MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-014D05
Chromosome	13 (Build37)
Map Location	86,556,354 - 86,557,387
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	LOC435373, LOC675662, Cox7c, LOC100042887, LOC100042893
Downstream gene	none
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-014D05.b	B6Ng01-014D05.g
ACC	DH848812	DH848813
length	1,203	1,021
definition	DH848812\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-014D05, 5' end.	DH848813\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-014D05, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattctttgttcagttctgagccccattttttaatggggttgttcgatt ttctgaagtccaccttcttgagttctttatatatgttggatattagcccc ctatctgatttaggataggtaaagatcctttcccaatctgttggtggtct ttttgtcttattgacggtatcttttgccttgcagaaactttggagtttca ttaggtcccatttgtcaattctcgatcttacagcacatgccattgctgtt ctgttcattgttggtgggattgcaggcttgtacaaccactctggaaatca gtctggcggttcatcagaaaattggacatagtactaccggaggatccagc aatacctctcctgggcatttatccagaagatgccccaactggtaagaagg acacatgctccactatgttcatagcagccttatttataatagccagaagc tggaaataacccagatgcccctcaacagaggaatggatacagaaaatgtg gtacatctacacaatggagtactactcagctattaaaaagaatgaattta tgaaattcctagtcaaatggatggacctggagggcatcatcctgagtgag gtaacacattcacaaaggaactcacacaatatgtactcactgataagtgg atattagccccaaacctaggattcccaagatataaggtacaatttgataa acacatgaaactcaagaagaatgaagactgaagtgtggacactatgcccc tccttagaattgggaacaaaacacccatggaaggagttacagagacaaag tttggagctgagatgaaaggatggaccatgtagagactgccatatccagg gatccaccccataatcagcacccaaacgctgacaccattgcataccctag caagatttatggaaaggacccagatgtagctatctctgtgagactatgct ggggcctagcaaacacagaagtgatgttcacagtcagctaatggatggat cacagggctcctaatgagagctagaaaagaacccatgagctatggatctg caaccctataggtgaacacatatgactacagtacccggagctctgactct agctgcatattatcaaagatgcctagtccgccatacctggaaaagaagtc aatgggacccacttggatgccagatacaggtatgcaaggccaaaagggga att	gaattctttttttttcaatttttattagatattttcttcatttgcatttc aaatatataggggccaaaaggcccctataccctcaccccgccctgctccc ctacccacccactctcacttcttggccctggtgttcccctgtactggggc atataaagtttgcaagaccaaagggcctctcttcccaatgatggccgatt aggtcatgttctgctacatatgcagctagagacacaagctctgggggtac tggttagttcatattgttgttccacctatagagttgcagaccccttcagc tccttgggtactttctctagctcctccattgggggccctgtgatccatcc aatagctgactgtgagcatccacttctgtatttgccaggcactggcatag cctcacacgaaaccctgatatagctgtctcgtgtaaaagaatttttaagc aatatttacttctgaatgaatataaataaaaatgcaactttatttttagc tgggaagttttctttagtgtcaagttgttcaactgaaacagcaaaaatat tttatctaatagattatataatttaacatgtttaagttgaaaaatggatc ttttgagatgatctctctttatagtatctgctgtcctggaactcactatg taaaccagggtggcctttaattgacagaactccttttgcctctgcttgtc tttgaaaataacactttttatagatttagcttcattcatctgctgagaag tgattcagacattacataaacttatatcttcagttaaaagtattcccaat tcaggattagtatagttaacagaattaaaaattaggaagtgaaaaaaaaa aagaaataggaagtgtatcatatggaattatagagatttacagtgtagtg actttttatctaggttatattaaaagctcgagttattgaagatggtaaca aaaatggataacaaagttttcacatatggattttatttactggggaaatg gttcattgagatattgatcaa
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
	seq1: chr13_86556354_86557387 seq2: B6Ng01-014D05.g_68_1088 (reverse) seq1 TTGATCAATTATTCTTCCAATGAACCATTTTTCCCCAGTAAAATAAAATA 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTGATCAAT--ATCT--CAATGAACCA--TTTCCCCAGT-AAATAAAAT- 42 seq1 CCATATGTGGAAAACTTTGGTTTATCCATTTTTTGTTACCATCTTTCAAT 100 \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| seq2 CCATATGT-GAAAACTTTG--TTATCCA-TTTTTGTTACCATC-TTCAAT 87 seq1 AACCTTGAGCTTTTTAATATAACTTAGAT-AAAAGTCACTACACTGTAAA 149 \|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AA-CTCGAGC-TTTTAATATAACCTAGATAAAAAGTCACTACACTGTAAA 135 seq1 TCTCTATATTTCCTTATGATACACTTCCTATTTTCTTTTTTTTTTCACTT 199 \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTCTATAATTCCATATGATACACTTCCTATTTCTTTTTTTTTTTCACTT 185 seq1 CCTATTTTTTAATTCTGTTAACTATACTAATCCTGAATTGGGAATACTTT 249 \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTAATTTTTAATTCTGTTAACTATACTAATCCTGAATTGGGAATACTTT 235 seq1 TAACTGAAGATATAAGTTTATGTAATGTCTGAATCACTTCTCAGCAGATG 299 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAACTGAAGATATAAGTTTATGTAATGTCTGAATCACTTCTCAGCAGATG 285 seq1 AATGAAGCTAAATCTATAAAAAGTGTTATTTTCAAAGACAAGCAGAGGCA 349 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AATGAAGCTAAATCTATAAAAAGTGTTATTTTCAAAGACAAGCAGAGGCA 335 seq1 AAAGGAGTTCTGTCAATTAAAGGCCACCCTGGTTTACATAGTGAGTTCCA 399 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAAGGAGTTCTGTCAATTAAAGGCCACCCTGGTTTACATAGTGAGTTCCA 385 seq1 GGACAGCAGATACTATAAAGAGAGATCATCTCAAAAGATCCATTTTTCAA 449 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGACAGCAGATACTATAAAGAGAGATCATCTCAAAAGATCCATTTTTCAA 435 seq1 CTT-AACATGTTAAATTATATAATCTATTAGATAAAATATTTTTGCTGTT 498 \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTTAAACATGTTAAATTATATAATCTATTAGATAAAATATTTTTGCTGTT 485 seq1 TCAGTTGAACAACTTGACACTAAAGAAAACTTCCCAGCTAAAAATAAAGT 548 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCAGTTGAACAACTTGACACTAAAGAAAACTTCCCAGCTAAAAATAAAGT 535 seq1 TGCATTTTTATTTATATTCATTCAGAAGTAAATATTGCTTAAAAATTCTT 598 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCATTTTTATTTATATTCATTCAGAAGTAAATATTGCTTAAAAATTCTT 585 seq1 TTACACGAGACAGCTATATCAGGGTTTCGTGTGAGGCTATGCCAGTGCCT 648 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTACACGAGACAGCTATATCAGGGTTTCGTGTGAGGCTATGCCAGTGCCT 635 seq1 GGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGG 698 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGG 685 seq1 GCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTGAAGGGGTCTG 748 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTGAAGGGGTCTG 735 seq1 CAACTCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCCAGAGCT 798 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAACTCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCCAGAGCT 785 seq1 TGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAACATGACCTAATCGGCCATCATT 848 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAACATGACCTAATCGGCCATCATT 835 seq1 GGGAAGAGAGGCCCTTTGGTCTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGG 898 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGGAAGAGAGGCCCTTTGGTCTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGG 885 seq1 GAACACCAGGGCCAAGAAGTGAGAGTGGGTGGGTAGGGGAGCAGGGCGGG 948 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAACACCAGGGCCAAGAAGTGAGAGTGGGTGGGTAGGGGAGCAGGGCGGG 935 seq1 GTGAGGGTATAGGGGCCTTTTGGCCCCTATATATTTGAAATGCAAATGAA 998 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTGAGGGTATAGGGGCCTTTTGGCCCCTATATATTTGAAATGCAAATGAA 985 seq1 GAAAATATCTAATAAAAATTGAAAAAAAAAGAATTC 1034 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAAAATATCTAATAAAAATTGAAAAAAAAAGAATTC 1021

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr13_86556354_86557387
seq2: B6Ng01-014D05.g_68_1088 (reverse)

seq1  TTGATCAATTATTCTTCCAATGAACCATTTTTCCCCAGTAAAATAAAATA  50
      |||||||||   |||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||| 
seq2  TTGATCAAT--ATCT--CAATGAACCA--TTTCCCCAGT-AAATAAAAT-  42

seq1  CCATATGTGGAAAACTTTGGTTTATCCATTTTTTGTTACCATCTTTCAAT  100
      |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||
seq2  CCATATGT-GAAAACTTTG--TTATCCA-TTTTTGTTACCATC-TTCAAT  87

seq1  AACCTTGAGCTTTTTAATATAACTTAGAT-AAAAGTCACTACACTGTAAA  149
      || || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AA-CTCGAGC-TTTTAATATAACCTAGATAAAAAGTCACTACACTGTAAA  135

seq1  TCTCTATATTTCCTTATGATACACTTCCTATTTTCTTTTTTTTTTCACTT  199
      |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||
seq2  TCTCTATAATTCCATATGATACACTTCCTATTTCTTTTTTTTTTTCACTT  185

seq1  CCTATTTTTTAATTCTGTTAACTATACTAATCCTGAATTGGGAATACTTT  249
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATTTTTAATTCTGTTAACTATACTAATCCTGAATTGGGAATACTTT  235

seq1  TAACTGAAGATATAAGTTTATGTAATGTCTGAATCACTTCTCAGCAGATG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGAAGATATAAGTTTATGTAATGTCTGAATCACTTCTCAGCAGATG  285

seq1  AATGAAGCTAAATCTATAAAAAGTGTTATTTTCAAAGACAAGCAGAGGCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAGCTAAATCTATAAAAAGTGTTATTTTCAAAGACAAGCAGAGGCA  335

seq1  AAAGGAGTTCTGTCAATTAAAGGCCACCCTGGTTTACATAGTGAGTTCCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAGTTCTGTCAATTAAAGGCCACCCTGGTTTACATAGTGAGTTCCA  385

seq1  GGACAGCAGATACTATAAAGAGAGATCATCTCAAAAGATCCATTTTTCAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGCAGATACTATAAAGAGAGATCATCTCAAAAGATCCATTTTTCAA  435

seq1  CTT-AACATGTTAAATTATATAATCTATTAGATAAAATATTTTTGCTGTT  498
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAACATGTTAAATTATATAATCTATTAGATAAAATATTTTTGCTGTT  485

seq1  TCAGTTGAACAACTTGACACTAAAGAAAACTTCCCAGCTAAAAATAAAGT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTGAACAACTTGACACTAAAGAAAACTTCCCAGCTAAAAATAAAGT  535

seq1  TGCATTTTTATTTATATTCATTCAGAAGTAAATATTGCTTAAAAATTCTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTTTTATTTATATTCATTCAGAAGTAAATATTGCTTAAAAATTCTT  585

seq1  TTACACGAGACAGCTATATCAGGGTTTCGTGTGAGGCTATGCCAGTGCCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACACGAGACAGCTATATCAGGGTTTCGTGTGAGGCTATGCCAGTGCCT  635

seq1  GGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGG  685

seq1  GCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTGAAGGGGTCTG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTGAAGGGGTCTG  735

seq1  CAACTCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCCAGAGCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCCAGAGCT  785

seq1  TGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAACATGACCTAATCGGCCATCATT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAACATGACCTAATCGGCCATCATT  835

seq1  GGGAAGAGAGGCCCTTTGGTCTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGAGAGGCCCTTTGGTCTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGG  885

seq1  GAACACCAGGGCCAAGAAGTGAGAGTGGGTGGGTAGGGGAGCAGGGCGGG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACACCAGGGCCAAGAAGTGAGAGTGGGTGGGTAGGGGAGCAGGGCGGG  935

seq1  GTGAGGGTATAGGGGCCTTTTGGCCCCTATATATTTGAAATGCAAATGAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATATCTAATAAAAATTGAAAAAAAAAGAATTC  1021

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