BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-120I18
Chromosome13 (Build37)
Map Location 39,192,133 - 39,206,761
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDsp, 6530403A03Rik, Bmp6, Txndc5, Muted, Eef1e1, LOC621102, Slc35b3
Downstream geneEG666867, LOC100041779, LOC382747, A230103O09Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-120I18.bB6Ng01-120I18.g
ACCDH924463DH924464
length8741,140
definitionDH924463|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-120I18, 5' end.DH924464|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-120I18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(39,192,133 - 39,193,006)(39,205,624 - 39,206,761)
sequence
gaattctctatatgatctttccattcttgagtgaaatattactttaaggc
tatgcacttcaaatttatagaaaaattctgttgtaagtttctggcagctt
ccatagaatttatagaaagtttactcattaattaaatacattattcaatc
ctcatgatctatctatcatatgttctgttatccctgttacaagttgggaa
cctgaggcttacaatgatcaaacctatagcagccaacagttaacagatga
attagaaatgggagccaagttcattgactcaatttggtcctttaaaaaaa
agtcatatatctgatagagacagcattagtttgctccattgtaatggcac
tgagtgtattaattgtgttccaggacacaccccatgcttagtaataattg
gttaacacaaattaaattccatgttttgtttcttagtatatatttttgat
aggaagaatgaacatgaagttgatatgtaattacaggagatgagttaggg
aggaaaaagaatatgattaaatatatttatgatattctcaaaaaacccaa
aatttaaaaaatataaaataaattcacctctccattctcacactctgcca
gtttacttttgtggcttatttttctgtaacaatcaacaatctgctaggtt
agatagcttttgtgaatttaaaaataagatttttctgatcatatgggtct
aacttggtttcttgagtcttgaacataacctacacattagttgggataat
ttaacataggcgtttaggctcttctcccctattttaaaatttacattaac
tattcaagacttgactgaaattccaactaatcaacatctctctctctctc
tctctctctctctctctctctctc
gaattcatttgctactgaaaggaagcagactccacgtaagataagcgtgt
agaatctgtatttgtaagatagtgagagaagaccatttattcactggtat
tctatataaatatgctaggcacttgctagaactaaggactgtcatctcca
cccctccagatggctagaaaatatgtttgatgttaccatcttgttgctga
taaagaatgggaggctctgagtgacttggtggccatttttctaggattat
gcacaagcctgtaagcaaagcttagagcttggtgaccacgagatatgcag
ttcttatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcga
tctattaactcccaattcttacgttggatcatcaagatggaaagttctag
aatttagaaataccttttggtatccttgttcatgacataggctgttctat
agtaatttcttccttgttcttctttttctcctttcctcctcctcttcctg
taccccacttcactttgacatttttagattattgagacaaaatcttatgt
agcccaggctagcttcactagttcaagattatcttcctgctctcatgtcc
taaattttgggggttacagttgtgtggcaccacaagtagacagcattgct
tttatctgacacttggtttgtaaagaaaacctcaatgacttcctctttct
agataacacttgtcaaatcctgtcaaatctttaggtctttgatcttctgc
tatttacatccatgtgtcttgtctctgccagttggcttttactgtcctgc
agcataagggtcttccctgaagtgatcctacgttagcagggcccatctgc
tagctggtctctcacattccatttctgaaacatctctggtggtctcatct
ccattaccctttcatttttatccaaagcatctgtccatcagactctttct
atctggacagttgtgctattcatccttgatagcatctttttagaatcaat
catgggtcacaaaaatgttcctcccccttgcaagctcatacaagttgctt
ttgcaacctttgtttggtggctattcttctcgttggcatggggtctggcc
aggttattttactagacctcaacatcttgcgaaatggaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_39192133_39193006
seq2: B6Ng01-120I18.b_45_918

seq1  GAATTCTCTATATGATCTTTCCATTCTTGAGTGAAATATTACTTTAAGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTATATGATCTTTCCATTCTTGAGTGAAATATTACTTTAAGGC  50

seq1  TATGCACTTCAAATTTATAGAAAAATTCTGTTGTAAGTTTCTGGCAGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCACTTCAAATTTATAGAAAAATTCTGTTGTAAGTTTCTGGCAGCTT  100

seq1  CCATAGAATTTATAGAAAGTTTACTCATTAATTAAATACATTATTCAATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGAATTTATAGAAAGTTTACTCATTAATTAAATACATTATTCAATC  150

seq1  CTCATGATCTATCTATCATATGTTCTGTTATCCCTGTTACAAGTTGGGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGATCTATCTATCATATGTTCTGTTATCCCTGTTACAAGTTGGGAA  200

seq1  CCTGAGGCTTACAATGATCAAACCTATAGCAGCCAACAGTTAACAGATGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGGCTTACAATGATCAAACCTATAGCAGCCAACAGTTAACAGATGA  250

seq1  ATTAGAAATGGGAGCCAAGTTCATTGACTCAATTTGGTCCTTTAAAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGAAATGGGAGCCAAGTTCATTGACTCAATTTGGTCCTTTAAAAAAA  300

seq1  AGTCATATATCTGATAGAGACAGCATTAGTTTGCTCCATTGTAATGGCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATATATCTGATAGAGACAGCATTAGTTTGCTCCATTGTAATGGCAC  350

seq1  TGAGTGTATTAATTGTGTTCCAGGACACACCCCATGCTTAGTAATAATTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGTATTAATTGTGTTCCAGGACACACCCCATGCTTAGTAATAATTG  400

seq1  GTTAACACAAATTAAATTCCATGTTTTGTTTCTTAGTATATATTTTTGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAACACAAATTAAATTCCATGTTTTGTTTCTTAGTATATATTTTTGAT  450

seq1  AGGAAGAATGAACATGAAGTTGATATGTAATTACAGGAGATGAGTTAGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGAATGAACATGAAGTTGATATGTAATTACAGGAGATGAGTTAGGG  500

seq1  AGGAAAAAGAATATGATTAAATATATTTATGATATTCTCAAAAAACCCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAAAGAATATGATTAAATATATTTATGATATTCTCAAAAAACCCAA  550

seq1  AATTTAAAAAATATAAAATAAATTCACCTCTCCATTCTCACACTCTGCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAAAAAATATAAAATAAATTCACCTCTCCATTCTCACACTCTGCCA  600

seq1  GTTTACTTTTGTGGCTTATTTTTCTGTAACAATCAACAATCTGCTAGGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTACTTTTGTGGCTTATTTTTCTGTAACAATCAACAATCTGCTAGGTT  650

seq1  AGATAGCTTTTGTGAATTTAAAAATAAGATTTTTCTGATCATATGGGTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGCTTTTGTGAATTTAAAAATAAGATTTTTCTGATCATATGGGTCT  700

seq1  AACTTGGTTTCTTGAGTCTTGAACATAACCTACACATTAGTTGGGATAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGGTTTCTTGAGTCTTGAACATAACCTACACATTAGTTGGGATAAT  750

seq1  TTAACATAGGCGTTTAGGCTCTTCTCCCCTATTTTAAAATTTACATTAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACATAGGCGTTTAGGCTCTTCTCCCCTATTTTAAAATTTACATTAAC  800

seq1  TATTCAAGACTTGACTGAAATTCCAACTAATCAACATCTCTCTCTCTCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCAAGACTTGACTGAAATTCCAACTAATCAACATCTCTCTCTCTCTC  850

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  874
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  874

seq1: chr13_39205624_39206761
seq2: B6Ng01-120I18.g_67_1206 (reverse)

seq1  TCTCCATCT-GCAAGATGATTGAAGTCTAGTAAAATATACTGGCCAGA-C  48
      ||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |
seq2  TCTCCATTTCGCAAGATG-TTGAGGTCTAGTAAAATAACCTGGCCAGACC  49

seq1  CCATGACAACGAG-AGAATAG-CACCAAACAAAAGATGCAAAAGCAACTT  96
      ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||
seq2  CCATGCCAACGAGAAGAATAGCCACCAAACAAAGGTTGCAAAAGCAACTT  99

seq1  GGTATGAAGCCTGCAAAGAGGA-GAACATTTTTTGTGACCAATGATTGA-  144
       ||||| ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| 
seq2  -GTATG-AGCTTGCAAGGGGGAGGAACA-TTTTTGTGACCCATGATTGAT  146

seq1  TCTAAAAAGATGCTATCAAGGATGAATAGCACAACTGTCCAGATAGGAAA  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TCTAAAAAGATGCTATCAAGGATGAATAGCACAACTGTCCAGATA-GAAA  195

seq1  GAGTCTGATGGACAGATGCTTTGGATAAAAATGAAAGGGTAATGGAGATG  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTGATGGACAGATGCTTTGGATAAAAATGAAAGGGTAATGGAGATG  245

seq1  AGACCCACAGAGATGTTTCAGAAATGGAATGTGGAGAGACCAGCTAGCAG  294
      |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGACCACCAGAGATGTTTCAGAAATGGAATGT-GAGAGACCAGCTAGCAG  294

seq1  AT-GGCCCTGCTAACGTAGGATCACTTCAGGGAAGACCCTTATGCTGCAG  343
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCCCTGCTAACGTAGGATCACTTCAGGGAAGACCCTTATGCTGCAG  344

seq1  GACAGTAAAAGCCAACTGGCAGAGACAAGACACATGGATGTAAATAGCAG  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTAAAAGCCAACTGGCAGAGACAAGACACATGGATGTAAATAGCAG  394

seq1  AAGATCAAAGACCTAAAGATTTGACAGGATTTGACAAGTGTTATCTAGAA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCAAAGACCTAAAGATTTGACAGGATTTGACAAGTGTTATCTAGAA  444

seq1  AGAGGAAGTCATTGAGGTTTTCTTTACAAACCAAGTGTCAGATAAAAGCA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAAGTCATTGAGGTTTTCTTTACAAACCAAGTGTCAGATAAAAGCA  494

seq1  ATGCTGTCTACTTGTGGTGCCACACAACTGTAA-CCCCAAAATTTAGGAC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ATGCTGTCTACTTGTGGTGCCACACAACTGTAACCCCCAAAATTTAGGAC  544

seq1  ATGAGAGCAGGAAGATAATCTTGAACTAGTGAAGCTAGCCTGGGCTACAT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGCAGGAAGATAATCTTGAACTAGTGAAGCTAGCCTGGGCTACAT  594

seq1  AAGATTTTGTCTCAATAATCTAAAAATGTCAAAGTGAAGTGGGGTACAGG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTTTGTCTCAATAATCTAAAAATGTCAAAGTGAAGTGGGGTACAGG  644

seq1  AAGAGGAGGAGGAAAGGAGAAAAAGAAGAACAAGGAAGAAATTACTATAG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGAGGAGGAAAGGAGAAAAAGAAGAACAAGGAAGAAATTACTATAG  694

seq1  AACAGCCTATGTCATGAACAAGGATACCAAAAGGTATTTCTAAATTCTAG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCCTATGTCATGAACAAGGATACCAAAAGGTATTTCTAAATTCTAG  744

seq1  AACTTTCCATCTTGATGATCCAACGTAAGAATTGGGAGTTAATAGATCGA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTTCCATCTTGATGATCCAACGTAAGAATTGGGAGTTAATAGATCGA  794

seq1  TAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAGAACTGC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAGAACTGC  844

seq1  ATATCTCGTGGTCACCAAGCTCTAAGCTTTGCTTACAGGCTTGTGCATAA  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTCGTGGTCACCAAGCTCTAAGCTTTGCTTACAGGCTTGTGCATAA  894

seq1  TCCTAGAAAAATGGCCACCAAGTCACTCAGAGCCTCCCATTCTTTATCAG  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGAAAAATGGCCACCAAGTCACTCAGAGCCTCCCATTCTTTATCAG  944

seq1  CAACAAGATGGTAACATCAAACATATTTTCTAGCCATCTGGAGGGGTGGA  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAGATGGTAACATCAAACATATTTTCTAGCCATCTGGAGGGGTGGA  994

seq1  GATGACAGTCCTTAGTTCTAGCAAGTGCCTAGCATATTTATATAGAATAC  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACAGTCCTTAGTTCTAGCAAGTGCCTAGCATATTTATATAGAATAC  1044

seq1  CAGTGAATAAATGGTCTTCTCTCACTATCTTACAAATACAGATTCTACAC  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGAATAAATGGTCTTCTCTCACTATCTTACAAATACAGATTCTACAC  1094

seq1  GCTTATCTTACGTGGAGTCTGCTTCCTTTCAGTAGCAAATGAATTC  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTATCTTACGTGGAGTCTGCTTCCTTTCAGTAGCAAATGAATTC  1140