BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-313L22
Chromosome12 (Build37)
Map Location 39,763,112 - 39,822,236
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDgkb, LOC668824, LOC100043142, Etv1, LOC100043145
Downstream geneLOC100043148, Arl4a, LOC100043606, Scin
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-313L22.bB6Ng01-313L22.g
ACCGA104871GA104872
length1,104605
definitionB6Ng01-313L22.b B6Ng01-313L22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(39,763,112 - 39,764,217)(39,821,691 - 39,822,236)
sequence
gaattcaccacttataaagggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtat
gtgtgtgtgtgcagggatccttggaagattttcaacatttgatgagatag
ctctttggatggttttcaagacctagaggggtccataatgaaggatcatg
ctgcttccattagtggatttttcctcttcatgtttgcagacaaagctgtg
aattggtccaatttcttgtttggctaaggtagtctttatttttaatagaa
aggctagtcaacttggcacatttgcaaatgagaagagcaaatgaatgcaa
gtaacatttagataattctcagggccaataggaaacaactttgtgcatgt
gacagctgtacctcgccccaccccctggtagcttacccaaaagagtaata
tattatgaaattgatgaagagttcatgtctgtttttacagctgttaatca
tcaggtgattgaacgatcatgttagaaaggaaatttgttgggttatgtat
gttaaaaatgcaactttatccttagatagttaatttccctaaatatgcca
cctttcagtttttgaggtcttttaaattactaagtaggttgactgaataa
gtactactttagggaattttactaacatttactcgtttattttatattta
aactagaggttccatctaccttaatatcatttttcttttccttgaaatga
taaatatattattacaaaatgaaccgtacttatgtttaatatttcaacag
atttttacatcgtttctacaaccgaatgtaacatcacaataaagttagtg
tttggaaacaggtgtttacaatggcaacatatgcctgctttgaaagttat
taggagatgtaactagtggatgacatctgaaagtaacttaatgaaaatac
ttcacactcacttaaatgtaaacaccagacaggggaatcacttaaccaat
aaaggaagtagacacaaataccagccttttcaaggtgtaaaatacatagt
tttcaggtatgggtagactcactgatgcctgtgctgtaggtgttaacagc
cccctcccaagctttttctagtacagaaacagttcagctggtgtgcacca
cacc
gaattctggtaatgtatgttaatgtttagctagcccttatattgaaggta
gtatcttttgcagactcatacatatggtgaatttctgctaaaaggtttag
aacaacaaagagaaataaagaaatcatgcagttgagaaaatgacacagtg
tagtttgttgcttaattgccatttcaatttttccaccaagtgttttcaca
aatagattagtaaaagttggtgtagatggatgatgaaggcttagaaaatc
ttaaactatgaccattttaatactaatgacattgttatatttattaaaat
gtatttgtgggtgagagggtatttatttctaggtgggcagatgtaacaat
ggatagtagcatttattttgtcagcatgaggaccccaatttgaatcctca
gtgaggaggtaaaattaagacccgcgttcatgctggtaatcttgaggaag
tcagtccagcacagttggaaaattctaccagaccccttccctcctggaag
agaaaagtcttggggcacttaagcacttaggtgcccctcctctccggaag
ggaagggagaggcttaattacattcctcagaccacaacaagggggaggtg
gggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_39763112_39764217
seq2: B6Ng01-313L22.b_47_1150

seq1  GAATTCACCACTTATAAAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCACTTATAAAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAT  50

seq1  GTGTGTGTGTGCAGGGATCCTTGGAAGATTTTCAACATTTGATGAGATAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGCAGGGATCCTTGGAAGATTTTCAACATTTGATGAGATAG  100

seq1  CTCTTTGGATGGTTTTCAAGACCTAGAGGGGTCCATAATGAAGGATCATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTGGATGGTTTTCAAGACCTAGAGGGGTCCATAATGAAGGATCATG  150

seq1  CTGCTTCCATTAGTGGATTTTTCCTCTTCATGTTTGCAGACAAAGCTGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTCCATTAGTGGATTTTTCCTCTTCATGTTTGCAGACAAAGCTGTG  200

seq1  AATTGGTCCAATTTCTTGTTTGGCTAAGGTAGTCTTTATTTTTAATAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGTCCAATTTCTTGTTTGGCTAAGGTAGTCTTTATTTTTAATAGAA  250

seq1  AGGCTAGTCAACTTGGCACATTTGCAAATGAGAAGAGCAAATGAATGCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTAGTCAACTTGGCACATTTGCAAATGAGAAGAGCAAATGAATGCAA  300

seq1  GTAACATTTAGATAATTCTCAGGGCCAATAGGAAACAACTTTGTGCATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACATTTAGATAATTCTCAGGGCCAATAGGAAACAACTTTGTGCATGT  350

seq1  GACAGCTGTACCTCGCCCCACCCCCTGGTAGCTTACCCAAAAGAGTAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCTGTACCTCGCCCCACCCCCTGGTAGCTTACCCAAAAGAGTAATA  400

seq1  TATTATGAAATTGATGAAGAGTTCATGTCTGTTTTTACAGCTGTTAATCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATGAAATTGATGAAGAGTTCATGTCTGTTTTTACAGCTGTTAATCA  450

seq1  TCAGGTGATTGAACGATCATGTTAGAAAGGAAATTTGTTGGGTTATGTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGTGATTGAACGATCATGTTAGAAAGGAAATTTGTTGGGTTATGTAT  500

seq1  GTTAAAAATGCAACTTTATCCTTAGATAGTTAATTTCCCTAAATATGCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAAAATGCAACTTTATCCTTAGATAGTTAATTTCCCTAAATATGCCA  550

seq1  CCTTTCAGTTTTTGAGGTCTTTTAAATTACTAAGTAGGTTGACTGAATAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCAGTTTTTGAGGTCTTTTAAATTACTAAGTAGGTTGACTGAATAA  600

seq1  GTACTACTTTAGGGAATTTTACTAACATTTACTCGTTTATTTTATATTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTACTTTAGGGAATTTTACTAACATTTACTCGTTTATTTTATATTTA  650

seq1  AACTAGAGGTTCCATCTACCTTAATATCATTTTTCTTTTCCTTGAAATGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGAGGTTCCATCTACCTTAATATCATTTTTCTTTTCCTTGAAATGA  700

seq1  TAAATATATTATTACAAAATGAACCGTACTTATGTTTAATATTTCAACAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATATATTATTACAAAATGAACCGTACTTATGTTTAATATTTCAACAG  750

seq1  A-TTTTACATCGTTTCTACAACCGAATGTAACATCACAATAAAGTTAGTG  799
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTACATCGTTTCTACAACCGAATGTAACATCACAATAAAGTTAGTG  800

seq1  TTTGGAAACAGGTGTTTACAATGGCAACATATGCCTGCTTTGAAAGTTAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAAACAGGTGTTTACAATGGCAACATATGCCTGCTTTGAAAGTTAT  850

seq1  TAGGAGATGTAACTAGTGGATGACATCTGAAAGTAACTTAATGAAAATAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGATGTAACTAGTGGATGACATCTGAAAGTAACTTAATGAAAATAC  900

seq1  TTCACACTCACTTAAATGTAAACACCAGACAGGGGAATCACTTAACCAAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACACTCACTTAAATGTAAACACCAGACAGGGGAATCACTTAACCAAT  950

seq1  AAAGGAAGTAGACACAAATACCAGCCTTTTC-AGGTGTAAAATACAATAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  AAAGGAAGTAGACACAAATACCAGCCTTTTCAAGGTGTAAAATAC-ATAG  999

seq1  TTTTCAGGTATGGGTAGAATTAACTGTTGCCTGTTGCTGTAGGTGTTAAC  1048
      ||||||||||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||
seq2  TTTTCAGGTATGGGTAG-ACTCACTGATGCCTG-TGCTGTAGGTGTTAAC  1047

seq1  AGCCCCCTCCCCAGCTTTTCTTAGTACCAGAAACAGTTTCAGCT-GTGTG  1097
      ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||
seq2  AGCCCCCTCCCAAGCTTTTTCTAGTA-CAGAAACAG-TTCAGCTGGTGTG  1095

seq1  AACCACACC  1106
       ||||||||
seq2  CACCACACC  1104

seq1: chr12_39821691_39822236
seq2: B6Ng01-313L22.g_66_611 (reverse)

seq1  CGGAGAGGAGGGGCACCTAAGTGCTTAAGTGCCCCAAGACTTTTCTCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGAGGAGGGGCACCTAAGTGCTTAAGTGCCCCAAGACTTTTCTCTTC  50

seq1  CAGGAGGGAAGGGGTCTGGTAGAATTTTCCAACTGTGCTGGACTGACTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGGGAAGGGGTCTGGTAGAATTTTCCAACTGTGCTGGACTGACTTC  100

seq1  CTCAAGATTACCAGCATGAACGCGGGTCTTAATTTTACCTCCTCACTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGATTACCAGCATGAACGCGGGTCTTAATTTTACCTCCTCACTGAG  150

seq1  GATTCAAATTGGGGTCCTCATGCTGACAAAATAAATGCTACTATCCATTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCAAATTGGGGTCCTCATGCTGACAAAATAAATGCTACTATCCATTG  200

seq1  TTACATCTGCCCACCTAGAAATAAATACCCTCTCACCCACAAATACATTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATCTGCCCACCTAGAAATAAATACCCTCTCACCCACAAATACATTT  250

seq1  TAATAAATATAACAATGTCATTAGTATTAAAATGGTCATAGTTTAAGATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAATATAACAATGTCATTAGTATTAAAATGGTCATAGTTTAAGATT  300

seq1  TTCTAAGCCTTCATCATCCATCTACACCAACTTTTACTAATCTATTTGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAGCCTTCATCATCCATCTACACCAACTTTTACTAATCTATTTGTG  350

seq1  AAAACACTTGGTGGAAAAATTGAAATGGCAATTAAGCAACAAACTACACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACTTGGTGGAAAAATTGAAATGGCAATTAAGCAACAAACTACACT  400

seq1  GTGTCATTTTCTCAACTGCATGATTTCTTTATTTCTCTTTGTTGTTCTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCATTTTCTCAACTGCATGATTTCTTTATTTCTCTTTGTTGTTCTAA  450

seq1  ACCTTTTAGCAGAAATTCACCATATGTATGAGTCTGCAAAAGATACTACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTTAGCAGAAATTCACCATATGTATGAGTCTGCAAAAGATACTACC  500

seq1  TTCAATATAAGGGCTAGCTAAACATTAACATACATTACCAGAATTC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATATAAGGGCTAGCTAAACATTAACATACATTACCAGAATTC  546