BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-350L09
Chromosome12 (Build37)
Map Location 96,547,474 - 96,666,332
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC217786, LOC100039603
Downstream geneLOC667688, Flrt2, 1700019M22Rik, LOC100039664
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-350L09.bB6Ng01-350L09.g
ACCGA131304GA131305
length1,1271,172
definitionB6Ng01-350L09.b B6Ng01-350L09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,665,195 - 96,666,332)(96,547,474 - 96,548,615)
sequence
gaattctttgcatggaaataaagtctagtgattcaaattagatcactgcc
aattgccatctccagatactgaaagttgtaggaaattgcagaccaaaccg
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ttagactctcctgctgtatacttcagagtgctctgcatctcagcttgtaa
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tttgttttagccatggacaggtagtgagatgagttgcagaagtgaacatg
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atcttgctttactcagatttaaatatcacatccaaaatacttttattaaa
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ttaagcattttaccttttcagtattccagtctaaatacacacacgaacac
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acacacacacactcacatacacacacactcacatacacacacactcacat
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acacacacatacacacacactcacattcactcacatacacacaccacatt
tatgttttacttttcccttcttatgacagtcaccgtgcaagttaatattt
tcctcccttctttccttgtgctcctatttgcaatttcatcctttggtgag
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quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_96665195_96666332
seq2: B6Ng01-350L09.b_47_1173 (reverse)

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      |||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||
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       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||
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      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAAGGGAAATCTTGAAATAGCAGAGAGGAACATGGGAGGGTGTGTCA  587

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCAGAGCACTCTGAAGTATACAGCAGGAGAGTCTAAAAGTCAGTGT  937

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTGGTTCTACTTTCCTAAAGTGCTGCTTTGAGGACACGGTTTGGTC  1037

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATTTCCTACAACTTTCAGTATCTGGAGATGGCAATTGGCAGTGATC  1087

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1: chr12_96547474_96548615
seq2: B6Ng01-350L09.g_71_1242

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGTCTTAATCACAAGAACTCAGGTAGGAGAACATCCCTCCTATTTC  300

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||
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seq2  GGAATGTCCAAAAATTTTGCTACCAACGTTTCCTTTAAGCATTCCCTATA  1100

seq1  --GATGT-CTACTAGGC---ATATACTT-AGGAATGTAAAGTATACATTC  1124
         |||| |||||| ||   |||||||| || |||  || ||||||| ||
seq2  AGAATGTCCTACTAAGCCATATATACTTAAGAAATTCAAGGTATACA-TC  1149

seq1  AT--ACAAAAGTAT---ACAAAG  1142
      ||  ||||||||||   ||||||
seq2  ATACACAAAAGTATTACACAAAG  1172


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