BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-307O06
Chromosome12 (Build37)
Map Location 114,132,123 - 114,328,133
singlet/doubletdoublet
Overlap geneJag2, Nudt14, Brf1, Btbd6, Pacs2, Tex22
Upstream genePpp1r13b, LOC100041886, 2010107E04Rik, BC048943, Tdrd9, A530050D06Rik, Kif26a, A730018C14Rik, A530016L24Rik, Tmem179, 2610204M08Rik, Adssl1, Siva1, Akt1, EG382639, AW555464, LOC382640, Pld4, AI450948, LOC100041194, BC022687, Cdca4, Gpr132
Downstream geneMta1, Crip2, Crip1, 4930427A07Rik, LOC676349, Tmem121, Igh, Igh-2, Gm900, Igh-1b, Igh-3, Ighg1, AI324046, LOC668370, LOC668375, EG382645, Igh-5, Igh-6, Ighj4, Ighj3, Ighj2, Ighj1, Ighd4-1, Ighd3-2, Ighd5-6, Ighd2-8, Ighd5-5, Ighd2-7, Ighd5-8, Ighd5-4, Ighd2-6, Ighd5-7, Ighd5-3, Ighd2-5, Ighd5-2, Ighd2-4, Ighd6-2, Ighd2-3, Ighd6-1, Ighd1-1, 4930523C11Rik, Ighd3-1, Ighd5-1, Adam6, Ighv5-1, Ighv2-1, Ighv5-2, Ighv2-2, Ighv5-3, Ighv5-4, Ighv6-1, Ighv2-3, Ighv5-5, Ighv5-6, Ankrd12-like, Ighv5-7, EG668389, Ighv5-8, Ighv5-9, Ighv5-10, Ighv2-5, Ighv5-11, Ighv5-12, Ighv2-6, Ighv5-9-1, EG628098, Ighv2-9-1, Ighv5-13, Ighv2-6-8, EG629785, Ighv2-7, LOC668405, Ighv5-15, Ighv5-16, Ighv5-17, Ighv5-18, Ighv2-8, Ighv2-9, Ighv5-19, Ighv7-1, Ighv7-2, Ighv14-1, Ighv4-1, Ighv3-1, Ighv11-1, Ighv14-2, Ighv4-2, Ighv3-2, Ighv11-2, Ighv14-3, EG629812, Ighv6-2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-307O06.bB6Ng01-307O06.g
ACCGA100537GA100538
length6741,096
definitionB6Ng01-307O06.b B6Ng01-307O06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(114,132,123 - 114,132,794)(114,327,040 - 114,328,133)
sequence
atgcctaagtagaaggaatcacacagaattgccaccatgtggctgtttag
actgaaaaaaaaaaaaaagcactttcacatggttcatcctgacagaacca
aagaccacctagttgtgaaagtcagagggacccataaggacgtgcatggg
cgggccagcagtgtgaagggggtgggagtccgtggtcctcatttcttgcc
attcctccataggtggaagctcttggtcaggcaattccagtgctcttgtg
cccgcctacaatgggctacatgtaggccatgcaggccatgcaggccatgc
agatggggactctctcctggcacttcttagccctgctgctgatgctcagg
caccccacagggctgctgtggtgggggtgcaggaggaggatgctatcatc
tcagaactctcctgtgacaggcttcaactggttggcttcagagccgagct
ctcctgtgtataaatcagaaaacagctttggaagcgatttggcagcaggg
attctaaatgttctgtgacctgcaacccagcaatttagtgtctaggaatt
taaacagcaaattggccagatgactcaatctccaccaatggagcttgggc
tgtttctcaaaagcagagacaagcaagagaagccagccaggctgcaggat
acaaggtttagtgggggtgaaggt
aagccgggaacccagtgtcaagcatgggcaactttgtgctttcacaacgg
gctctgggcagttggtgcagcactacccagcttgctgattccttcaaggc
cccatggacaggcttgaatcatgcccacacttgaaccgaggatccatcac
ttcctcttgactcaaaatcccctgtacccatccccactcacacataaacc
taggccaccactagcagtctcggagtctggggtcctgacaggttagggtt
actaccctccttttcctgtctttcctccagcttgatgtccccaaatgtgg
catgctatcaccccagtcctaaaccctctgcaggatccccaagctcagga
caaactgaaacataaagagccagggctccctgtgttagcacaaaccttct
gcacaaagcacactgccttcctagctctgtccaactctaagctcactgtc
cggaatgagttctgctttctggaaacctccctatgtctagaatctcacta
ggtccctttcttcgagttgtccccaccatagtgccaccaccatatctctg
aggtcacatataccatctaggccttgaggctggatccaggagtcccgaat
ggttcatgacatgaacaccccactggaggggctggacatggcaggatctc
accacctcctcacgcagctgctcagtaatggggctgataaagcagcgggc
catgaagtagggtatttgtggcaatcctgcgccccatctcccaagaggtc
cacaagtctgctcaccagtaggcctcacattacaggggctcctatggaag
gtcttccctgactcacactcccttgtgtggttctcccatagttcccaaac
ccggtttcttggaaaaggaagctcgcctgagacctgagacctttgtcctg
accctgtgtgtcctctgtgggagggtcaagaccgcagtgagacacaaagg
aggcacagggggtaccgaagtcattcccccaaccacaagaaaggcactgg
acatatatactgggctgagcagagctgcttctaggagtgagggccatctt
tgaggtctggaccttcaaaattcttcatctcgaagaggcgcgtcct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_114132123_114132794
seq2: B6Ng01-307O06.b_60_732

seq1  ATGCCTAAGTAGAAGGAATCACACAGAATTGCCACCATGTGGCTGTTTAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTAAGTAGAAGGAATCACACAGAATTGCCACCATGTGGCTGTTTAG  50

seq1  ACTGAAAAAAAAAAAAAAGCACTTTCACATGGTTCATCCTGACAGAACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAAAAAAAAAAAAAGCACTTTCACATGGTTCATCCTGACAGAACCA  100

seq1  AAGACCACCTAGTTGTGAAAGTCAGAGGGACCCATAAGGACGTGCATGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCACCTAGTTGTGAAAGTCAGAGGGACCCATAAGGACGTGCATGGG  150

seq1  CGGGCCAGCAGTGTGAAGGGGGTGGGAGTCCGTGGTCCTCATTTCTTGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGCCAGCAGTGTGAAGGGGGTGGGAGTCCGTGGTCCTCATTTCTTGCC  200

seq1  ATTCCTCCATAGGTGGAAGCTCTTGGTCAGGCAATTCCAGTGCTCTTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTCCATAGGTGGAAGCTCTTGGTCAGGCAATTCCAGTGCTCTTGTG  250

seq1  CCCGCCTACAATGGGCTACATGTAGGCCATGCAGGCCATGCAGGCCATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGCCTACAATGGGCTACATGTAGGCCATGCAGGCCATGCAGGCCATGC  300

seq1  AGATGGGGACTCTCTCCTGGCACTTCTTAGCCCTGCTGCTGATGCTCAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGGGACTCTCTCCTGGCACTTCTTAGCCCTGCTGCTGATGCTCAGG  350

seq1  CACCCCACAGGGCTGCTGTGGTGGGGGTGCAGGAGGAGGATGCTATCATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCACAGGGCTGCTGTGGTGGGGGTGCAGGAGGAGGATGCTATCATC  400

seq1  TCAGAACTCTCCTGTGACAGGCTTCAACTGGTTGGCTTCAGAGCCGAGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAACTCTCCTGTGACAGGCTTCAACTGGTTGGCTTCAGAGCCGAGCT  450

seq1  CTCCTGTGTATAAATCAGAAAACAGCTTTGGAAGCGATTTGGCAGCAGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGTGTATAAATCAGAAAACAGCTTTGGAAGCGATTTGGCAGCAGGG  500

seq1  ATTCTAAATGTTCTGTGACCTGCAACCCAGCAATTTAGTGTCTAGGAATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTAAATGTTCTGTGACCTGCAACCCAGCAATTTAGTGTCTAGGAATT  550

seq1  TAAACAGCAAATTGGCCAGATGACTCAATCTCCACCAATGGAGCTTGGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAGCAAATTGGCCAGATGACTCAATCTCCACCAATGGAGCTTGGGC  600

seq1  TGTTTCTCAAAAGCAGAGACAAGCAAGAGAAGCCAGCCAGGCTGCAGGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTCAAAAGCAGAGACAAGCAAGAGAAGCCAGCCAGGCTGCAGGAT  650

seq1  ACAAGG-TTAGTGGGGGTGAAGG  672
      |||||| ||||||||||||||||
seq2  ACAAGGTTTAGTGGGGGTGAAGG  673

seq1: chr12_114327040_114328133
seq2: B6Ng01-307O06.g_80_1175 (reverse)

seq1  AGGACGCGCCTCTTTGGAAGGATGAGAATTTTG-AGGCCCAGACCTC-AA  48
      |||||||||||||| |  | ||  ||||||||| ||| ||||||||| ||
seq2  AGGACGCGCCTCTTCGAGATGA--AGAATTTTGAAGGTCCAGACCTCAAA  48

seq1  GATGG-CCTCACTCCTAAGAAGCAGCTCTGCTCAGCCCAGTATTATATTG  97
      ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||
seq2  GATGGCCCTCACTCCT-AGAAGCAGCTCTGCTCAGCCCAGTA-TATA-TG  95

seq1  TCCAGTGCCTTTCTTTGTGGT--GGGGAATGACTTCGGTACCCCCTGTGC  145
      ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTGCCTTTC-TTGTGGTTGGGGGAATGACTTCGGTACCCCCTGTGC  144

seq1  CCTCTTTGTGTCTCACTGCGGTCTTGACCCTCCCACAGAGGACACACA-G  194
      |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTCCTTTGTGTCTCACTGCGGTCTTGACCCTCCCACAGAGGACACACAGG  194

seq1  GTCAGGACAAAGGTCTCAGGTCTCAGGCGAGCTTCC-TTTCCAAGAAACC  243
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GTCAGGACAAAGGTCTCAGGTCTCAGGCGAGCTTCCTTTTCCAAGAAACC  244

seq1  -GGTTTGGGAACTATGGGAGAACCACACAAGGGAGTGTGAGTCAGGGAAG  292
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTGGGAACTATGGGAGAACCACACAAGGGAGTGTGAGTCAGGGAAG  294

seq1  ACCTTCCATAGGAGCCCCTGTAATGTGAGGCCTACTGGTGAGCAGACTTG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCCATAGGAGCCCCTGTAATGTGAGGCCTACTGGTGAGCAGACTTG  344

seq1  TGGACCTCTTGGGAGATGGGGCGCAGGATTGCCACAAATACCCTACTTCA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACCTCTTGGGAGATGGGGCGCAGGATTGCCACAAATACCCTACTTCA  394

seq1  TGGCCCGCTGCTTTATCAGCCCCATTACTGAGCAGCTGCGTGAGGAGGTG  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCCGCTGCTTTATCAGCCCCATTACTGAGCAGCTGCGTGAGGAGGTG  444

seq1  GTGAGATCCTGCCATGTCCAGCCCCTCCAGTGGGGTGTTCATGTCATGAA  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGATCCTGCCATGTCCAGCCCCTCCAGTGGGGTGTTCATGTCATGAA  494

seq1  CCATTCGGGACTCCTGGATCCAGCCTCAAGGCCTAGATGGTATATGTGAC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCGGGACTCCTGGATCCAGCCTCAAGGCCTAGATGGTATATGTGAC  544

seq1  CTCAGAGATATGGTGGTGGCACTATGGTGGGGACAACTCGAAGAAAGGGA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAGATATGGTGGTGGCACTATGGTGGGGACAACTCGAAGAAAGGGA  594

seq1  CCTAGTGAGATTCTAGACATAGGGAGGTTTCCAGAAAGCAGAACTCATTC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTGAGATTCTAGACATAGGGAGGTTTCCAGAAAGCAGAACTCATTC  644

seq1  CGGACAGTGAGCTTAGAGTTGGACAGAGCTAGGAAGGCAGTGTGCTTTGT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGACAGTGAGCTTAGAGTTGGACAGAGCTAGGAAGGCAGTGTGCTTTGT  694

seq1  GCAGAAGGTTTGTGCTAACACAGGGAGCCCTGGCTCTTTATGTTTCAGTT  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAAGGTTTGTGCTAACACAGGGAGCCCTGGCTCTTTATGTTTCAGTT  744

seq1  TGTCCTGAGCTTGGGGATCCTGCAGAGGGTTTAGGACTGGGGTGATAGCA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTGAGCTTGGGGATCCTGCAGAGGGTTTAGGACTGGGGTGATAGCA  794

seq1  TGCCACATTTGGGGACATCAAGCTGGAGGAAAGACAGGAAAAGGAGGGTA  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACATTTGGGGACATCAAGCTGGAGGAAAGACAGGAAAAGGAGGGTA  844

seq1  GTAACCCTAACCTGTCAGGACCCCAGACTCCGAGACTGCTAGTGGTGGCC  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACCCTAACCTGTCAGGACCCCAGACTCCGAGACTGCTAGTGGTGGCC  894

seq1  TAGGTTTATGTGTGAGTGGGGATGGGTACAGGGGATTTTGAGTCAAGAGG  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTTATGTGTGAGTGGGGATGGGTACAGGGGATTTTGAGTCAAGAGG  944

seq1  AAGTGATGGATCCTCGGTTCAAGTGTGGGCATGATTCAAGCCTGTCCATG  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGATGGATCCTCGGTTCAAGTGTGGGCATGATTCAAGCCTGTCCATG  994

seq1  GGGCCTTGAAGGAATCAGCAAGCTGGGTAGTGCTGCACCAACTGCCCAGA  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTTGAAGGAATCAGCAAGCTGGGTAGTGCTGCACCAACTGCCCAGA  1044

seq1  GCCCGTTGTGAAAGCACAAAGTTGCCCATGCTTGACACTGGGTTCCCGGC  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCGTTGTGAAAGCACAAAGTTGCCCATGCTTGACACTGGGTTCCCGGC  1094

seq1  TT  1094
      ||
seq2  TT  1096