BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-310E14
Chromosome12 (Build37)
Map Location 27,577,121 - 27,723,989
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneRnf144, Rsad2, Tyki, LOC668731, 1700020D12Rik
Downstream geneSox11, LOC100043009, LOC669327
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-310E14.bB6Ng01-310E14.g
ACCGA102305GA102306
length1,0671,101
definitionB6Ng01-310E14.b B6Ng01-310E14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(27,722,919 - 27,723,989)(27,577,121 - 27,578,220)
sequence
gaattccctcaaattaaaattcgtattgtaggtctttaccacacctttag
gagtcaacctcttcagtccttagactgagacggaggtctttctatgactg
gacagaacaggctttgaattctttttctatttccatctcacccctttctt
actctgcttccaaagaagctttggttgtagtcacaaagtttgtttgtttt
taaaaaattaattaattaattaattaatttttaattaggtatgttcttca
tttacattccaaagttttttgttcttctaaaatccattcgttcctacacc
tatgaatcttcattctctgtaccctccaacagagttacctgatttttctc
aaatttaataaatctattctcaattccagggcaaactcattgtcatcttt
gaggactctctgccaaccctctggggtaccaactaaatatctactctgtt
ccgcagtgaatctctaaggtgccccatggtccatcccaccgaggagctgc
agggggacttcacaacactctttgctccctgtctgatccctgatgtgttg
atagaagtcggtagacacggactttatgtgcatgttgggatggcggacac
tgagctacaagtaagtcatcttcatgtttacagttagacgaagttaacat
tttagagggaaatggcctaagagaaagccctaatgactatcttaggagca
cactggtgtcccgtcagctggggaaaaaaataccatcaacccattctgtc
tccataaggggcttttacttccttgagtcattgctgtgtagacaaggggt
gatttccttaaagagcaggaatgtcaacaggccactgatttcacttcata
tttgcgtgaggattgaacagcattgtgaaaacctcagagctcctaaatta
cacacactgtctatgacatggtttcttgaacattgcacaagcctaatgtc
aaagcaagcctcaacatttcacttctctgatgtacctttgaacttgacag
tgttttcaatgcagaacacgtggggtggacctgatgctgagcccaggctg
gaaagagccaagaggag
gaattcttgagcataaagcaagctgttgtgtgtctctggatgtcgtcacg
ggaacgagttttgccactaatggtggtggtggagcacaggaaagggcatg
tgatagagcagaaaagcccctcacaaactaggttaccagtcaacctgggc
ctttataaaagttttcaggatctagaaggccagtcagttctcatcagcac
tggagctaaggatctttccaaatactgagattatgaaggaacaaaatctc
caagctggaattatacttgggctgggtgaagaaagatcattcttttctca
ccctgtaatacatggattgtgctgtctcatgacatcctaaggagctgcag
atgctcagcagtggaaaactattggagaatatcatctataatgagaacac
agccaccttggcttccaccagcatcctgtgccctttcctaggatttcctg
ccttgaggctgctgccccattctctaggtcaagagcccatggagctgaaa
acatggagcatttgcaaagatgcacaaggacgaccaccaacatccatccc
ctcccaagtccttccactttcccccatagtttcctattttgacttctctt
ctatgttgggagtgagttggatactgaaattagttgtgatgaaatacaaa
ttgaaaacaaaactctacttcccaagttccaccatgggctcagtttaatc
tttttgctaaaatccaagcagaaactatgatagaagtgaacaggctttct
gcgtccacacacaagagttcctagaacgcgcttaaagaaacagactgtct
agaaaggtattgcactctttgttctgtttatatctgttctaccatttctg
gcattgtcagagacaaatggagagggcgtgagtggagcaacatggattct
cactcattgatgctttgcttcaagaagaaaacccgtctgagaatttggag
aaagtggtcaatgtgtgggttgtgctcagcaaggtgagcacctagagatg
ttatgcactcaccttcacatttccagtgtgtttacacagatattctgatg
actgtgctcatcccagaatacctcccctgtgagggagagagtccactcta
c
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_27722919_27723989
seq2: B6Ng01-310E14.b_51_1117 (reverse)

seq1  CTCCTCTTTGGCCTCTTTCCAGCCTGGGGCTCAGCACTCAGGTTCCACCC  50
      ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||
seq2  CTCCTCTT--GGCTCTTTCCAGCCT-GGGCTCAGCA-TCAGGTCCACCCC  46

seq1  ACGTG-TCTGCATTTGAAAACACTGTCAAGTTCAAAGGTACATCAGAGAA  99
      ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGTTCTGCA-TTGAAAACACTGTCAAGTTCAAAGGTACATCAGAGAA  95

seq1  GTGAAATGTTGAGGCTTGCTTTGACATTAGGCTTGTGCAATGTTCAAGAA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAATGTTGAGGCTTGCTTTGACATTAGGCTTGTGCAATGTTCAAGAA  145

seq1  ACCATGTCATAGACAGTGTGTGTAATTTAGGAGCTCTGAGGTTTTCACAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGTCATAGACAGTGTGTGTAATTTAGGAGCTCTGAGGTTTTCACAA  195

seq1  TGCTGTTCAATCCTCACGCAAATATGAAGTGAAATCAGTGGCCTGTTGAC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTTCAATCCTCACGCAAATATGAAGTGAAATCAGTGGCCTGTTGAC  245

seq1  ATTCCTGCTCTTTAAGGAAATCACCCCTTGTCTACACAGCAATGACTCAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTGCTCTTTAAGGAAATCACCCCTTGTCTACACAGCAATGACTCAA  295

seq1  GGAAGTAAAAGCCCCTTATGGAGACAGAATGGGTTGATGGTATTTTTTTC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTAAAAGCCCCTTATGGAGACAGAATGGGTTGATGGTATTTTTTTC  345

seq1  CCCAGCTGACGGGACACCAGTGTGCTCCTAAGATAGTCATTAGGGCTTTC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCTGACGGGACACCAGTGTGCTCCTAAGATAGTCATTAGGGCTTTC  395

seq1  TCTTAGGCCATTTCCCTCTAAAATGTTAACTTCGTCTAACTGTAAACATG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGGCCATTTCCCTCTAAAATGTTAACTTCGTCTAACTGTAAACATG  445

seq1  AAGATGACTTACTTGTAGCTCAGTGTCCGCCATCCCAACATGCACATAAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGACTTACTTGTAGCTCAGTGTCCGCCATCCCAACATGCACATAAA  495

seq1  GTCCGTGTCTACCGACTTCTATCAACACATCAGGGATCAGACAGGGAGCA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCGTGTCTACCGACTTCTATCAACACATCAGGGATCAGACAGGGAGCA  545

seq1  AAGAGTGTTGTGAAGTCCCCCTGCAGCTCCTCGGTGGGATGGACCATGGG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTGTTGTGAAGTCCCCCTGCAGCTCCTCGGTGGGATGGACCATGGG  595

seq1  GCACCTTAGAGATTCACTGCGGAACAGAGTAGATATTTAGTTGGTACCCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTTAGAGATTCACTGCGGAACAGAGTAGATATTTAGTTGGTACCCC  645

seq1  AGAGGGTTGGCAGAGAGTCCTCAAAGATGACAATGAGTTTGCCCTGGAAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGTTGGCAGAGAGTCCTCAAAGATGACAATGAGTTTGCCCTGGAAT  695

seq1  TGAGAATAGATTTATTAAATTTGAGAAAAATCAGGTAACTCTGTTGGAGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAATAGATTTATTAAATTTGAGAAAAATCAGGTAACTCTGTTGGAGG  745

seq1  GTACAGAGAATGAAGATTCATAGGTGTAGGAACGAATGGATTTTAGAAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAGAGAATGAAGATTCATAGGTGTAGGAACGAATGGATTTTAGAAGA  795

seq1  ACAAAAAACTTTGGAATGTAAATGAAGAACATACCTAATTAAAAATTAAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAAACTTTGGAATGTAAATGAAGAACATACCTAATTAAAAATTAAT  845

seq1  TAATTAATTAATTAATTTTTTAAAAACAAACAAACTTTGTGACTACAACC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTAATTAATTAATTTTTTAAAAACAAACAAACTTTGTGACTACAACC  895

seq1  AAAGCTTCTTTGGAAGCAGAGTAAGAAAGGGGTGAGATGGAAATAGAAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTTCTTTGGAAGCAGAGTAAGAAAGGGGTGAGATGGAAATAGAAAA  945

seq1  AGAATTCAAAGCCTGTTCTGTCCAGTCATAGAAAGACCTCCGTCTCAGTC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTCAAAGCCTGTTCTGTCCAGTCATAGAAAGACCTCCGTCTCAGTC  995

seq1  TAAGGACTGAAGAGGTTGACTCCTAAAGGTGTGGTAAAGACCTACAATAC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGACTGAAGAGGTTGACTCCTAAAGGTGTGGTAAAGACCTACAATAC  1045

seq1  GAATTTTAATTTGAGGGAATTC  1071
      ||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTTAATTTGAGGGAATTC  1067

seq1: chr12_27577121_27578220
seq2: B6Ng01-310E14.g_66_1166

seq1  GAATTCTTGAGCATAAAGCAAGCTGTTGTGTGTCTCTGGATGTCGTCACG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGAGCATAAAGCAAGCTGTTGTGTGTCTCTGGATGTCGTCACG  50

seq1  GGAACGAGTTTTGCCACTAATGGTGGTGGTGGAGCACAGGAAAGGGCATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACGAGTTTTGCCACTAATGGTGGTGGTGGAGCACAGGAAAGGGCATG  100

seq1  TGATAGAGCAGAAAAGCCCCTCACAAACTAGGTTACCAGTCAACCTGGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGAGCAGAAAAGCCCCTCACAAACTAGGTTACCAGTCAACCTGGGC  150

seq1  CTTTATAAAAGTTTTCAGGATCTAGAAGGCCAGTCAGTTCTCATCAGCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATAAAAGTTTTCAGGATCTAGAAGGCCAGTCAGTTCTCATCAGCAC  200

seq1  TGGAGCTAAGGATCTTTCCAAATACTGAGATTATGAAGGAACAAAATCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTAAGGATCTTTCCAAATACTGAGATTATGAAGGAACAAAATCTC  250

seq1  CAAGCTGGAATTATACTTGGGCTGGGTGAAGAAAGATCATTCTTTTCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTGGAATTATACTTGGGCTGGGTGAAGAAAGATCATTCTTTTCTCA  300

seq1  CCCTGTAATACATGGATTGTGCTGTCTCATGACATCCTAAGGAGCTGCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTAATACATGGATTGTGCTGTCTCATGACATCCTAAGGAGCTGCAG  350

seq1  ATGCTCAGCAGTGGAAAACTATTGGAGAATATCATCTATAATGAGAACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCAGCAGTGGAAAACTATTGGAGAATATCATCTATAATGAGAACAC  400

seq1  AGCCACCTTGGCTTCCACCAGCATCCTGTGCCCTTTCCTAGGATTTCCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACCTTGGCTTCCACCAGCATCCTGTGCCCTTTCCTAGGATTTCCTG  450

seq1  CCTTGAGGCTGCTGCCCCATTCTCTAGGTCAAGAGCCCATGGAGCTGAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAGGCTGCTGCCCCATTCTCTAGGTCAAGAGCCCATGGAGCTGAAA  500

seq1  ACATGGAGCATTTGCAAAGATGCACAAGGACGACCACCAACATCCATCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGAGCATTTGCAAAGATGCACAAGGACGACCACCAACATCCATCCC  550

seq1  CTCCCAAGTCCTTCCACTTTCCCCCATAGTTTCCTATTTTGACTTCTCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAAGTCCTTCCACTTTCCCCCATAGTTTCCTATTTTGACTTCTCTT  600

seq1  CTATGTTGGGAGTGAGTTGGATACTGAAATTAGTTGTGATGAAATACAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTTGGGAGTGAGTTGGATACTGAAATTAGTTGTGATGAAATACAAA  650

seq1  TTGAAAACAAAACTCTACTTCCCAAGTTCCACCATGGGCTCAGTTTAATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAACAAAACTCTACTTCCCAAGTTCCACCATGGGCTCAGTTTAATC  700

seq1  TTTTTGCTAAAATCCAAGCAGAAACTATGATAGAAGTGAACAGGCTTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGCTAAAATCCAAGCAGAAACTATGATAGAAGTGAACAGGCTTTCT  750

seq1  GCGTCCACACACAAGAGTTCCTAGAACGCGCTTAAAGAAACAGACTGTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTCCACACACAAGAGTTCCTAGAACGCGCTTAAAGAAACAGACTGTCT  800

seq1  AGAAAGGTATTGCACTCTTTGTTCTGTTTATATCTGTTCTACCATTTCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGTATTGCACTCTTTGTTCTGTTTATATCTGTTCTACCATTTCTG  850

seq1  GCATTGTCAGAGACAAATGGAGAGGGCGTGAGTGGAGCAACATGGATTCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGTCAGAGACAAATGGAGAGGGCGTGAGTGGAGCAACATGGATTCT  900

seq1  CACTCATTGATGCTTTGCTTCAGGAAGAAAACCCGTCTGAGAATTTGGAG  950
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCATTGATGCTTTGCTTCAAGAAGAAAACCCGTCTGAGAATTTGGAG  950

seq1  AAAGTGGTCAATGTGTGGGTTGTGCTCAGGCAAGGTGAGCACCTAGAAGA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
seq2  AAAGTGGTCAATGTGTGGGTTGTGCTCA-GCAAGGTGAGCACCTAG-AGA  998

seq1  TGTTATGCACCTCACC-TCACATTTCCAGTGTGTTTACACAGATATTCTG  1049
      ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATGCA-CTCACCTTCACATTTCCAGTGTGTTTACACAGATATTCTG  1047

seq1  ATGGACTGTGCTCATCCCAG-ATACCT-CCCTGTGAAGGAGAGAG--CAC  1095
      || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||
seq2  AT-GACTGTGCTCATCCCAGAATACCTCCCCTGTGAGGGAGAGAGTCCAC  1096

seq1  TCTAC  1100
      |||||
seq2  TCTAC  1101