BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-098B01
Chromosome13 (Build37)
Map Location 93,508,232 - 93,640,039
singlet/doubletdoublet
Overlap geneThbs4, EG624619
Upstream geneRasgrf2, Msh3, Dhfr, 6430502M16Rik, 4930405M20Rik, Zfyve16, LOC100039070, Spz1, Serinc5, Ppia-ps13_1124.1
Downstream geneEG218444, Papd4, LOC100039163, Homer1, Jmy, EG619883, Bhmt, Bhmt2, Dmgdh, Arsb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-098B01.bB6Ng01-098B01.g
ACCDH908259DH908260
length381835
definitionDH908259|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098B01, 5' end.DH908260|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098B01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,639,659 - 93,640,039)(93,508,232 - 93,509,066)
sequence
tctaaattttgaaagcatgaattatgtaacactcactacttgttacaagt
ccatttagctcatcctaaagagatgaaacttcgctcaatactcatttctt
acacactcatttcttacatatcacttgctgacccatcagcccaccccgct
gtgtaatgaagttactgctgtgtgcccaatgccaggtagatgccgggagg
atgtgatgaagacctctgcttttatgacgcttactttaaaagatatacaa
attgaaatttttgttgtgaagactaaacaaattactatctcgggaacatt
ttgaccattgcacatatataggttttgtttttaattgctggggtacagag
tgtttgaggtggagttgtttgtttttgttgt
gaattctcctgagggcgactggaggttaaccatgctgaaggcacgtagaa
cactttccacaaagttcccccccacaaaccagctctctttagttctgtgg
gggaccatccaagggcttgtgcttctctggtacttgagcatactacctgc
actggctatttttatgtgaccttgacacaagttagagtcatcaaaattta
gggagccttaattgaggaagtgccttcataagatccagttgtcaggcatc
tccttaattagtggtctaagggggagggtccagtccattatgggtggtgc
cactcctgggttggtagccctgagctctataaggaagcaggatgagcaag
ctatgaagagcaagctactaagcagcacacttccatggcctctgcatcag
ctcctgcctccaggttcctgccctggcttccttcagtaatgaactatgac
gtggaagcataagacaaataaaccctttccttcccatgttgctttggtca
gggtgtttcatcatagcaacagcaaccttaactaggagactacctgagca
ggaaagcctagagatagacagtctcggatgctggtggcaggagagttgca
ggccaccaaagcatctgggcttttggagggttgggtgtggcatgggtccc
agtgaggctttctgcagcctgatggctcgcaggtgtcagctgtggtggtt
tcttgttatgaaaaacatgtgaaggaaactttgcaagaggaagagagtgt
cttttgcctggggctgttggactgcaggccacagacagctggctttgtta
tttctgagagggctgggggagtggagagtggggag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_93639659_93640039
seq2: B6Ng01-098B01.b_54_434 (reverse)

seq1  ACAACAAAAACAAACAACTCCACCTCAAACACTCTGTACCCCAGCAATTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAAAAACAAACAACTCCACCTCAAACACTCTGTACCCCAGCAATTA  50

seq1  AAAACAAAACCTATATATGTGCAATGGTCAAAATGTTCCCGAGATAGTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAAAACCTATATATGTGCAATGGTCAAAATGTTCCCGAGATAGTAA  100

seq1  TTTGTTTAGTCTTCACAACAAAAATTTCAATTTGTATATCTTTTAAAGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTAGTCTTCACAACAAAAATTTCAATTTGTATATCTTTTAAAGTA  150

seq1  AGCGTCATAAAAGCAGAGGTCTTCATCACATCCTCCCGGCATCTACCTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGTCATAAAAGCAGAGGTCTTCATCACATCCTCCCGGCATCTACCTGG  200

seq1  CATTGGGCACACAGCAGTAACTTCATTACACAGCGGGGTGGGCTGATGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGGCACACAGCAGTAACTTCATTACACAGCGGGGTGGGCTGATGGG  250

seq1  TCAGCAAGTGATATGTAAGAAATGAGTGTGTAAGAAATGAGTATTGAGCG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAAGTGATATGTAAGAAATGAGTGTGTAAGAAATGAGTATTGAGCG  300

seq1  AAGTTTCATCTCTTTAGGATGAGCTAAATGGACTTGTAACAAGTAGTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTCATCTCTTTAGGATGAGCTAAATGGACTTGTAACAAGTAGTGAG  350

seq1  TGTTACATAATTCATGCTTTCAAAATTTAGA  381
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTACATAATTCATGCTTTCAAAATTTAGA  381

seq1: chr13_93508232_93509066
seq2: B6Ng01-098B01.g_65_899

seq1  GAATTCTCCTGAGGGCGACTGGAGGTTAACCATGCTGAAGGCACGTAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTGAGGGCGACTGGAGGTTAACCATGCTGAAGGCACGTAGAA  50

seq1  CACTTTCCACAAAGTTCCCCCCCACAAACCAGCTCTCTTTAGTTCTGTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCCACAAAGTTCCCCCCCACAAACCAGCTCTCTTTAGTTCTGTGG  100

seq1  GGGACCATCCAAGGGCTTGTGCTTCTCTGGTACTTGAGCATACTACCTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCATCCAAGGGCTTGTGCTTCTCTGGTACTTGAGCATACTACCTGC  150

seq1  ACTGGCTATTTTTATGTGACCTTGACACAAGTTAGAGTCATCAAAATTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCTATTTTTATGTGACCTTGACACAAGTTAGAGTCATCAAAATTTA  200

seq1  GGGAGCCTTAATTGAGGAAGTGCCTTCATAAGATCCAGTTGTCAGGCATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGCCTTAATTGAGGAAGTGCCTTCATAAGATCCAGTTGTCAGGCATC  250

seq1  TCCTTAATTAGTGGTCTAAGGGGGAGGGTCCAGTCCATTATGGGTGGTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAATTAGTGGTCTAAGGGGGAGGGTCCAGTCCATTATGGGTGGTGC  300

seq1  CACTCCTGGGTTGGTAGCCCTGAGCTCTATAAGGAAGCAGGATGAGCAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCTGGGTTGGTAGCCCTGAGCTCTATAAGGAAGCAGGATGAGCAAG  350

seq1  CTATGAAGAGCAAGCTACTAAGCAGCACACTTCCATGGCCTCTGCATCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGAAGAGCAAGCTACTAAGCAGCACACTTCCATGGCCTCTGCATCAG  400

seq1  CTCCTGCCTCCAGGTTCCTGCCCTGGCTTCCTTCAGTAATGAACTATGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCCTCCAGGTTCCTGCCCTGGCTTCCTTCAGTAATGAACTATGAC  450

seq1  GTGGAAGCATAAGACAAATAAACCCTTTCCTTCCCATGTTGCTTTGGTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAAGCATAAGACAAATAAACCCTTTCCTTCCCATGTTGCTTTGGTCA  500

seq1  GGGTGTTTCATCATAGCAACAGCAACCTTAACTAGGAGACTACCTGAGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTTTCATCATAGCAACAGCAACCTTAACTAGGAGACTACCTGAGCA  550

seq1  GGAAAGCCTAGAGATAGACAGTCTCGGATGCTGGTGGCAGGAGAGTTGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGCCTAGAGATAGACAGTCTCGGATGCTGGTGGCAGGAGAGTTGCA  600

seq1  GGCCACCAAAGCATCTGGGCTTTTGGAGGGTTGGGTGTGGCATGGGTCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACCAAAGCATCTGGGCTTTTGGAGGGTTGGGTGTGGCATGGGTCCC  650

seq1  AGTGAGGCTTTCTGCAGCCTGATGGCTCGCAGGTGTCAGCTGTGGTGGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGGCTTTCTGCAGCCTGATGGCTCGCAGGTGTCAGCTGTGGTGGTT  700

seq1  TCTTGTTATGAAAAACATGTGAAGGAAACTTTGCAAGAGGAAGAGAGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTATGAAAAACATGTGAAGGAAACTTTGCAAGAGGAAGAGAGTGT  750

seq1  CTTTTGCCTGGGGCTGTTGGACTGCAGGCCACAGACAGCTGGCTTTGTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGCCTGGGGCTGTTGGACTGCAGGCCACAGACAGCTGGCTTTGTTA  800

seq1  TTTCTGAGAGGGCTGGGGGAGTGGAGAGTGGGGAG  835
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGAGAGGGCTGGGGGAGTGGAGAGTGGGGAG  835