BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-016L19
Chromosome13 (Build37)
Map Location 70,142,806 - 70,316,904
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG620143, LOC100042291
Upstream geneLOC218332, Pols, A530095I07Rik, Srd5a1, Nsun2, LOC100042260, 3110006E14Rik, 4930547H16Rik, Med10
Downstream gene4930520P13Rik, EG633042, BC018507, EG620473, Adamts16, 8030423J24Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-016L19.bB6Ng01-016L19.g
ACCDH850614DH850615
length1,177970
definitionDH850614|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-016L19, 5' end.DH850615|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-016L19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,315,717 - 70,316,904)(70,142,806 - 70,143,777)
sequence
gaattccttaatttattattggagaatgtcgtacacataaacaatggatt
ttgattgaatacagactcatcctgtgactcccccctagaatccacccaca
cccgtcctctcagtttcacagttttagaaataacccacgaagcccagcta
ataaacttcttttattctacatcactttttttgaatttgactcggctctc
aaggtttctcgaaggatgagcaccctctcctccaaaaaggcgtggcagag
ttaccttgaaatggaaagcatataaaatatggcgaagcagcaataaatgt
tcctggtgcgggagatgctggcatgtctttgtttgacagggttctaaaaa
tgtcaacctcactctctcagcactatgtgtccagggtctagggataagct
aaccccctctcacctcaggatgccttatatttgtctctgaattctgtggc
ttagaggtctcttaccccccaaccccttcgtctcttagtttgcatgcaca
ttcttgaaaatgtacagtgacacctttaccagcatcccacaaagggattt
gttcagaattgggtagaaaactgatacaggattctctggtctagggaaca
ttagcagtctctttgtcatgtgttgttgaacctggagactcttcattcct
tgtcttgagccagttttcccacttgaccgtaagactggttgtgtcctgaa
atgcaatctgccagaaaagtcagctggtcatgtggacctgaggtgatttt
ggcaaggaagccatgtctgcctcatggcttctctccagcctctgcccctc
cttcttccctccagttttagggtttattctctctaccttgagcaattacc
tattagtgtatcatattctttcctcatgctctcagcccaaactcaactct
aactgttctgtgccagcagttatggacgtaactttgctcaacacattagc
aatagaatgctggtcttttatcatcttctacatccaaggcctcccccatt
tttgtctgttgcagctgtgacagactatgggtgccatcatactagccctg
accctaaaggaacatgggggcaagagtacaggagacagtgttagtcaaaa
catcactttttcttgacatctgtgacaagaagctccaagatgcaattgct
ggatgaagcaaatggtctctttagaac
gaattcattttctcagggatggagaagtgtgttgctttaagcgaaagata
tgaagtcactttctacttgaaaagtgaaactgtgagctgaggagtcgaaa
taaccattcttgctattgatatgcagagggtcaatgaggtttcatgaaca
aaaagcaaggtcctccatcgtaggtgatagtctcactagatacaaaggta
tgtggataagacacattctgtcctctcctctggaaagggggaaacgcacc
tggcagtctctgtctgacttgttttataatgttcattatagaaagctcaa
ccagctaggagctaattgggcagataactagaagcagacataaaggaaat
tgatgtatggaatgatgtaaaagctaacaggatggccacgaagcttatga
atatctacagtggcagcgtcggggggtgcagcaactactattcagtccaa
actttccccatatctggcattcactggtgtcagggtgaggtgcatccaca
acttccacaggctgtcgcctggcactgctgccatgcaggacacttgcatt
tcaaaagctccgtggagccaggatgcaatcctctgggagacctggcttcc
tgtggatcagatgcctttgggagagagacggttgatggaagatttgaatc
ttcacaggggattcctaaataaagcacaaggaaagacaaaatttatttag
gctcttgacacaaaatgtatgagagatgtcccccaaaccattcaaccaaa
tactgacagggttaccgcagacatccggggtcaagggctctgtgacttca
gacaacatcaagtccccagcttctagatgcccttctgacccattgattat
ggtttaagacatacagcctggatcgataacttgcttagagtctcacataa
cccaggaagtatttccatacctgttttatgacgttaagagggttgttatt
aaggatactgattgaatagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_70315717_70316904
seq2: B6Ng01-016L19.b_44_1220 (reverse)

seq1  GTTCTAAAAAGAACCATTTGCTTCCACTCCAGCAAAATGCATCTTGGAGA  50
      |||||||| || ||||||||||||   |||||| || |||||||||||| 
seq2  GTTCTAAAGAG-ACCATTTGCTTC--ATCCAGC-AATTGCATCTTGGAG-  45

seq1  TTTTTCTTGTTCACAGATGGTCAAGAAAAAGTGATG-TCTGACTTACCAC  99
         |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||   
seq2  --CTTCTTG-TCACAGAT-GTCAAGAAAAAGTGATGTTTTGACTAAC--A  89

seq1  CTGTCTCCTGTACTTCTTGGCCCCATGTTCCTTTAGTGTCAGGGCTAGTA  149
      ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTGTCTCCTGTAC-TCTTGCCCCCATGTTCCTTTAGGGTCAGGGCTAGTA  138

seq1  TGATGGCACCCATAGTCTGTCACAGCTGGCAACAGAC-AAAATGGGGGAG  198
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
seq2  TGATGGCACCCATAGTCTGTCACAGCT-GCAACAGACAAAAATGGGGGAG  187

seq1  GCCTTGGATGTAGAAGATGATAAAAGACCAGCATTCTATTGCTAATGTGT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGGATGTAGAAGATGATAAAAGACCAGCATTCTATTGCTAATGTGT  237

seq1  TGAGCAAAGTTACGTCCATAACTGCTGGCACAGAACAGTTAGAGTTGAGT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAAAGTTACGTCCATAACTGCTGGCACAGAACAGTTAGAGTTGAGT  287

seq1  TTGGGCTGAGAGCATGAGGAAAGAATATGATACACTAATAGGTAATTGCT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCTGAGAGCATGAGGAAAGAATATGATACACTAATAGGTAATTGCT  337

seq1  CAAGGTAGAGAGAATAAACCCTAAAACTGGAGGGAAGAAGGAGGGGCAGA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTAGAGAGAATAAACCCTAAAACTGGAGGGAAGAAGGAGGGGCAGA  387

seq1  GGCTGGAGAGAAGCCATGAGGCAGACATGGCTTCCTTGCCAAAATCACCT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGAGAGAAGCCATGAGGCAGACATGGCTTCCTTGCCAAAATCACCT  437

seq1  CAGGTCCACATGACCAGCTGACTTTTCTGGCAGATTGCATTTCAGGACAC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCCACATGACCAGCTGACTTTTCTGGCAGATTGCATTTCAGGACAC  487

seq1  AACCAGTCTTACGGTCAAGTGGGAAAACTGGCTCAAGACAAGGAATGAAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGTCTTACGGTCAAGTGGGAAAACTGGCTCAAGACAAGGAATGAAG  537

seq1  AGTCTCCAGGTTCAACAACACATGACAAAGAGACTGCTAATGTTCCCTAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCCAGGTTCAACAACACATGACAAAGAGACTGCTAATGTTCCCTAG  587

seq1  ACCAGAGAATCCTGTATCAGTTTTCTACCCAATTCTGAACAAATCCCTTT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAGAATCCTGTATCAGTTTTCTACCCAATTCTGAACAAATCCCTTT  637

seq1  GTGGGATGCTGGTAAAGGTGTCACTGTACATTTTCAAGAATGTGCATGCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGATGCTGGTAAAGGTGTCACTGTACATTTTCAAGAATGTGCATGCA  687

seq1  AACTAAGAGACGAAGGGGTTGGGGGGTAAGAGACCTCTAAGCCACAGAAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAAGAGACGAAGGGGTTGGGGGGTAAGAGACCTCTAAGCCACAGAAT  737

seq1  TCAGAGACAAATATAAGGCATCCTGAGGTGAGAGGGGGTTAGCTTATCCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGACAAATATAAGGCATCCTGAGGTGAGAGGGGGTTAGCTTATCCC  787

seq1  TAGACCCTGGACACATAGTGCTGAGAGAGTGAGGTTGACATTTTTAGAAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACCCTGGACACATAGTGCTGAGAGAGTGAGGTTGACATTTTTAGAAC  837

seq1  CCTGTCAAACAAAGACATGCCAGCATCTCCCGCACCAGGAACATTTATTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCAAACAAAGACATGCCAGCATCTCCCGCACCAGGAACATTTATTG  887

seq1  CTGCTTCGCCATATTTTATATGCTTTCCATTTCAAGGTAACTCTGCCACG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTCGCCATATTTTATATGCTTTCCATTTCAAGGTAACTCTGCCACG  937

seq1  CCTTTTTGGAGGAGAGGGTGCTCATCCTTCGAGAAACCTTGAGAGCCGAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTTGGAGGAGAGGGTGCTCATCCTTCGAGAAACCTTGAGAGCCGAG  987

seq1  TCAAATTCAAAAAAAGTGATGTAGAATAAAAGAAGTTTATTAGCTGGGCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATTCAAAAAAAGTGATGTAGAATAAAAGAAGTTTATTAGCTGGGCT  1037

seq1  TCGTGGGTTATTTCTAAAACTGTGAAACTGAGAGGACGGGTGTGGGTGGA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGGGTTATTTCTAAAACTGTGAAACTGAGAGGACGGGTGTGGGTGGA  1087

seq1  TTCTAGGGGGGAGTCACAGGATGAGTCTGTATTCAATCAAAATCCATTGT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGGGGGGAGTCACAGGATGAGTCTGTATTCAATCAAAATCCATTGT  1137

seq1  TTATGTGTACGACATTCTCCAATAATAAATTAAGGAATTC  1188
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTGTACGACATTCTCCAATAATAAATTAAGGAATTC  1177

seq1: chr13_70142806_70143777
seq2: B6Ng01-016L19.g_68_1037

seq1  GAATTCATTTTCTCAGGGATGGAGAAGTGTGTTGCTTTAAGCGAAAGATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTTCTCAGGGATGGAGAAGTGTGTTGCTTTAAGCGAAAGATA  50

seq1  TGAAGTCACTTTCTACTTGAAAAGTGAAACTGTGAGCTGAGGAGTCGAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTCACTTTCTACTTGAAAAGTGAAACTGTGAGCTGAGGAGTCGAAA  100

seq1  TAACCATTCTTGCTATTGATATGCAGAGGGTCAATGAGGTTTCATGAACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCATTCTTGCTATTGATATGCAGAGGGTCAATGAGGTTTCATGAACA  150

seq1  AAAAGCAAGGTCCTCCATCGTAGGTGATAGTCTCACTAGATACAAAGGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCAAGGTCCTCCATCGTAGGTGATAGTCTCACTAGATACAAAGGTA  200

seq1  TGTGGATAAGACACATTCTGTCCTCTCCTCTGGAAAGGGGGAAACGCACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGATAAGACACATTCTGTCCTCTCCTCTGGAAAGGGGGAAACGCACC  250

seq1  TGGCAGTCTCTGTCTGACTTGTTTTATAATGTTCATTATAGAAAGCTCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGTCTCTGTCTGACTTGTTTTATAATGTTCATTATAGAAAGCTCAA  300

seq1  CCAGCTAGGAGCTAATTGGGCAGATAACTAGAAGCAGACATAAAGGAAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTAGGAGCTAATTGGGCAGATAACTAGAAGCAGACATAAAGGAAAT  350

seq1  TGATGTATGGAATGATGTAAAAGCTAACAGGATGGCCACGAAGCTTATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTATGGAATGATGTAAAAGCTAACAGGATGGCCACGAAGCTTATGA  400

seq1  ATATCTACAGTGGCAGCGTCGGGGGGTGCAGCAACTACTATTCAGTCCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTACAGTGGCAGCGTCGGGGGGTGCAGCAACTACTATTCAGTCCAA  450

seq1  ACTTTCCCCATATCTGGCATTCACTGGTGTCAGGGTGAGGTGCATCCACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCCCCATATCTGGCATTCACTGGTGTCAGGGTGAGGTGCATCCACA  500

seq1  ACTTCCACAGGCTGTCGCCTGGCACTGCTGCCATGCAGGACACTTGCATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCACAGGCTGTCGCCTGGCACTGCTGCCATGCAGGACACTTGCATT  550

seq1  TCAAAAGCTCCGTGGAGCCAGGATGCAATCCTCTGGGAGACCTGGCTTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAGCTCCGTGGAGCCAGGATGCAATCCTCTGGGAGACCTGGCTTCC  600

seq1  TGTGGATCAGATGCCTTTGGGAGAGAGACGGTTGATGGAAGATTTGAATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGATCAGATGCCTTTGGGAGAGAGACGGTTGATGGAAGATTTGAATC  650

seq1  TTCACAGGGGATTCCTAAATAAAGCACAAGGAAAGACAAAATTTATTTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAGGGGATTCCTAAATAAAGCACAAGGAAAGACAAAATTTATTTAG  700

seq1  GCTCTTGACACAAAATGTATGAGAGATGTCCCCCAAACCATTCAACCAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTGACACAAAATGTATGAGAGATGTCCCCCAAACCATTCAACCAAA  750

seq1  TACTGACAGGGTTACCGCAGACATCCGGGGTCAAGGGCTCTGTGACTTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGACAGGGTTACCGCAGACATCCGGGGTCAAGGGCTCTGTGACTTCA  800

seq1  GACAACATCAAGTCCCCAGCTTCTAGATGCCCTTCTGACCCATTGATTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAACATCAAGTCCCCAGCTTCTAGATGCCCTTCTGACCCATTGATTAT  850

seq1  GGTTTAAGACATACAGCCTGGATCGATAACTTGCTTAGAAGTCTCACATA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GGTTTAAGACATACAGCCTGGATCGATAACTTGCTTAG-AGTCTCACATA  899

seq1  ACCCAAGGAAGTATTTCCATAACCTG-TTTATGACGTTAAGAAGGGATGT  949
      |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||
seq2  ACCC-AGGAAGTATTTCCAT-ACCTGTTTTATGACGTTAAG-AGGGTTGT  946

seq1  TATAAAGGATACTGA-TGAATAGC  972
      ||| ||||||||||| ||||||||
seq2  TATTAAGGATACTGATTGAATAGC  970