seq1: chr12_28685322_28686401
seq2: B6Ng01-303I01.b_46_1135 (reverse)
seq1 CAAGCGTGCACACACATA-CA---CTCACACACATATGTAACC-TAC-AC 44
||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||| ||| ||
seq2 CAAGCGTGCACACACCTATCATTCCACACACCCATATGTAACCTTACAAC 50
seq1 ATAGAGGAGATGGTCTGGCCAGTTCCAAGTCAGACTAC-AGTCATGATTC 93
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2 ATAGAGGAGATGGTCTGGCCAGTTCCAAGTCAGACTACAAGTCATGATTC 100
seq1 CA-TTCCCATGTGTATTGATGTTAACTGAATTTGTGCAC-AAGTATTAGA 141
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2 CATTTCCCATGTGTATTGATGTTAACTGAATTTGTGCACAAAGTATTAGA 150
seq1 CTAGGAAAGAACAAGGCTCAGTGCCCAGCTGTGGTGCTCAGAAGTCAGTG 191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTAGGAAAGAACAAGGCTCAGTGCCCAGCTGTGGTGCTCAGAAGTCAGTG 200
seq1 ACTGCTGTAGGTATACCTTTCTGCTCTAGGAACTATGTTGTGTCAAAGGA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTGCTGTAGGTATACCTTTCTGCTCTAGGAACTATGTTGTGTCAAAGGA 250
seq1 CAG-AAGTTTTAAATGTCCCGACTTGTGAGTTCATGACTGTTCTTAGACT 290
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGAAAGTTTTAAATGTCCCGACTTGTGAGTTCATGACTGTTCTTAGACT 300
seq1 GTAATCTAAAGTACTCAGACCTTTCTAACCTAAACAAACAAACAAACAAA 340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTAATCTAAAGTACTCAGACCTTTCTAACCTAAACAAACAAACAAACAAA 350
seq1 GACATTTGAACTATAAAGGATGCCACACAGGGCTTTCAGCCAAGCTAACA 390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GACATTTGAACTATAAAGGATGCCACACAGGGCTTTCAGCCAAGCTAACA 400
seq1 GTGATGAAGTCCCTGGTCAGGCTGAATGAATGCAAGTCATTAAGAGGGAA 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGATGAAGTCCCTGGTCAGGCTGAATGAATGCAAGTCATTAAGAGGGAA 450
seq1 TCTGCCACTGAGTGAAATCAGTAAAACTCTTTAATTGCTGACTACAAATA 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTGCCACTGAGTGAAATCAGTAAAACTCTTTAATTGCTGACTACAAATA 500
seq1 CCAGCAGGGGACATGGCTGCACACTGCGCCTTGGGCTTCTGGCTCCCCGC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCAGCAGGGGACATGGCTGCACACTGCGCCTTGGGCTTCTGGCTCCCCGC 550
seq1 TCACTGTCTCTGGAAGCTTTGCTAGTCACTGTTATAGTAAATCTTTTACT 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCACTGTCTCTGGAAGCTTTGCTAGTCACTGTTATAGTAAATCTTTTACT 600
seq1 TAGTTAAAGGAATGAGTCCTTCAAGTTTATAACCACATTATGCACACGAA 640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGTTAAAGGAATGAGTCCTTCAAGTTTATAACCACATTATGCACACGAA 650
seq1 CATGTGGACATGGAAGGTTGCATCATATATGTAGACATAAGGTAGAGTAG 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATGTGGACATGGAAGGTTGCATCATATATGTAGACATAAGGTAGAGTAG 700
seq1 AAAGATTGGCATTCCAGTAACACACAAACCAAAACACATAAAAATGGGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAAGATTGGCATTCCAGTAACACACAAACCAAAACACATAAAAATGGGGC 750
seq1 ATAACAGAACACCAGCCAATGAGATGGCTCAGAGGGTGAAAGAGCTCACT 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATAACAGAACACCAGCCAATGAGATGGCTCAGAGGGTGAAAGAGCTCACT 800
seq1 GCCAAGCCTGGCACACTGAATTTGATCCCTAGGACCCACAAGGTGGAAAG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCAAGCCTGGCACACTGAATTTGATCCCTAGGACCCACAAGGTGGAAAG 850
seq1 GGAAAAGACTTCTTCAAGCTGTGTTCTGACCTCTACCACATGTGTGCCAA 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGAAAAGACTTCTTCAAGCTGTGTTCTGACCTCTACCACATGTGTGCCAA 900
seq1 TGCGAGCATACCTCTGCCCCTCCCCAAATCTAATAAACGTATTAAAAAAA 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCGAGCATACCTCTGCCCCTCCCCAAATCTAATAAACGTATTAAAAAAA 950
seq1 AACTTTGAAAAGAAAATTATTGATTTTCTCTGGACAGTGGAACAATGGCT 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACTTTGAAAAGAAAATTATTGATTTTCTCTGGACAGTGGAACAATGGCT 1000
seq1 TTTTATGTCCTTTTCAAACCTTGCTACGTGTTTTCTATGCCATTATAAAT 1040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTTATGTCCTTTTCAAACCTTGCTACGTGTTTTCTATGCCATTATAAAT 1050
seq1 ATACATTCTTAGTTTCTTTCAGGTTTCCTTGCATGAATTC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATACATTCTTAGTTTCTTTCAGGTTTCCTTGCATGAATTC 1090
| seq1: chr7_6000997_6001221
seq2: B6Ng01-303I01.g_90_177 (reverse)
seq1 CACATCACACACACACACACCTCTGCGCACATCACACACACACACACACA 50
|||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2 -----CACACACACACACA-------------CACACACACACACACACA 32
seq1 CACACACACACACACACACGCACACACATTTACACAGA---GAGAGAGGA 97
||||||||||||||||||| ||||||| ||| || | || | ||
seq2 CACACACACACACACACACACACACACGTTTGTTCACATTTGATACTGGG 82
seq1 TTTCA-AAACAGTTCTAAAAGAACGTTATTTTGTAATGTTAAGAATTAAA 146
||||
seq2 CTTCAG-------------------------------------------- 88
seq1 GGCCTTGAGGCTTGGGCAAGTGCAGCAGGCAGACTGCAGAGCAGAGATGG 196
seq2 -------------------------------------------------- 88
seq1 ACTGAGCATACTGTAGCCTTGGGCTTCAG 225
seq2 ----------------------------- 88
|
