| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-049B23.T7 (MSMg01no049_b23.b1) | MSMg01-049B23.TJ (MSMg01no049_b23.g1) |
|---|
| ACC | AG278690 | AG278691 |
|---|
| length | 1,244 | 1,274 |
|---|
length of high quality
(start - end) | --- | 144 (126 - 269) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_b23.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_b23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:10:48 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_b23.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_b23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:10:48 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | ATTTTTCTTTATGCGTTTAATCTATTGGGCGCTAAGACTACTAAGGGAGA
GGATCCGCGGAATTCTCTGAATTCAAAGGCCTCTTTACAAACAGCTGACT
TCAACCCAGCCTTTTGACCACCCCTTTAGATGGAGCTCCCCGTTCTCATA
CTAGGACTCTGAGAACAGGACAGAGAGAAGAGAGACACAGTAAAGACTCA
CCAGAATAATCTAAAATAGAAGTCAAAGGAGTAGGATGGATGAGTGTTCA
GATGTGCCTCAAGTCTGTTTCAAGATGAGATTATAATACGCAGACCTTCA
GCATCTCAAACCTCAGTGCTTAATCACACAACCATCATAGAATGACAGCA
TTGCCTGCCTTGCAGACAGGATCCCAGCTTCTTCTGCGTCCTCTCTTTAA
TGGGACTCTCACTGTTGTTCACCACTATTCCATACCATCATCATTGACAT
TATGAATACTGCAATATAACCTTTCACTGAGTGGATATCTTCAGGATTCT
TCTTTAGATCATTTCTGCTGTGTTTGAGGTTCGACATATTACATGTAGCC
TAGACAGTCCCTCACGCTAGATGACTACAGAAAAATATGTTCATCATTAA
ATACTAAGCTATGGAATAACAGACTGTGAGATCTGTGCTCTCACAGTTTT
GGTTAACGAGTCATAAGGAAAGGATTCATTTCAGAACATGTATCATGAGT
CAGTATTTTGACATAACATAATATTTTTTTTACCCTAATTTTCTCCGTCC
TCTTGGTTAGACAACGTGATCTTAAATATGCCTAAGAATAATATGATGGG
TGTTTTATCTCCCTATGGGTTGTGACTTTACCTTAACCTTCCCTGGTTTG
TGCTCTTCAGTCTCAAATCTTCTTTGGTCCATAGTTGTCTTTTATTGTGC
TATTTGCGTTTTATTTACTTATTTTTGTCCTTTTCCTAATTTTCTTTGTT
TACCATAATCTTTGAAGTTTATGGATTTCTGCTTCATTTTATTATATTTT
TCCTAATTTAATATTCTTTCTTTTTTGTGTTTCCTTTTTTAATTATATTA
TTCTCTTTACTATATTCTCCAATCCCTATTAATTCTTTTTGTTTTTTGTT
CATCTAAATATATTTTTTCTTACTCTTGTTTCTATCTTTGTCCCTATTTC
TATACAATTTTCTCCTCAAATGTTTTCCACCTTTTCTCTACTTTATGGTT
TCTTGTGTGTCGTCTTTTATAATTTCTCTTGTTCCCTTACTCTC
| ATATGGTAGCAGCCGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXTTTGCTTTATCATAAATCCAAATAATCCCCTGTAGA
TTTCCTTTAAATTACCACCCACGGATCCCTCAGCCCTTGACACACATTGT
GAGGAAATTATTTGATTCATTTTCTTGGTGTACTTAAAGCATTCCACTGG
TCTGAGAGCAATTGGATGCATGAAAGAAATACAAACGTAACAGTTAAACA
GCCTCCCAGACCGCCCAGACCCATCTCAGCCCCGATTGGATGCTACAAAT
GAGGAGATAGCTGATAGAAACCACACGGGGCTTGCTGGCACTAGCAAAGC
AAAAGCCAATTATGATTGGCCATCCCTGACTATAATTCCATCAGTTCAAT
CCACCAATTCTACAGGAAGAAACTTCAGAGACACCATGTTTCCCTTCTTC
TCCACAAACTCGGGAAGGCACGCCAAGGTTCCAAATCAGACAAGGCTCTA
CCCCCGAGTCACAGCACATGCCTTCCAAATCACCTGGTTTGAATTCTCAC
GTACACGCAAACATCCCAGTCCATGACTTACCCACAAATCACCCACTAGG
ACCCAGAACTGTCACCCCAGACGTTCAAGTTCATCCCCTTAACCATGCCA
CTGCATTGTCACGTGCCAAATGTTTTTATGCTTTTCTCACAACATAGGTT
TTCTCTTTATCTTTTCCACACATGTCTTGCTTTGTGAGTCCTTCACAATC
TGCACACACCCACCCGGCCCTTCTTTTTAAGCTTCTCACCCTTTTTACCT
TCAACATTTCTCCTGTCATTTCTTCCTGGCTTACTTGACTTACCCTAACG
TCCCTGGCCTATGCTTTCCTTCTCACTCGAATCTTTAGCTTCAATCTCTA
TTCCACCATCCCTGCTCCTCCTTCCTTTTCAACAACTTTCCCCCCCCTCC
AAATTAAACCCGGCTATCACTTTCCCTCCGGGTCCTTCTTCTTTGAACTA
CTGCCTTACTTCCCATCTTCCGTGCTCGATGTTCCACCCCCTCGCCACAT
CTATAACTTCTGGAATCTCCTCTTCTCCTTACCCCTTCCTCTTCTCATCT
CTACCATTCTTTGTACAATTCCCTATCCCATTAATCCCTCTCTCCCCTCT
GTTCTCCTCTTTCTCTTCTTCTTCCTCCTATCCAAGACTCTCCCTCCTTC
TGTAGCCCTCCTCACTCCCGACTCTTTCTCTCCTCTTTACACCACTCTCT
TCTTGTCACTCCTAATTCGATCTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 7 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 9 16 15 15 8 8 8 8 8 11 8 9 10 12 13 8 8 8 8 9 9 8 8 8 12 8 8 8 19 23 33 33 33
33 25 22 19 18 13 11 12 10 10 10 15 18 25 28 30 33 19 19 10 10 10 14 12 12 12 11 16 12 8 8 8 8 8 8 13 10 10 20 22 23 18 12 10 10 11 22 16 21 21
21 21 21 22 32 32 25 24 15 15 11 17 8 10 12 12 18 28 24 21 12 10 10 12 12 9 10 10 10 12 16 11 11 10 11 13 12 8 9 9 10 10 14 12 13 15 11 11 12 17
17 17 11 11 12 24 24 33 29 24 31 18 19 12 12 12 12 16 21 19 18 23 31 28 28 23 28 28 20 20 17 24 24 32 28 20 20 19 19 19 24 23 19 19 12 10 10 10 9 11
13 16 22 16 15 10 8 8 8 9 11 11 11 9 8 8 8 8 12 11 12 12 11 12 12 22 22 23 23 14 14 14 15 15 17 28 18 14 14 24 28 32 30 33 28 28 28 30 28 32
37 33 28 18 18 12 12 12 22 19 14 13 16 16 19 19 24 28 38 27 24 12 12 11 12 12 32 21 25 25 32 27 12 12 10 10 13 15 12 14 15 15 12 11 11 13 20 19 15 13
10 10 10 19 19 32 43 18 18 14 19 19 19 19 15 17 17 11 11 11 21 12 11 11 12 21 17 20 20 24 19 11 11 11 16 18 19 28 32 36 37 32 26 21 14 12 12 12 11 11
11 23 15 23 23 36 24 21 13 19 22 15 13 21 21 26 28 25 28 18 18 11 11 11 13 15 13 14 26 28 41 46 34 30 22 14 14 18 13 13 13 24 28 39 43 43 37 36 35 28
28 20 18 9 9 9 9 8 8 10 8 6 6 8 8 11 12 15 12 11 11 12 15 13 22 18 28 23 15 10 10 10 12 10 10 10 11 15 18 20 12 15 15 30 23 25 12 12 12 12
23 24 33 17 15 9 9 9 13 23 19 12 11 11 11 15 15 20 18 20 20 24 16 11 10 10 10 10 10 15 18 23 28 21 22 10 8 8 12 12 10 9 12 22 19 21 24 15 10 11
11 11 10 11 11 11 12 12 11 9 11 12 24 15 14 10 27 23 38 26 20 32 24 24 13 13 10 11 10 10 10 10 11 13 24 12 12 12 10 8 8 10 8 11 11 10 11 10 8 8
10 14 15 12 10 8 8 8 8 10 10 18 16 11 11 12 16 15 12 14 9 9 9 9 24 12 10 9 10 10 12 12 14 8 8 11 12 9 8 11 13 10 10 10 10 10 10 10 10 12
12 12 11 11 15 11 12 13 13 11 17 18 12 8 8 8 8 10 10 8 15 13 14 24 21 16 12 11 11 12 13 10 10 10 10 15 21 21 19 17 13 10 8 6 8 6 6 8 8 10
10 12 11 11 13 17 18 12 10 11 13 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 10 10 10 10 23 13 16 14 19 15 10 10 10 9 12 9 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 12
12 8 8 10 11 10 10 11 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 12 15 15 14 13 10 8 10 10 10 8 8 10 8 8 9 9 9 12 17 15 12 8 8 7 7 8 8 11 8 10 10
10 10 11 10 13 10 10 12 10 10 8 8 8 8 8 9 12 11 11 11 11 11 12 12 8 8 7 7 8 8 10 9 8 10 12 12 12 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 9
8 9 9 8 8 11 13 8 8 10 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 10 10 11 11 11 10 10 10 10 9 8 10 10 8 8
8 8 8 11 13 10 10 10 11 11 9 8 8 8 8 8 8 9 9 11 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 16 10 9 9 8 8 8 8 8
8 6 6 8 6 10 11 12 11 8 10 8 8 8 8 8 10 10 9 9 10 12 15 13 12 12 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 12 12 14 14 14 16 15 14 10
10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 10 12 12 7 6 8 8 8 8 10 10
8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 10 10 10 10 8 8 11 11 10 10 11 14 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8
8 8 8 9 9 11 9 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 7 7 9 9 8 10 10 8 8 8 8 8 9 10 8 11 11 11 11 13 15 19 15 10 10 10 10
6 8 6 6 6 6 11 11 9 9 9 10 13 15 17 18 12 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 7 7 8 8 17 12 10 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 6
6 8 8 8 6 6 10 8 14 12 10 12 11 10 9 12 9 9 8 8 6 6 8 7 9 8 8 6 6 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 7 7 10 12 10 10 8 8 8 8 10
8 8 6 6 6 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 10 10 9 8 8 8 10 10 9 6 10 6 8 8 8 6 8 7 6 6 6 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 10 15 17 6 7 9 11 10 12 10 9 8 8 13 19 8 6 6 9 12 12 9 9 11 21 23 22 24 18 12 10 14 8 10 10 21 23 34 34 30 30 37 33 33
43 43 59 42 31 24 16 11 11 11 16 13 14 14 17 23 23 33 28 23 23 23 23 33 33 42 42 37 37 40 43 43 34 43 43 36 36 43 43 43 47 24 22 20 20 20 18 24 28 20
23 15 10 8 10 8 8 11 12 24 16 11 11 11 22 22 27 12 12 12 15 12 10 9 10 10 23 19 43 43 43 43 43 31 31 27 27 31 32 31 33 33 30 30 31 44 44 46 43 43
46 47 47 43 36 37 29 35 35 43 42 57 57 59 46 36 36 25 25 25 36 41 44 44 34 32 15 15 14 19 19 21 30 37 42 30 30 20 20 20 20 22 32 32 19 19 15 38 26 35
35 35 43 43 33 33 32 43 37 37 52 43 43 38 33 33 43 38 35 35 35 43 41 41 41 41 27 28 28 32 32 27 27 23 27 25 43 35 35 35 39 39 57 39 39 39 39 39 39 39
33 33 33 43 42 43 43 35 42 42 42 36 57 46 35 35 36 13 12 9 9 10 19 19 22 16 24 11 13 10 9 10 9 15 10 11 11 9 9 16 18 18 19 32 32 43 43 35 35 33
33 29 29 29 35 35 37 43 42 32 36 27 43 19 27 14 14 14 28 24 32 20 20 18 19 17 16 14 14 18 18 24 15 12 11 10 10 14 17 20 23 25 13 13 13 28 22 23 8 8
8 10 12 19 19 16 15 15 29 32 42 41 43 39 39 31 31 20 20 20 23 28 23 30 19 26 14 14 12 24 18 18 9 9 9 23 12 24 17 29 22 22 11 11 11 22 22 18 11 11
11 12 11 11 11 11 12 21 30 34 37 37 30 30 30 28 28 28 28 32 16 15 10 10 10 10 11 11 13 18 18 28 25 26 18 18 22 31 31 31 12 14 13 12 10 19 19 43 36 36
22 19 15 9 9 9 15 13 14 10 9 9 10 9 9 9 11 11 11 11 11 13 18 12 17 17 19 19 18 12 12 9 9 10 10 18 18 11 10 10 12 18 15 12 15 15 19 18 13 8
8 8 8 10 16 17 12 15 16 20 12 12 13 15 13 15 17 10 10 10 18 18 28 29 29 21 21 13 11 12 16 18 18 12 15 11 20 20 28 28 23 23 22 12 13 11 11 11 17 13
9 12 9 10 10 12 14 15 15 13 12 12 15 27 24 21 16 11 13 13 17 30 29 24 23 10 11 10 16 12 12 10 10 10 12 15 19 23 21 13 11 11 19 11 12 12 12 12 8 8
8 8 8 10 8 9 10 13 10 12 12 12 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 11 18 16 15 12 16 12 10 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8
6 6 8 8 8 9 8 7 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 10 13 11 11 10 14 10 10 10 12 16 15 12 11 11 11 11 8 8 8 13 10 15 13 10 10 10 11 10 10 10 10
14 9 8 8 6 6 8 8 10 12 12 16 13 13 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 12 10 10 8 17 8 8 8 8 8 9 18 17 16 10 10 9 8 10 6 6
8 8 8 10 9 9 11 12 11 19 22 23 15 12 8 8 8 8 10 10 8 8 8 6 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 12 10 10 11 12 15 9 9
9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10 12 12 15 10 8 8 10 8 8 9 9 8 10 10 8 9 9 13 11 8 8 11 8 9 10 12 10 10 10 10 8
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 10 8 8 8 10 10 13 20 15 11 10 11 8 10 6 6 8 8 8 6 6 8 8 11
11 10 10 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 11 11 11 15 15 13 13 11 8 8 6
6 8 8 10 8 8 10 8 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 10 8 12 12 11 11 9 9 12 12 9 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8
8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 12 9 9 8 8 11 8 8 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 12 11 9 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 9 9 13 8 12 8 8 8 8 11 11 11 11 11 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 10 10 7 8 8 8 9 9 15 8 10 8 13 7 7 8 8 10 9 9 9
10 13 11 12 7 7 6 6 8 10 8 8 8 8 12 10 8 8 7 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 15 11 12
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 15 16 12 9 9 9 10 10 10 9 9 8 8 10 10 12 8 6 6 10 15 10 9 9 10 9 6 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10
13 13 10 8 8 8 8 8 8 8 12 13 10 8 8 8 8 6 6 6 8 10 8 8 |
|---|
