BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-499I04.T7 (MSMg01no499_i04.b1) | MSMg01-499I04.TJ (MSMg01no499_i04.g1) |
ACC | AG575575 | AG575576 |
length | 730 | 702 |
length of high quality (start - end) | 544 (89 - 632) | 617 (62 - 678) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no499_i04.b1 PHD_FILE: MSMg01no499_i04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:25:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no499_i04.g1 PHD_FILE: MSMg01no499_i04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:25:54 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GGATGATGACGTAGAAGTGGCGGGGGGTAGAGGAGTCTCTATAGTTCGAG
AATGGGCGGAATTCTCAACTGAGTCACACAGAATGGCTGAGAAGCACCTA
AAAAGTGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACC
CTGAGATTCCACCTCACACCTGTCAGAATAGCTAAGATTAAAAATTCAGG
TGACAGGAGATGCTGGTGAGGATGTGGAGAAGGAGGATCACTCCTCCATT
GTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACTACTCTGGAAATTGGTTTGGCAG
CTCCTCAGAAAATTGGTCATGGCTCTACCAGTTTTTTCAGCAATACCACT
CCTGGACATATACCCAGAAGGTGCTCCAACTTGTAATAAGGACACATACT
CCACTATGTTCATAGCAGTCTTATTTATAATAGTAAGAAGCTGGAAAGAA
CCTAGTTGTCCCTCAACAGAGGAATGGGTACCAAAAAATGTGGTACATTT
ACACAGTGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAACAATGAATTTATTAAATTC
GTAGACAAATGGATGGATCTGGAGGATAGCATCCTAAGTGAGGTAACCCA
ATCACAAAAGAACACACATGATATGCACTCACTGATAAGTGGATATTAGC
TCAGAACCTCAGATTAACCAAGATACTATGTGCAAAACACATGAAACTCA
TGATGAAAGAAGACCAATGTTTTGGATACT
| GXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXTCCCACACTGTGTTCCAGAATAGTTGATCTAAACCTTGAACA
TGCATTTCAGCCATAGCCATATACTATTCCCATTTTCAGACCCTAAGATC
TATGAAACAAAGTTTAAATTAATAACCTACTTTGCTTTTTGAGATAGCTT
TACTCTAGAGGCAGGGATCAGGTCCACATTTGACATTCAGACAGTGCTGA
TGTGACGCAATCCAGTTAATGCAAAAGTAACAAGTCTATTATTGCAACAG
TAAATGCTGTTTTATTTATGATTTCTTCATGAAGTTATTTTGAGACCAGA
TCACAAGATCTTGTACCCGAGGCATTTTTCAAACTTACTATGATACCAAT
GATGACCTTGAACTTCTGACCCTCTTCCTTCTTTCTCCCAGTTGCTGGTA
TTAGCTTATGCCATCACACCATCCAGTTTATAATGTGCTGAGGCTTGAAC
CCCAAGCCTTTTTTTTTTTTTAATTCAGGAATGTGATTACAAACTACAGT
CCAACTAAAAGAATAAAAAATGTAAAGCAGGCCTCAATCCAATCAAGAGG
GCAGCTAGTTTTCCATATAAATTGTCTTACTTATTTATGGGTACATATTA
CAGGCCATCGTTGAAGGCCTTATCTGTTACAGGGTTCAGAAATAGATAAG
AG
|
quality values | Open.Hide. 9 10 10 11 19 22 19 9 9 9 11 12 11 13 12 10 10 9 10 9 18 18 10 9 9 9 10 12 12 10 9 10 8 6 8 8 6 9 11 23 23 8 6 6 6 7 6 6 6 9
9 10 9 9 9 10 11 11 21 21 27 30 33 31 31 31 30 21 19 9 9 9 9 6 6 6 6 7 7 12 12 11 17 17 15 15 15 13 18 21 26 36 48 53 57 57 59 59 59 57
48 57 47 50 50 50 50 53 53 50 48 54 43 47 43 43 57 57 54 50 50 48 48 48 44 44 23 21 13 23 16 23 30 32 42 47 57 42 42 42 42 47 57 57 57 57 57 57 57 59
57 48 48 30 30 17 30 30 42 47 54 57 57 57 48 48 57 59 68 68 59 57 43 43 35 35 35 43 43 57 57 57 59 59 52 52 52 57 57 57 59 57 57 57 57 43 43 32 43 43
57 57 57 57 50 57 57 57 57 46 50 50 50 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 59 59 59 68 51 51 50 50 50 50 59 57 57 57 59 59 57 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 44 43 43 43 44 47 59 59 68 68 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 54 54 54
54 54 59 57 59 59 47 47 43 40 40 50 50 47 47 57 48 48 57 59 57 53 53 50 50 50 41 32 32 15 15 9 12 11 8 10 8 8 8 10 15 19 34 41 59 59 50 50 50 50
57 57 57 53 53 53 53 50 57 59 59 59 57 50 50 53 53 68 68 59 59 57 34 43 24 28 20 32 32 46 48 59 48 54 54 59 59 68 59 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 48
48 48 48 48 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 47 43 43 57 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 44 59 59 44 35 42 42 35 35 32 43 43 57 57 57 57 57 52 52 52 57
52 43 43 33 33 35 43 43 52 43 43 43 43 42 32 43 43 52 52 43 43 39 43 43 52 57 52 52 52 52 43 43 43 59 59 52 52 52 52 52 43 36 32 17 17 32 38 52 54 52
52 57 57 38 38 18 18 18 38 38 38 36 20 32 32 43 43 44 43 43 37 44 50 42 42 41 32 32 50 44 39 37 37 44 42 46 57 57 47 44 37 35 35 42 42 37 43 43 57 47
36 36 25 25 37 30 30 20 31 31 39 37 37 32 32 37 42 33 30 25 36 37 30 28 33 37 43 39 39 35 35 32 42 42 42 42 33 39 30 28 28 29 29 29 28 39 39 39 36 37
37 37 37 37 37 37 28 22 28 27 23 24 33 28 27 27 22 21 21 29 25 28 28 36 32 36 35 28 28 20 20 19 26 21 23 25 18 18 15 19 11 15 12 11 11 17 17 25 30 34
30 30 18 15 12 13 13 14 21 12 10 9 8 10 13 9 8 10 11 11 11 11 11 8 8 8 8 13 12 24 22 26 13 13 12 12 19 19 19 17 10 10 13 17 11 11 13 12 14 10
8 8 6 6 6 7 9 9 9 12 10 10 10 11 11 8 8 8 8 9 16 27 21 17 16 13 15 10 13 12 | Open.Hide.12 15 19 14 9 9 19 25 41 47 59 59 59 29 21 9 9 9 7 7 9 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 21 21 42 50 50 42 41 33 25 17 12 10 12 9 9
9 11 12 12 12 12 14 17 18 19 18 14 21 26 33 37 47 59 59 59 59 50 42 37 37 47 47 47 47 47 47 47 47 47 51 47 68 68 68 59 59 54 54 57 59 59 50 50 50 47
42 41 39 39 41 48 42 41 37 41 41 47 46 57 57 44 44 28 30 35 44 44 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 51 47 47 50 50 51 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 37 37 37 43 50 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59
59 57 57 57 43 43 43 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 47 59 52 52 52 52 52 57 57 62 62 62 62 68 68 62 62 43 43 35 35 26 35 35 43 44 62 62 62 62 62
62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 41 41 41 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 41 39 39 15 15 11 18 18 38 38 52 43 43 44 44 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 52 62 62
62 52 52 62 62 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 50 50 50 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 54 54 48 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 44 48 48 48 48 48 57 68 57 57 54 48
48 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 41 37 37 30 30 25 27 39 32 34 28 28 28 37 37 37 37 30 30 30 37 39 43 43 36 36 36 43
40 39 36 36 43 43 57 43 43 36 36 36 39 39 37 43 44 39 39 31 32 22 22 23 30 31 37 37 31 28 19 24 24 32 23 23 31 28 37 30 39 37 37 37 37 33 37 36 31 32
36 37 37 39 39 39 40 37 31 31 39 39 39 39 35 35 35 35 30 37 32 24 22 11 11 11 22 22 39 33 33 28 28 24 30 34 39 39 32 36 20 28 25 32 32 37 40 32 30 25
22 18 14 13 16 20 34 26 31 25 24 24 30 25 31 31 28 24 22 27 28 27 27 30 30 17 17 15 26 19 22 17 24 18 17 12 16 11 11 11 21 14 18 16 21 20 24 17 11 11
11 11 |