgtttgt
atatatgaacattcactcatataagttttgatttgttctctgatgggtgg
ttagtcctaactacatagcttggactcctatttcttttatacttcaactg
ctaaactggaaatgaaattatccaacatgtgtcctgttagtgtttctcac
taattttttctcacaaacaatgaacaaaatagtagaattaaaaagatact
atcatgtgttatttttagagctctattcacagaggagagaaaaaaacatg
ctatgtaagaggtatgggtagaaaataagaatgtattcattcttattaag
tattcactctcaggaggctcatatacttaactttaaaaaaaaggtaagat
gtctcctttgagattgcatctcctagaaatgtcagtgaagctacacctat
gacgccttatcaatatggctgcctctagaagacccaaacatggatgacac
ctaaaaacacattaacatgggagggggtaaatcacacacggtccagatcc
tagaaaaaaataaatgacatacaacctgagagattgtgaagaatagcaca
tc
gaattcttaggcacaaatacaggacaattctctgatccttagataatttt
agattttccttatttaaaatttcctttcactttatcgcaactggcatttc
tagcctgggcaagatcttcaatcaggtgccaccatcaccagtaaatggac
aacttttcttgatgattttcaaagaatgcagtgtgtactcctttgacatt
ataagacaaggcagtatttagggatttatccttgaattaaaatttagcct
gaaccactcagtgattgcatgatacatatgtcctgtgttataagagccca
cgtaatgaactgatggataatcagccctgagatttttcagtctttatcaa
ggacatgacaaaataaaaattataaattgttgtcttaagatgaccactca
gcattaatattatttagtgaaaaataactagaaataaaagttttccttca
acctcaagttttggctataaagaagaaaatattaaacattaatatttcta
tgttcagattacagcactttatcatcgatattttcagaagccatttcttg
aaacaaattcagtttatcatcttgagaacatgttcttgagcaccctaaaa
tcaaaagctatatattctggccactgctgtttttctctccttttttttcc
catttttttaagacaaggcatcatgaatatagcagtatgtcattaagcaa
cactattgctatgttctttagcagaataacatattaggttttctcatagg
accatgaactatcaagtctcagattctcagccatcaaaaattagttagtt
acttctgtaatatttgagttgctattgtacctctataatctgtatgctgg
gtgactagtgtaggctgcaatgattgtgcctgggagatgttgatgaatgt
ctcagatagaatgctgactaccgtccagtatctcccaacactagtcagta
ggggtttccatttctagttaggcactcaatcgatttctgtttgatgacct
ctgtaagtgttatctttagcaataggcctcatcaacacatgtgcttacac
aaaatctcaaaacatcaattaggctatacaatcttgggagctagatcctg
gg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_67617234_67617980
seq2: B6Ng01-302G10.b_47_798

seq1  GAATTCCACTTACTAACATAGATTGCCGTGCTTCTTCAGATTTCACATGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACTTACTAACATAGATTGCCGTGCTTCTTCAGATTTCACATGA  50

seq1  TAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTTATCTGTACTCATGTATACACAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTTATCTGTACTCATGTATACACAAA  100

seq1  TTCCTTATATGTATGCATACGTGTACACATATTATATTAGAGTACTATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTATATGTATGCATACGTGTACACATATTATATTAGAGTACTATAT  150

seq1  GTGTGTGCATATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATGTTTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGCATATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATGTTTGT  200

seq1  ATATATGAACATTCACTCATATAAGTTTTGATTTGTTCTCTGATGGGTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGAACATTCACTCATATAAGTTTTGATTTGTTCTCTGATGGGTGG  250

seq1  TTAGTCCTAACTACATAGCTTGGACTCCTATTTCTTTTATACTTCAACTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCCTAACTACATAGCTTGGACTCCTATTTCTTTTATACTTCAACTG  300

seq1  CTAAACTGGAAATGAAATTATCCAACATGTGTCCTGTTAGTGTTTCTCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACTGGAAATGAAATTATCCAACATGTGTCCTGTTAGTGTTTCTCAC  350

seq1  TAATTTTTTCTCACAAACAATGAACAAAATAGTAGAATTAAAAAGATACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTTTCTCACAAACAATGAACAAAATAGTAGAATTAAAAAGATACT  400

seq1  ATCATGTGTAATTTTTAGAGCTCTATTCACAGAGGAGAGAAAAAAACATG  450
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGTGTTATTTTTAGAGCTCTATTCACAGAGGAGAGAAAAAAACATG  450

seq1  CTATGTAAGAGGTATGGGTAGAAAATAAGAATGTATTCATTCTTATTAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTAAGAGGTATGGGTAGAAAATAAGAATGTATTCATTCTTATTAAG  500

seq1  TATTCACTCTCAGGAGGCTCATATACTTAACTTTAAAAGAAAGGTAAGAT  550
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TATTCACTCTCAGGAGGCTCATATACTTAACTTTAAAAAAAAGGTAAGAT  550

seq1  GTCTCCTTTGAGATTGCATCTCCTAGAAATGTCAGTGAAGCTACACCTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCTTTGAGATTGCATCTCCTAGAAATGTCAGTGAAGCTACACCTAT  600

seq1  GACGCCTTATCAATATGGCTGCCTCTAGAAGACCCAAACAAGGATGACAC  650
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GACGCCTTATCAATATGGCTGCCTCTAGAAGACCCAAACATGGATGACAC  650

seq1  CAAAAAACACATTAACATGG--AGGGGTAAATCACACAGGGTCCAGATCC  698
      | ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CTAAAAACACATTAACATGGGAGGGGGTAAATCACACACGGTCCAGATCC  700

seq1  TAGAAAAAAA-AAATGACATACAA-CTGAGAGATTGTG-AGAATAGCACA  745
      |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
seq2  TAGAAAAAAATAAATGACATACAACCTGAGAGATTGTGAAGAATAGCACA  750

seq1  TC  747
      ||
seq2  TC  752

seq1: chr12_67767450_67768554
seq2: B6Ng01-302G10.g_68_1169 (reverse)

seq1  CCCAGAATCTGGCTCCCAAGATTGTATTGGCTAAATGGAATG-TTTGAGA  49
      ||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||  ||| |||||||
seq2  CCCAGGATCTAGCTCCCAAGATTGTATAGCCTAATTG--ATGTTTTGAGA  48

seq1  TTTTGTTGTAAGCAACATGTGTTGATGAGGCCCTATTGCTAAAGATAACA  99
      ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TTTTG-TGTAAGC-ACATGTGTTGATGAGG-CCTATTGCTAAAGATAACA  95

seq1  CTTACAGAGGTCATCAAACAAGAAATCGATTGAGTGCCTAACTAGAAATG  149
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACAGAGGTCATCAAAC-AGAAATCGATTGAGTGCCTAACTAGAAATG  144

seq1  G-AACCCCTACTGACTAGTGTT-GGAGATACTGGACGGTAGTCAGCATTC  197
      | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCCCTACTGACTAGTGTTGGGAGATACTGGACGGTAGTCAGCATTC  194

seq1  TATCTGAGACATTCATCAACATCTCCCAGGCACAATCATTGCAGCCTACA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGAGACATTCATCAACATCTCCCAGGCACAATCATTGCAGCCTACA  244

seq1  CTAGTCACCCAGCATACAGATTATAGAGGTACAATAGCAACTCAAATATT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTCACCCAGCATACAGATTATAGAGGTACAATAGCAACTCAAATATT  294

seq1  ACAGAAGTAACTAACTAATTTTTGATGGCTGAGAATCTGAGACTTGATAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAGTAACTAACTAATTTTTGATGGCTGAGAATCTGAGACTTGATAG  344

seq1  TTCATGGTCCTATGAGAAAACCTAATATGTTATTCTGCTAAAGAACATAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGGTCCTATGAGAAAACCTAATATGTTATTCTGCTAAAGAACATAG  394

seq1  CAATAGTGTTGCTTAATGACATACTGCTATATTCATGATGCCTTGTCTTA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGTGTTGCTTAATGACATACTGCTATATTCATGATGCCTTGTCTTA  444

seq1  AAAAAATGGGAAAAAAAAGGAGAGAAAAACAGCAGTGGCCAGAATATATA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATGGGAAAAAAAAGGAGAGAAAAACAGCAGTGGCCAGAATATATA  494

seq1  GCTTTTGATTTTAGGGTGCTCAAGAACATGTTCTCAAGATGATAAACTGA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTGATTTTAGGGTGCTCAAGAACATGTTCTCAAGATGATAAACTGA  544

seq1  ATTTGTTTCAAGAAATGGCTTCTGAAAATATCGATGATAAAGTGCTGTAA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTTCAAGAAATGGCTTCTGAAAATATCGATGATAAAGTGCTGTAA  594

seq1  TCTGAACATAGAAATATTAATGTTTAATATTTTCTTCTTTATAGCCAAAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAACATAGAAATATTAATGTTTAATATTTTCTTCTTTATAGCCAAAA  644

seq1  CTTGAGGTTGAAGGAAAACTTTTATTTCTAGTTATTTTTCACTAAATAAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGGTTGAAGGAAAACTTTTATTTCTAGTTATTTTTCACTAAATAAT  694

seq1  ATTAATGCTGAGTGGTCATCTTAAGACAACAATTTATAATTTTTATTTTG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATGCTGAGTGGTCATCTTAAGACAACAATTTATAATTTTTATTTTG  744

seq1  TCATGTCCTTGATAAAGACTGAAAAATCTCAGGGCTGATTATCCATCAGT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTCCTTGATAAAGACTGAAAAATCTCAGGGCTGATTATCCATCAGT  794

seq1  TCATTACGTGGGCTCTTATAACACAGGACATATGTATCATGCAATCACTG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTACGTGGGCTCTTATAACACAGGACATATGTATCATGCAATCACTG  844

seq1  AGTGGTTCAGGCTAAATTTTAATTCAAGGATAAATCCCTAAATACTGCCT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTTCAGGCTAAATTTTAATTCAAGGATAAATCCCTAAATACTGCCT  894

seq1  TGTCTTATAATGTCAAAGGAGTACACACTGCATTCTTTGAAAATCATCAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTATAATGTCAAAGGAGTACACACTGCATTCTTTGAAAATCATCAA  944

seq1  GAAAAGTTGTCCATTTACTGGTGATGGTGGCACCTGATTGAAGATCTTGC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGTTGTCCATTTACTGGTGATGGTGGCACCTGATTGAAGATCTTGC  994

seq1  CCAGGCTAGAAATGCCAGTTGCGATAAAGTGAAAGGAAATTTTAAATAAG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTAGAAATGCCAGTTGCGATAAAGTGAAAGGAAATTTTAAATAAG  1044

seq1  GAAAATCTAAAATTATCTAAGGATCAGAGAATTGTCCTGTATTTGTGCCT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATCTAAAATTATCTAAGGATCAGAGAATTGTCCTGTATTTGTGCCT  1094

seq1  AAGAATTC  1105
      ||||||||
seq2  AAGAATTC  1102