BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-325D17
Chromosome12 (Build37)
Map Location 22,967,094 - 22,968,175
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneEG668645, EG668646, LOC100043416, LOC668650, EG668496, LOC668653, EG432637, LOC668656, EG629133, EG668660, EG668662, LOC668664
Downstream gene2410018L13Rik, LOC77114, EG668669, EG668670, LOC668680, LOC100042895, LOC100043435, EG628081, LOC100042903
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-325D17.bB6Ng01-325D17.g
ACCGA113343GA113344
length1,08083
definitionB6Ng01-325D17.b B6Ng01-325D17.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcatcaggtagactgaagtggaagtcagccctagtggatgaaaggt
tggttggtttctgttaagcacagaagaccatgtggtaatctgggttcaag
gcattcgttttggattttgttttctcgagacagagtctcactatgtagcc
ctggctgacctggaactcactatggagatcaggctggcctcaaactcaca
gagatctacctgccactgcctctcatgtgctgggattcaagacatgtacc
actatgcctggatttcaaaatgttctttcatttccaatcagggagatact
ttgaaaatgcaaaccttcttgaagtggtttggtgactttccatgagcaga
caacaggagtttgatcctttgacctaaatcatggaaagatagagcatcca
attcctgcaagttgccctctgacctcatgctagggcaaatgcacactccc
ttatatgtatgctccttccccccttcccaaacactaattgtgtaatgata
aataaagcaggaactggggatggagagatggctcagtggttaaaagcagt
gactgctcttccaggggtcctgagttcaatttccagcaaccacatggtgg
cttgcaaccatctgtaatggggtctgatgctctcttctagtgtgtatgaa
gacagctacattgtactcgtatacatacaatatatagatacaccttaaaa
aaaataaagcaggaactgaatgaggaaatgcctgagtcaatagactatgg
ttcaatctctgggtacaagcaaggttggaggagaagtgaggcagcacagt
caggcattctgggccatgaaggatctcttagagcatattgaagaatttag
ggtttattcgtagactgtagggagaccctggaaaatattgagccacttta
aaactgcatttgctttttagaacgatctctatgggaacgagtctggcact
cagtaaacagggtgattggaaagttgattaacccagagatgggaggattt
attataaataccacttgcagatgagagagacctaaatggataaggcacag
tgggaaatgagggctcaggaccacagtgcc

tccgcggaattctttccgttcccttcccttcccttccctcccctctcctc
ccttccctcccctcaccttcccctccctcccct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_22967094_22968175
seq2: B6Ng01-325D17.b_46_1125

seq1  GAATTCATCAGGTAGACTGAAGTGGAAGTCAGCCCTAGTGGATGAAAGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCAGGTAGACTGAAGTGGAAGTCAGCCCTAGTGGATGAAAGGT  50

seq1  TGGTTGGTTTCTGTTAAGCACAGAAGACCATGTGGTAATCTGGGTTCAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGGTTTCTGTTAAGCACAGAAGACCATGTGGTAATCTGGGTTCAAG  100

seq1  GCATTCGTTTTGGATTTTGTTTTCTCGAGACAGAGTCTCACTATGTAGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTCGTTTTGGATTTTGTTTTCTCGAGACAGAGTCTCACTATGTAGCC  150

seq1  CTGGCTGACCTGGAACTCACTATGGAGATCAGGCTGGCCTCAAACTCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGACCTGGAACTCACTATGGAGATCAGGCTGGCCTCAAACTCACA  200

seq1  GAGATCTACCTGCCACTGCCTCTCATGTGCTGGGATTCAAGACATGTACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCTACCTGCCACTGCCTCTCATGTGCTGGGATTCAAGACATGTACC  250

seq1  ACTATGCCTGGATTTCAAAATGTTCTTTCATTTCCAATCAGGGAGATACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGCCTGGATTTCAAAATGTTCTTTCATTTCCAATCAGGGAGATACT  300

seq1  TTGAAAATGCAAACCTTCTTGAAGTGGTTTGGTGACTTTCCATGAGCAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAATGCAAACCTTCTTGAAGTGGTTTGGTGACTTTCCATGAGCAGA  350

seq1  CAACAGGAGTTTGATCCTTTGACCTAAATCATGGAAAGATAGAGCATCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGGAGTTTGATCCTTTGACCTAAATCATGGAAAGATAGAGCATCCA  400

seq1  ATTCCTGCAAGTTGCCCTCTGACCTCATGCTAGGGCAAATGCACACTCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTGCAAGTTGCCCTCTGACCTCATGCTAGGGCAAATGCACACTCCC  450

seq1  TTATATGTATGCTCCTTCCCCCCTTCCCAAACACTAATTGTGTAATGATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATGTATGCTCCTTCCCCCCTTCCCAAACACTAATTGTGTAATGATA  500

seq1  AATAAAGCAGGAACTGGGGATGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAAAGCAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAGCAGGAACTGGGGATGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAAAGCAGT  550

seq1  GACTGCTCTTCCAGGGGTCCTGAGTTCAATTTCCAGCAACCACATGGTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCTCTTCCAGGGGTCCTGAGTTCAATTTCCAGCAACCACATGGTGG  600

seq1  CTTGCAACCATCTGTAATGGGGTCTGATGCTCTCTTCTAGTGTGTATGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAACCATCTGTAATGGGGTCTGATGCTCTCTTCTAGTGTGTATGAA  650

seq1  GACAGCTACATTGTACTCGTATACATACAATATATAGATACACCTTAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCTACATTGTACTCGTATACATACAATATATAGATACACCTTAAAA  700

seq1  AAAATAAAGCAGGAACTGAATGAGGAAATGCCTGAGTCAATAGACTATGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAAGCAGGAACTGAATGAGGAAATGCCTGAGTCAATAGACTATGG  750

seq1  TTCAATCTCTGGGTACAAGCAAGGTTGGAGGAGAAGTGAGGCAGCACAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATCTCTGGGTACAAGCAAGGTTGGAGGAGAAGTGAGGCAGCACAGT  800

seq1  CAGGCATTCTGGGCCATGAAGGATCTCTTAGAGCATATTGAAGAATTTAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCATTCTGGGCCATGAAGGATCTCTTAGAGCATATTGAAGAATTTAG  850

seq1  GGTTTATTCGTAGACTGTAGGGAGACCCTGGAAAATATTGAGCCAC-TTA  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GGTTTATTCGTAGACTGTAGGGAGACCCTGGAAAATATTGAGCCACTTTA  900

seq1  AAACTGCATTTGCTTTTTAGAACGATCTCTATGGGAACGAGTCTGGCACC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AAACTGCATTTGCTTTTTAGAACGATCTCTATGGGAACGAGTCTGGCACT  950

seq1  CAGTAAACAGGGTGATTGGAAAGTTGATTAACCCAGAGATGGGAAGATTT  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CAGTAAACAGGGTGATTGGAAAGTTGATTAACCCAGAGATGGGAGGATTT  1000

seq1  ATTATAAAATAACACTTGCAGATGAGGAGAGACCTAAATGGATAAGGGCA  1049
      ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
seq2  ATTAT-AAATACCACTTGCAGATGA-GAGAGACCTAAATGGATAA-GGCA  1047

seq1  CAGTGGGAAATGAGGGCTCAGGACCACAGTGCC  1082
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGGAAATGAGGGCTCAGGACCACAGTGCC  1080


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |