BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-185P10.T7 (MSMg01no185_p10.b1) | MSMg01-185P10.TJ (MSMg01no185_p10.g1) |
ACC | AG377792 | AG377793 |
length | 749 | 777 |
length of high quality (start - end) | 312 (65 - 376) | 525 (77 - 601) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no185_p10.b1 PHD_FILE: MSMg01no185_p10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:00:48 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no185_p10.g1 PHD_FILE: MSMg01no185_p10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:00:48 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NTTAAAAGNNNNNNGCCTTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCATTTTACAGGTGTTATGTGAGGTTAT
TTTTTATATAAATTGTATATTATGATGGTTATTACCACTACACAGAAAAG
CAATTTTAATATAATTATATTGAACCAGCCACCTTTTTGAGAAATACATT
TTCATAAAAAATATTTTTCTGAGGGTGGGAAGCAGGTGCATCATCTATTT
TTGTATCCTAACATTTTTCTTCTTATATAAAGGGACATTAAATGTTTAAA
TGTGACAGGTGCATTTAGATGCCATTAGACTTATCCTAAACAGAGACAAA
ACTACACAAAAGAAATTTTTGTTGGATCTTTTGACTCCCCCCCCCATTAC
TTTCCATTGAATTTTTGCATGTGTAACACAACCCCAACAATAAAACTAAT
GATGTTCTAGAAAGGTGTCAAGATTTAGATTGCTACAAACACTTTAAAAA
GCTAAATGGCACAGAAGGCTGGTGATGAGGCTAATGATGGAGAGATAATG
GCTTCTGTGAACGTCAGCCTTGGATGAAAACAACTCAAGAACAATACCCA
TGTACCCACAGTGAACTGTATTTTTACATTCCTCAAATAAGACTTCTCTT
GTCCCCATGTAATAATTCTACTCATTATATTTTTACCTAATCCCTGCAAG
AACCATCCTGATTCCCCTTTTTCTGCTTCCCTGCCAAGTGTGGGGGGGG
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCA
GAGAAGCACCTGACAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCA
AATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGA
TAAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGA
ACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTTACAACCACTCTGGAAA
TCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCC
AGCAATACCTCACCTGGGCATATATCCAGAAGATTCCCCAACTGGTAAGA
AGGACACATGCTCCACTATGCCCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGA
ATCTGGAAAGAACCTAGATGCCCCTCATCAGAGGAATGGATACAGAAAAT
ATGGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAAT
TTATGAAATTCTTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGT
GAGGTAACACATTCCTCAAGAATCTCACACAATATGTACTCACTGATCAG
TGGATATTAGCCCCAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATATAAATTTG
CTAAAACACATGAAACCTCAGCAAGAATGATAACTGAAAGTGGGGAACAC
TATGCCCCCTCCCTAAAATTAGGTCTC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 8 10 9 3 0 0 0 0 0 0 3 7 8 8 8 19 19 10 9 9 9 12 14 28 32 39 39 37 32 32 30 30 30 30 33 33 37 37 37 48 35 35 30 35 35 35
47 53 50 50 50 57 53 53 48 33 26 17 22 22 40 41 68 68 42 42 42 42 50 50 50 50 50 68 51 50 50 50 50 50 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 44 50 43 37 32 24 13 8 8 8 8 8 21 30 57 57 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 54 54 57 59 59 68
68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 44 28 25 25 25 28 33 37 39 43 57 57 57 48
48 59 57 57 48 48 48 57 57 57 59 59 57 57 57 53 53 50 59 59 46 59 30 21 9 9 9 9 9 12 12 25 21 24 14 14 14 23 21 24 19 13 11 11 11 11 11 12 21 30
37 59 47 47 48 50 48 48 48 48 48 59 59 57 57 50 53 53 48 48 48 46 46 59 41 22 19 8 8 7 8 9 12 13 11 11 11 11 15 12 13 17 27 25 12 12 11 12 15 15
15 24 27 37 36 32 37 32 37 35 35 35 28 29 26 26 29 33 33 33 25 37 37 48 34 42 32 31 20 32 30 54 54 42 42 37 37 28 29 30 30 30 29 29 36 28 28 28 23 28
28 24 25 20 17 15 15 15 15 15 15 15 14 14 14 18 18 23 28 34 28 28 20 20 24 21 19 12 11 12 15 16 19 21 28 28 25 23 15 13 13 13 18 18 28 23 23 19 21 11
8 8 8 8 11 15 12 12 13 16 21 24 24 19 23 16 16 11 10 10 11 11 11 11 11 11 15 12 11 11 12 12 10 10 10 10 14 11 11 11 15 15 19 19 17 17 15 15 12 12
11 11 9 11 11 19 15 15 15 14 12 17 10 10 8 11 10 10 11 10 18 15 19 14 14 12 12 14 13 14 9 8 8 8 13 13 10 9 10 8 12 13 14 10 8 8 8 8 8 8
12 18 9 9 9 9 9 10 10 10 10 11 11 13 11 15 13 10 10 9 13 8 8 8 8 8 8 9 12 13 9 8 6 6 6 9 10 10 13 13 14 14 14 11 10 8 8 8 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 10 12 11 11 11 22 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 11 13 14 20 22 25 20 | Open.Hide. 8 8 8 15 15 8 8 8 8 17 21 32 32 37 41 41 47 47 42 48 48 48 48 48 48 48 42 47 47 41 26 23 12 10 9 10 10 9 19 12 18 20 29 29 44 47 53 53 47 47
47 47 47 53 53 53 53 53 50 48 43 29 28 29 21 24 18 19 19 26 21 41 41 41 47 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 50 51 50 50 50 50 57 68 68 57 57 57 54 54 54
54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 46 46 48 50 57 54 50 42 37 35 19 25 12 15 15 19 41 38 57 57 57 57 68 68 57 57 57 50 50 57 50 50 50 57 57 57 50
50 50 50 50 50 52 52 57 57 57 57 57 57 57 50 50 46 41 41 50 50 50 48 48 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 47 47 47
57 57 57 57 57 50 50 51 51 51 57 57 57 54 54 54 54 54 57 54 48 48 48 53 50 50 59 59 57 59 59 59 48 48 48 53 53 50 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 50 50
50 50 47 53 48 50 50 50 42 41 30 22 8 8 8 11 21 27 59 59 37 39 37 41 47 47 59 59 57 48 48 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 54 54 54
54 54 54 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 57 68 59 59 59 57 57 57 43 40 28 28 28 32 33 37 39 39 48 57 59 59 59 59 57 54 54 54 54 54 68 68 68 68
57 57 54 54 57 59 59 59 27 27 9 9 9 23 27 37 43 43 43 43 47 59 59 48 48 48 48 40 39 39 36 19 18 9 9 9 21 23 47 47 47 59 59 59 59 47 47 23 19 9
9 9 9 19 23 41 42 47 47 48 48 48 59 59 59 59 36 28 24 13 13 18 18 20 9 9 9 25 25 48 48 48 48 59 57 50 50 50 50 48 57 48 48 57 57 57 57 59 28 32
24 20 20 32 32 57 48 48 48 48 48 54 44 44 37 28 28 32 40 44 54 54 59 57 68 68 68 57 57 59 54 54 57 57 57 57 57 54 54 54 48 44 44 25 25 31 44 47 54 54
54 59 48 48 43 43 43 43 42 43 30 26 17 30 26 43 43 46 46 48 43 43 43 43 43 43 46 43 59 37 30 30 30 30 37 34 34 24 24 28 34 37 30 33 33 33 33 33 43 39
39 39 36 36 39 39 47 47 47 47 47 48 48 48 34 34 28 28 35 37 39 37 37 39 39 19 15 10 10 10 15 13 24 28 28 30 37 32 35 33 37 37 39 39 39 37 30 22 18 17
21 21 18 12 11 11 12 16 16 22 28 17 19 16 11 13 11 20 20 21 23 11 10 10 21 23 36 28 33 28 28 30 37 37 47 42 47 48 37 37 30 30 30 24 15 10 8 8 8 13
9 9 10 9 10 19 19 15 10 10 10 12 19 23 15 11 8 8 8 10 8 9 8 13 8 10 8 11 8 9 9 9 10 10 10 9 14 10 9 9 14 14 12 10 10 10 12 14 15 17
12 13 10 8 8 10 8 8 8 13 15 12 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 15 17 15 8 8 8 10 15 15 15 11 9 10 10 10 10 11 11 10 8 8 6 6 6
8 11 17 17 18 16 12 10 10 10 15 9 9 9 10 12 11 10 12 10 10 10 10 13 10 10 10 |