BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-391N18.T7 (MSMg01no391_n18.b1) | MSMg01-391N18.TJ (MSMg01no391_n18.g1) |
ACC | AG493531 | AG493532 |
length | 771 | 843 |
length of high quality (start - end) | 317 (62 - 378) | 137 (82 - 218) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no391_n18.b1 PHD_FILE: MSMg01no391_n18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:36:12 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no391_n18.g1 PHD_FILE: MSMg01no391_n18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:36:12 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CGGCCGCTAAACGACTCACATTTTCAGAACATCCGCGGAATTCTGCACAT
TTCCGTAGATCATATAGCACCCTCCACCAACACTGTGTCTCTTCATACAA
TCCAGGAGCAAGCCCAAGCAATCTGCAAGGTCTTATCCACAGCATTTGAC
TCTGTGTTGACCTCTGACAAGTCCTGAACTCTGCAGGCAAGTGGAAACTG
ACCCACGGAGCTTACCTGTTCCTACATCTATCTGCAGCTGTGGACTATTA
GAGGGTGTAATGCCCTGACCCGGTTTTCTAAAGTGTAATGTATGAAATAT
TGGTTTTATTCTAAAAGGTGTTAACAGTAGGTCAACTTCCAATAAATTAC
CTGCTTTCTGGACAAAAGAGAAGCCTTGGCGTCTGGACAGATGGCTTGGC
ACCTCCCCACCCCCTGCACAGGATCTGGGTTCAGCTCCCAGCACCTATAT
GGTGGCTCCCAACTGCCTGTAACTCCTGTGCCCCGACATCCTACTCCCCC
CCCCTGGCTTCCTCCGCCAACCCCCCCCCCCTGTCTATTCCCCCCCCTAC
CTCCCTGCCAGCTAATCTTATATTGTCCCCCACACCTTATATCCTCCTCA
CCGACCTTTTAACCCCCCGCCCCCTTCCTACATTTCCCCCCCCACTCTCC
CCCTTTATTTTTTCCAACAACCCCCCCCACCTCTCCTTTTTAATAATAAC
CCCCCACCCCCCTCCCATTTAATCTCCCCCTATTTTTTTCCTATCCCCCC
CCTTACTCCTTTTCCCCCCCC
| AATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXTTTCGAGAACATTCATCAGGNAGACTGAAGTGGAAGTCAG
CCCTAGTGGATGAAAGGTTGGCTGGTTTCTGTTAAGCACAGAAGACCATG
TGGTAATCTGGTTTCAAGGCATGCTTTTTGGTTTTTGTTTTCTTGAGACA
GAGTCTCACTATGTAGCCCTGGCTGACCTGGAACTCACTATGGAGATCAT
TTTTTTCTCAAACCCACTGACACATACCTGTCCCTGCCTCCCAAGTGCTG
GACACCAAGGCAAGTTCTTCCTCGCTTGGACACCCCCCGGCGACACCACA
ACCAAAATTTTTTTTTCTCTCCCCATGCGCGGGGGGGGTGAATATTTTTG
CCTTTCAACCCCCCACCCCCCCTCTTTATTTTTATCTTTTTCTCCTCTCC
TTTCTTCTCCCCCCCTCATTCCCCCTTTTTTGCCCCCTCCCCTCCTTTCT
CTCTTCCCTCCTTTCTCCCTCCCCACTTCTTCCCCCTTCCTTCCTTCCTT
CCCCCCCTCCCCCCCCGCCCCCATTTTTTTGCCCCCTTTTTTCTTCCCCT
TTTCTTACCCTCTTTTTCTTACTTCATCCCCCTCCCTCTTTCCCTTCTCC
TTTCCTCCCCCTTTCCCCCCCTCCACCTCCCAACCTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTCCCCCGCGTGCCGCTTCCCCCTTATCCTCCACCCACCTTCCCCG
CCTTCTCTCTATTTCCCTTGTGCCACCTATCGCCTCCTCATTTCTCCTTA
TTTTCCCCTTTACTTTCCTTTTTTTCCCCCTCTCTCTCTCCCC
|
quality values | Open.Hide. 7 7 9 9 9 17 11 12 9 7 8 22 22 41 21 19 10 8 8 8 11 7 7 7 6 6 6 6 8 8 8 8 10 15 15 15 24 21 33 33 33 31 31 31 23 19 8 8 7 9
10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 15 26 28 33 39 44 41 47 48 48 59 36 36 33 28 32 33 24 23 42 42 42 42 57 57 57 57 57 59 48 36 36 23 23 18 42 20 25 25
36 42 42 37 36 36 28 44 25 32 36 37 37 37 37 37 37 42 44 57 57 57 44 57 40 57 57 57 57 59 59 43 57 57 57 57 57 47 47 37 42 37 50 57 57 57 57 68 68 57
57 57 57 47 57 52 52 52 52 52 50 50 50 54 52 50 50 46 47 52 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 52 57 57 57 52 52 57 57 68 68 59 68 68 59 59 59 59 59 59 50 50 50 48 48 48 57 57 57 57 57 68 57 57 57 48 48 48 43 43 43 43 57 57 57 68 59 59 68
68 68 68 59 68 59 59 54 54 57 46 57 54 54 57 50 50 48 48 42 42 41 34 30 30 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 59 59 57 48 48 48 43 37
37 30 30 32 37 32 21 17 11 11 11 11 12 12 18 23 26 37 37 37 37 39 43 43 37 39 35 35 35 35 32 34 20 32 32 43 47 48 48 48 54 54 54 54 54 40 32 31 29 35
31 36 28 40 40 54 47 44 41 28 28 30 36 30 32 37 33 33 30 30 25 28 28 32 28 27 22 12 11 12 12 12 21 28 18 18 18 30 29 37 24 24 14 14 14 25 23 10 8 7
7 8 7 9 9 15 14 10 10 10 10 10 10 10 10 18 10 8 8 8 10 10 15 19 15 17 11 11 16 11 17 11 10 9 9 9 9 15 18 19 13 12 12 12 11 11 12 10 12 12
10 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 15 11 11 11 11 15 18 17 14 10 10 9 10 15 14 11 9 10 9 9 9 10 13 8 8 7 7 8 10 16 30 26 30 32 26
17 10 10 9 11 8 12 9 9 12 14 9 9 9 6 6 8 8 8 6 9 15 15 19 16 13 16 13 17 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 13 17 18 15 8 8 6 7
8 8 10 12 13 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 6 6 10 10 19 11 10 8 8 8 8 15 8 8 6 7 8 8 9 8 6 6 6 10 10 10 9
10 9 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 9 9 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 9 12 8 9 12 12 12 13 11 8 8 8 16 16 13
13 18 19 15 13 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 17 17 26 13 8 8 7 7 11 12 11 8 8 10 17 16 21 18 17 12 11 11 10 13 10 9 9 10 10
13 15 19 17 7 7 8 15 22 19 19 8 8 8 8 8 10 10 13 8 8 7 6 6 6 6 11 17 19 10 9 9 8 12 15 14 16 10 12 10 10 8 8 8 8 15 16 22 10 11
9 8 8 10 6 6 6 6 8 8 7 7 10 8 12 19 30 13 9 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 9 9 9 23 17 30 28 28 33 31 31 37 39 25 27 3 0 3 3 0 3 27 21 12 23 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 19 19 33 33 33 33
33 33 37 37 37 23 23 8 6 6 6 7 6 8 6 6 6 6 6 6 10 12 16 18 22 26 33 21 21 3 0 3 29 29 39 41 42 37 39 41 50 53 53 53 57 44 48 48 48 48
48 57 59 59 48 57 57 47 50 50 47 47 41 43 37 37 37 34 21 19 8 8 8 8 8 28 28 41 39 39 37 39 39 59 48 48 57 57 57 57 44 43 43 43 43 44 48 48 48 48
48 43 43 39 39 42 42 31 29 21 15 15 17 30 32 48 32 28 13 12 12 11 11 11 19 21 36 29 32 44 43 43 43 57 59 59 68 59 59 59 59 59 44 36 37 40 40 48 48 47
42 42 30 30 23 34 21 34 34 41 37 40 28 30 13 13 12 19 23 24 14 14 14 16 24 19 23 19 27 13 17 19 30 28 37 28 30 21 28 18 18 11 12 12 15 18 11 9 10 12
19 21 21 16 11 12 16 18 12 11 11 23 12 12 11 12 9 10 10 12 12 11 11 8 8 6 6 8 15 16 30 39 34 34 28 24 22 12 12 12 15 12 12 12 30 30 30 26 10 9
9 9 8 10 16 20 30 18 19 12 12 11 11 11 11 9 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 15 8 10 8 7 8 8 9 9 9 9 9 8 10 8 6 6 6 6 11 6 6 6 6
6 9 10 10 10 13 9 9 16 10 17 17 15 19 10 9 8 8 6 7 6 8 10 11 18 18 15 15 11 11 11 11 11 11 11 13 10 13 16 13 11 11 11 10 11 11 12 10 10 10
10 11 11 11 10 10 9 8 8 14 13 10 10 11 11 13 19 21 23 23 20 10 11 11 11 10 10 11 16 16 17 15 10 10 10 10 10 12 12 10 12 17 15 8 8 9 9 8 9 10
10 8 8 9 10 8 13 13 8 8 8 8 8 8 8 13 6 6 8 8 8 8 10 8 6 7 10 10 8 8 6 6 6 8 8 15 15 10 10 8 8 8 12 8 8 8 12 12 12 12
10 15 15 11 11 15 14 20 15 19 11 9 10 15 15 25 22 22 22 27 22 18 23 11 10 10 8 8 7 6 8 8 11 10 19 19 18 18 17 21 15 10 14 15 14 20 20 17 16 14
10 12 11 17 10 10 10 10 13 15 12 12 12 16 17 10 10 9 15 10 10 9 11 11 17 17 28 21 13 8 6 6 10 15 13 12 9 9 11 14 24 18 13 13 18 14 9 12 9 7
10 8 10 10 10 13 8 8 9 11 6 6 6 8 10 12 14 14 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 16 15 11 9 9 9 10 10 15 15 15 14 14 19 17 19 15 10 10 6 6 6
6 15 18 21 14 14 14 18 19 23 18 18 18 19 26 14 14 14 24 16 18 15 15 10 9 8 10 11 9 9 8 8 8 8 10 14 16 17 16 16 14 18 21 23 23 24 29 29 39 37
34 30 21 16 20 24 25 27 22 16 10 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 11 9 9 9 10 10 13 11 8 8 15 13 8 8 8 15 10 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6
6 6 10 12 11 12 8 8 8 8 9 8 8 10 12 8 8 11 8 8 7 6 7 8 8 10 10 15 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 13 8 8 8 8 18 13 21
19 15 12 9 9 10 10 11 10 13 9 9 9 10 12 13 11 11 11 14 14 16 9 8 7 6 6 8 17 17 17 12 12 10 12 9 9 12 7 8 8 8 8 |