BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-037J24
Chromosome13 (Build37)
Map Location 68,264,924 - 68,365,547
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC666222, AA414992
Upstream geneRsl1, LOC674699, Zfp455, Zfp458, Zfp457, A230042K10Rik, E130120F12Rik, Zfp456, 2810487A22Rik, Zfp459, C330011K17Rik, LOC666098, 9630025I21Rik, Zfp817, Zfp87, Zfp748, A530054K11Rik, LOC328277, 3830402I07Rik, EG666137, Zfp85-rs1, LOC674597, Zfp273, BC048507, LOC666185, LOC100042687, LOC100042692, LOC674779, LOC677603, LOC100042124
Downstream geneLOC666238, EG666245, EG666272, LOC100042223, Mtrr, LOC100042233, Fastkd3, 1700001L19Rik, Adcy2, LOC666205
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-037J24.bB6Ng01-037J24.g
ACCDH865426DH865427
length1,0121,072
definitionDH865426|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-037J24, 5' end.DH865427|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-037J24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,364,541 - 68,365,547)(68,264,924 - 68,265,993)
sequence
gaattcagtcaacacattttaatcaggtgactttcttgtgaacctgaaaa
catgccctgtctggaagtctcagacgtaatcagtgtttctaagttgatat
agtaaagggaggataaattggctctaacaaatgactgtgtgaggggatac
caaggaagctatcctcatgtgacctctagggtagaaaggaacgggagggc
tatggcttccacgggaatctgctgcacaccatgggaagggcctactctgg
ggttttgtctctacaccagctcagaggacaggatggaggtgcactcttac
tgcagcctgtctagaatatctcacggaacaaatatgttgtgtcaggcaag
acaaaaacgcatctgctttcctgataaagaagaatgtagtgggacttgga
acatttctccaagaacaaaatttattttgcagtgataaaaacacttggca
ataaatgcccaaatgaagtgagtgagttaatttcacttcaaagacaagcc
accattcatgtctaaacggagacttcagatctgtgtgcagatctcttctg
ctggaggccataggtcagtgtgctgcacattctttttatgtgagctgcac
tcaatctgttttctccacaccagactcagcagtttaaggagcactgtgca
aaggaaggtactttttgaaccaggacagctgtttgcctgtgtggtaacca
aaaaagaagaggtggatggagctgaagggtccttttccagacagaaatgt
agctcaggttagtttgcagtagcagaatggcttgatgcatagagcagaag
actccaacttgagacacagataaatgttggcgctcagaccctgaaggcac
ctctgcctcctcatccctgatcttaataaacaggaatgaaaggcatattt
agaacacacttatgtttgtacagatcaataatctgtacatatgtctatct
atgcacatatgcatagatagatgaaagtagatgatagatagatgattgtt
aggatagataga
gaattcccaaagccccagatcttccacagatgcacactggaggaaactgt
tctgggctgttagtgtatccctcacaaagcactgtggttttctttgattc
attcccttggcaagggagatggatacagactgatggtctgtatacttgtt
tggaatgtgtattgattgaacttgtgctgtgcaagtctagatttcttttt
cttgcatttcttctttctctcctagggaaaaataatgcataattgcatac
tctgtcagttcctgacatcactaaccaccagatgcaatgtctccttatgc
tcacagttctcaggacacactgattcctctacagtaggctgttccttgtt
catgtgtagctgagacaggaaatcacaagctcgagatgatgatactttct
gtcctgagtgcttttccctcttatcctcctgttagctcaaacgtgtgcaa
agatgttatggctagacctctggcttagttgatcagcaggaataatgcct
ttgaaaagcctaaggaaaagtaatagaagatggagcttgttatggcttga
atatatttggcccagggagtggcactattagaagtagccttgttggagta
ggtatgtccctcttggagtaggtgtgtcaccatgggtatgggttttaaga
ccctcatcctagctacctggaagccagtattctgctagcagccttcagat
gaagatgtagactctctactcctcctgcatcctgcctgcctggatgctgc
catgctttcagccttgatgatatggactgaacctttgaacctgtaagcca
gcaccaattaaatgttgtccttataaaacttgccttggtctcggtacctg
ttcatagcagtaaaccctaagacaggagctgttggaaacattcagagcag
agtccttgggtaagggaaaggatgggtggagtttatcttcccactttcct
acaagatgatagctacaaccaaatgactgcgagaattctggagtctccat
tttctgacgtcgagtagctcaaggaccaatatattttagccgtgtgaggt
gtgctggtgaaggctaaaagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_68364541_68365547
seq2: B6Ng01-037J24.b_48_1059 (reverse)

seq1  TCTATCTATC--------TATCTATCTATCTATCTACCTATCATCTATCT  42
      ||||||||||         ||||||||||| ||||| || ||||||||||
seq2  TCTATCTATCCTAACAATCATCTATCTATC-ATCTA-CTTTCATCTATCT  48

seq1  ATGCATATGTGCATTAGATAGACATATGTACAGATTATTGATCTGTACAA  92
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATATGTGCA-TAGATAGACATATGTACAGATTATTGATCTGTACAA  97

seq1  ACATAAGTGTGTTCTAATTATGCCTTTCATTCCTGTTTATTAAGATCAGG  142
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAGTGTGTTCTAAATATGCCTTTCATTCCTGTTTATTAAGATCAGG  147

seq1  GATGAGGAGGCAGAGGTGCCTTCAGGGTCTGAGCGCCAACATTTATCTGT  192
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGGAGGCAGAGGTGCCTTCAGGGTCTGAGCGCCAACATTTATCTGT  197

seq1  GTCTCAAGTTGGAGTCTTCTGCTCTATGCATCAAGCCATTCTGCTACTGC  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAAGTTGGAGTCTTCTGCTCTATGCATCAAGCCATTCTGCTACTGC  247

seq1  AAACTAACCTGAGCTACATTTCTGTCTGGAAAAGGACCCTTCAGCTCCAT  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAACCTGAGCTACATTTCTGTCTGGAAAAGGACCCTTCAGCTCCAT  297

seq1  CCACCTCTTCTTTTTTGGTTACCACACAGGCAAACAGCTGTCCTGGTTCA  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTCTTCTTTTTTGGTTACCACACAGGCAAACAGCTGTCCTGGTTCA  347

seq1  AAAAGTACCTTCCTTTGCACAGTGCTCCTTAAACTGCTGAGTCTGGTGTG  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTACCTTCCTTTGCACAGTGCTCCTTAAACTGCTGAGTCTGGTGTG  397

seq1  GAGAAAACAGATTGAGTGCAGCTCACATAAAAAGAATGTGCAGCACACTG  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAACAGATTGAGTGCAGCTCACATAAAAAGAATGTGCAGCACACTG  447

seq1  ACCTATGGCCTCCAGCAGAAGAGATCTGCACACAGATCTGAAGTCTCCGT  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATGGCCTCCAGCAGAAGAGATCTGCACACAGATCTGAAGTCTCCGT  497

seq1  TTAGACATGAATGGTGGCTTGTCTTTGAAGTGAAATTAACTCACTCACTT  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGACATGAATGGTGGCTTGTCTTTGAAGTGAAATTAACTCACTCACTT  547

seq1  CATTTGGGCATTTATTGCCAAGTGTTTTTATCACTGCAAAATAAATTTTG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGGGCATTTATTGCCAAGTGTTTTTATCACTGCAAAATAAATTTTG  597

seq1  TTCTTGGAGAAATGTTCCAAGTCCCACTACATTCTTCTTTATCAGGAAAG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGGAGAAATGTTCCAAGTCCCACTACATTCTTCTTTATCAGGAAAG  647

seq1  CAGATGCGTTTTTGTCTTGCCTGACACAACATATTTGTTCCGTGAGATAT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGCGTTTTTGTCTTGCCTGACACAACATATTTGTTCCGTGAGATAT  697

seq1  TCTAGACAGGCTGCAGTAAGAGTGCACCTCCATCCTGTCCTCTGAGCTGG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGACAGGCTGCAGTAAGAGTGCACCTCCATCCTGTCCTCTGAGCTGG  747

seq1  TGTAGAGACAAAACCCCAGAGTAGGCCCTTCCCATGGTGTGCAGCAGATT  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAGACAAAACCCCAGAGTAGGCCCTTCCCATGGTGTGCAGCAGATT  797

seq1  CCCGTGGAAGCCATAGCCCTCCCGTTCCTTTCTACCCTAGAGGTCACATG  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGTGGAAGCCATAGCCCTCCCGTTCCTTTCTACCCTAGAGGTCACATG  847

seq1  AGGATAGCTTCCTTGGTATCCCCTCACACAGTCATTTGTTAGAGCCAATT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATAGCTTCCTTGGTATCCCCTCACACAGTCATTTGTTAGAGCCAATT  897

seq1  TATCCTCCCTTTACTATATCAACTTAGAAACACTGATTACGTCTGAGACT  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTCCCTTTACTATATCAACTTAGAAACACTGATTACGTCTGAGACT  947

seq1  TCCAGACAGGGCATGTTTTCAGGTTCACAAGAAAGTCACCTGATTAAAAT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGACAGGGCATGTTTTCAGGTTCACAAGAAAGTCACCTGATTAAAAT  997

seq1  GTGTTGACTGAATTC  1007
      |||||||||||||||
seq2  GTGTTGACTGAATTC  1012

seq1: chr13_68264924_68265993
seq2: B6Ng01-037J24.g_68_1139

seq1  GAATTCCCAAAGCCCCAGATCTTCCACAGATGCACACTGGAGGAAACTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAAAGCCCCAGATCTTCCACAGATGCACACTGGAGGAAACTGT  50

seq1  TCTGGGCTGTTAGTGTATCCCTCACAAAGCACTGTGGTTTTCTTTGATTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGCTGTTAGTGTATCCCTCACAAAGCACTGTGGTTTTCTTTGATTC  100

seq1  ATTCCCTTGGCAAGGGAGATGGATACAGACTGATGGTCTGTATACTTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCTTGGCAAGGGAGATGGATACAGACTGATGGTCTGTATACTTGTT  150

seq1  TGGAATGTGTATTGATTGAACTTGTGCTGTGCAAGTCTAGATTTCTTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATGTGTATTGATTGAACTTGTGCTGTGCAAGTCTAGATTTCTTTTT  200

seq1  CTTGCATTTCTTCTTTCTCTCCTAGGGAAAAATAATGCATAATTGCATAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCATTTCTTCTTTCTCTCCTAGGGAAAAATAATGCATAATTGCATAC  250

seq1  TCTGTCAGTTCCTGACATCACTAACCACCAGATGCAATGTCTCCTTATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCAGTTCCTGACATCACTAACCACCAGATGCAATGTCTCCTTATGC  300

seq1  TCACAGTTCTCAGGACACACTGATTCCTCTACAGTAGGCTGTTCCTTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGTTCTCAGGACACACTGATTCCTCTACAGTAGGCTGTTCCTTGTT  350

seq1  CATGTGTAGCTGAGACAGGAAATCACAAGCTCGAGATGATGATACTTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTAGCTGAGACAGGAAATCACAAGCTCGAGATGATGATACTTTCT  400

seq1  GTCCTGAGTGCTTTTCCCTCTTATCCTCCTGTTAGCTCAAACGTGTGCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGAGTGCTTTTCCCTCTTATCCTCCTGTTAGCTCAAACGTGTGCAA  450

seq1  AGATGTTATGGCTAGACCTCTGGCTTAGTTGATCAGCAGGAATAATGCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTTATGGCTAGACCTCTGGCTTAGTTGATCAGCAGGAATAATGCCT  500

seq1  TTGAAAAGCCTAAGGAAAAGTAATAGAAGATGGAGCTTGTTATGGCTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAAGCCTAAGGAAAAGTAATAGAAGATGGAGCTTGTTATGGCTTGA  550

seq1  ATATATTTGGCCCAGGGAGTGGCACTATTAGAAGTAGCCTTGTTGGAGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATTTGGCCCAGGGAGTGGCACTATTAGAAGTAGCCTTGTTGGAGTA  600

seq1  GGTATGTCCCTCTTGGAGTAGGTGTGTCACCATGGGTATGGGTTTTAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATGTCCCTCTTGGAGTAGGTGTGTCACCATGGGTATGGGTTTTAAGA  650

seq1  CCCTCATCCTAGCTACCTGGAAGCCAGTATTCTGCTAGCAGCCTTCAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCATCCTAGCTACCTGGAAGCCAGTATTCTGCTAGCAGCCTTCAGAT  700

seq1  GAAGATGTAGAACTCTCTACTCCTCCTGCATCCTGCCTGCCTGGATGCTG  750
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATGTAG-ACTCTCTACTCCTCCTGCATCCTGCCTGCCTGGATGCTG  749

seq1  CCATGCTTCCAGCCTTGATGATAATGGACTGAACCTTTGAACCTGTAAGC  800
      |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCTTTCAGCCTTGATGAT-ATGGACTGAACCTTTGAACCTGTAAGC  798

seq1  CAGCACCAATTAAATGTTGTCCTTATAAAACTTGCCTTGGTCTCGGTACC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACCAATTAAATGTTGTCCTTATAAAACTTGCCTTGGTCTCGGTACC  848

seq1  TGTTCATAGCAGTAAAACCCTAAGACA-GAGCTGTTGGAACCATTCAGAG  899
      ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
seq2  TGTTCATAGCAGT-AAACCCTAAGACAGGAGCTGTTGGAAACATTCAGAG  897

seq1  CAGAGTCCTT-GGTAAGGGACA-GATGGGTGGAGTTTATCTTCCCACTTT  947
      |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTCCTTGGGTAAGGGAAAGGATGGGTGGAGTTTATCTTCCCACTTT  947

seq1  -CTACCAGATGATTAGCTAACAACCAAATGACAGC-AGAATTCT-GAGTC  994
       |||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||
seq2  CCTACAAGATGA-TAGCT-ACAACCAAATGACTGCGAGAATTCTGGAGTC  995

seq1  TCCA-TTTCTGACGTCAGTTAGCTCAAAGACCTATATATTTTAGCCAGTT  1043
      |||| |||||||||||   |||||||| |||| |||||||||||||   |
seq2  TCCATTTTCTGACGTCGAGTAGCTCAAGGACCAATATATTTTAGCCGTGT  1045

seq1  GAGGTGTTGCTGGTG-AGGCTAAGAGAA  1070
      |||||| |||||||| ||||||| ||||
seq2  GAGGTG-TGCTGGTGAAGGCTAAAAGAA  1072