BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-032F17
Chromosome13 (Build37)
Map Location 44,666,137 - 44,799,032
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneRnf182, LOC100039403, Cd83, LOC100039432, A730030A06, EG637868, EG667157
Downstream geneJarid2, Dtnbp1, Hsp25-ps1, LOC100039502, LOC667204, LOC100039533, Mylip, Gmpr, Atxn1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-032F17.bB6Ng01-032F17.g
ACCDH861719DH861720
length590587
definitionDH861719|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032F17, 5' end.DH861720|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032F17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(44,666,137 - 44,666,732)(44,798,446 - 44,799,032)
sequence
aaggtcacccttggctacttaacaacattgaggcaagtctgactgtttga
tattctgtgtctttagaaaaacaaaaaaatcagctacttggccacaagtt
ggaaagagggctagggaacagaatctggttgtatcttcaaatgcctgaca
gaaacagtgtatacagaaagaaggataatggtggacagcaggtagccatt
agctcatgacacataacaggcaagaatgtagcgagcgccctcagatccaa
ggtgcaccttccatgtcgcagtaagaggaaaaaaaagaaaaacaaaaaac
caagagtaatgttaacactgatgtgaccacagcaaatctgcaatggtgaa
acaggggtgatgccaggatacagacaggtgggattctgatacctgtccta
tcatatgagacatatgataggacatatgtcctatcatatgatatcatagg
agaccttaaacatgccaatcaaggcctctgtctgtggtggttggatatgc
ttgggccagagagtagcactagtaggaggtttttggccttgttggagtgg
atgtggccttgttggaggaagtgtgtcacggtgggggtgg
gaattctctgagccagagctggatgtaagtttgggaaagagcatgtaggg
cccttgagttcaaataaggagtgtgtaactcaggcgaatacagtggcaca
cccatattgtgcctatactcagagcagaaacagggcgtggagactggggg
ggcgggggtaggtagagctcactgaaagtttgatgctagccaggattaca
atgagagatgctgtttcaataaagtcaaaagcaactagaaagactgccta
gcaattaaggctgatctttctcaagacccatgtttggttcttcataccca
tactggttgtcttcaactctagctccaggggaatccgagtccttctggaa
cacacacacacacacacacacacacacactcacactgggcatgctaacac
aagcctttataaaggggaaaaggagatatgatggaacaagtctgcagtcc
ttccgtccttctaagatggtcggatcaggagttcaaggcctgcctcaact
acttgagaccttgcctcaaaaagccaaccaaaaaaccccaaaacaaacaa
acaaacaaacaaaaaaactgccgggagaggtggtcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_44666137_44666732
seq2: B6Ng01-032F17.b_46_641

seq1  GAATTCAAGGTCACCCTTGGCTACTTAACAACATTGAGGCAAGTCTGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGTCACCCTTGGCTACTTAACAACATTGAGGCAAGTCTGACT  50

seq1  GTTTGATATTCTGTGTCTTTAGAAAAACAAAAAAATCAGCTACTTGGCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGATATTCTGTGTCTTTAGAAAAACAAAAAAATCAGCTACTTGGCCA  100

seq1  CAAGTTGGAAAGAGGGCTAGGGAACAGAATCTGGTTGTATCTTCAAATGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTGGAAAGAGGGCTAGGGAACAGAATCTGGTTGTATCTTCAAATGC  150

seq1  CTGACAGAAACAGTGTATACAGAAAGAAGGATAATGGTGGACAGCAGGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACAGAAACAGTGTATACAGAAAGAAGGATAATGGTGGACAGCAGGTA  200

seq1  GCCATTAGCTCATGACACATAACAGGCAAGAATGTAGCGAGCGCCCTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATTAGCTCATGACACATAACAGGCAAGAATGTAGCGAGCGCCCTCAG  250

seq1  ATCCAAGGTGCACCTTCCATGTCGCAGTAAGAGGAAAAAAAAGAAAAACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAGGTGCACCTTCCATGTCGCAGTAAGAGGAAAAAAAAGAAAAACA  300

seq1  AAAAACCAAGAGTAATGTTAACACTGATGTGACCACAGCAAATCTGCAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACCAAGAGTAATGTTAACACTGATGTGACCACAGCAAATCTGCAAT  350

seq1  GGTGAAACAGGGGTGATGCCAGGATACAGACAGGTGGGATTCTGATACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAAACAGGGGTGATGCCAGGATACAGACAGGTGGGATTCTGATACCT  400

seq1  GTCCTATCATATGAGACATATGATAGGACATATGTCCTATCATATGATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTATCATATGAGACATATGATAGGACATATGTCCTATCATATGATAT  450

seq1  CATAGGAGACCTTAAACATGCCAATCAAGGCCTCTGTCTGTGGTGGTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGGAGACCTTAAACATGCCAATCAAGGCCTCTGTCTGTGGTGGTTGG  500

seq1  ATATGCTTGGGCCAGAGAGTAGCACTAGTAGGAGGTTTTTGGCCTTGTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCTTGGGCCAGAGAGTAGCACTAGTAGGAGGTTTTTGGCCTTGTTG  550

seq1  GAGTGGATGTGGCCTTGTTGGAGGAAGTGTGTCACGGTGGGGGTGG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGATGTGGCCTTGTTGGAGGAAGTGTGTCACGGTGGGGGTGG  596

seq1: chr13_44798446_44799032
seq2: B6Ng01-032F17.g_70_656 (reverse)

seq1  TGGACCACCTCTCCCGGCAGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACCACCTCTCCCGGCAGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGG  50

seq1  GGTTTTTTGGTTGGCTTTTTGAGGCAAGGTCTCAAGTAGTTGAGGCAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTTTGGTTGGCTTTTTGAGGCAAGGTCTCAAGTAGTTGAGGCAGGC  100

seq1  CTTGAACTCCTGATCCGACCATCTTAGAAGGACGGAAGGACTGCAGACTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAACTCCTGATCCGACCATCTTAGAAGGACGGAAGGACTGCAGACTT  150

seq1  GTTCCATCATATCTCCTTTTCCCCTTTATAAAGGCTTGTGTTAGCATGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCATCATATCTCCTTTTCCCCTTTATAAAGGCTTGTGTTAGCATGCC  200

seq1  CAGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCCAGAAGGACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCCAGAAGGACT  250

seq1  CGGATTCCCCTGGAGCTAGAGTTGAAGACAACCAGTATGGGTATGAAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGATTCCCCTGGAGCTAGAGTTGAAGACAACCAGTATGGGTATGAAGAA  300

seq1  CCAAACATGGGTCTTGAGAAAGATCAGCCTTAATTGCTAGGCAGTCTTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACATGGGTCTTGAGAAAGATCAGCCTTAATTGCTAGGCAGTCTTTC  350

seq1  TAGTTGCTTTTGACTTTATTGAAACAGCATCTCTCATTGTAATCCTGGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTGCTTTTGACTTTATTGAAACAGCATCTCTCATTGTAATCCTGGCT  400

seq1  AGCATCAAACTTTCAGTGAGCTCTACCTACCCCCGCCCCCCCAGTCTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCAAACTTTCAGTGAGCTCTACCTACCCCCGCCCCCCCAGTCTCCA  450

seq1  CGCCCTGTTTCTGCTCTGAGTATAGGCACAATATGGGTGTGCCACTGTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCCTGTTTCTGCTCTGAGTATAGGCACAATATGGGTGTGCCACTGTAT  500

seq1  TCGCCTGAGTTACACACTCCTTATTTGAACTCAAGGGCCCTACATGCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCCTGAGTTACACACTCCTTATTTGAACTCAAGGGCCCTACATGCTCT  550

seq1  TTCCCAAACTTACATCCAGCTCTGGCTCAGAGAATTC  587
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAAACTTACATCCAGCTCTGGCTCAGAGAATTC  587