BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-085G11
Chromosome13 (Build37)
Map Location 38,332,676 - 38,448,357
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBmp6
Upstream geneLy86, LOC100042794, LOC100042800, LOC100042802, LOC100041624, Rreb1, Ssr1, Cage1, Riok1, Dsp, 6530403A03Rik
Downstream geneTxndc5, Muted, Eef1e1, LOC621102, Slc35b3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-085G11.bB6Ng01-085G11.g
ACCDH899086DH899087
length695448
definitionDH899086|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-085G11, 5' end.DH899087|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-085G11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(38,332,676 - 38,333,369)(38,447,905 - 38,448,357)
sequence
gaattcactcataggcctagacttcaggtacagaatttagcattacaaca
catagcaacagaccaaacctcaacaccttctgcccatagccctaacagat
ggcctacatgagtctgctttaaaggaagtaaacaaacaaacaaactattc
tgagcctaatatggttatgagtgaattctgagtggccattcacattacct
tgaaaaccgaaacatcatgaatggcattaggaggaccagacaggaaggcc
actccaacagttgttctctcagctgtaggtctgtggaagccaaaagacaa
ttaaacttagtgatacccctgagtagtttacccattggccatgcgtatgt
taagtgacatacaaaagttaacgcattgtccattaaatggctggagatgg
cttaagatggcttgtgctctacattccatctgtggcgggttaaataggta
tggccccccacagattcctgtttgaatgcttgaccataaggagtgacact
attaggaaagtgtggcctttttgagtcccttgctcaagtcaaggagactg
tgtaatactgccttcagatcaggatgtagaagtctcagctcctccagcac
caggtctgcctgtatactgcatgtgtttgcatgtgaatatgggcttgtgc
aatagggaaaaaacaaagaggcagaaatgtgatgtgatgtgtgtg
aagttcccaggtcttatccaagggctcttctaatctgtaagaacaggact
ctaggtaccttagcaccaccaagaaaccaacgactttaactgtaatagtc
cgcagtcacttgcaaagctctatagaagtgtgtgttacctgctctattgg
gtcaatggcagatgcaccaaactatgggtggacagacatgcgttacagtg
agagtaaacgcaatgaagttgctagtgctattgatggagaggaagagggg
gagggagttgggcatggtgggacacagctgtaactccagcactctggaga
ctgagtcagcaaggttaggagtccaagatcatccttgggtgcatatcaag
ttcaaggctagcctaggttacctgaaactttttttctaaaattaaaattt
aaaaaaaaaagaaatagacaaaaacctaaattctgctgcatttcacct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_38332676_38333369
seq2: B6Ng01-085G11.b_44_738

seq1  GAATTCACTCATAGGCCTAGACTTCAGGTACAGAATTTAGCATTACAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCATAGGCCTAGACTTCAGGTACAGAATTTAGCATTACAACA  50

seq1  CATAGCAACAGACCAAACCTCAACACCTTCTGCCCATAGCCCTAACAGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGCAACAGACCAAACCTCAACACCTTCTGCCCATAGCCCTAACAGAT  100

seq1  GGCCTACATGAGTCTGCTTTAAAGGAAGTAAACAAACAAACAAACTATTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTACATGAGTCTGCTTTAAAGGAAGTAAACAAACAAACAAACTATTC  150

seq1  TGAGCCTAATATGGTTATGAGTGAATTCTGAGTGGCCATTCACATTACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCTAATATGGTTATGAGTGAATTCTGAGTGGCCATTCACATTACCT  200

seq1  TGAAAACCGAAACATCATGAATGGCATTAGGAGGACCAGACAGGAAGGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAACCGAAACATCATGAATGGCATTAGGAGGACCAGACAGGAAGGCC  250

seq1  ACTCCAACAGTTGTTCTCTCAGCTGTAGGTCTGTGGAAGCCAAAAGACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAACAGTTGTTCTCTCAGCTGTAGGTCTGTGGAAGCCAAAAGACAA  300

seq1  TTAAACTTAGTGATACCCCTGAGTAGTTTACCCATTGGCCATGCGTATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACTTAGTGATACCCCTGAGTAGTTTACCCATTGGCCATGCGTATGT  350

seq1  TAAGTGACATACAAAAGTTAACGCATTGTCCATTAAATGGCTGGAGATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGACATACAAAAGTTAACGCATTGTCCATTAAATGGCTGGAGATGG  400

seq1  CTTAAGATGGCTTGTGCTCTACATTCCATCTGTGGCGGGTTAAATAGGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGATGGCTTGTGCTCTACATTCCATCTGTGGCGGGTTAAATAGGTA  450

seq1  TGGCCCCCCACAGATTCCTGTTTGAATGCTTGACCATAAGGAGTGACACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCCCCCACAGATTCCTGTTTGAATGCTTGACCATAAGGAGTGACACT  500

seq1  ATTAGGAAAGTGTGGCCTTTTTGAGTCCCTTGCTCAAGTCAAGGAGACTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGGAAAGTGTGGCCTTTTTGAGTCCCTTGCTCAAGTCAAGGAGACTG  550

seq1  TGTAATACTGCCTTCAGATCAGGATGTAGAAGTCTCAGCTCCTCCAGCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATACTGCCTTCAGATCAGGATGTAGAAGTCTCAGCTCCTCCAGCAC  600

seq1  CAGGTCTGCCTGTATACTGCATGTGTTTGCATGTGAATATGGGCTTGTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCTGCCTGTATACTGCATGTGTTTGCATGTGAATATGGGCTTGTGC  650

seq1  AATAGGG-AAAAACAAAGAGGCAGAAATGTGATGTGATGTGTGTG  694
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGGAAAAAACAAAGAGGCAGAAATGTGATGTGATGTGTGTG  695

seq1: chr13_38447905_38448357
seq2: B6Ng01-085G11.g_67_520 (reverse)

seq1  AGGTGAAATGCAGCAGAATTTAGGTTTTTGTCTCTTTCTTTTTTTTTTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AGGTGAAATGCAGCAGAATTTAGGTTTTTGTCTATTTCTTTTTTTTTTAA  50

seq1  ATTTTAATTTTTG-TACAGTGTTTCATGTAACCTAGGCTGGCCTTGAACT  99
      ||||||||||| |  | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||
seq2  ATTTTAATTTTAGAAAAAAAGTTTCAGGTAACCTAGGCTAGCCTTGAACT  100

seq1  TGATATGCACCCAAGGATGATCTTGGACTCCTAACCTTGCTGACTCAGTC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATGCACCCAAGGATGATCTTGGACTCCTAACCTTGCTGACTCAGTC  150

seq1  TCCAGAGTGCTGGAGTTACAGCTGTGTCCCACCATGCCCAACTCCCTCCC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAGTGCTGGAGTTACAGCTGTGTCCCACCATGCCCAACTCCCTCCC  200

seq1  CCTCTTCCTCTCCATCAATAGCACTAGCAACTTCATTGCGTTTACTCTCA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTCCTCTCCATCAATAGCACTAGCAACTTCATTGCGTTTACTCTCA  250

seq1  CTGTAACGCATGTCTGTCCACCCATAGTTTGGTGCATCTGCCATTGACCC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAACGCATGTCTGTCCACCCATAGTTTGGTGCATCTGCCATTGACCC  300

seq1  AATAGAGCAGGTAACACACACTTCTATAGAGCTTTGCAAGTGACTGCGGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGAGCAGGTAACACACACTTCTATAGAGCTTTGCAAGTGACTGCGGA  350

seq1  CTATTACAGTTAAAGTCGTTGGTTTCTTGGTGGTGCTAAGGTACCTAGAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTACAGTTAAAGTCGTTGGTTTCTTGGTGGTGCTAAGGTACCTAGAG  400

seq1  TCCTGTTCTTACAGATTAGAAGAGCCCTTGGATAAGACCTGGGAGCTTGA  449
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TCCTGTTCTTACAGATTAGAAGAGCCCTTGGATAAGACCTGGGAACTTGA  450

seq1  ATTC  453
      ||||
seq2  ATTC  454