BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-127O18
Chromosome13 (Build37)
Map Location 34,296,781 - 34,440,203
singlet/doubletdoublet
Overlap gene3110004L20Rik
Upstream geneSerpinb9e, Serpinb9f, OTTMUSG00000000724, Serpinb9g, LOC100041370, EG619715, LOC382743, OTTMUSG00000000712, LOC193403, Vmn2r-ps94, OTTMUSG00000000720, Serpinb6c, Serpinb6a, Nqo2, 4930482L21Rik, Ripk1, Bphl, Tubb2a, LOC100042686, Tubb2b, 2310047M15Rik
Downstream geneLOC620132, EG666666, 1300014I06Rik, D0H6S2654E, EG432746, LOC666677, Prpf4b, 4933417A18Rik, LOC666697, 1810022C23Rik, Peci
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-127O18.bB6Ng01-127O18.g
ACCDH929910DH929911
length367994
definitionDH929910|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-127O18, 5' end.DH929911|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-127O18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(34,439,837 - 34,440,203)(34,296,781 - 34,297,779)
sequence
ttaagttggctcagctgaacacttgcttgagagattaaacaaatatgaaa
agcttgcttaatgacttaagagtcaaggtaaagcctttgtagatcttaac
agaggacatcatcagatgatcacagctgggtgtactcagtcactccgcaa
ggacacactgagaatctcacatgtgcagatattgttatcacttccgggaa
cactgctgagcaagggaactactaggtgcttacattctggaggtggaagg
taaagccagtatgtaagtaagtaagtcaaacaacggctaacagcaaaggc
catccaaaaaatacggggtggggttgttgctagttgaaaacaaccaactt
ctgtatactagctgggg
gaattcaaaccaaaccaaacctggccacagcttgggacctgagaagaaca
tagctctgaaactcagagatagggaatattctaaccaaaaataataaaac
aaaataaagcagatgaaagctgcatctgcccagtgtacctcatgcttaaa
aagccatggaacagaattaagtaagaggatctctgattgggtggatggag
gttatgtgatcagttcactggcaacggcacttcatggaagaacaatcagg
gctggatcagaggagtgaattctagggtaggatccatgctggtctaggct
gtggggaacaaagagggccaacagccacacactgggaaaggtggcagagt
gcagagacattccaactacttctggtcagcacaggagcttcacacacaac
aagtgcctctgatatattccactgtcttgacacggcagcctggtagtgcc
cagtagcagtcaagtggtaaaacaacttcagtgccaggaagggatttctg
tttggcatgtgtccctgtggccaatgacctaaacccttcttgtctgctct
agtattgacgtgctgttaggcaccaatactagcactggtaggtctggaac
ttgggccttcagaattccttctatattgtgcatgtttatggtattcttcg
aaagcagaataagggccagtgagatggctcaggaagacaatagccaagac
tgagcacctgagtgtcctatccctatgacccgcatggtggaaggagagaa
ccaactcctgcttgttgtcttctgacttcacatgttttgtatggaccaca
ctgaagacacacacacacacacacacatgcatacccttacatgcacatgc
acacacatctagagtaatagattttttaaaatgatttatttgtacttaag
tgtatgcatttgcccttgtgagttatatggcatcatttacacgcaggtcc
tgtggaggcaaaggtatcaaatcctgcaactggagtttacaagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_34439837_34440203
seq2: B6Ng01-127O18.b_58_424 (reverse)

seq1  CCCCAGCTAGTATACAGAAGTTGGTTGTTTTCAACTAGCAACAACCCCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGCTAGTATACAGAAGTTGGTTGTTTTCAACTAGCAACAACCCCAC  50

seq1  CCCGTATTTTTTGGATGGCCTTTGCTGTTAGCCGTTGTTTGACTTACTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGTATTTTTTGGATGGCCTTTGCTGTTAGCCGTTGTTTGACTTACTTA  100

seq1  CTTACATACTGGCTTTACCTTCCACCTCCAGAATGTAAGCACCTAGTAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACATACTGGCTTTACCTTCCACCTCCAGAATGTAAGCACCTAGTAGT  150

seq1  TCCCTTGCTCAGCAGTGTTCCCGGAAGTGATAACAATATCTGCACATGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTGCTCAGCAGTGTTCCCGGAAGTGATAACAATATCTGCACATGTG  200

seq1  AGATTCTCAGTGTGTCCTTGCGGAGTGACTGAGTACACCCAGCTGTGATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCTCAGTGTGTCCTTGCGGAGTGACTGAGTACACCCAGCTGTGATC  250

seq1  ATCTGATGATGTCCTCTGTTAAGATCTACAAAGGCTTTACCTTGACTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGATGATGTCCTCTGTTAAGATCTACAAAGGCTTTACCTTGACTCTT  300

seq1  AAGTCATTAAGCAAGCTTTTCATATTTGTTTAATCTCTCAAGCAAGTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCATTAAGCAAGCTTTTCATATTTGTTTAATCTCTCAAGCAAGTGTT  350

seq1  CAGCTGAGCCAACTTAA  367
      |||||||||||||||||
seq2  CAGCTGAGCCAACTTAA  367

seq1: chr13_34296781_34297779
seq2: B6Ng01-127O18.g_71_1064

seq1  GAATTCAAACCAAACCAAACCTGGCCACAGCTTGGGACCTGAGAAGAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAACCAAACCAAACCTGGCCACAGCTTGGGACCTGAGAAGAACA  50

seq1  TAGCTCTGAAACTCAGAGATAGGGAATATTCTAACCAAAAATAATAAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCTGAAACTCAGAGATAGGGAATATTCTAACCAAAAATAATAAAAC  100

seq1  AAAATAAAGCAGATGAAAGCTGCATCTGCCCAGTGTACCTCATGCTTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAAGCAGATGAAAGCTGCATCTGCCCAGTGTACCTCATGCTTAAA  150

seq1  AAGCCATGGAACAGAATTAAGTAAGAGGATCTCTGATTGGGTGGATGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCATGGAACAGAATTAAGTAAGAGGATCTCTGATTGGGTGGATGGAG  200

seq1  GTTATGTGATCAGTTCACTGGCAACGGCACTTCATGGAAGAACAATCAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGTGATCAGTTCACTGGCAACGGCACTTCATGGAAGAACAATCAGG  250

seq1  GCTGGATCAGAGGAGTGAATTCTAGGGTAGGATCCATGCTGGTCTAGGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGATCAGAGGAGTGAATTCTAGGGTAGGATCCATGCTGGTCTAGGCT  300

seq1  GTGGGGAACAAAGAGGGCCAACAGCCACACACTGGGAAAGGTGGCAGAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGAACAAAGAGGGCCAACAGCCACACACTGGGAAAGGTGGCAGAGT  350

seq1  GCAGAGACATTCCAACTACTTCTGGTCAGCACAGGAGCTTCACACACAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGACATTCCAACTACTTCTGGTCAGCACAGGAGCTTCACACACAAC  400

seq1  AAGTGCCTCTGATATATTCCACTGTCTTGACACGGCAGCCTGGTAGTGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCCTCTGATATATTCCACTGTCTTGACACGGCAGCCTGGTAGTGCC  450

seq1  CAGTAGCAGTCAAGTGGTAAAACAACTTCAGTGCCAGGAAGGGATTTCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAGCAGTCAAGTGGTAAAACAACTTCAGTGCCAGGAAGGGATTTCTG  500

seq1  TTTGGCATGTGTCCCTGTGGCCAATGACCTAAACCCTTCTTGTCTGCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGCATGTGTCCCTGTGGCCAATGACCTAAACCCTTCTTGTCTGCTCT  550

seq1  AGTATTGACGTGCTGTTAGGCACCAATACTAGCACTGGTAGGTCTGGAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTGACGTGCTGTTAGGCACCAATACTAGCACTGGTAGGTCTGGAAC  600

seq1  TTGGGCCTTCAGAATTCCTTCTATATTGTGCATGTTTATGGTATTCTTCG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCCTTCAGAATTCCTTCTATATTGTGCATGTTTATGGTATTCTTCG  650

seq1  AAAGCAGAATAAGGGCCAGTGAGATGGCTCAGGAAGACAATAGCCAAGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAGAATAAGGGCCAGTGAGATGGCTCAGGAAGACAATAGCCAAGAC  700

seq1  TGAGCACCTGAGTGTCCTATCCCTATGACCCGCATGGTGGAAGGAGAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCACCTGAGTGTCCTATCCCTATGACCCGCATGGTGGAAGGAGAGAA  750

seq1  CCAACTCCTGCTTGTTGTCTTCTGACTTCACATGTTTGTTATGGACCACA  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||
seq2  CCAACTCCTGCTTGTTGTCTTCTGACTTCACATGTTTTGTATGGACCACA  800

seq1  CTG-AGACACACACACACACACACACATGCATACACATACATGCACATGC  849
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
seq2  CTGAAGACACACACACACACACACACATGCATACCCTTACATGCACATGC  850

seq1  ACACACATCTAGAGTAATAGATTTTTTAAAATGATTTATTTGGTACTTAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ACACACATCTAGAGTAATAGATTTTTTAAAATGATTTATTT-GTACTTAA  899

seq1  GTGTATGCATTTGCCTATGTGAGTTTATAT-GCATCATTTACACGCAGGT  948
      |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGCATTTGCCCTTGTGAG-TTATATGGCATCATTTACACGCAGGT  948

seq1  ACCTGTGGAGGCCAGAGGGTATCAGATACCCTGCAACTGGAGTTTACAAG  998
       |||||||||||   | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||
seq2  -CCTGTGGAGGC--AAAGGTATCAAAT--CCTGCAACTGGAGTTTACAAG  993

seq1  C  999
      |
seq2  C  994