BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-114N19
Chromosome13 (Build37)
Map Location 70,796,502 - 70,961,000
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdamts16
Upstream geneLOC100042260, 3110006E14Rik, 4930547H16Rik, Med10, EG620143, LOC100042291, 4930520P13Rik, EG633042, BC018507, EG620473
Downstream gene8030423J24Rik, LOC627230, LOC100042360
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-114N19.bB6Ng01-114N19.g
ACCDH920276DH920277
length9571,089
definitionDH920276|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114N19, 5' end.DH920277|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114N19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,796,502 - 70,797,457)(70,959,905 - 70,961,000)
sequence
gaattcttggccatcttcagttccctgtttttggtcttttggacacacag
ttgcaggtcatctgatgggtgagaagcatcctgcttggacagccaccttc
cctataagtcacccctaccccttcctgcctctcaccgctctgacactggt
tctgggaggcttctgactgaacggtagaggcgtcatggactcccacctcc
atatgcccggctttggctttcacctgtcccctttagaaattctccggtgg
gcagtatgttgagaatcagaaggtccacacccgcactgactcagtgtcta
cacttgcactgatgtcactgtggttttaaaccaagttgactttgacactt
caagtaactcttgtccagggagattacagtaaaacaaaacaaaacaaaca
aaaataagacgaagcccaatttctgattttagtaactttcaccacatggg
ccaccatggttgcctgggtgctctttggccatctactgctcctgaactat
tgtgtcaagaatcttacctagtctaagtaagatcctgcctgtcacttcga
aagatctgctttagcatagacagaaaaaaaacccacaatactcacgctgc
ccttgtccttttcctctctggcgcctatctgtgacaggtaggacttccca
gatagcatcatccaccctgtgttcagcttgttcaggtagtgtttataggg
aactggcattggcctcatgagtgctagtgctaatgagttctgtacttagt
tgcctgcccaggtctctctgagggaccacttaaggttaattataaagtag
ttaaataatccaagtggggtggtacaggcctttgatcccagaacttggga
ggcaaaggcaggcaggtctctgtgagtttgaggccagtctggtctgcata
ttgcattttaggacagccagagctacatagtgagatcatagtctcaaaaa
tacgttt
gaattctctgcaggtcctggttctcaaaagatggtcatcaaagccagaag
atagtaactgagtgggaagatgatgggagagatgacatagatgagcctcc
actgcttgtggttgagaccattgcaactgttacagtgaataaaagagtta
cataataaaaataaatggatatataataactgagttatagtactggttaa
tgtaaaaagtttacttagccttctgggcatcctacttatattatatcctc
tgagactggctctctggccatgagataggaggaggaaaacgttgccacat
ctttggggtttctttgagtacacaggggcaacgatatcctctacccactg
catatatgcatatgactgcatgtgttcttggtcatgtcagcctcctccct
tggaggattataaatgttaggactctcaaagatagtgtcacagtggttta
gagggacagcagtgagcagccacagcagccaacctaaactggacattttc
ggggttgtttgctgggcgtttattatccgctaaccttttcctttgcttgt
tttgttttgtatttttgctcttctagaaacagtgggtcggtccaggcatt
ctagccttaaacagtgtcccaccaatgaggaatagcccaggttcttgtgg
aataactgggctactgtgacgtcaatctttccaggaggaaaacaagacgc
tatttgtgtaataaattctggacagcagcttcttagggagttctttaata
gtccatctctatatgcactgtgacatcttcagaaatcttcatgagtatca
gtggccacatcagcttgcatgaagatcatataatttgagtctaacaatct
gaaaataccatctgtcctaacatttataaccctccaaggatgctgacgtg
accaagagcatatgcagccatatgcataactgagcttggaagctatgaat
ggtccaatttggtctccatagtaacagatgttaaagcactcctaggtcat
tacatgtgtaataaaagtagggtaaaactgcatgggtccagatgatcacc
tccaggccctggatgaaagcttgaagatcatagctcagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_70796502_70797457
seq2: B6Ng01-114N19.b_47_1003

seq1  GAATTCTTGGCCATCTTCAGTTCCCTGTTTTTGGTCTTTTGGACACACAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGGCCATCTTCAGTTCCCTGTTTTTGGTCTTTTGGACACACAG  50

seq1  TTGCAGGTCATCTGATGGGTGAGAAGCATCCTGCTTGGACAGCCACCTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGGTCATCTGATGGGTGAGAAGCATCCTGCTTGGACAGCCACCTTC  100

seq1  CCTATAAGTCACCCCTACCCCTTCCTGCCTCTCACCGCTCTGACACTGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATAAGTCACCCCTACCCCTTCCTGCCTCTCACCGCTCTGACACTGGT  150

seq1  TCTGGGAGGCTTCTGACTGAACGGTAGAGGCGTCATGGACTCCCACCTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGAGGCTTCTGACTGAACGGTAGAGGCGTCATGGACTCCCACCTCC  200

seq1  ATATGCCCGGCTTTGGCTTTCACCTGTCCCCTTTAGAAATTCTCCGGTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCCCGGCTTTGGCTTTCACCTGTCCCCTTTAGAAATTCTCCGGTGG  250

seq1  GCAGTATGTTGAGAATCAGAAGGTCCACACCCGCACTGACTCAGTGTCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTATGTTGAGAATCAGAAGGTCCACACCCGCACTGACTCAGTGTCTA  300

seq1  CACTTGCACTGATGTCACTGTGGTTTTAAACCAAGTTGACTTTGACACTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGCACTGATGTCACTGTGGTTTTAAACCAAGTTGACTTTGACACTT  350

seq1  CAAGTAACTCTTGTCCAGGGAGATTACAGTAAAACAAAACAAAACAAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTAACTCTTGTCCAGGGAGATTACAGTAAAACAAAACAAAACAAACA  400

seq1  AAAATAAGACGAAGCCCAATTTCTGATTTTAGTAACTTTCACCACATGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAGACGAAGCCCAATTTCTGATTTTAGTAACTTTCACCACATGGG  450

seq1  CCACCATGGTTGCCTGGGTGCTCTTTGGCCATCTACTGCTCCTGAACTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATGGTTGCCTGGGTGCTCTTTGGCCATCTACTGCTCCTGAACTAT  500

seq1  TGTGTCAAGAATCTTACCTAGTCTAAGTAAGATCCTGCCTGTCACTTCGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCAAGAATCTTACCTAGTCTAAGTAAGATCCTGCCTGTCACTTCGA  550

seq1  AAGATCTGCTTTAGCATAGACAGAAAAAAAACCCACAATACTCACGCTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCTGCTTTAGCATAGACAGAAAAAAAACCCACAATACTCACGCTGC  600

seq1  CCTTGTCCTTTTCCTCTCTGGCGCCTATCTGTGACAGGTAGGACTTCCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTCCTTTTCCTCTCTGGCGCCTATCTGTGACAGGTAGGACTTCCCA  650

seq1  GATAGCATCATCCACCCTGTGTTCAGCTTGTTCAGGTAGTGTTTATAGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGCATCATCCACCCTGTGTTCAGCTTGTTCAGGTAGTGTTTATAGGG  700

seq1  AACTGGCATTGGCCTCATGAGTGCTAGTGCTAATGAGTTCTGTACTTAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGCATTGGCCTCATGAGTGCTAGTGCTAATGAGTTCTGTACTTAGT  750

seq1  TGCCTGCCCAGGTCTCTCTGAGGGACCACTTAAGGTTAATTATAAAGTAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGCCCAGGTCTCTCTGAGGGACCACTTAAGGTTAATTATAAAGTAG  800

seq1  TTAAATAATCCAAGTGGGGTGGTACAGGCCTTTGATCCCAGAACTTGGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATAATCCAAGTGGGGTGGTACAGGCCTTTGATCCCAGAACTTGGGA  850

seq1  GGCAAAGGCAGGCAGGTCTCTGTGAGTTTGAGGCCAGTCTGGTCTGCATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAAGGCAGGCAGGTCTCTGTGAGTTTGAGGCCAGTCTGGTCTGCATA  900

seq1  GTGCATTCTAGGACAGCCAGAGCTACATAGTGAGATCAT-GTCTCAAAAA  949
       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TTGCATTTTAGGACAGCCAGAGCTACATAGTGAGATCATAGTCTCAAAAA  950

seq1  TACGTTT  956
      |||||||
seq2  TACGTTT  957

seq1: chr13_70959905_70961000
seq2: B6Ng01-114N19.g_68_1156 (reverse)

seq1  ACTGAGCTTATGATCTTCAAAGGCCTTTCACTCAGGGCCTGGAGGTGATC  50
      ||||||| ||||||||||||    ||||||  ||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGC-TATGATCTTCAA---GCTTTCATCCAGGGCCTGGAGGTGATC  46

seq1  ATCTGGACCAATGCAGTTTTACCCTACTTCTATTACACATGTAATGACCT  100
      ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGACCCATGCAGTTTTACCCTACTTTTATTACACATGTAATGACCT  96

seq1  AGGGAGTTGCTTTAAACATCTGTTACTATGGAGACCAAATTGGACCATTC  150
      | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-GGAG-TGCTTT-AACATCTGTTACTATGGAGACCAAATTGGACCATTC  143

seq1  ATAGCTTCCAAGCTCAGTTATGCATATGGCTGCATATGCTCTTGGTCACG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTTCCAAGCTCAGTTATGCATATGGCTGCATATGCTCTTGGTCACG  193

seq1  TCAGCATCCTTGGAGGGTTATAAATGTTAGGACAGATGGTATTTTCAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATCCTTGGAGGGTTATAAATGTTAGGACAGATGGTATTTTCAGAT  243

seq1  TGTTAGACTCAAATTATATGATCTTCATGCAAGCTGATGTGGCCACTGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGACTCAAATTATATGATCTTCATGCAAGCTGATGTGGCCACTGAT  293

seq1  ACTCATGAAGATTTCTGAAGATGTCACAGTGCATATAGAGATGGACTATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATGAAGATTTCTGAAGATGTCACAGTGCATATAGAGATGGACTATT  343

seq1  AAAGAACTCCCTAAGAAGCTGCTGTCCAGAATTTATTACACAAATAGCGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAACTCCCTAAGAAGCTGCTGTCCAGAATTTATTACACAAATAGCGT  393

seq1  CTTGTTTTCCTCCTGGAAAGATTGACGTCACAGTAGCCCAGTTATTCCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTTTCCTCCTGGAAAGATTGACGTCACAGTAGCCCAGTTATTCCAC  443

seq1  AAGAACCTGGGCTATTCCTCATTGGTGGGACACTGTTTAAGGCTAGAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACCTGGGCTATTCCTCATTGGTGGGACACTGTTTAAGGCTAGAATG  493

seq1  CCTGGACCGACCCACTGTTTCTAGAAGAGCAAAAATACAAAACAAAACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGACCGACCCACTGTTTCTAGAAGAGCAAAAATACAAAACAAAACAA  543

seq1  GCAAAGGAAAAGGTTAGCGGATAATAAACGCCCAGCAAACAACCCCGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGGAAAAGGTTAGCGGATAATAAACGCCCAGCAAACAACCCCGAAA  593

seq1  ATGTCCAGTTTAGGTTGGCTGCTGTGGCTGCTCACTGCTGTCCCTCTAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCAGTTTAGGTTGGCTGCTGTGGCTGCTCACTGCTGTCCCTCTAAA  643

seq1  CCACTGTGACACTATCTTTGAGAGTCCTAACATTTATAATCCTCCAAGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGTGACACTATCTTTGAGAGTCCTAACATTTATAATCCTCCAAGGG  693

seq1  AGGAGGCTGACATGACCAAGAACACATGCAGTCATATGCATATATGCAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGCTGACATGACCAAGAACACATGCAGTCATATGCATATATGCAGT  743

seq1  GGGTAGAGGATATCGTTGCCCCTGTGTACTCAAAGAAACCCCAAAGATGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGAGGATATCGTTGCCCCTGTGTACTCAAAGAAACCCCAAAGATGT  793

seq1  GGCAACGTTTTCCTCCTCCTATCTCATGGCCAGAGAGCCAGTCTCAGAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAACGTTTTCCTCCTCCTATCTCATGGCCAGAGAGCCAGTCTCAGAGG  843

seq1  ATATAATATAAGTAGGATGCCCAGAAGGCTAAGTAAACTTTTTACATTAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATATAAGTAGGATGCCCAGAAGGCTAAGTAAACTTTTTACATTAA  893

seq1  CCAGTACTATAACTCAGTTATTATATATCCATTTATTTTTATTATGTAAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTACTATAACTCAGTTATTATATATCCATTTATTTTTATTATGTAAC  943

seq1  TCTTTTATTCACTGTAACAGTTGCAATGGTCTCAACCACAAGCAGTGGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTATTCACTGTAACAGTTGCAATGGTCTCAACCACAAGCAGTGGAG  993

seq1  GCTCATCTATGTCATCTCTCCCATCATCTTCCCACTCAGTTACTATCTTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCATCTATGTCATCTCTCCCATCATCTTCCCACTCAGTTACTATCTTC  1043

seq1  TGGCTTTGATGACCATCTTTTGAGAACCAGGACCTGCAGAGAATTC  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTTGATGACCATCTTTTGAGAACCAGGACCTGCAGAGAATTC  1089