BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-309M20.T7 (MSMg01no309_m20.b1) | MSMg01-309M20.TJ (MSMg01no309_m20.g1) |
ACC | AG433485 | AG433486 |
length | 760 | 743 |
length of high quality (start - end) | 324 (45 - 368) | 293 (77 - 369) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no309_m20.b1 PHD_FILE: MSMg01no309_m20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:51:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no309_m20.g1 PHD_FILE: MSMg01no309_m20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:51:29 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCAGGAGATGTAGCCATTCAGATCTCTTGAGTTCAAGGTCAGTATACA
GAGCAAGTTCTAGGACAGCCAAGCTTAGGCAGTAAATGAGTTGGAAAATA
GAAAGCTGGTGATAATATAATAGAAGAAGAGGGCCATGTTTGAATCTCCA
GCAAGCAGCAGAACTCAGCAGCTTTGGCCATGTATCTCTGGCTTTATAGT
CAAAAATAGAAAAAAATACTGGGACAATTGATGCTGGTTAGCTAGAGCTA
AGGAATTAGCAGTGATTAAGAAGAGACTAGAATCACTGAGGTAAAATCTG
GGAAGTTTTTCTGATATTTCTTAGATACCCCACCCCGCACCTCATGCTGC
AGCTGGTCTTGGCAACATGCCCCAATCTCCCAAAATATACTGGTTTTGAA
GGTATGAATGAGTCATGGAGAGCAGTTGAGGCTTGGCACCATGAAGGAAG
CATAATGGGAGACTATTGGCAAAGCCTAGTTGCAATGAGAAACCCCAGTG
TGTTAGAGATGCCAGTATTATGGTATGACCACCATAAACAGCAGCAACAG
TGGAGTGTAGTCTGCCAGAGCCCATAGTGCTATCTAGAGCCGAGCTGGAG
AAGTGACCCTATCTCTTTTGAGAAGCCCACAAGACCATGTGTAGACTTTA
TACTTTGTATTTTGACACTTAAAAGTTACCTTGGAGAGCTTATGATATTC
ACCGACGCCG
| CCGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTTCTATGATGGGGATTTGTTTT
TGATATCAGAATTTCTCAAAGTTAAGGCCAGATCTCTGGGGTGCTTTGGG
GGTTTAAAGATTGTATAATTTTCTTTAAAAGTATAAAATTAATAATATGT
AGTTAAATATGGAAGTTGAAATCTGTTGAGAATAGGAAAATCTCAATAAA
TTATACATTTTAAGAGTTAGTGTGCTGGTTCTGCCTTTATCACTGTGAAA
AAGATTCTTGTGTTAAGTTATCAGAAGGAAGGTCTGTTTTGGTGTGGAGG
ACTGTACATAACTGTGCTGTTTTTTGGGCCCCCGCCGCAATATGCTGGCT
ATTTCATGGTGGACAGGAACCCCACCACAGACTCAATATCATCATCCAGG
ACACACCTATGATGACCTAATTTCTTCGTAGAGGAAAACTTCTGAAGGTT
TTAAACTTCCCTCAGAGTGTCATCCACTGAAAATAAAGATGTTAAAACAT
GGCCTCTGGTGAAAGAGTCCAGATTCAATTATAGCTGCCTGAGAAATGGT
ATGATCGTGATGTAAACTGCCTCTCTTGCTAGCTAGCTACATTGGAAATG
CTCTTTCTCCCCTAAATTTTTGCCAAAAGTGTTTGTTTTTGTCTCCCCGC
TTTTTTATTATCTCTCCTTCCCCTATTTTCGTCTACCACTTTT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 13 15 34 43 43 37 37 37 31 31 37 24 25 25 28 28 28 48 50 35 35 31 31 31 35 44 57 53 57 48 48 48 48 48 37 37 24 30 30 40 43 68 68 47 47
47 47 51 50 50 50 50 42 42 41 41 41 48 48 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 59 68 59 59 54 52 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 57 59 59 59 57 59 57 59 59 59 57 57 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 54 54 59 59 68 59 57 57 68 57 57 57 57 46 57 57 57 54 54 54 59 59 59 57 57 57 57 57 48 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 57 57 57 57 57 47 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 47 59 41 28 24 14 18 18 21 21 12 12 18 27 37 57 57 54 57 57 48 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 37 47 21 23 11 11 11 14 9 9 9 12 9 11 11 11 11 11 12 19 9 9 9 10 8 8 8 8 10 10 27 34 59 59 59 59 59 43 43 43
43 47 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 34 28 20 12 11 15 13 17 17 16 14 14 19 28 34 28 28 28 17 12 10 10 10 10 15 14 18 18 12 15 19 32 41 59 47 41 28
28 12 12 12 25 25 34 39 32 34 25 25 25 34 30 30 30 37 37 43 43 43 43 46 46 46 46 57 48 48 48 48 43 59 43 43 36 36 36 43 43 43 42 36 32 32 30 36 37 42
39 43 39 39 35 32 41 41 30 28 32 41 47 59 57 57 34 32 20 20 20 28 32 42 42 32 32 20 20 32 32 43 37 43 43 42 38 21 18 13 22 19 42 30 30 28 28 25 40 29
37 24 19 19 27 17 15 24 22 37 28 30 30 36 33 35 32 42 39 43 40 31 28 20 20 25 30 23 28 14 14 12 24 15 19 15 23 15 19 19 13 13 12 11 11 17 11 11 16 19
28 15 14 14 13 21 13 12 10 10 10 10 10 10 17 15 17 17 19 19 28 32 28 15 15 12 12 12 10 8 10 10 10 10 12 8 10 8 10 10 9 9 10 10 10 15 13 16 15 15
16 15 15 11 12 11 12 12 10 11 10 10 10 10 10 10 19 23 15 13 11 11 10 10 10 10 13 10 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 9 9 11 12 9 9 9 10 10 8 8 8
10 10 10 10 13 10 9 9 9 9 11 11 11 9 8 8 8 8 13 10 11 11 9 9 8 8 13 12 12 12 10 10 11 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 7 8 8 10 10 8 6
6 8 8 8 6 6 6 6 8 6 | Open.Hide. 6 6 6 6 10 10 10 8 8 15 19 35 32 37 41 41 41 50 50 50 50 53 53 53 53 53 53 57 57 53 44 27 17 10 10 10 10 10 12 12 19 19 36 25 42 42 48 54 54 51
51 51 51 51 51 68 68 68 68 54 44 42 15 19 8 8 8 10 12 24 17 37 42 42 47 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 47 47 42 47 47 51 68 68 68 59 59
53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 36 36 36 33 33 33 47 34 32 23 8 8 6 6 6 8 19 26 41 42 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 57
57 59 59 59 59 59 59 50 50 47 47 47 42 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 44 32 24 21 18 22 18 20 20 28 34 40 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50
50 50 50 50 57 50 50 50 50 50 59 59 37 30 24 11 11 9 11 11 13 15 13 13 12 11 11 11 11 11 9 12 9 9 12 13 15 11 11 11 15 24 32 41 46 50 50 44 59 40
43 43 48 48 50 57 48 48 43 43 40 43 40 41 40 39 28 27 12 10 9 10 9 9 8 8 9 9 9 9 9 15 15 18 21 14 14 12 10 8 6 6 8 21 21 39 31 28 28 28
28 28 28 28 28 28 33 37 43 57 57 57 48 50 57 57 48 48 48 48 48 48 50 50 48 41 47 47 47 32 32 20 22 22 31 27 37 37 37 37 37 59 41 41 32 31 37 37 37 37
37 37 35 35 35 35 39 47 57 47 50 47 43 43 24 24 10 10 10 24 16 21 19 19 9 9 9 9 23 22 25 25 24 27 19 17 19 24 17 16 9 9 9 14 11 18 21 15 19 10
8 8 8 8 8 10 11 10 11 18 19 22 22 26 24 24 16 16 11 15 16 16 14 9 9 9 13 22 20 15 8 8 8 10 15 22 24 25 24 20 15 9 9 11 10 14 14 14 14 14
13 13 10 10 10 12 10 10 13 15 19 8 8 8 8 10 10 10 8 8 11 10 10 13 15 19 19 19 19 16 9 9 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 14 13 17 11 11 11 10 8
10 8 10 10 17 18 11 11 11 23 17 9 9 10 9 9 12 18 16 12 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 9 9 10 14 18 12 12 8 9 9 9 9 10 13 13 13
11 10 13 13 9 9 10 10 8 10 10 10 9 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 8 10 8 8 8 8 8 |