BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-124N24
Chromosome13 (Build37)
Map Location 36,511,108 - 36,643,503
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFars2
Upstream geneCdyl, Rpp40, LOC100041568, Ppp1r3g, Lyrm4, LOC100042773, LOC100041590
Downstream geneLOC666758, Nrn1, F13a1, Ly86, LOC100042794, LOC100042800
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-124N24.bB6Ng01-124N24.g
ACCDH927668DH927669
length1,090595
definitionDH927668|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124N24, 5' end.DH927669|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124N24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,511,108 - 36,512,191)(36,642,909 - 36,643,503)
sequence
gaattcaatcccagaacccacttggtacaaagtaggaaatgactcctcag
gttgtcccctgactttcatgtacctaccgtggcacacatatgtgtgtaca
cacatgtgtacatacatacatacacacactcacagtcacactcacactaa
ataaatacagaaatgtttgacattttaaagttgacaactgtgctggaaag
atggctcagcagttaagagcacttgtgaagggactaagtttgattcccag
catccacatgatcactcacaacctcctgtaactctacttccagttccaat
gggtccagtgccctcttctggccacttcaggcaccaggcacacatgtagt
acacagacatacatgaaaaacaaaacactcacataaataagataaatctt
agggggagagaaagaacaacttcctagcactgaggacctaagctgagttt
cattagtccttaaacccacatcatgaggctcacccatgactcactctcta
aaaggaagcaagcaaaggagaatgtgaatggaattcgaactacactttga
tcagcatttctcaaaatgggaggcaggaaaaacaatcttgttataagttg
tacatacttctttcctgctttgcctggcaggggaatctgtgtgcctacta
tgtggaatcgtcacctccatgtcttgagaaccaaagtgcaatatgacaca
aagtacccatggttcttgacttctgctcacctctgcaccccaaaacagca
tccccaagaggagagaaagccacagaaaaggaagatgtaaggaaataaaa
gaggggtgattatatttagattttttttaacctagattgaattgatgagt
gtttctccatagaacgtcttagttttggggaatcctacatcttagttttg
ggattcctgctgctccatgtacctgcttaaatctgaaataacggtatacc
atgtctgatgcaggaattaaacctgcatattagacagataaaattcttca
agaagaactagtgtgcatagggtgctattctttagccctgtatgaggaaa
agaggatcaatatacttattccaggatgagaatcttattg
gaattctggtcttgcaaagtcatatctgataaaccgtgtgcatctgccta
gggacctccctctctggctcccggaggctagctttcaagctgagaaaagc
tattggggatgtagaacatcggaccagaagggtggggcaggcttctgagc
ttccatgagctgttaggagcaatgcactgccaggtcctcaaagtcccatt
ataaatggtggcaatggagtcccgctgagattctgcgcgtgggtctgggc
ctccttgttccgagtttctgcatggccttaataaccactcagctacttca
ttgtccctcatcagagccggcgagctcatgtggtggggctgtttgccact
ccacgggctgtaggtaattagacgcatagaagacacaggtggctctattt
tattaaagcaaaattaaaacaaatgcagccgagagaagagatcaaaccat
gaagctgtacagaaaaaggaatgggccagaatgttctctgctgtgtgtac
ttggtcccgatccttgaggttaacaggtaaattgtcttttaaagccattt
tctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_36511108_36512191
seq2: B6Ng01-124N24.b_47_1136

seq1  GAATTCAATCCCAGAACCCACTTGGTACAAAGTAGGAAATGACTCCTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATCCCAGAACCCACTTGGTACAAAGTAGGAAATGACTCCTCAG  50

seq1  GTTGTCCCCTGACTTTCATGTACCTACCGTGGCACACATATGTGTGTACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCCCCTGACTTTCATGTACCTACCGTGGCACACATATGTGTGTACA  100

seq1  CACATGTGTACATACATACATACACACACTCACAGTCACACTCACACTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGTGTACATACATACATACACACACTCACAGTCACACTCACACTAA  150

seq1  ATAAATACAGAAATGTTTGACATTTTAAAGTTGACAACTGTGCTGGAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATACAGAAATGTTTGACATTTTAAAGTTGACAACTGTGCTGGAAAG  200

seq1  ATGGCTCAGCAGTTAAGAGCACTTGTGAAGGGACTAAGTTTGATTCCCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTCAGCAGTTAAGAGCACTTGTGAAGGGACTAAGTTTGATTCCCAG  250

seq1  CATCCACATGATCACTCACAACCTCCTGTAACTCTACTTCCAGTTCCAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCACATGATCACTCACAACCTCCTGTAACTCTACTTCCAGTTCCAAT  300

seq1  GGGTCCAGTGCCCTCTTCTGGCCACTTCAGGCACCAGGCACACATGTAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCAGTGCCCTCTTCTGGCCACTTCAGGCACCAGGCACACATGTAGT  350

seq1  ACACAGACATACATGAAAAACAAAACACTCACATAAATAAGATAAATCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGACATACATGAAAAACAAAACACTCACATAAATAAGATAAATCTT  400

seq1  AGGGGGAGAGAAAGAACAACTTCCTAGCACTGAGGACCTAAGCTGAGTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGAGAGAAAGAACAACTTCCTAGCACTGAGGACCTAAGCTGAGTTT  450

seq1  CATTAGTCCTTAAACCCACATCATGAGGCTCACCCATGACTCACTCTCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAGTCCTTAAACCCACATCATGAGGCTCACCCATGACTCACTCTCTA  500

seq1  AAAGGAAGCAAGCAAAGGAGAATGTGAATGGAATTCGAACTACACTTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAAGCAAGCAAAGGAGAATGTGAATGGAATTCGAACTACACTTTGA  550

seq1  TCAGCATTTCTCAAAATGGGAGGCAGGAAAAACAATCTTGTTATAAGTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATTTCTCAAAATGGGAGGCAGGAAAAACAATCTTGTTATAAGTTG  600

seq1  TACATACTTCTTTCCTGCTTTGCCTGGCAGGGGAATCTGTGTGCCTACTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATACTTCTTTCCTGCTTTGCCTGGCAGGGGAATCTGTGTGCCTACTA  650

seq1  TGTGGAATCGTCACCTCCATGTCTTGAGAACCAAAGTGCAATATGACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAATCGTCACCTCCATGTCTTGAGAACCAAAGTGCAATATGACACA  700

seq1  AAGTACCCATGGTTCTTGACTTCTGCTCACCTCTGCACCCCAAAACAGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTACCCATGGTTCTTGACTTCTGCTCACCTCTGCACCCCAAAACAGCA  750

seq1  TCCCCAAGAGGAGAGAAAGCCACAGAAAAGGAAGATGTAAGGAAATAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAAGAGGAGAGAAAGCCACAGAAAAGGAAGATGTAAGGAAATAAAA  800

seq1  GAGGGGTGATTATATTTAGATTTTTTTTAACCTAGATTGAATTGATGAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGTGATTATATTTAGATTTTTTTTAACCTAGATTGAATTGATGAGT  850

seq1  GTTTCTCCATAGAACGTCTTAGTTTTGGGGAATCCTACATCTTAGTTTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTCCATAGAACGTCTTAGTTTTGGGGAATCCTACATCTTAGTTTTG  900

seq1  GGATTCCTGCTGCTCCATGTACCTGCTTAAATCTGAAATAACGTTATACC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GGATTCCTGCTGCTCCATGTACCTGCTTAAATCTGAAATAACGGTATACC  950

seq1  ATGTCTGATGCAGGAA-TATACCTGCAATATTAGACAGATCAAATTC-TC  998
      |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||
seq2  ATGTCTGATGCAGGAATTAAACCTGC-ATATTAGACAGATAAAATTCTTC  999

seq1  AAGAAG-ACTAGTGTGCATA-GGTGCTATTC-TTAGCACTGTATGAGGAA  1045
      |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||
seq2  AAGAAGAACTAGTGTGCATAGGGTGCTATTCTTTAGCCCTGTATGAGGAA  1049

seq1  AGGA-GATCAATATACATATT-CAGGATGAAAATCTAATTG  1084
      | || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||
seq2  AAGAGGATCAATATACTTATTCCAGGATGAGAATCTTATTG  1090

seq1: chr13_36642909_36643503
seq2: B6Ng01-124N24.g_67_661 (reverse)

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAATG  50

seq1  GCTTTAAAAGACAATTTACCTGTTAACCTCAAGGATCGGGACCAAGTACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTAAAAGACAATTTACCTGTTAACCTCAAGGATCGGGACCAAGTACA  100

seq1  CACAGCAGAGAACATTCTGGCCCATTCCTTTTTCTGTACAGCTTCATGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCAGAGAACATTCTGGCCCATTCCTTTTTCTGTACAGCTTCATGGT  150

seq1  TTGATCTCTTCTCTCGGCTGCATTTGTTTTAATTTTGCTTTAATAAAATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCTCTTCTCTCGGCTGCATTTGTTTTAATTTTGCTTTAATAAAATA  200

seq1  GAGCCACCTGTGTCTTCTATGCGTCTAATTACCTACAGCCCGTGGAGTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCACCTGTGTCTTCTATGCGTCTAATTACCTACAGCCCGTGGAGTGG  250

seq1  CAAACAGCCCCACCACATGAGCTCGCCGGCTCTGATGAGGGACAATGAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAGCCCCACCACATGAGCTCGCCGGCTCTGATGAGGGACAATGAAG  300

seq1  TAGCTGAGTGGTTATTAAGGCCATGCAGAAACTCGGAACAAGGAGGCCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTGAGTGGTTATTAAGGCCATGCAGAAACTCGGAACAAGGAGGCCCA  350

seq1  GACCCACGCGCAGAATCTCAGCGGGACTCCATTGCCACCATTTATAATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCACGCGCAGAATCTCAGCGGGACTCCATTGCCACCATTTATAATGG  400

seq1  GACTTTGAGGACCTGGCAGTGCATTGCTCCTAACAGCTCATGGAAGCTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTGAGGACCTGGCAGTGCATTGCTCCTAACAGCTCATGGAAGCTCA  450

seq1  GAAGCCTGCCCCACCCTTCTGGTCCGATGTTCTACATCCCCAATAGCTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCCTGCCCCACCCTTCTGGTCCGATGTTCTACATCCCCAATAGCTTT  500

seq1  TCTCAGCTTGAAAGCTAGCCTCCGGGAGCCAGAGAGGGAGGTCCCTAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGCTTGAAAGCTAGCCTCCGGGAGCCAGAGAGGGAGGTCCCTAGGC  550

seq1  AGATGCACACGGTTTATCAGATATGACTTTGCAAGACCAGAATTC  595
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCACACGGTTTATCAGATATGACTTTGCAAGACCAGAATTC  595