| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-391A22.T7 (MSMg01no391_a22.b1) | MSMg01-391A22.TJ (MSMg01no391_a22.g1) |
|---|
| ACC | AG492922 | AG492923 |
|---|
| length | 785 | 810 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 340 (63 - 402) | 281 (74 - 354) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no391_a22.b1 PHD_FILE: MSMg01no391_a22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:35:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no391_a22.g1 PHD_FILE: MSMg01no391_a22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:35:09 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (106,314,524 - 106,314,859) | (106,158,262 - 106,158,542) |
|---|
| sequence | GCGGCGCTAAACGACTCCTATAGTTCCACATCCGCGGAATTCCCAGCTAT
GTCCCCTTACGCAAATGGCTTGACCTCTCTGGGCAGACATTCTGCTATAT
ACAGATAAACAACTTTAATTTGTAGAGCCATTGGGAATATTCAGTGACGA
GCCTCGCACACAGGGCTCTTGGCTTTTTCCTCCCACTGGGCAGGCATCTC
TGCCTGCTCCATCTTACATCGACTTCTCAGGGCTTCTCTGGCAAGTCCTT
AGCTTGTCCTTCACACTGAAAACAATTGATTTGTCAGCTATTTGCCAGGG
ACTTTCCAAGGGCCTTTGGGAACAGGAGCGATAGGCTGGGACTAAAGCAG
CTACAGATTCCTGTGCTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCC
CCCCCCCCCCCCCGTGTCCCCTCTTTTCCCCTCTCCCTTCCCCCCCCCCC
GCTGCCTTCCCGTCTCCCTCTTTCCCCTCCCCCCCCCCCCCCTCCCGTCT
TTGTTTTTTNCCCTTCCCCCCCCCCTCCCCTTTCCTTCCTCCCCCCCCCT
TCTTCACCCACCTCCCCCCCCCCCTTCTTCCCCCCTACCTACCCCCCCCA
CCCCCCTCTTCTCTCTCCTCCCTCCACAGCTTTCTTTCTTTCCCCCCACC
CCCCTCTTCTTCCTCTATCCCCCCCCCCACCCTCCTCCCCCCCCCTCGCC
CCCCTCTCTTTCTCCCTCCCTTCTATCTCCCCCCCTACCCACCCCCTATT
TTTCGTATACTCTCTCCCTCCCTTCCCCCCGTTCT
| ATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCACCTATGAATAAAACCGATGTGGTTG
CAGTTACCCGTAATCCCAGCATTCCTGCAGGAGATGCAGGGCAGAGACAT
GGAGAGCTAGCCTGGAGAACTCGGGTATAGAAATGATAAAGGGGGCCCTG
CTGCAGAAATAAGATAGACGGAAAGAACCCAGTCATTGAAGCTGGCCTCC
GAGTTCCACGTGCACACTGTGACACACACACAACCATAGTCACGCAGGAA
ACAAAATAAGTCACTATAAGAAACTGTTCTTTTTTTAGGGGAGGGGGGTT
TTCGAGANNGGGTTTCTCTGTNGTCCTGGGTGGCGTGGAACTCCCTTTGC
CCACCTATCTGCCCCCCCCCCCTCATATCTCCCCCCTAATATCCGCCTGC
CTTGTCTCCTCCCTGTTGGTTATCCCCGGTCCTGTTCCCCCCTCCCTCCG
CCCCCCCCCTCCGCGTTCTCCTATCCCCGCCCCCCTGTTTTTCCCTCCTC
CCCCCTTCCCCCTTCACTTTCCCCCCCCCCTTTCCCGCTTGCGTGTCTTT
CCCCGCCCCCCCCTTCGTCCCCCCCCTCCCCTTTCCCCTCCCCTCTTCTC
CCTTCGCCCTTTCTCCATTTGCCTTTCTTTTTCCCCCCTTTTTTCCCCTT
TCCTTCCTCCCCCCCCCACCCCTTTCTTTCCCCCTCCCCCTTTTTCTCCC
CCCCCCCCCCCTTCTTCCCCCCTTTTCTTCCCCCCTCCCCTTCCCCCCTT
TTCCTCCCCN
|
|---|
| quality values | Open.Hide.11 14 10 13 10 8 8 10 8 8 8 17 17 22 19 11 11 11 26 25 21 17 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 12 15 15 19 13 17 15 17 8 8 9 12 15 14 27 18 23 11
11 11 12 11 21 25 22 20 11 10 10 15 16 20 28 30 37 37 30 30 39 41 59 57 39 39 39 42 39 40 40 44 44 57 57 43 43 37 36 33 43 33 36 30 39 39 48 59 48 36
33 28 28 28 33 37 41 28 27 16 16 17 23 32 39 41 41 50 41 44 47 37 39 35 35 35 30 34 25 28 28 32 34 59 47 47 42 42 42 42 43 36 36 32 43 43 57 57 57 57
46 46 43 46 46 43 39 39 39 39 37 37 33 43 37 37 37 42 42 42 44 44 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 54 54 48 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 68 68 68 68 59 59 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 68 57 57 52 50 43 38 24 13 13 15 26 41 29 57 48 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 43 43 43 48 57 57 57 59 59 54 59 59 68 59 59 59 59 57 59 47 48 43 43 43 47 47 48 59 57 48 48 48 57 47 47 46 46 43 59 59 48 47 23 15 9 8 8
10 10 13 12 10 8 10 8 8 10 11 10 10 10 10 10 13 15 12 14 14 10 10 8 11 9 9 9 12 12 10 10 11 11 17 22 16 9 9 9 9 9 9 21 14 19 9 9 8 8
8 8 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 15 15 8 11 9 14 10 10 9 9 9 16 19 12 8 8 13 17 12 13 13 10 10 8 7 7
9 9 9 10 10 14 10 10 3 0 3 11 11 9 9 10 15 15 20 15 15 9 6 8 8 8 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 10 11 7 7 8 8 13 20 18 22 16 13 6 8
6 6 6 8 11 11 10 10 9 9 8 8 8 9 10 9 13 13 10 10 10 9 9 9 9 9 11 10 10 11 18 17 21 9 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 21 25 13 9 8 8
8 13 15 15 15 10 10 10 8 8 8 12 8 12 10 12 8 9 8 10 13 14 10 8 6 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 8 8 10 9 9 9 11 16 19 23 19 8 6 6 15
17 15 10 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 7 7 8 8 8 8 10 15 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 10 8 8 10 12 10 11 24 22 19 8 8 8 8 8 8 8
10 10 12 12 19 11 11 11 10 9 9 9 9 10 9 9 12 10 13 13 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 12 10 12 9 9 9 19 11 11 11 20 20 14 10 10 10 14 23
10 10 6 6 8 8 8 8 8 6 6 10 12 8 8 8 10 8 9 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 9 13 8 8 8 | Open.Hide. 9 15 8 8 8 8 7 7 9 9 14 14 29 27 34 25 30 34 34 35 37 37 33 25 28 28 28 30 21 16 9 9 11 11 11 10 12 16 16 28 21 32 32 29 36 37 32 33 30 33
33 33 44 50 50 59 41 33 20 12 14 9 9 9 20 20 30 19 28 28 28 31 36 36 36 36 42 59 57 57 42 42 47 47 53 53 57 57 48 48 50 54 54 54 68 68 68 68 48 48
48 48 47 50 57 59 59 59 59 48 48 48 48 57 50 50 47 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 48 48 41 41 41 41 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 47
50 50 57 57 50 57 57 57 57 57 57 54 57 52 57 57 57 57 52 52 52 52 43 44 43 52 52 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 52
59 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 57 57 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 57 68 57 57 57 57 59 52 57 59 59 59 68
57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 57
57 54 54 54 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 43 28 19 16 13 10 10 10 16 26 40 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 47 47 39 33 33
30 30 17 17 15 20 3 0 0 3 11 11 11 21 21 30 23 19 15 11 3 0 3 9 9 18 15 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 11 10 9 11 8 9 11 9 6 8 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 12 10 9 14 8 9 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 7 6 8 8 8 8 9 10 10 19 12 16 12 12 11
13 14 13 10 10 8 8 8 10 10 10 12 10 10 10 10 9 10 10 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 14 11 23 32 21 21 10 9 8 8 8 8 8
8 12 10 12 25 30 27 19 9 10 8 8 13 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 17 17 15 14 15 14 10 10 10 10 16 16 24 19 16 10 8 8 8 10
10 11 8 9 10 10 11 11 17 20 19 10 9 9 8 8 9 12 12 15 19 12 8 8 10 9 10 8 10 10 8 8 8 8 8 6 7 9 12 8 9 9 8 10 10 8 8 10 13 14
15 16 23 13 13 12 14 19 28 37 17 16 9 12 9 8 8 6 6 8 10 22 27 21 11 8 11 8 8 8 12 8 9 10 10 12 15 10 10 8 6 10 8 8 8 8 9 13 12 9
8 12 10 8 8 8 8 10 11 10 14 13 12 10 10 7 7 9 10 9 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 11 10 10 16 13 14 10 10 10 11 10 10 9 9 10 11 15 14 10 10
8 9 10 10 6 7 6 6 8 11 25 23 19 13 14 14 8 9 10 15 10 13 10 9 9 9 10 9 9 12 12 15 10 9 12 12 14 16 18 14 11 9 9 10 10 11 14 12 12 9
8 8 9 19 16 20 18 18 15 18 13 19 17 14 16 12 14 11 11 8 8 8 11 12 15 15 13 16 13 14 18 13 10 9 8 8 8 9 9 10 20 20 12 16 16 16 16 10 14 11
14 13 9 9 12 19 14 13 3 0 |
|---|
