BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-103K11
Chromosome13 (Build37)
Map Location 95,197,952 - 95,348,981
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAp3b1
Upstream geneJmy, EG619883, Bhmt, Bhmt2, Dmgdh, Arsb, Cycs-ps3, Lhfpl2, Scamp1, LOC435378, ENSMUSG00000042857
Downstream geneTbca, Otp, Wdr41, Pde8b, Zbed3, Aggf1, Crhbp, S100z, F2rl1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-103K11.bB6Ng01-103K11.g
ACCDH912177DH912178
length1,0061,113
definitionDH912177|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103K11, 5' end.DH912178|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103K11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,197,952 - 95,198,959)(95,347,844 - 95,348,981)
sequence
gaattctgtgtagtcaaggctagccacaaactcaaaaagatctactggga
ctggtgagatggctcagcagttaagaacactggttgttcttccagaggtc
ctgagttcagttcccagtaaccacatggtggctcacaaccaccttctggc
ttgcaggtggacatgcaaacagaacacacacatgcataagtcaattagaa
aaagtttaagaaaagatctacccgactctgcctcctgagtgctgggatta
aaggtgtgtgttattactcatgatttttgttgcattgaaagaagtaaaaa
tgtcaagcaggaaggatatagcttccaaaaatggagaaattggcaaaatt
agcttccaaaatggagaaataagtatattgtggtatggacatacctattc
atctaaatttcttgatatattttaaagtaagcatagatagtaggtcacag
agtccccaagcacttactctgtctgtctttaaagttcgttagtcattcat
tgagtattacagcttgttagcttgtggtatacagattcacaggaaagtgt
gacagactgttaacaattgtgaatgtgttagtgccacaaagcacctcata
aactcgtagttgttgttctctctctggcagtccccaagttgacttgctga
tgcttgcatcctggctcttgtttgtaaggccaccacaaatactatgtttc
caaagtaattgagatgggagttttccagagccccccttccctattcttaa
tttagaatattagtatatgcacataagtatcttgttctaagtattagagt
attgattaagaaaaagaagtgttagatctgggcttggtggtttagcccat
aatcccagcacttgtaagtcagggacaggaaggtggatctctgagtttaa
agctagcctgctctacatagttccaggccttccaggactacatggtgaga
ctctgtctcagagagagagagagagagagagagagagagaagacatgtag
agagag
gaattcttatatattttcctgatttctggggcttcagagggaaaaatacc
atgttcttattttggtccagtggtggtccccacaaaggccagaaagaatg
ggaatagagtttgaggctatgtggccttccactgggctctttccagcgta
tggctaggggtggagactgggaactgcttgaagaacaaggtgtcttctct
cacttcatctcagccttgcaatgttttttccatgctgcaaatggatagct
ataaaattccttccagaatgttctatgattccactttcaaaatatgtggc
catgatgggatggtcaagctataggtctacccggtgtaggtctggattga
aggcatgtgactgtgacttgtatctgcacctctggggacagcctgtgact
tccatacaggccccacataggggagagcctgtcctttcccatcaaatgtc
agaaagaaactggaggtggtgttccatgctgccttacccagaggaacatt
ccacggaagtgccaggcaagatgcttgcaaaggtaggcagacatgatgga
aggccacagagcagcaccaggcagacacgtgcccgtctgacttcttcctc
catcatgcctgcacagcataagacagagtgggaaacagaacaaattcaac
ctctgaatgcttactcaagttatcttagtgtatacattcctgctaattaa
atggcactgtctttaaatgagtttgagttcatgtagccaataaagaggcc
caatatagataaccttatagataaaactacaatttttattcaggcagtag
aaaaaaaaaccaattctttctaacagggtatttcctcatagaccttgata
gtcccagtgaaattcaagtaagagtcagaggaagggttgtgtggggcttt
caaagtggtgtatttagtgaatgaaatccctggatgactttctgctttgg
gaaccagcagccatcagacactaagttctggagggttcctttaagaaatc
atcttctgagaaagtaagaatcagctgttcgagtcaatgatcgttcattg
atatctgctgaggctggtacttggactctccaaggagcacgcagtgacca
ctcattgtcagca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_95197952_95198959
seq2: B6Ng01-103K11.b_44_1049

seq1  GAATTCTGTGTAGTCAAGGCTAGCCACAAACTCAAAAAGATCTACTGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTGTAGTCAAGGCTAGCCACAAACTCAAAAAGATCTACTGGGA  50

seq1  CTGGTGAGATGGCTCAGCAGTTAAGAACACTGGTTGTTCTTCCAGAGGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGAGATGGCTCAGCAGTTAAGAACACTGGTTGTTCTTCCAGAGGTC  100

seq1  CTGAGTTCAGTTCCCAGTAACCACATGGTGGCTCACAACCACCTTCTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTTCAGTTCCCAGTAACCACATGGTGGCTCACAACCACCTTCTGGC  150

seq1  TTGCAGGTGGACATGCAAACAGAACACACACATGCATAAGTCAATTAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGGTGGACATGCAAACAGAACACACACATGCATAAGTCAATTAGAA  200

seq1  AAAGTTTAAGAAAAGATCTACCCGACTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTTAAGAAAAGATCTACCCGACTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATTA  250

seq1  AAGGTGTGTGTTATTACTCATGATTTTTGTTGCATTGAAAGAAGTAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGTGTGTTATTACTCATGATTTTTGTTGCATTGAAAGAAGTAAAAA  300

seq1  TGTCAAGCAGGAAGGATATAGCTTCCAAAAATGGAGAAATTGGCAAAATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAAGCAGGAAGGATATAGCTTCCAAAAATGGAGAAATTGGCAAAATT  350

seq1  AGCTTCCAAAATGGAGAAATAAGTATATTGTGGTATGGACATACCTATTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCAAAATGGAGAAATAAGTATATTGTGGTATGGACATACCTATTC  400

seq1  ATCTAAATTTCTTGATATATTTTAAAGTAAGCATAGATAGTAGGTCACAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAATTTCTTGATATATTTTAAAGTAAGCATAGATAGTAGGTCACAG  450

seq1  AGTCCCCAAGCACTTACTCTGTCTGTCTTTAAAGTTCGTTAGTCATTCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCCCAAGCACTTACTCTGTCTGTCTTTAAAGTTCGTTAGTCATTCAT  500

seq1  TGAGTATTACAGCTTGTTAGCTTGTGGTATACAGATTCACAGGAAAGTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTATTACAGCTTGTTAGCTTGTGGTATACAGATTCACAGGAAAGTGT  550

seq1  GACAGACTGTTAACAATTGTGAATGTGTTAGTGCCACAAAGCACCTCATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGACTGTTAACAATTGTGAATGTGTTAGTGCCACAAAGCACCTCATA  600

seq1  AACTCGTAGTTGTTGTTCTCTCTCTGGCAGTCCCCAAGTTGACTTGCTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCGTAGTTGTTGTTCTCTCTCTGGCAGTCCCCAAGTTGACTTGCTGA  650

seq1  TGCTTGCATCCTGGCTCTTGTTTGTAAGGCCACCACAAATACTATGTTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGCATCCTGGCTCTTGTTTGTAAGGCCACCACAAATACTATGTTTC  700

seq1  CAAAGTAATTGAGATGGGAGTTTTCCAGAGCCCCCCTTCCCTATTCTTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTAATTGAGATGGGAGTTTTCCAGAGCCCCCCTTCCCTATTCTTAA  750

seq1  TTTAGAATATTAGTATATGCACATAAGTATCTTGTTCTAAGTATTAGAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAATATTAGTATATGCACATAAGTATCTTGTTCTAAGTATTAGAGT  800

seq1  ATTGATTAAGAAAAAGAAGTGTTAGATCTGGGCTTGGTGGTTTAGCCCAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTAAGAAAAAGAAGTGTTAGATCTGGGCTTGGTGGTTTAGCCCAT  850

seq1  AATCCCAGCACTTGTAAGTCAGGGACAGGAAGGTGGATCTCTGAGTTTAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCCAGCACTTGTAAGTCAGGGACAGGAAGGTGGATCTCTGAGTTTAA  900

seq1  AGCTAGCCTGCTCTACATAGGTTCCAGGCCTTCCAGGACTACATGGTGAG  950
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGCCTGCTCTACATA-GTTCCAGGCCTTCCAGGACTACATGGTGAG  949

seq1  ACTCTGTCTCAAGGAAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAG  1000
      |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |   
seq2  ACTCTGTCTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA-AGACATGT  998

seq1  AGAGAGAG  1008
      ||||||||
seq2  AGAGAGAG  1006

seq1: chr13_95347844_95348981
seq2: B6Ng01-103K11.g_70_1182 (reverse)

seq1  TGCTGACAATGAGTGGCTCAACTGCAGTGCCTTCCCTTGGTGAGTCCCAG  50
      |||||||||||||||| || ||||| ||||    |||||| |||||| ||
seq2  TGCTGACAATGAGTGG-TC-ACTGC-GTGC---TCCTTGGAGAGTCCAAG  44

seq1  TTACCAGCCTCAAGCAGATATACAAATAGAAACGGATTCATTGACCTCCG  100
       |||||||||| ||||||||| ||   |  ||||   ||||||||   ||
seq2  -TACCAGCCTC-AGCAGATAT-CA---ATGAACG--ATCATTGAC--TCG  84

seq1  AACAAGCTGATTCTCTACTTTCTTCAGAAGATGATTTCCCTAAAAGGAAC  150
      ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| 
seq2  AAC-AGCTGATTCT-TACTTTC-TCAGAAGATGATTT--CTTAAAGGAA-  128

seq1  CCCTCCAGAACTTAGTGTTCTTGATGGCTTGCTGGTTTCCAAAGCAGAAA  200
      ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||
seq2  CCCTCCAGAACTTAGTGT--CTGATGGC-TGCTGGTTCCCAAAGCAGAAA  175

seq1  GTCATCCAGGGATTTCATTCACTAAATACACCACTTTGAAAGCCCCACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATCCAGGGATTTCATTCACTAAATACACCACTTTGAAAGCCCCACAC  225

seq1  AACCCTTCCTCTGACTCTTACTTGAATTTCACTGGGACTATCAAGGTCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTTCCTCTGACTCTTACTTGAATTTCACTGGGACTATCAAGGTCTA  275

seq1  TGAGGAAATACCCTGTTAGAAAGAATTGGTTTTTTTTTCTACTGCCTGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGAAATACCCTGTTAGAAAGAATTGGTTTTTTTTTCTACTGCCTGAA  325

seq1  TAAAAATTGTAGTTTTATCTATAAGGTTATCTATATTGGGCCTCTTTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATTGTAGTTTTATCTATAAGGTTATCTATATTGGGCCTCTTTATT  375

seq1  GGCTACATGAACTCAAACTCATTTAAAGACAGTGCCATTTAATTAGCAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACATGAACTCAAACTCATTTAAAGACAGTGCCATTTAATTAGCAGG  425

seq1  AATGTATACACTAAGATAACTTGAGTAAGCATTCAGAGGTTGAATTTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTATACACTAAGATAACTTGAGTAAGCATTCAGAGGTTGAATTTGTT  475

seq1  CTGTTTCCCACTCTGTCTTATGCTGTGCAGGCATGATGGAGGAAGAAGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTCCCACTCTGTCTTATGCTGTGCAGGCATGATGGAGGAAGAAGTC  525

seq1  AGACGGGCACGTGTCTGCCTGGTGCTGCTCTGTGGCCTTCCATCATGTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACGGGCACGTGTCTGCCTGGTGCTGCTCTGTGGCCTTCCATCATGTCT  575

seq1  GCCTACCTTTGCAAGCATCTTGCCTGGCACTTCCGTGGAATGTTCCTCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTACCTTTGCAAGCATCTTGCCTGGCACTTCCGTGGAATGTTCCTCTG  625

seq1  GGTAAGGCAGCATGGAACACCACCTCCAGTTTCTTTCTGACATTTGATGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAGGCAGCATGGAACACCACCTCCAGTTTCTTTCTGACATTTGATGG  675

seq1  GAAAGGACAGGCTCTCCCCTATGTGGGGCCTGTATGGAAGTCACAGGCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGACAGGCTCTCCCCTATGTGGGGCCTGTATGGAAGTCACAGGCTG  725

seq1  TCCCCAGAGGTGCAGATACAAGTCACAGTCACATGCCTTCAATCCAGACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAGAGGTGCAGATACAAGTCACAGTCACATGCCTTCAATCCAGACC  775

seq1  TACACCGGGTAGACCTATAGCTTGACCATCCCATCATGGCCACATATTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACCGGGTAGACCTATAGCTTGACCATCCCATCATGGCCACATATTTT  825

seq1  GAAAGTGGAATCATAGAACATTCTGGAAGGAATTTTATAGCTATCCATTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTGGAATCATAGAACATTCTGGAAGGAATTTTATAGCTATCCATTT  875

seq1  GCAGCATGGAAAAAACATTGCAAGGCTGAGATGAAGTGAGAGAAGACACC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCATGGAAAAAACATTGCAAGGCTGAGATGAAGTGAGAGAAGACACC  925

seq1  TTGTTCTTCAAGCAGTTCCCAGTCTCCACCCCTAGCCATACGCTGGAAAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCTTCAAGCAGTTCCCAGTCTCCACCCCTAGCCATACGCTGGAAAG  975

seq1  AGCCCAGTGGAAGGCCACATAGCCTCAAACTCTATTCCCATTCTTTCTGG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGTGGAAGGCCACATAGCCTCAAACTCTATTCCCATTCTTTCTGG  1025

seq1  CCTTTGTGGGGACCACCACTGGACCAAAATAAGAACATGGTATTTTTCCC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGTGGGGACCACCACTGGACCAAAATAAGAACATGGTATTTTTCCC  1075

seq1  TCTGAAGCCCCAGAAATCAGGAAAATATATAAGAATTC  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAGCCCCAGAAATCAGGAAAATATATAAGAATTC  1113