BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-211A03.T7 (MSMg01no211_a03.b1) | MSMg01-211A03.TJ (MSMg01no211_a03.g1) |
ACC | AG392907 | AG392908 |
length | 1,241 | 1,248 |
length of high quality (start - end) | 419 (29 - 447) | 326 (72 - 397) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no211_a03.b1 PHD_FILE: MSMg01no211_a03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:35:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no211_a03.g1 PHD_FILE: MSMg01no211_a03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:35:46 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (30,925,998 - 30,926,402) | (30,988,410 - 30,988,735) |
---|
sequence | NNCCGTCATTGGGGCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCA
CCAGATGAAGGTGACGGCTCTTCATGTGAAAGGTGATTGGTATAGGACCT
GCAGGCTCCTCAAAGGTTCTGCAGTACCAAGAGTTGTCATTTCACTCTAG
GCTCTTGATATCCAGTGACAGGAAGAGGTGAATTCCAAAGTAAATGAAAC
ACATCCTTCTCACAGAACAATGCTCTTTCATTGGAGGAAAGTTGTTTGTA
TCCATCTGCAAACCCCACTATTCTCTGATGCAATCCAGATCCATGCTCTG
GACTTACCACTTTCCAGTGGCACAGTGGAACTCATTAACCCCTCTAGGAG
ACCCGATCTTCCCACCTTCTTTATCATGTGTGCTGATCTCTCCTTTGTTC
ACAGATATCTCAACAGACAGCAGAGCCCCATGGCCCCCACTGGATTGTTT
GTACGACCCCACGACAAGAACCAGGACACTCCTTGACATCTTTGAAGGGG
ACAACTGCCCAAGTATAGAATTTTAGGGATGCTTCAGAGTTCTGAGGGGC
TAATGAAATTCAATGTCAAAAACAGTAAATGTTTTTGTGGAAAACAAAAA
CCAACAGAAACTCAGTTTAACATCTCACCAGCAACAGATAAACTGAGAAA
ATGTTTATGTGTAAACTACGTGGAGGTATCTTAGTGGACAAAATTGTAAG
AAATTTATTCTCAAGCTGCAAACTTCAGTGGAAATATAATATTTTAATGT
GAGAAGATATAGAATTAATGCTATTTTTGTTTGAAGACATTTATGGATGT
GTTAATCCATACATAAAATAATAAAATAGCTAGCCTCTCTTTAAGATGCA
TAAAACATACATAAAACAAAATAGCTGATGGTTAATTTATAAAATATTGA
AAGTAATAGGTTATATTTAGAAGAGTTATTTTATCAGTGTAAAAATGCTG
AATAAAAGGCCTGATTAAAGAATGGACGAAATTTTATGTCTTTCTCAGCC
CAACCTGAACTGGAAATAACAATGTTCTCCTGGGGGGTTATGGGCTTCCC
TTTTAAAATTCCGAAGCCGGACCCCCGTGTAAAAAATTTCTCTAACCCCC
CCTTTATCGTTCATGAGAAAAAAATTCTGCCTTTATTTTTTCTCTGGCAA
ATATAACCTCTCTTTTTCTCCAAAACCTATAATCAACATTTTCCTGTTTC
CCCACGATAATTCATTAAAACCTATCTCTCTCGCTCACCCC
| NNNCCTATCACGTGAGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACCTGCCATGTACATTCAGAGAACAGGAA
CCACATGGCATGAGAGAGTAAGAAAACAAGATATTTTAAAATTAATTTAC
TGTGTAAGTAATGGTTTTGTTTTAATGATTAACAGGTGCCACATGAAATC
TCTTGAAAAGTGAAAGGGTAAAGTTTGTTTTGCACTTTAAAAACATGCAG
CTGCTGTATGGAGAGTACATGCAGACACAGCAGTAAGAACATCACATGCA
GGCTAAGGTTACCCAGGCAAATGATGCGCAGTGCTCTGCTGTGCTTGAGA
ACAAATGATCAGGGTCCAGATGCCCTTTGTAGATGCAGTGTTAGGCTGTT
TATAGGGAACCAGGGTAGCAGGAATACAGAGAGTGAGCACCCTGTGTTGA
TTTTTTTTCCCCCCCCCCGACAATTACTTTACTAAACTGACAAAAGGGGG
CCTGTGAAGTCAGGTGAAGGAAAGGGCAGGAAGTCAGTATCCCATGTCCA
TTGCATGAGCTGTCCAGAGGAGTATAATGCTTAGGTCCACAGGGCAACAG
CGGAGATGGACAATCAGATAAGGAAGGGTTTAACTTGAATTGATGGGACC
AAGGCAACTCTCTAAGGACACATGGATAGAGATGATGCTGAGAATGTGGC
TGAAAGAGAACACAGGTGTCGAGAAGGAAAGAATGCTGTGGACTCGGCTC
TGGCTCTCCCATCCTTTAGGAGGCTATCTTTCTCATCTCCTCTGCATGGA
ACATGAATCCTAGAGGCAAACTACTGAGTGTGTAGCACAATTGCAGATCC
TGATTATACCTTACATGAATGTCATAAGGTCGAAGAATTTACACCACCTT
CCTAAAACCTACCCTAGGGTTCAAATGAGGCCCAACCCAGCCCCCACTAT
GATCTCAAAAGCCTGGAGAACTTACAGGTCTGTACATCTTGTGGCTAGGG
GAACCAAATGAACCTGAAAACTGTCCCCAGAACAAAATGCTACTCTTAAA
AACTTCTTTTCCCCCAATCCCCAAAAAAAATAATGGGGGGGATTTTTGTA
ACCCCTGGAGCGGAAAAATTTTCCTTCCCCCTTTTTTTTTTAAGGAGACC
CTTTACAAATATTTTAAAAACTTTTTATTTTCTCTTCACACCATAATTTC
TTTTTTTTTCCCCCCACAGCTCAAACAAATTTCTGCTCTGCCTTGACT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 9 9 11 8 8 8 8 11 10 8 8 8 13 15 10 8 8 8 8 8 19 21 35 24 28 28 26 29 37 43 43 43 43 43 48 43 43 47 42 42 36 36
36 40 42 42 42 54 54 68 68 68 68 68 50 50 48 47 47 57 57 57 47 57 57 50 50 50 50 50 51 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 50 50 51 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 50 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 35 35 35 50 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 62 62 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 59 59 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 28 23 9 9 9 16
19 39 44 48 57 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 50 50 42 42 30 25 18 11 11 11 10
10 8 8 8 9 9 10 9 9 9 9 9 12 16 27 34 41 50 50 50 50 53 48 57 43 43 37 37 40 47 32 37 26 22 12 12 12 15 18 18 21 32 28 32 32 29 34 34 39 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 50 50 50 53 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 57 59 59 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68
68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 59 59 57 48 48 48 48 48 48 48
57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 50 50 50 48 47 47 59 59 47 43 41 37 37 41 41 41 47 59 47 47 46 43 43 43 41 37 37 41 41 41 47 41 50 50 50 50 48 48 57 57
57 48 48 48 57 50 50 50 50 48 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41 39 39 37 37 31 32 37 37 37 37 41 41 40 40 39 39 39 39 34 34 39 39 39
39 39 39 34 25 30 30 30 28 34 34 33 30 30 30 25 26 41 40 43 37 39 40 59 46 50 47 47 47 41 39 39 40 36 28 32 30 31 31 28 34 34 37 33 27 27 32 37 36 36
36 37 24 22 22 24 22 25 35 34 34 32 36 14 17 8 8 8 17 16 34 39 31 22 28 28 29 30 33 37 23 22 11 11 11 16 16 32 32 37 34 25 30 15 15 9 9 9 9 11
10 10 11 23 23 18 23 17 23 11 11 9 17 8 8 8 11 8 9 9 9 9 10 17 16 30 29 19 19 17 14 14 14 23 16 18 12 13 11 14 16 32 37 37 40 37 37 37 32 29
29 32 37 36 28 18 12 13 10 10 15 14 27 30 21 17 16 18 15 15 15 17 13 10 10 10 21 18 24 30 32 33 28 21 13 11 11 12 13 18 18 15 12 16 10 10 10 10 10 12
9 9 11 9 16 15 18 18 21 16 15 22 19 19 15 10 12 10 10 10 10 12 12 11 9 10 9 9 10 19 21 25 13 8 8 8 8 10 10 8 8 11 8 11 11 15 8 8 6 7
6 10 8 8 8 8 8 8 8 11 9 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 13 9 6 6 8 6 6 6 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 9 7 7 7 10 9 10 14 12
12 23 15 18 14 15 26 11 10 10 8 8 8 12 9 9 9 9 9 9 10 10 17 17 14 12 12 10 10 8 10 8 9 11 10 9 9 8 8 9 9 10 10 9 16 13 23 19 13 7
6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 8 6 6 6 6 8 11 13 8 8 8 8 8 9 8 10 12 12 11 11 11 8 11 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 12 15 8 8 6 6 8 8 9 9 10 8 8 6 8 6 7 7 7 8 7 9 13 9 8 10 8 8 8 6 6 8 10 13
10 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 7 6 6 6 6 12 14 8 10 8 7 7 8 8 8 6 6 8 10 6 6 10 8 8 8 10 9 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 9 6 6 6 7 6 6 6 7 8 9 9 12 8 10 12 13 7 8 8 6 8 10 15 22 19 21 10 10 10 21 19 25 14 26 14 21 19 12 12 14 26
21 43 43 43 39 48 48 50 50 50 54 68 41 27 15 11 11 12 11 16 12 12 20 21 42 29 36 42 41 41 41 48 48 48 68 68 44 44 30 30 30 43 43 57 57 57 47 48 48 57
57 48 47 47 39 39 28 28 20 25 21 28 19 26 35 43 50 50 50 50 38 43 43 59 59 59 38 32 15 13 13 15 18 38 43 50 52 52 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 37
37 35 36 32 50 57 57 52 43 43 32 32 29 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 45 45 45 52 57 57 38 32 13 13 13 24 26 41 39 57 43 52 43 43 43 57 52 57 52 52 52
52 52 57 57 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 47 43 35 35 43 47 62 62 62 52 52 52 59 59 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 43 43 44 33
28 43 43 52 52 52 52 43 57 43 43 35 35 35 43 43 52 52 52 52 43 44 31 31 31 42 42 43 57 44 57 52 52 43 44 27 27 27 44 43 52 52 43 43 37 43 43 43 44 59
57 52 52 46 57 57 57 57 50 50 57 57 57 57 57 54 54 46 48 42 46 44 48 48 42 42 44 42 42 42 33 28 32 41 42 44 47 57 47 57 48 48 48 44 44 32 32 18 18 18
32 32 57 57 47 47 48 43 48 47 59 59 59 35 35 28 34 20 23 23 37 37 59 48 48 48 40 40 28 32 23 23 23 34 34 39 41 30 30 30 37 37 34 34 18 16 16 12 12 12
11 11 11 11 13 15 23 30 47 47 59 59 48 53 43 43 41 41 37 43 33 36 43 43 43 43 43 36 36 36 33 33 30 30 28 37 37 44 44 37 37 43 43 26 28 12 12 11 12 12
14 17 15 18 13 10 10 12 12 29 19 27 27 25 16 7 7 6 6 8 13 27 47 59 59 59 43 39 30 28 13 13 13 16 12 10 10 9 10 9 9 11 16 23 13 11 11 12 12 12
12 12 18 12 28 23 41 44 50 59 59 59 47 47 39 37 39 43 37 43 43 43 40 47 43 43 40 40 31 35 37 43 43 43 43 59 43 54 54 59 59 59 57 43 43 37 44 44 43 43
48 57 44 59 43 31 32 20 31 31 47 43 47 42 44 33 33 33 35 32 35 39 37 42 44 42 43 43 43 44 30 37 23 37 28 39 39 48 48 48 59 59 59 43 43 39 39 43 40 28
21 14 14 24 26 28 30 26 20 20 28 34 39 39 39 39 39 39 47 47 48 48 48 47 47 39 35 35 35 43 34 37 32 41 37 59 37 30 35 39 39 41 47 47 37 31 31 35 31 31
41 41 47 47 47 39 34 34 39 43 43 43 37 37 37 43 39 39 37 39 36 28 28 25 26 34 34 28 28 28 23 28 30 26 37 30 30 30 23 23 17 16 15 27 23 25 19 11 11 18
23 32 24 28 18 18 17 23 19 23 24 30 30 37 37 41 37 32 28 20 20 31 32 39 23 23 10 10 13 19 19 33 34 34 40 34 34 28 28 20 13 13 26 26 24 28 19 20 20 32
32 27 21 21 11 19 19 30 28 31 41 41 41 47 47 30 25 13 11 10 10 10 10 16 21 32 30 30 23 20 23 23 32 32 39 39 30 30 25 29 34 33 34 32 37 31 30 25 29 34
33 31 33 32 35 28 29 33 25 15 18 9 9 9 15 13 25 11 8 9 12 15 15 20 16 15 10 10 10 12 15 16 18 12 12 10 10 8 9 9 9 11 17 12 10 9 9 11 11 11
14 12 12 11 10 13 10 10 10 26 26 28 28 14 14 14 24 17 22 23 18 18 11 11 12 14 19 25 15 15 14 19 19 9 9 9 10 13 14 16 16 11 11 11 11 11 10 10 8 9
9 8 10 8 15 24 28 18 22 20 12 11 8 8 8 8 8 9 10 10 17 17 24 22 21 15 13 10 10 9 10 10 10 15 15 16 11 12 10 14 12 14 22 17 11 10 10 10 14 10
10 10 11 11 11 11 9 9 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 10 9 9 9 12 12 8 6 6 6 6 8 8 6 8 8 8 8 9 12 15 12 11 10 15
15 10 10 9 8 10 9 9 8 10 10 12 12 10 9 9 9 9 14 12 12 9 8 10 9 9 10 12 9 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 10 10 11 11 11 11 11 11 16
10 10 10 10 13 14 14 14 17 14 14 11 15 11 9 9 9 9 9 9 13 12 15 17 17 13 9 10 9 10 9 8 10 10 10 12 14 15 15 14 12 20 11 13 9 11 9 8 9 9
10 10 11 10 15 10 6 6 6 6 6 6 13 10 18 19 25 25 24 11 12 8 8 8 8 8 8 6 8 10 12 19 26 26 30 34 25 23 19 17 8 8 8 7 7 6 6 8 8 10
10 11 6 8 6 7 6 6 8 9 9 10 8 10 10 10 10 12 12 9 8 8 8 8 8 9 10 9 9 10 9 8 8 7 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 13 15 8 6 6 6
8 8 10 12 14 15 12 17 11 11 11 11 20 19 8 6 6 8 8 12 12 12 11 13 10 10 8 8 8 10 13 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |