BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-096B05
Chromosome13 (Build37)
Map Location 68,069,992 - 68,222,330
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042687, LOC100042692, LOC674779
Upstream genePtdss1, Zfp712, Zfp708, Zfp759, Rsl1, LOC674699, Zfp455, Zfp458, Zfp457, A230042K10Rik, E130120F12Rik, Zfp456, 2810487A22Rik, Zfp459, C330011K17Rik, LOC666098, 9630025I21Rik, Zfp817, Zfp87, Zfp748, A530054K11Rik, LOC328277, 3830402I07Rik, EG666137, Zfp85-rs1, LOC674597, Zfp273, BC048507, LOC666185
Downstream geneLOC677603, LOC100042124, LOC666222, AA414992, LOC666238, EG666245, EG666272, LOC100042223, Mtrr, LOC100042233, Fastkd3, 1700001L19Rik, Adcy2, LOC666205
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-096B05.bB6Ng01-096B05.g
ACCDH906836DH906837
length1,1001,099
definitionDH906836|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096B05, 5' end.DH906837|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096B05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,221,223 - 68,222,330)(68,069,992 - 68,071,099)
sequence
gaattcccaaggcctgagatcttccacagatgcacacctggggaatccgt
tctgggctcttagtgtatccctcacaaagccctgtagttttctttgattg
gttcccttggcaagggagacagataaagactaatgatctgtatacgtgtt
tggaatgtgtattgattgaacttgtgctgtgcaagtctagatttcttttt
cttgcatttttttctttctgtccttgggaaaaataatgcataattgcatg
ctctgtcacttgctgacaccactaaccaccggatgcaatgtctacttatg
ctcacagttctcaggacacactgattcctctaccgcaggttgtgccttgg
tcatgtgtagctgagacaggaaatcacaagctcgagatgatgatactttc
tgtcctcagtgcttttctctcttatcctcctggtagctcaaatgtgtgca
gagatgttatgcctagacctctggcttgactgatcaggacggataatgcc
tttgaatagcctaaggaaaagtaatagaagatggagcttgttacggtttg
tatatgtttggcccagtgagtggcactattagaagaagtagccttgttgg
agtaggtatatccctcttggagtaggtgtgtctccacgggtatgggtttt
aagaccctcatcctagctacctggaatccagtattctgctagcagccttc
agatgaagatgtagaactctctactcctcctgcatcctgcctgcctggat
gctgccatgcttccagccttgatgataatggactgaacctctgaacctgc
aagccagcaccaattaaatgttgtccttataagacttgccttggtctcag
tacctgttcatagcagtaaaaacctaagacaaagctgtggaaacattcag
agcagagtccttgttaagggacagatgggtggagttatcttccactttcc
acagatgattagcttacatccagatgacagcagaattctcagtctctttc
tgacgcagtagctcaaagacctgtatactttaggcaggtgaaggggtgct
ggggaggctaaaaaacccctaagaaataataagtaaaaataatcttgatt

gaattcccaaagccccagatcttccacagatgcacactggaggaaactgt
tctgggctgttagtgtatccctcacaaggcactgtggttttctttgattg
gttcccttggcaagggagatggatacagactgatggtctgtatacttgtt
tgaaatgtgtattgattgaacttgtgctgtgcaagtctagatttcttttt
cttgcatttcttctttctctcctagggaaaaataatgcataattgcatac
tctgtcagttcctgacatcactaaccaccagatgcaatgtctccttatgc
tcacagttctcaggacacactgattcctctacagtaggctgtgccttgct
catgtgtagctgagacaggaagtcacaagctcgagatgatgatactttct
gttctgagtgcttttccctcttatcctcctgttagctcaaacgtgtgcag
agatgttatggctagacctctggcttagctgatcagcaggaataatgcct
ttgaaaagcctaaggaaaagtaatagaagatggagcttgttacagcttga
atatgtttggcccagggagtggcactattagaagaagtagccttgttgga
gtaggtatgtccctcttggagtaggtgtgtcaccatgggtatgggtttta
agaccctcattctagctacctggaagccagtattctgctagcagccttca
gatgaagatgtagaactctctactcctcctgcatcctgcctgcctggatg
ctgccatgcttccagccttgaagataatggactgaacctctgaacctgta
agtcagcaccaattaaatgttgtcctttataagacttgccttggtctcgg
tacctgttcatagcagtaaaacccttatacagagctgttggaaacactca
gagcagagtccttggtaagggacagatgggtggagttcatcttcccactt
tctaccagatgatagctacaaccaaatgacagcagaatctgagtctcatt
tctgacgtcagttagctcaaagacctatatattttagccagttgagtgtg
ctggtgagctaagagaccctattggtaagatagatataaataatctagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_68221223_68222330
seq2: B6Ng01-096B05.b_45_1144 (reverse)

seq1  AATC-AGATTATTTTTACTTATCTATTCTATAGGGGTTTTCTTAGCCTCA  49
      |||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||| 
seq2  AATCAAGATTATTTTTACTTAT-TATTTCTTAGGGGTTTT-TTAGCCTCC  48

seq1  CCAGCAACACCTCAACTGGCTAAAGTATACAGGTCTTTGAGCTAACTGAC  99
      |||||| | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
seq2  CCAGCACCCCTTCACCTGCCTAAAGTATACAGGTCTTTGAGCT-ACTG-C  96

seq1  GTCAGAAAGGAGACTGAGAATTCTGCTGTCATCTGGTTGTTAGCTAATCA  149
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
seq2  GTCAGAAA-GAGACTGAGAATTCTGCTGTCATCTGGATGTAAGCTAATCA  145

seq1  TCTGGTGGAAAGTGGGAAGATAAACTCCACCCATCTGTCCCTTAACAAGG  199
      ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCT-GTGGAAAGT-GGAAGAT-AACTCCACCCATCTGTCCCTTAACAAGG  192

seq1  ACTCTGCTCTGAATGTTTCCAACAGCTTTGTCTTAGGTTTTTACTGCTAT  249
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGCTCTGAATGTTTCC-ACAGCTTTGTCTTAGGTTTTTACTGCTAT  241

seq1  GAACAGGTACTGAGACCAAGGCAAGTCTTATAAGGACAACATTTAATTGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGGTACTGAGACCAAGGCAAGTCTTATAAGGACAACATTTAATTGG  291

seq1  TGCTGGCTTGCAGGTTCAGAGGTTCAGTCCATTATCATCAAGGCTGGAAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGCTTGCAGGTTCAGAGGTTCAGTCCATTATCATCAAGGCTGGAAG  341

seq1  CATGGCAGCATCCAGGCAGGCAGGATGCAGGAGGAGTAGAGAGTTCTACA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCAGCATCCAGGCAGGCAGGATGCAGGAGGAGTAGAGAGTTCTACA  391

seq1  TCTTCATCTGAAGGCTGCTAGCAGAATACTGGATTCCAGGTAGCTAGGAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCATCTGAAGGCTGCTAGCAGAATACTGGATTCCAGGTAGCTAGGAT  441

seq1  GAGGGTCTTAAAACCCATACCCGTGGAGACACACCTACTCCAAGAGGGAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTCTTAAAACCCATACCCGTGGAGACACACCTACTCCAAGAGGGAT  491

seq1  ATACCTACTCCAACAAGGCTACTTCTTCTAATAGTGCCACTCACTGGGCC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTACTCCAACAAGGCTACTTCTTCTAATAGTGCCACTCACTGGGCC  541

seq1  AAACATATACAAACCGTAACAAGCTCCATCTTCTATTACTTTTCCTTAGG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATATACAAACCGTAACAAGCTCCATCTTCTATTACTTTTCCTTAGG  591

seq1  CTATTCAAAGGCATTATCCGTCCTGATCAGTCAAGCCAGAGGTCTAGGCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCAAAGGCATTATCCGTCCTGATCAGTCAAGCCAGAGGTCTAGGCA  641

seq1  TAACATCTCTGCACACATTTGAGCTACCAGGAGGATAAGAGAGAAAAGCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATCTCTGCACACATTTGAGCTACCAGGAGGATAAGAGAGAAAAGCA  691

seq1  CTGAGGACAGAAAGTATCATCATCTCGAGCTTGTGATTTCCTGTCTCAGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGACAGAAAGTATCATCATCTCGAGCTTGTGATTTCCTGTCTCAGC  741

seq1  TACACATGACCAAGGCACAACCTGCGGTAGAGGAATCAGTGTGTCCTGAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACATGACCAAGGCACAACCTGCGGTAGAGGAATCAGTGTGTCCTGAG  791

seq1  AACTGTGAGCATAAGTAGACATTGCATCCGGTGGTTAGTGGTGTCAGCAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTGAGCATAAGTAGACATTGCATCCGGTGGTTAGTGGTGTCAGCAA  841

seq1  GTGACAGAGCATGCAATTATGCATTATTTTTCCCAAGGACAGAAAGAAAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACAGAGCATGCAATTATGCATTATTTTTCCCAAGGACAGAAAGAAAA  891

seq1  AAATGCAAGAAAAAGAAATCTAGACTTGCACAGCACAAGTTCAATCAATA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCAAGAAAAAGAAATCTAGACTTGCACAGCACAAGTTCAATCAATA  941

seq1  CACATTCCAAACACGTATACAGATCATTAGTCTTTATCTGTCTCCCTTGC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTCCAAACACGTATACAGATCATTAGTCTTTATCTGTCTCCCTTGC  991

seq1  CAAGGGAACCAATCAAAGAAAACTACAGGGCTTTGTGAGGGATACACTAA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGAACCAATCAAAGAAAACTACAGGGCTTTGTGAGGGATACACTAA  1041

seq1  GAGCCCAGAACGGATTCCCCAGGTGTGCATCTGTGGAAGATCTCAGGCCT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCCAGAACGGATTCCCCAGGTGTGCATCTGTGGAAGATCTCAGGCCT  1091

seq1  TGGGAATTC  1108
      |||||||||
seq2  TGGGAATTC  1100

seq1: chr13_68069992_68071099
seq2: B6Ng01-096B05.g_67_1165

seq1  GAATTCCCAAAGCCCCAGATCTTCCACAGATGCACACTGGAGGAAACTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAAAGCCCCAGATCTTCCACAGATGCACACTGGAGGAAACTGT  50

seq1  TCTGGGCTGTTAGTGTATCCCTCACAAGGCACTGTGGTTTTCTTTGATTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGCTGTTAGTGTATCCCTCACAAGGCACTGTGGTTTTCTTTGATTG  100

seq1  GTTCCCTTGGCAAGGGAGATGGATACAGACTGATGGTCTGTATACTTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCCTTGGCAAGGGAGATGGATACAGACTGATGGTCTGTATACTTGTT  150

seq1  TGAAATGTGTATTGATTGAACTTGTGCTGTGCAAGTCTAGATTTCTTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATGTGTATTGATTGAACTTGTGCTGTGCAAGTCTAGATTTCTTTTT  200

seq1  CTTGCATTTCTTCTTTCTCTCCTAGGGAAAAATAATGCATAATTGCATAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCATTTCTTCTTTCTCTCCTAGGGAAAAATAATGCATAATTGCATAC  250

seq1  TCTGTCAGTTCCTGACATCACTAACCACCAGATGCAATGTCTCCTTATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCAGTTCCTGACATCACTAACCACCAGATGCAATGTCTCCTTATGC  300

seq1  TCACAGTTCTCAGGACACACTGATTCCTCTACAGTAGGCTGTGCCTTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGTTCTCAGGACACACTGATTCCTCTACAGTAGGCTGTGCCTTGCT  350

seq1  CATGTGTAGCTGAGACAGGAAGTCACAAGCTCGAGATGATGATACTTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTAGCTGAGACAGGAAGTCACAAGCTCGAGATGATGATACTTTCT  400

seq1  GTTCTGAGTGCTTTTCCCTCTTATCCTCCTGTTAGCTCAAACGTGTGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGAGTGCTTTTCCCTCTTATCCTCCTGTTAGCTCAAACGTGTGCAG  450

seq1  AGATGTTATGGCTAGACCTCTGGCTTAGCTGATCAGCAGGAATAATGCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTTATGGCTAGACCTCTGGCTTAGCTGATCAGCAGGAATAATGCCT  500

seq1  TTGAAAAGCCTAAGGAAAAGTAATAGAAGATGGAGCTTGTTACAGCTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAAGCCTAAGGAAAAGTAATAGAAGATGGAGCTTGTTACAGCTTGA  550

seq1  ATATGTTTGGCCCAGGGAGTGGCACTATTAGAAGAAGTAGCCTTGTTGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTTTGGCCCAGGGAGTGGCACTATTAGAAGAAGTAGCCTTGTTGGA  600

seq1  GTAGGTATGTCCCTCTTGGAGTAGGTGTGTCACCATGGGTATGGGTTTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGTATGTCCCTCTTGGAGTAGGTGTGTCACCATGGGTATGGGTTTTA  650

seq1  AGACCCTCATTCTAGCTACCTGGAAGCCAGTATTCTGCTAGCAGCCTTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCTCATTCTAGCTACCTGGAAGCCAGTATTCTGCTAGCAGCCTTCA  700

seq1  GATGAAGATGTAGAACTCTCTACTCCTCCTGCATCCTGCCTGCCTGGATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAGATGTAGAACTCTCTACTCCTCCTGCATCCTGCCTGCCTGGATG  750

seq1  CTGCCATGCTTCCAGCCTTGAAGATAATGGACTGAACCTCTGAACCTGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCATGCTTCCAGCCTTGAAGATAATGGACTGAACCTCTGAACCTGTA  800

seq1  AGTCAGCACCAATTAAATGTTGTCC-TTATAAGACTTGCCTTGGTCTCGG  849
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGCACCAATTAAATGTTGTCCTTTATAAGACTTGCCTTGGTCTCGG  850

seq1  TACCTGTTCATAGCAGTAAAACCCTTATACAGAGCTGTTGGAAACACTCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGTTCATAGCAGTAAAACCCTTATACAGAGCTGTTGGAAACACTCA  900

seq1  GAGCAGAGTCCTTGGTAAGGGACAGATGGGTGGAGTTCATCTTCCCACTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGAGTCCTTGGTAAGGGACAGATGGGTGGAGTTCATCTTCCCACTT  950

seq1  TCTACCAGATGATTAGCTAACAACCAAATGACAGCAGAATTCTGAGTCTC  999
      |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| 
seq2  TCTACCAGATGA-TAGCT-ACAACCAAATGACAGCAGAA-TCTGAGTCT-  996

seq1  CATTTCTGACGTCAGTTAGCTCAAAGACCTATATATTTTAGCCAGTTGAG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CATTTCTGACGTCAGTTAGCTCAAAGACCTATATATTTTAGCCAGTTGA-  1045

seq1  GTGTTGCTGGTGAGGCTAAGAGAACCCCTATGGGATAGATAAGTATAAAA  1099
      ||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||  |||||  ||| |||
seq2  GTG-TGCTGGTGA-GCTAAGAGA--CCCTATTGGTAAGATAGATAT-AAA  1090

seq1  TAATCTAGT  1108
      |||||||||
seq2  TAATCTAGT  1099