BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302P22
Chromosome12 (Build37)
Map Location 105,848,677 - 105,948,341
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDicer1
Upstream gene8430415E04Rik, Serpina10, Serpina6, Gm46, Serpina1f, EG435316, Serpina1b, Serpina1d, LOC667951, LOC628801, Serpina1a, LOC667954, Serpina1c, Serpina1e, Serpina11, Serpina9, Serpina12, Serpina4-ps1, Serpina5, Serpina3a, Serpina3b, Serpina3c, LOC435318, LOC628883, Serpina3f, LOC667997, Serpina3g, Serpina3h, EG628900, EG238395, Serpina3k, EG628916, Serpina3m, Serpina3n, Gsc
Downstream geneClmn, 4831426I19Rik, Snhg10, Glrx5, LOC100040301, Tcl1b2, Tcl1b1, Tcl1b5, Tcl1b3, Tcl1b4, Tcl1, LOC100040310, 2810011L19Rik, LOC100040339, EG668081, D430019H16Rik, Bdkrb2, Bdkrb1, 2410024A21Rik, 4933433P14Rik, Ak7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302P22.bB6Ng01-302P22.g
ACCGA096904GA096905
length1,141944
definitionB6Ng01-302P22.b B6Ng01-302P22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(105,947,213 - 105,948,341)(105,848,677 - 105,849,619)
sequence
gaattcattttgattagatgtcgttttaaaagatgggatgtagctgtgtt
agaacccttgcctcataacgtgtgagaccctggattctatcccagcacta
ccaaagtttaaaacaaatcggaacaactagaaggcttgaaagcttgttgg
tattttcaaactaaagtacttggttgtggcagcttgggtgtcagcagtat
taggcagaggttctgagtctgccccgtgggctggtaaacgtaattgggaa
atgctctgttcttgttttcagggtccaccgatggacagtgtacggttggc
tgaaagagtggtagctctcatttgctgtgaaaaactgcacaaaattggta
tgtaaacatgcttggaaaacatttatcagtgagaaaaaggtggcaaagtg
tccgtcagaagcacatggaggcctctgcgggtttctgggtttgtcagggc
ctagacatgctgctttgactatacctcggtcggctcactatgccttttct
gtacctcagagaccctacagagctgggcagggctgctgactttcacagct
tcactgtaaacagctgccactttttgcttctgttgttggccccttttaca
cacataaggatgctctaactattggattctaagccagccatatgtatgtt
taatgtattagactatgtctaatgtattaatgtattagacatgtattaat
gtattagactatgtcaggttagtctatgtcggtgaagaagacaatccttt
aaaaagtgaaaaacttgtgcttaaaagggatgtgtgagcctggctagttg
atattttaattttggattttagagttaggtttgttcatgctgaatgcatg
agtgtcacgtagagcccctaaagttttcagctgtgactactttacagtgt
ttgtgaggtttatctatccttatgtatgtgcgcggttacttgcactgtgt
gcctgcctgctagctggagggcagaatgaatgtacctgagccctggaaac
ttgtacttacagattgtcatgagtcaccatgtggggtgcctggggaacta
gacctgggtccttctccgcgagcagcaagtgcttccttcactgcctgagc
aagctcttttccagtgtctaacgggccagggccgctgttgc
gaattccagtgctggcaagagatggagacaggcagatttctggggctcac
cagccagccacactggccaatcactgaactctaggtttagtgagagactc
tgtctggaaaatgaagctggagggtggaaggctcctccggcctccacacg
tgcacacataaatatgtgcctgtgtacccagacacatgcatgcatatatt
catactaaactctgtcctcatccctccctaccacgtgaccttggatggtc
actttgcctctctgatcatttgcaccggcttaattataattccagatcgc
ctccaggagccttagtggaggggtgagcatgtgttttcctggaactgggc
tgaggtttgtaaaatcagtgtaagaagcagttggcgctgccccatgcatg
agcaggaggcatggatctgagtctggattccagacacagagtccaacctg
atggtgagtgagcaggtgcacctagggaggctaagagggctatttcctca
gctgtacagagggatcacagtggcatgtcctagagacagatgtgcccaca
cctctcgccagtgcacagcagagcttatacttagcctgttgcagaatcag
aggcttgaggtaggtgacaccaatcttaggtattccaaggagctgacaca
gcaaggactcatctgctagtaagagcagaaagcctgggtataaaagtgcg
gggagggcagccaagtaatatggttagcagaaagacaacacccccatcgg
tctcctgcaagctgtgatttttttttttcagtcgggtgtcttctaaaata
cccagtgctgtcattgtctctctagcaatagatgcactgcttctgaagaa
ggttattgtcacataagagagatggccctgggttttcaaaagatcccctt
tgaaaactgtgagctctctctctctctctctctctctctctgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_105947213_105948341
seq2: B6Ng01-302P22.b_49_1189 (reverse)

seq1  GCAACCAAAGCGCCCCTG--CCGTTAGACACT-GAAAAGAGCTGGCTCA-  46
      |||||   |||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| 
seq2  GCAAC---AGCGGCCCTGGCCCGTTAGACACTGGAAAAGAGCTTGCTCAG  47

seq1  GCAGTGA--GGAGCACTGGCTGCTCGCGGAG-AGGACCCAGGTCTAGTTC  93
      |||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGAAGGAAGCACTTGCTGCTCGCGGAGAAGGACCCAGGTCTAGTTC  97

seq1  CC--AGCA-CCCACATGGTGACTCATGACAATCTGTAAGTACA--GTTCC  138
      ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
seq2  CCCAGGCACCCCACATGGTGACTCATGACAATCTGTAAGTACAAGTTTCC  147

seq1  AGGGCTCAGGTACCTTCA-TCTGCCCTCCAGCTAGCAGGCAGGCACACAG  187
      ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTCAGGTACATTCATTCTGCCCTCCAGCTAGCAGGCAGGCACACAG  197

seq1  TGCAAGTAACCGCGCACATACAT-AGGATAGATAAACCTCACAAACACTG  236
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAGTAACCGCGCACATACATAAGGATAGATAAACCTCACAAACACTG  247

seq1  TAAAGTAGTCACAGCTG-AAACTTTAGGGGCTCTACGTGACACTCATGCA  285
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTAGTCACAGCTGAAAACTTTAGGGGCTCTACGTGACACTCATGCA  297

seq1  TTCAGCATGAACAAACCTAACTCTAAAATCCAAAATTAAAATATCAACTA  335
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCATGAACAAACCTAACTCTAAAATCCAAAATTAAAATATCAACTA  347

seq1  GCCAGGCTCACACATCCCTTTTAAGCACAAGTTTTTCACTTTTTAAAGGA  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGGCTCACACATCCCTTTTAAGCACAAGTTTTTCACTTTTTAAAGGA  397

seq1  TTGTCTTCTTCACCGACATAGACTAACCTGACATAGTCTAATACATTAAT  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTTCTTCACCGACATAGACTAACCTGACATAGTCTAATACATTAAT  447

seq1  ACATGTCTAATACATTAATACATTAGACATAGTCTAATACATTAAACATA  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTCTAATACATTAATACATTAGACATAGTCTAATACATTAAACATA  497

seq1  CATATGGCTGGCTTAGAATCCAATAGTTAGAGCATCCTTATGTGTGTAAA  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGGCTGGCTTAGAATCCAATAGTTAGAGCATCCTTATGTGTGTAAA  547

seq1  AGGGGCCAACAACAGAAGCAAAAAGTGGCAGCTGTTTACAGTGAAGCTGT  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGCCAACAACAGAAGCAAAAAGTGGCAGCTGTTTACAGTGAAGCTGT  597

seq1  GAAAGTCAGCAGCCCTGCCCAGCTCTGTAGGGTCTCTGAGGTACAGAAAA  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTCAGCAGCCCTGCCCAGCTCTGTAGGGTCTCTGAGGTACAGAAAA  647

seq1  GGCATAGTGAGCCGACCGAGGTATAGTCAAAGCAGCATGTCTAGGCCCTG  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATAGTGAGCCGACCGAGGTATAGTCAAAGCAGCATGTCTAGGCCCTG  697

seq1  ACAAACCCAGAAACCCGCAGAGGCCTCCATGTGCTTCTGACGGACACTTT  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACCCAGAAACCCGCAGAGGCCTCCATGTGCTTCTGACGGACACTTT  747

seq1  GCCACCTTTTTCTCACTGATAAATGTTTTCCAAGCATGTTTACATACCAA  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCTTTTTCTCACTGATAAATGTTTTCCAAGCATGTTTACATACCAA  797

seq1  TTTTGTGCAGTTTTTCACAGCAAATGAGAGCTACCACTCTTTCAGCCAAC  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTGCAGTTTTTCACAGCAAATGAGAGCTACCACTCTTTCAGCCAAC  847

seq1  CGTACACTGTCCATCGGTGGACCCTGAAAACAAGAACAGAGCATTTCCCA  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTACACTGTCCATCGGTGGACCCTGAAAACAAGAACAGAGCATTTCCCA  897

seq1  ATTACGTTTACCAGCCCACGGGGCAGACTCAGAACCTCTGCCTAATACTG  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACGTTTACCAGCCCACGGGGCAGACTCAGAACCTCTGCCTAATACTG  947

seq1  CTGACACCCAAGCTGCCACAACCAAGTACTTTAGTTTGAAAATACCAACA  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACACCCAAGCTGCCACAACCAAGTACTTTAGTTTGAAAATACCAACA  997

seq1  AGCTTTCAAGCCTTCTAGTTGTTCCGATTTGTTTTAAACTTTGGTAGTGC  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTCAAGCCTTCTAGTTGTTCCGATTTGTTTTAAACTTTGGTAGTGC  1047

seq1  TGGGATAGAATCCAGGGTCTCACACGTTATGAGGCAAGGGTTCTAACACA  1085
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATAGAATCCAGGGTCTCACACGTTATGAGGCAAGGGTTCTAACACA  1097

seq1  GCTACATCCCATCTTTTAAAACGACATCTAATCAAAATGAATTC  1129
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACATCCCATCTTTTAAAACGACATCTAATCAAAATGAATTC  1141

seq1: chr12_105848677_105849619
seq2: B6Ng01-302P22.g_68_1011

seq1  GAATTCCAGTGCTGGCAAGAGATGGAGACAGGCAGATTTCTGGGGCTCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTGCTGGCAAGAGATGGAGACAGGCAGATTTCTGGGGCTCAC  50

seq1  CAGCCAGCCACACTGGCCAATCACTGAACTCTAGGTTTAGTGAGAGACTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGCCACACTGGCCAATCACTGAACTCTAGGTTTAGTGAGAGACTC  100

seq1  TGTCTGGAAAATGAAGCTGGAGGGTGGAAGGCTCCTCCGGCCTCCACACG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGGAAAATGAAGCTGGAGGGTGGAAGGCTCCTCCGGCCTCCACACG  150

seq1  TGCACACATAAATATGTGCCTGTGTACCCAGACACATGCATGCATATATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACACATAAATATGTGCCTGTGTACCCAGACACATGCATGCATATATT  200

seq1  CATACTAAACTCTGTCCTCATCCCTCCCTACCACGTGACCTTGGATGGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTAAACTCTGTCCTCATCCCTCCCTACCACGTGACCTTGGATGGTC  250

seq1  ACTTTGCCTCTCTGATCATTTGCACCGGCTTAATTATAATTCCAGATCGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGCCTCTCTGATCATTTGCACCGGCTTAATTATAATTCCAGATCGC  300

seq1  CTCCAGGAGCCTTAGTGGAGGGGTGAGCATGTGTTTTCCTGGAACTGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGGAGCCTTAGTGGAGGGGTGAGCATGTGTTTTCCTGGAACTGGGC  350

seq1  TGAGGTTTGTAAAATCAGTGTAAGAAGCAGTTGGCGCTGCCCCATGCATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTTTGTAAAATCAGTGTAAGAAGCAGTTGGCGCTGCCCCATGCATG  400

seq1  AGCAGGAGGCATGGATCTGAGTCTGGATTCCAGACACAGAGTCCAACCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGAGGCATGGATCTGAGTCTGGATTCCAGACACAGAGTCCAACCTG  450

seq1  ATGGTGAGTGAGCAGGTGCACCTAGGGAGGCTAAGAGGGCTATTTCCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGAGTGAGCAGGTGCACCTAGGGAGGCTAAGAGGGCTATTTCCTCA  500

seq1  GCTGTACAGAGGGATCACAGTGGCATGTCCTAGAGACAGATGTGCCCACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTACAGAGGGATCACAGTGGCATGTCCTAGAGACAGATGTGCCCACA  550

seq1  CCTCTCGCCAGTGCACAGCAGAGCTTATACTTAGCCTGTTGCAGAATCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCGCCAGTGCACAGCAGAGCTTATACTTAGCCTGTTGCAGAATCAG  600

seq1  AGGCTTGAGGTAGGTGACACCAATCTTAGGTATTCCAAGGAGCTGACACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTGAGGTAGGTGACACCAATCTTAGGTATTCCAAGGAGCTGACACA  650

seq1  GCAAGGACTCATCTGCTAGTAAGAGCAGAAAGCCTGGGTATAAAAGTGCG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGACTCATCTGCTAGTAAGAGCAGAAAGCCTGGGTATAAAAGTGCG  700

seq1  GGGAGGGCAGCCAAGTAATATGGTTAGCAGAAAGACAACACCCCCATCGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGGCAGCCAAGTAATATGGTTAGCAGAAAGACAACACCCCCATCGG  750

seq1  TCTCCTGCAAGCTGTGA-TTTTTTTTTTCAGTCGGGTGTCTTCTAAAATA  799
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTGCAAGCTGTGATTTTTTTTTTTCAGTCGGGTGTCTTCTAAAATA  800

seq1  CCCAGTGCTGTCATTGTCTCTCTAGCAATAGATGCACTGCTTCTGAAGAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTGCTGTCATTGTCTCTCTAGCAATAGATGCACTGCTTCTGAAGAA  850

seq1  GGTTATTGTCACATAAGAGAGATGGCCCT-GGTTTTCAAAAGATCCCCTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
seq2  GGTTATTGTCACATAAGAGAGATGGCCCTGGGTTTTCAAAAGATCCCC-T  899

seq1  TTGAAAACTGTGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTG  943
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAACTGTGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTG  944