BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-318B24
Chromosome12 (Build37)
Map Location 26,017,680 - 26,110,857
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG668711, EG668714, LOC629364, Taf1b, Grhl1, EG629383, Klf11, Cys1, Rrm2, LOC668719, Mboat2, EG629397, C330002I19Rik, Id2
Downstream geneLOC100042973, LOC100042974, LOC668726, Rnf144
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-318B24.bB6Ng01-318B24.g
ACCGA108092GA108093
length5121,135
definitionB6Ng01-318B24.b B6Ng01-318B24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,110,340 - 26,110,857)(26,017,680 - 26,018,818)
sequence
cagcacaattcacaaccttggctgtaacgggtggcaacagagagacaact
tttcatttttttcagaaatcagaatgtgaaaatagcaataaaccaggctt
aaggcctgagtgtgctggacctcaggcagggcctccctcctcccagggca
tgattcaggaatcttacaaacaaaactattaatttttgtttacaggagtg
agatcctagctcccagcatccctgggatatagagtattattttatcaaat
ataatcctgccagatgcacctcaggaaacaccctgcaatgttatttaaat
gccttggcaaccatgtaaagaaaatggcttcagagctcacaaagactctc
tctatggcttttgcaaagacaataatgtacagctctcccttgagaagccc
acatgtgcttcttatgtgtgccttcttgtgcttccatgtgcaccttgttc
cttctctgatcacccctttgtatatgtgtatgtatatgtatacatatatg
tatgtgtgtatg
gaattctctgagggagcgctttgaaacaagtgtgggtcctgccctgtgga
tgtggggtgaattattgcacagtcacgacctgaggcttccatcctcctgc
ttatcactcacaccagctcaaaccaacatgtgttcattcctccaggaagc
actgagctttaaccagtggaggacacaggaaaagatccttggctcataac
ttaataggcctgtcaggagctgagtgaattctgtacaggttttatgaaga
tctttccattatagatcacagagacacttttgtacggcccaagttaaggc
atgggattgattgattcatgtaattgcaaggttataaggtggggctagtg
caggggttctcaaccttcctaatgctgcgaccctttaatacagttcctca
cgttgtgctacctctaactgtaacattatttttgttgctacttcataact
gtaattttgctactgttgcagatgtaattaagatatctgtgttttccaat
ggtcctgggtgacccctgtgaaagcgttgttcaacccacaaaggggtcac
aaagcacaaaggttgaaaatcactgtggttcagggccgatagcagaaaca
tttatgtcatggcaagggactctgtgcaggacgatggatgggtcatgaac
ggcaacaggaaggctggattcacagtgacaattgttctggaagcagtgac
aagtggctcagcccaagcagacttaggatgaagagagaagggagaggagc
cacgtgctagcagcctactagtaggaagtcaccagcatccttggacagga
gagcaagggtgccacagtgtccgtgagatctgatgtggtgggtaaatgag
aatagccatcacaggctcataggtttggatgcttcatccccagatagcag
atgtgtttgggaaggattaggagatgtggccttgttggaggagatgtgtc
actgggggtgagctttgagatttcaaagctcataccaattccaggtttgc
cctcctgcctatgctttatatcaagatgtaaactcttagctacattgggc
ttcagtgcatgcccattctgcttccaccattgtgatcatggaatacctct
ctgaagtttaagcacgccacgttattaaatatttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_26110340_26110857
seq2: B6Ng01-318B24.b_44_561 (reverse)

seq1  CATACACACATACATATATGTATACATATACATACACATATACAAAGGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACACACATACATATATGTATACATATACATACACATATACAAAGGGG  50

seq1  TGATCAGAGAAGGAACAAGGTGCACATGGAAGCACAAGAAGGCACACATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCAGAGAAGGAACAAGGTGCACATGGAAGCACAAGAAGGCACACATA  100

seq1  AGAAGCACATGTGGGCTTCTCAAGGGAGAGCTGTACATTATTGTCTTTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCACATGTGGGCTTCTCAAGGGAGAGCTGTACATTATTGTCTTTGC  150

seq1  AAAAGCCATAGAGAGAGTCTTTGTGAGCTCTGAAGCCATTTTCTTTACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCCATAGAGAGAGTCTTTGTGAGCTCTGAAGCCATTTTCTTTACAT  200

seq1  GGTTGCCAAGGCATTTAAATAACATTGCAGGGTGTTTCCTGAGGTGCATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGCCAAGGCATTTAAATAACATTGCAGGGTGTTTCCTGAGGTGCATC  250

seq1  TGGCAGGATTATATTTGATAAAATAATACTCTATATCCCAGGGATGCTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGGATTATATTTGATAAAATAATACTCTATATCCCAGGGATGCTGG  300

seq1  GAGCTAGGATCTCACTCCTGTAAACAAAAATTAATAGTTTTGTTTGTAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTAGGATCTCACTCCTGTAAACAAAAATTAATAGTTTTGTTTGTAAG  350

seq1  ATTCCTGAATCATGCCCTGGGAGGAGGGAGGCCCTGCCTGAGGTCCAGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTGAATCATGCCCTGGGAGGAGGGAGGCCCTGCCTGAGGTCCAGCA  400

seq1  CACTCAGGCCTTAAGCCTGGTTTATTGCTATTTTCACATTCTGATTTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCAGGCCTTAAGCCTGGTTTATTGCTATTTTCACATTCTGATTTCTG  450

seq1  AAAAAAATGAAAAGTTGTCTCTCTGTTGCCACCCGTTACAGCCAAGGTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATGAAAAGTTGTCTCTCTGTTGCCACCCGTTACAGCCAAGGTTG  500

seq1  TGAATTGTGCTGGAATTC  518
      ||||||||||||||||||
seq2  TGAATTGTGCTGGAATTC  518

seq1: chr12_26017680_26018818
seq2: B6Ng01-318B24.g_66_1200

seq1  GAATTCTCTGAGGGAGCGCTTTGAAACAAGTGTGGGTCCTGCCCTGTGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGAGGGAGCGCTTTGAAACAAGTGTGGGTCCTGCCCTGTGGA  50

seq1  TGTGGGGTGAATTATTGCACAGTCACGACCTGAGGCTTCCATCCTCCTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGGTGAATTATTGCACAGTCACGACCTGAGGCTTCCATCCTCCTGC  100

seq1  TTATCACTCACACCAGCTCAAACCAACATGTGTTCATTCCTCCAGGAAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCACTCACACCAGCTCAAACCAACATGTGTTCATTCCTCCAGGAAGC  150

seq1  ACTGAGCTTTAACCAGTGGAGGACACAGGAAAAGATCCTTGGCTCATAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGCTTTAACCAGTGGAGGACACAGGAAAAGATCCTTGGCTCATAAC  200

seq1  TTAATAGGCCTGTCAGGAGCTGAGTGAATTCTGTACAGGTTTTATGAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAGGCCTGTCAGGAGCTGAGTGAATTCTGTACAGGTTTTATGAAGA  250

seq1  TCTTTCCATTATAGATCACAGAGACACTTTTGTACGGCCCAAGTTAAGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCCATTATAGATCACAGAGACACTTTTGTACGGCCCAAGTTAAGGC  300

seq1  ATGGGATTGATTGATTCATGTAATTGCAAGGTTATAAGGTGGGGCTAGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGATTGATTGATTCATGTAATTGCAAGGTTATAAGGTGGGGCTAGTG  350

seq1  CAGGGGTTCTCAACCTTCCTAATGCTGCGACCCTTTAATACAGTTCCTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGTTCTCAACCTTCCTAATGCTGCGACCCTTTAATACAGTTCCTCA  400

seq1  CGTTGTGCTACCTCTAACTGTAACATTATTTTTGTTGCTACTTCATAACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTGTGCTACCTCTAACTGTAACATTATTTTTGTTGCTACTTCATAACT  450

seq1  GTAATTTTGCTACTGTTGCAGATGTAATTAAGATATCTGTGTTTTCCAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTTTGCTACTGTTGCAGATGTAATTAAGATATCTGTGTTTTCCAAT  500

seq1  GGTCCTGGGTGACCCCTGTGAAAGCGTTGTTCAACCCACAAAGGGGTCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTGGGTGACCCCTGTGAAAGCGTTGTTCAACCCACAAAGGGGTCAC  550

seq1  AAAGCACAAAGGTTGAAAATCACTGTGGTTCAGGGCCGATAGCAGAAACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCACAAAGGTTGAAAATCACTGTGGTTCAGGGCCGATAGCAGAAACA  600

seq1  TTTATGTCATGGCAAGGGACTCTGTGCAGGACGATGGATGGGTCATGAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGTCATGGCAAGGGACTCTGTGCAGGACGATGGATGGGTCATGAAC  650

seq1  GGCAACAGGAAGGCTGGATTCACAGTGACAATTGTTCTGGAAGCAGTGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAACAGGAAGGCTGGATTCACAGTGACAATTGTTCTGGAAGCAGTGAC  700

seq1  AAGTGGCTCAGCCCAAGCAGACTTAGGATGAAGAGAGAAGGGAGAGGAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGCTCAGCCCAAGCAGACTTAGGATGAAGAGAGAAGGGAGAGGAGC  750

seq1  CACGTGCTAGCAGCCTACTAGTAGGAAGTCACCAGCATCCTTGGACAGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTGCTAGCAGCCTACTAGTAGGAAGTCACCAGCATCCTTGGACAGGA  800

seq1  GAGCAAGGGTGCCACAGTGTCCGTGAGATCTGATGTGGTGGGTAAATGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAGGGTGCCACAGTGTCCGTGAGATCTGATGTGGTGGGTAAATGAG  850

seq1  AATAGCCATCACAGGCTCATAGGTTTGGATGCTTCATCCCCAGATAGCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCCATCACAGGCTCATAGGTTTGGATGCTTCATCCCCAGATAGCAG  900

seq1  ATGTGTTTGGGAAGGATTAGGAGATGTGGCCTTGTTGGAGGAGATGTGTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTTGGGAAGGATTAGGAGATGTGGCCTTGTTGGAGGAGATGTGTC  950

seq1  ACTGGGGGTGAGCTTTGAGATTTCAAAAGCTCATACC-ATTCCAGTTTTG  999
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||
seq2  ACTGGGGGTGAGCTTTGAGATTTC-AAAGCTCATACCAATTCCAGGTTTG  999

seq1  CCCTCCCTGCCTATTGCTTTTATATCAGGATGTAAAACTCTTAGCTACAT  1049
      |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||
seq2  CCCT-CCTGCCTA-TGC-TTTATATCAAGATGT-AAACTCTTAGCTACAT  1045

seq1  T-GGCTCCAGTGCCATGCCCA-TCTGCTTCCCACCATGGTGATCATGGGA  1097
      | |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |
seq2  TGGGCTTCAGTG-CATGCCCATTCTGCTT-CCACCATTGTGATCATGGAA  1093

seq1  TAACTCTCTAAAATTATAAGCAC-CCACCTAATTAAATATTTC  1139
      || |||||| || || ||||||| |||| | ||||||||||||
seq2  TACCTCTCTGAAGTT-TAAGCACGCCACGTTATTAAATATTTC  1135