BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-509F05.T7 (MSMg01no509_f05.b1) | MSMg01-509F05.TJ (MSMg01no509_f05.g1) |
ACC | AG583029 | AG583030 |
length | 755 | 773 |
length of high quality (start - end) | 620 (48 - 667) | 559 (80 - 638) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no509_f05.b1 PHD_FILE: MSMg01no509_f05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:38:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no509_f05.g1 PHD_FILE: MSMg01no509_f05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:38:32 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NAATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGCGC
GGAATTCTTTATTTCACTCTGTACTCCATTTTTAATGGGGTTATTTGAAT
TTCTGGAGTTCAACTTCTTGAGCTCTTTGTATATATTGGATATTAGTCCC
CTATCAGATTTAGGATTGGTAAAAATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGCCT
TTGTGTCTTATTGACAGTGTCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAGTTTTA
TGAGGTCCCATTTGTCAATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTT
CTGTTTAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCTAC
TTTCTCCTCTATTAATTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGGTCTTTGA
TCCACTTAGACTTGAGCTTAGTACAAGGAGATAGGAATGGATCAATTCAC
ATTCTTCTACATGATAACCACCAGTTGTGCCAGCACCATTTGTTGAAAAT
GCTGTCTTTTTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATCAAGT
GACCATAGGTATGTGGATTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATTCCATTGA
TCTACCTGTCTGTCATTGTACCAGTACCATGCAGTTTTTATCACAATTGC
TCTGTAGTACAGCTTAAAGTCAGGTTTATCTTTCATCTAAGGGTTTCAGA
GCATCAGGTCTTATGTTGAAGTCCTTGATCCAGTTGCCGCAGAGTTTAAT
GAAGG
| NNCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGACCTGAGGGTGCTACATAG
TGAGAGCCTGTCTCAAGACAAACAAAAATAAATGGTAAGATAAATAAAAA
AGAAACCCAAAATGTCAAAGGATGTTGCTGTTAGCAAGGTCTGTATAGCA
AAAGGACTCTGACCCACAGAATCTCAACTCATCAGAACAGCCAGACGCCT
TTACTTTTTGTTTAACTAAGGAAGCAGGGTGGATTAACTCCGTTCAACCT
CTAACTTGCATCCGTGTCTCCTATTTTCCACAATTATATTAACTTTAAAA
ACTGTCTTTTTATTAGTTTTAAAGTCAGTTACACAGGACTGGGTGTCATC
ATACATGTGCCATACATGGTTCGCATACACATGTGCCATTCTGTTCACAT
ATTCCTCTGTTCACATCTGTTCTCTTCCCCACTGCCAGACCTCCCTTGTA
CCCTTGTTTCCCTTCTTTTACAGACAGTCTCCTCTTCTGTCTTCTTATTT
CATATAGGAGCTGGTGAGCCAGCCAGCCTGACATAGGCACGTGCAAACAA
CAACAAAAAAGACACTCAGTCTTAAACCAGGTGGGAGAGAAGGACCAAGC
TTTAAGGCTGTCCTCTGACCTCTATGCATTCCAGAGCACGTGTGCCCCTG
CACTTGCAACACATGCATACACATAGGGAAAGAATGGAAAATCACACCCC
ACCCCAACCACTTGTTAAATATT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 8 10 10 11 10 19 8 3 0 3 17 12 16 16 27 30 19 19 14 30 41 31 30 29 21 17 9 9 7 8 6 6 8 8 9 11 17 11 11 6 6 6 15 21
59 30 33 33 33 33 33 41 41 41 34 24 15 10 10 9 9 15 26 34 37 40 40 40 26 26 24 24 35 36 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 53 53 68 68 68 68 44
44 36 43 43 43 44 68 44 42 26 29 30 32 24 32 31 32 35 41 41 59 31 31 24 31 42 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 51 51 51 68 34 32 12 19 24 33
35 37 44 24 26 12 28 28 51 51 51 68 48 48 46 46 46 48 57 68 68 68 68 43 43 32 32 35 38 44 38 32 32 28 28 43 32 33 38 44 44 68 68 68 59 38 30 14 14 30
38 44 68 44 44 33 33 42 44 57 68 57 44 42 35 35 44 44 44 29 29 41 44 44 44 38 26 26 35 38 26 35 20 43 43 43 20 20 43 43 62 43 39 35 59 59 68 68 68 68
68 68 68 41 41 26 26 35 35 35 44 44 44 44 31 31 35 44 44 35 35 35 26 26 44 43 43 43 44 35 27 26 43 43 39 43 43 44 39 27 27 35 44 44 52 52 52 44 44 31
39 39 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 43 44 39 39 35 31 29 29 39 39 52 45 45 52 52 62 62 52 52 43 43 35 35 44 44 68 68 68 44 44 52 52 52 52 52 62 62
62 62 43 41 35 35 35 43 35 35 62 44 68 68 68 62 62 43 43 35 44 44 44 35 35 41 41 41 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 31 31 43 44 62 62 59
35 35 31 31 39 27 38 38 38 14 32 32 44 44 44 31 31 36 41 41 38 38 22 24 35 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 42 39 35 44 44 35 29 29 36
43 44 38 33 33 33 35 32 38 32 35 44 44 68 57 44 43 35 33 33 32 32 18 38 41 59 59 44 38 28 18 14 28 28 30 18 29 29 44 41 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57
43 43 36 44 28 28 36 44 59 44 44 24 24 17 19 25 36 44 44 57 57 57 59 59 59 57 44 44 24 24 18 23 28 30 23 34 32 23 23 20 32 34 34 28 23 18 25 40 43 43
43 33 25 25 19 34 34 57 48 59 59 59 59 59 48 48 34 34 28 23 23 34 41 32 32 30 31 34 28 20 15 26 23 17 17 30 30 23 28 30 39 41 32 32 28 28 37 43 43 40
36 36 43 47 43 37 37 41 30 30 37 40 30 30 33 42 43 46 44 36 24 23 14 24 34 24 28 28 35 42 34 43 46 46 57 59 57 48 43 42 32 28 28 37 37 48 57 57 32 32
23 19 21 22 23 28 30 30 22 30 32 37 22 17 9 9 9 9 14 12 20 18 24 18 24 24 25 25 25 25 25 30 21 13 13 13 15 12 13 11 11 11 17 15 22 13 12 11 13 11
11 11 23 15 12 11 12 12 12 12 21 28 26 28 25 22 22 28 27 13 13 11 11 12 15 15 25 19 13 11 11 11 12 16 19 19 22 18 12 15 11 11 9 9 9 10 12 15 22 34
21 11 11 11 11 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 8 8 8 7 8 17 3 0 3 23 18 26 26 35 43 44 41 42 50 41 37 37 34 34 23 23 9 9 9 10 9 10 11 11 10 10 15 15 24 17 20 12 18
28 37 36 36 33 37 33 33 33 25 25 9 9 9 9 11 11 11 11 12 15 21 21 16 18 28 29 30 30 39 44 39 43 43 32 35 35 53 53 43 43 43 40 42 37 30 21 34 34 68
68 68 68 46 43 41 28 30 36 44 37 31 31 31 25 36 42 31 32 37 44 39 37 37 57 48 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 43 35 32 32 32 32 32 42 42 51 42 42 24 32 32 44 44 50 50 50 50 50 50 57 52 52 52 59 44 44 44 27 27 43 44 44 44 33 33 43 44 57 68 59 59 43 43 52
59 59 68 44 44 36 36 35 39 39 44 43 33 33 33 24 27 18 43 34 34 24 33 33 35 31 39 39 35 35 35 24 24 11 34 34 38 38 35 43 23 35 20 43 35 24 24 17 28 34
59 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 62 62 52 52 43 43 43 68 68 41 41 35 35 26 44 44 68 68 68 68 68 68 62 62 43 43 39 39 27 27 44 26 39 39 43 35 35 39
35 35 44 43 52 52 62 52 43 43 39 43 35 31 44 44 39 39 39 39 39 39 62 62 44 44 35 29 23 29 43 43 62 62 68 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 68 68 62 62
52 52 43 44 35 35 43 44 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 31 31 31 44 44 44 43 35 35 35 26 44 44 62 62 62 62 62 68 44 44 35 35 41 35 35
35 44 43 41 39 62 59 44 43 35 35 39 44 43 52 52 38 38 41 41 20 43 38 52 57 59 43 39 39 39 42 59 59 59 43 35 35 42 59 43 42 42 44 44 33 42 42 52 52 57
44 59 35 35 41 42 38 38 44 44 32 42 42 43 52 52 42 42 44 44 27 41 28 33 35 38 38 38 42 33 35 43 43 43 32 32 20 38 32 26 26 42 42 42 43 32 41 32 50 44
43 43 48 43 44 44 44 44 32 36 43 43 42 42 35 35 44 44 57 43 43 37 48 43 46 37 37 23 27 41 30 41 41 35 32 41 30 36 37 28 23 30 24 30 30 44 44 59 48 43
43 43 48 30 43 43 43 33 37 30 36 43 43 59 44 43 28 21 12 15 12 21 12 15 13 26 14 18 26 34 31 30 21 27 21 17 12 23 18 28 28 34 32 30 30 34 28 22 22 22
24 24 24 20 20 24 35 43 59 37 36 23 28 22 26 18 12 11 16 11 12 20 28 32 34 32 12 12 11 12 14 30 37 32 32 15 15 12 12 12 11 11 11 23 16 19 19 18 30 34
47 59 30 27 13 13 13 19 19 24 15 12 16 18 23 20 32 32 24 24 23 20 20 28 28 31 37 28 21 14 12 12 9 9 9 9 9 16 23 28 29 17 17 14 19 16 24 22 24 31
28 30 31 32 27 30 24 18 16 16 19 22 25 28 34 28 28 24 28 12 12 12 12 12 19 17 22 22 17 19 10 11 11 14 16 20 22 22 20 26 12 12 12 12 12 12 12 16 16 11
11 9 11 12 9 9 10 17 15 20 18 22 18 16 12 12 12 17 10 8 8 8 8 |