BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-098B07
Chromosome13 (Build37)
Map Location 93,508,232 - 93,640,045
singlet/doubletdoublet
Overlap geneThbs4, EG624619
Upstream geneRasgrf2, Msh3, Dhfr, 6430502M16Rik, 4930405M20Rik, Zfyve16, LOC100039070, Spz1, Serinc5, Ppia-ps13_1124.1
Downstream geneEG218444, Papd4, LOC100039163, Homer1, Jmy, EG619883, Bhmt, Bhmt2, Dmgdh, Arsb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-098B07.bB6Ng01-098B07.g
ACCDH908271DH908272
length719833
definitionDH908271|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098B07, 5' end.DH908272|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098B07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,639,327 - 93,640,045)(93,508,232 - 93,509,064)
sequence
gaattctctaaattttgaaagcatgaattatgtaacactcactacttgtt
acaagtccatttagctcatcctaaagagatgaaacttcgctcaatactca
tttcttacacactcatttcttacatatcacttgctgacccatcagcccac
cccgctgtgtaatgaagttactgctgtgtgcccaatgccaggtagatgcc
gggaggatgtgatgaagacctctgcttttatgacgcttactttaaaagat
atacaaattgaaatttttgttgtgaagactaaacaaattactatctcggg
aacattttgaccattgcacatatataggttttgtttttaattgctggggt
acagagtgtttgaggtggagttgtttgtttttgttgttgtttttgttttg
tagccaatgctggcctctgtcttactgtgtggctgaggatgaccgtgggc
tcctggtcttcctgcctctataccacaacagcctgctctgaaagtagatt
ttcttacccactgaaatgaagaagtgactttccagatctttggggagagc
aatgcagcatgaggaactgggtttggattcccagaacctacataaaaccc
tagctgcagcagcctgcaccaatatccccagccctaggaggacagagaca
gggggacccctgaagcttgtgagtctagtcagctctggaaaaactacact
agctgagacctcgccatct
gaattctcctgagggcgactggaggttaaccatgctgaaggcacgtagaa
cactttccacaaagttcccccccacaaaccagctctctttagttctgtgg
gggaccatccaagggcttgtgcttctctggtacttgagcatactacctgc
actggctatttttatgtgaccttgacacaagttagagtcatcaaaattta
gggagccttaattgaggaagtgccttcataagatccagttgtcaggcatc
tccttaattagtggtctaagggggagggtccagtccattatgggtggtgc
cactcctgggttggtagccctgagctctataaggaagcaggatgagcaag
ctatgaagagcaagctactaagcagcacacttccatggcctctgcatcag
ctcctgcctccaggttcctgccctggcttccttcagtaatgaactatgac
gtggaagcataagacaaataaaccctttccttcccatgttgctttggtca
gggtgtttcatcatagcaacagcaaccttaactaggagactacctgagca
ggaaagcctagagatagacagtctcggatgctggtggcaggagagttgca
ggccaccaaagcatctgggcttttggagggttgggtgtggcatgggtccc
agtgaggctttctgcagcctgatggctcgcaggtgtcagctgtggtggtt
tcttgttatgaaaaacatgtgaaggaaactttgcaagaggaagagagtgt
cttttgcctggggctgttggactgcaggccacagacagctggctttgtta
tttctgagagggctgggggagtggagagtgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_93639327_93640045
seq2: B6Ng01-098B07.b_46_764 (reverse)

seq1  AGATGGCGAGCTCTCAGCTAGTGTAGTTTTTCCAGAGCTGACTAGACTCA  50
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGCGAGGTCTCAGCTAGTGTAGTTTTTCCAGAGCTGACTAGACTCA  50

seq1  CAAGCTTCAGGGGTCCCCCTGTCTCTGTCCTCCTAGGGCTGGGGATATTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTTCAGGGGTCCCCCTGTCTCTGTCCTCCTAGGGCTGGGGATATTG  100

seq1  GTGCAGGCTGCTGCAGCTAGGGTTTTATGTAGGTTCTGGGAATCCAAACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGGCTGCTGCAGCTAGGGTTTTATGTAGGTTCTGGGAATCCAAACC  150

seq1  CAGTTCCTCATGCTGCATTGCTCTCCCCAAAGATCTGGAAAGTCACTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCCTCATGCTGCATTGCTCTCCCCAAAGATCTGGAAAGTCACTTCT  200

seq1  TCATTTCAGTGGGTAAGAAAATCTACTTTCAGAGCAGGCTGTTGTGGTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTCAGTGGGTAAGAAAATCTACTTTCAGAGCAGGCTGTTGTGGTAT  250

seq1  AGAGGCAGGAAGACCAGGAGCCCACGGTCATCCTCAGCCACACAGTAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAGGAAGACCAGGAGCCCACGGTCATCCTCAGCCACACAGTAAGA  300

seq1  CAGAGGCCAGCATTGGCTACAAAACAAAAACAACAACAAAAACAAACAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGCCAGCATTGGCTACAAAACAAAAACAACAACAAAAACAAACAAC  350

seq1  TCCACCTCAAACACTCTGTACCCCAGCAATTAAAAACAAAACCTATATAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCTCAAACACTCTGTACCCCAGCAATTAAAAACAAAACCTATATAT  400

seq1  GTGCAATGGTCAAAATGTTCCCGAGATAGTAATTTGTTTAGTCTTCACAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAATGGTCAAAATGTTCCCGAGATAGTAATTTGTTTAGTCTTCACAA  450

seq1  CAAAAATTTCAATTTGTATATCTTTTAAAGTAAGCGTCATAAAAGCAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAATTTCAATTTGTATATCTTTTAAAGTAAGCGTCATAAAAGCAGAG  500

seq1  GTCTTCATCACATCCTCCCGGCATCTACCTGGCATTGGGCACACAGCAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCATCACATCCTCCCGGCATCTACCTGGCATTGGGCACACAGCAGT  550

seq1  AACTTCATTACACAGCGGGGTGGGCTGATGGGTCAGCAAGTGATATGTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCATTACACAGCGGGGTGGGCTGATGGGTCAGCAAGTGATATGTAA  600

seq1  GAAATGAGTGTGTAAGAAATGAGTATTGAGCGAAGTTTCATCTCTTTAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGAGTGTGTAAGAAATGAGTATTGAGCGAAGTTTCATCTCTTTAGG  650

seq1  ATGAGCTAAATGGACTTGTAACAAGTAGTGAGTGTTACATAATTCATGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCTAAATGGACTTGTAACAAGTAGTGAGTGTTACATAATTCATGCT  700

seq1  TTCAAAATTTAGAGAATTC  719
      |||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAATTTAGAGAATTC  719

seq1: chr13_93508232_93509064
seq2: B6Ng01-098B07.g_68_900

seq1  GAATTCTCCTGAGGGCGACTGGAGGTTAACCATGCTGAAGGCACGTAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTGAGGGCGACTGGAGGTTAACCATGCTGAAGGCACGTAGAA  50

seq1  CACTTTCCACAAAGTTCCCCCCCACAAACCAGCTCTCTTTAGTTCTGTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCCACAAAGTTCCCCCCCACAAACCAGCTCTCTTTAGTTCTGTGG  100

seq1  GGGACCATCCAAGGGCTTGTGCTTCTCTGGTACTTGAGCATACTACCTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCATCCAAGGGCTTGTGCTTCTCTGGTACTTGAGCATACTACCTGC  150

seq1  ACTGGCTATTTTTATGTGACCTTGACACAAGTTAGAGTCATCAAAATTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCTATTTTTATGTGACCTTGACACAAGTTAGAGTCATCAAAATTTA  200

seq1  GGGAGCCTTAATTGAGGAAGTGCCTTCATAAGATCCAGTTGTCAGGCATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGCCTTAATTGAGGAAGTGCCTTCATAAGATCCAGTTGTCAGGCATC  250

seq1  TCCTTAATTAGTGGTCTAAGGGGGAGGGTCCAGTCCATTATGGGTGGTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAATTAGTGGTCTAAGGGGGAGGGTCCAGTCCATTATGGGTGGTGC  300

seq1  CACTCCTGGGTTGGTAGCCCTGAGCTCTATAAGGAAGCAGGATGAGCAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCTGGGTTGGTAGCCCTGAGCTCTATAAGGAAGCAGGATGAGCAAG  350

seq1  CTATGAAGAGCAAGCTACTAAGCAGCACACTTCCATGGCCTCTGCATCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGAAGAGCAAGCTACTAAGCAGCACACTTCCATGGCCTCTGCATCAG  400

seq1  CTCCTGCCTCCAGGTTCCTGCCCTGGCTTCCTTCAGTAATGAACTATGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCCTCCAGGTTCCTGCCCTGGCTTCCTTCAGTAATGAACTATGAC  450

seq1  GTGGAAGCATAAGACAAATAAACCCTTTCCTTCCCATGTTGCTTTGGTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAAGCATAAGACAAATAAACCCTTTCCTTCCCATGTTGCTTTGGTCA  500

seq1  GGGTGTTTCATCATAGCAACAGCAACCTTAACTAGGAGACTACCTGAGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTTTCATCATAGCAACAGCAACCTTAACTAGGAGACTACCTGAGCA  550

seq1  GGAAAGCCTAGAGATAGACAGTCTCGGATGCTGGTGGCAGGAGAGTTGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGCCTAGAGATAGACAGTCTCGGATGCTGGTGGCAGGAGAGTTGCA  600

seq1  GGCCACCAAAGCATCTGGGCTTTTGGAGGGTTGGGTGTGGCATGGGTCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACCAAAGCATCTGGGCTTTTGGAGGGTTGGGTGTGGCATGGGTCCC  650

seq1  AGTGAGGCTTTCTGCAGCCTGATGGCTCGCAGGTGTCAGCTGTGGTGGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGGCTTTCTGCAGCCTGATGGCTCGCAGGTGTCAGCTGTGGTGGTT  700

seq1  TCTTGTTATGAAAAACATGTGAAGGAAACTTTGCAAGAGGAAGAGAGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTATGAAAAACATGTGAAGGAAACTTTGCAAGAGGAAGAGAGTGT  750

seq1  CTTTTGCCTGGGGCTGTTGGACTGCAGGCCACAGACAGCTGGCTTTGTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGCCTGGGGCTGTTGGACTGCAGGCCACAGACAGCTGGCTTTGTTA  800

seq1  TTTCTGAGAGGGCTGGGGGAGTGGAGAGTGGGG  833
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGAGAGGGCTGGGGGAGTGGAGAGTGGGG  833