BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128L14
Chromosome13 (Build37)
Map Location 4,832,347 - 4,964,274
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG432723
Upstream geneCalm4, Calm5, LOC100039279, Net1, Tubal3, Ucn3, Akr1c14, Akr1c18, LOC100039262, Akr1c13, Akr1c19, Akr1c12, Akr1c6, Akr1c20, Akr1c21, Akr1e1, EG432721
Downstream gene1700016G22Rik, Klf6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128L14.bB6Ng01-128L14.g
ACCDH930498DH930499
length1,1951,054
definitionDH930498|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128L14, 5' end.DH930499|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128L14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(4,832,347 - 4,833,563)(4,963,206 - 4,964,274)
sequence
gaattcctaaagatatggtttgaaggaatccaattttccagtatttgata
gaaaatacatttgaataatgcagtcatggtagtcatgggaattcatctct
tctactaccttcaacaggaaggtaatttatacactgtattttaaaggtat
tccttattttaactatcaacagaaaggacatttaagaggatagaagtatc
ttaaaatatgtaatgtgggaaatttgcctaaaatatacataaacaaaatt
tatctataaaagcgtttaaaaggttgtaaaattcctaaagtaccaatggg
tctggaaatgcaaatatatttatagtgttacatgtagtaaattataatag
ataagtcttatattaaaaacatgttctttatcatttggcatgtgtttaaa
caaaaatgttattggttacctaggttgctatgccatattgaagtggccct
ctgtctccatcttgctggtgttatgtttagctgagattgacttggttgta
ataagctgtggtgctgaggaggaaacccagaacttgttctatacaaggta
agtgctcagttgtagcacgacacctaactaaacttactcatttctattaa
taatagtgattttgattgacagatcagatttgtattggatacaatgatac
acacacacacacatatatatgtacatatatatgattgttaataatgtttt
aaaattatatatgtattgacagaagacaatttttttatagagccaagcag
gcatttatcttctgacttcaggagacagaccaaccaccaaatttccctgc
tcttgttttcttctccctcttgctccagccccactagcttcagcccatag
gtttttatttgtcttttattacagatggttgtaagccaccatgcttggat
ttgaactcatgacttctggaagagcagtcagtgctcttaaccgctgagct
atcttaccagtctgattgtgatattaaactagtcatagaatggagatcag
aaacattaagctatctgtatacttaatgtcatagaaaaatatgctgtaat
aacatgactccctcttatattcctctcaagtatcacatcctgctcactgg
agatttatggacccacatccacatgaaatagggagaaagaaaaatcggat
gaactatttcctctcctcccttctcactccatttctccctccctt
gaattccacccacaatggtgtccaatctgtgcattttccaaatatgcttg
ccaaagaatgaaaactactgaaaaaaggctggaatagacacaagaaaagg
aaaggaagtaaattcaaaagtttaatgagatttaaagtaagttaatttgg
ttaagaattgttattgttattatattatattattattattattattatta
ttattcccattttggccaattgctgttaaacatttgggtgttaataaaat
ggagaaggaatattatttcatcttttacttggatttatgtaagccttaca
aatccatattgaaaagttataaagttaaagcttttaaaactaaactgtgc
acataaaaatatgggatcctcattagagaaacacaattagtatgatagtg
ttattttattaatagttcttacaggttaataaaacaagaaattaactgaa
gatgatttttcccatacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacatacacacacacacatatatgtgtgtgtacgtgtgatttttatat
tatatatataaaatgttagatgtgtttatattatattcacatatatatgg
atacatactttttgtaaactttaacaactaattttaagttcatttttttt
cttctgaatcttctcactctcatataatactattatattatttatatata
taatagtataaaaagtatttaagattatatagtcttacatagctgtgaat
ggagtcaatcttgctctattgcccaagagaccttaaattgttatcttcct
atcagatttccaagttattacaattacaggcaggcaccaatatgctccaa
atagatgatgcttgagaaacaattcagtcttttggtgatgctagtcaagt
gcttactatctaagcacatcttacccaagtacagttttaaattatcacta
aatatagcggtaggaaaagaaacacatatttgtagtcagacagtcagtaa
atgtgaaacaacaattaacaaacaataaaaatgagtgggatttggggggt
gtac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_4832347_4833563
seq2: B6Ng01-128L14.b_49_1243

seq1  GAATTCCTAAAGATATGGTTTGAAGGAATCCAATTTTCCAGTATTTGATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAAAGATATGGTTTGAAGGAATCCAATTTTCCAGTATTTGATA  50

seq1  GAAAATACATTTGAATAATGCAGTCATGGTAGTCATGGGAATTCATCTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATACATTTGAATAATGCAGTCATGGTAGTCATGGGAATTCATCTCT  100

seq1  TCTACTACCTTCAACAGGAAGGTAATTTATACACTGTATTTTAAAGGTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTACCTTCAACAGGAAGGTAATTTATACACTGTATTTTAAAGGTAT  150

seq1  TCCTTATTTTAACTATCAACAGAAAGGACATTTAAGAGGATAGAAGTATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTATTTTAACTATCAACAGAAAGGACATTTAAGAGGATAGAAGTATC  200

seq1  TTAAAATATGTAATGTGGGAAATTTGCCTAAAATATACATAAACAAAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATATGTAATGTGGGAAATTTGCCTAAAATATACATAAACAAAATT  250

seq1  TATCTATAAAAGCGTTTAAAAGGTTGTAAAATTCCTAAAGTACCAATGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATAAAAGCGTTTAAAAGGTTGTAAAATTCCTAAAGTACCAATGGG  300

seq1  TCTGGAAATGCAAATATATTTATAGTGTTACATGTAGTAAATTATAATAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAAATGCAAATATATTTATAGTGTTACATGTAGTAAATTATAATAG  350

seq1  ATAAGTCTTATATTAAAAACATGTTCTTTATCATTTGGCATGTGTTTAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTCTTATATTAAAAACATGTTCTTTATCATTTGGCATGTGTTTAAA  400

seq1  CAAAAATGTTATTGGTTACCTAGGTTGCTATGCCATATTGAAGTGGCCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAATGTTATTGGTTACCTAGGTTGCTATGCCATATTGAAGTGGCCCT  450

seq1  CTGTCTCCATCTTGCTGGTGTTATGTTTAGCTGAGATTGACTTGGTTGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTCCATCTTGCTGGTGTTATGTTTAGCTGAGATTGACTTGGTTGTA  500

seq1  ATAAGCTGTGGTGCTGAGGAGGAAACCCAGAACTTGTTCTATACAAGGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCTGTGGTGCTGAGGAGGAAACCCAGAACTTGTTCTATACAAGGTA  550

seq1  AGTGCTCAGTTGTAGCACGACACCTAACTAAACTTACTCATTTCTATTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTCAGTTGTAGCACGACACCTAACTAAACTTACTCATTTCTATTAA  600

seq1  TAATAGTGATTTTGATTGACAGATCAGATTTGTATTGGATACAATGATAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGTGATTTTGATTGACAGATCAGATTTGTATTGGATACAATGATAC  650

seq1  ACACACACACACATATATATGTACATATATATGATTGTTAATAATGTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACATATATATGTACATATATATGATTGTTAATAATGTTTT  700

seq1  AAAATTATATATGTATTGACAGAAGACAATTTTTTTATAGAGCCAAGCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTATATATGTATTGACAGAAGACAATTTTTTTATAGAGCCAAGCAG  750

seq1  GCATTTATCTTCTGACTTCAGGAGACAGACCAACCACCAAATTTCCCTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTATCTTCTGACTTCAGGAGACAGACCAACCACCAAATTTCCCTGC  800

seq1  TCTTGTTTTCTTCTCCCTCTTGCTCCAGCCCCACTAGCTTCAGCCCATAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTTTCTTCTCCCTCTTGCTCCAGCCCCACTAGCTTCAGCCCATAG  850

seq1  GTTTTTATTTGTCTTTTATTACAGATGGTTGTAAGCCACCATGCTTGGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTATTTGTCTTTTATTACAGATGGTTGTAAGCCACCATGCTTGGAT  900

seq1  TTGAACTCATGACTTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCGCTGAGCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTCATGACTTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCGCTGAGCT  950

seq1  ATCTTACCAGTCTGATTGTTGATAATTAAACTAGTCATAAGAATGGAGAT  1000
      |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||
seq2  ATCTTACCAGTCTGATTG-TGAT-ATTAAACTAGTCAT-AGAATGGAGAT  997

seq1  CAGAAACATTAAGCTATCTTGTATACTTAATTGTCATAGAAAAATATGCT  1050
      |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CAGAAACATTAAGCTATC-TGTATACTTAA-TGTCATAGAAAAATATGCT  1045

seq1  GTAATAACATGACTCCCTCTTATATTCCTTCTCAAAGTATCCACCATCAC  1100
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||| |
seq2  GTAATAACATGACTCCCTCTTATATTCC-TCTC-AAGTATC--ACATC-C  1090

seq1  TGCTACACT-GAGATCTATGAACCCAACAATCCAACAATGAACTACAGAG  1149
      |||| |||| ||||| |||| |||||   |||||   ||||| ||  |||
seq2  TGCT-CACTGGAGATTTATGGACCCA--CATCCA--CATGAAATAGGGAG  1135

seq1  AAAGAAATA-CGTATGAACCTTATTCTCTCTCTCTCCCCCTTCCTCCCCT  1198
      ||||||| | || ||||||  ||||  |||||   | ||||||   | ||
seq2  AAAGAAAAATCGGATGAAC--TATTTCCTCTC---CTCCCTTC--TCACT  1178

seq1  CCCTTTCTCTCCCTCCCTT  1217
      || ||  ||||||||||||
seq2  CCATT--TCTCCCTCCCTT  1195

seq1: chr13_4963206_4964274
seq2: B6Ng01-128L14.g_67_1120 (reverse)

seq1  GTACACCCCACATAATCCCACATCATTTTTTAATTGTTTGTTTATTTGTT  50
      ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||| |||   |
seq2  GTACACCCCCCA-AATCCCAC-TCATTTTT--ATTGTTTGTTAATT--GT  44

seq1  TGTTTCACATTTACTGACTGGTTCTGACCTACAAATATGTGTTTCTTTTC  100
      ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| 
seq2  TGTTTCACATTTACTGACTG--TCTGA-CTACAAATATGTGTTTCTTTT-  90

seq1  CCTACCGCTATTTTTAGTGATAATTTAAAACTTGTACTTTGGGTTAAGAT  150
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||
seq2  CCTACCGCTATATTTAGTGATAATTTAAAAC-TGTACTT--GGGTAAGAT  137

seq1  GTGCTTTAGATAGTAAAGCACTTGACTAGCATTCACAAAAGACCTGAATT  200
      |||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||
seq2  GTGC-TTAGATAGT-AAGCACTTGACTAGCATCACCAAAAGA-CTGAATT  184

seq1  GGTTTCTC-AGCATCATCTATTTGGAGCATATTGGTGCCTGCCTGTAATT  249
       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -GTTTCTCAAGCATCATCTATTTGGAGCATATTGGTGCCTGCCTGTAATT  233

seq1  GTAAT-ACTTGGAAATCTGATAGGAAGATAACAAATTTAAGGTCTCTTTG  298
      ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||
seq2  GTAATAACTTGGAAATCTGATAGGAAGATAAC-AATTTAAGGTCTC-TTG  281

seq1  GGCAATAGAGCAAGATTGACTCCATTCACAGCTATGTAAGACTATATAAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAATAGAGCAAGATTGACTCCATTCACAGCTATGTAAGACTATATAAT  331

seq1  CTTAAATACTTTTTATACTATTATATATAT-AATAATATAATAGTATTAT  397
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CTTAAATACTTTTTATACTATTATATATATAAATAATATAATAGTATTAT  381

seq1  ATGAGAGTGAGAAGATTCAGAAG-AAAAAAATGAACTTAAAATTAGTTGT  446
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGTGAGAAGATTCAGAAGAAAAAAAATGAACTTAAAATTAGTTGT  431

seq1  TAAAGTTTACAAAAAGTATGTATCCATATATATGTGAATATAATATAAAC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTTTACAAAAAGTATGTATCCATATATATGTGAATATAATATAAAC  481

seq1  ACATCTAACATTTTATATATATAATATAAAAATCACACGTACACACACAT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTAACATTTTATATATATAATATAAAAATCACACGTACACACACAT  531

seq1  ATATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  581

seq1  GTGTGTGTATGGGAAAAATCATCTTCAGTTAATTTCTTGTTTTATTAACC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTATGGGAAAAATCATCTTCAGTTAATTTCTTGTTTTATTAACC  631

seq1  TGTAAGAACTATTAATAAAATAACACTATCATACTAATTGTGTTTCTCTA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGAACTATTAATAAAATAACACTATCATACTAATTGTGTTTCTCTA  681

seq1  ATGAGGATCCCATATTTTTATGTGCACAGTTTAGTTTTAAAAGCTTTAAC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGATCCCATATTTTTATGTGCACAGTTTAGTTTTAAAAGCTTTAAC  731

seq1  TTTATAACTTTTCAATATGGATTTGTAAGGCTTACATAAATCCAAGTAAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAACTTTTCAATATGGATTTGTAAGGCTTACATAAATCCAAGTAAA  781

seq1  AGATGAAATAATATTCCTTCTCCATTTTATTAACACCCAAATGTTTAACA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAAATAATATTCCTTCTCCATTTTATTAACACCCAAATGTTTAACA  831

seq1  GCAATTGGCCAAAATGGGAATAATAATAATAATAATAATAATAATATAAT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTGGCCAAAATGGGAATAATAATAATAATAATAATAATAATATAAT  881

seq1  ATAATAACAATAACAATTCTTAACCAAATTAACTTACTTTAAATCTCATT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAACAATAACAATTCTTAACCAAATTAACTTACTTTAAATCTCATT  931

seq1  AAACTTTTGAATTTACTTCCTTTCCTTTTCTTGTGTCTATTCCAGCCTTT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTTTGAATTTACTTCCTTTCCTTTTCTTGTGTCTATTCCAGCCTTT  981

seq1  TTTCAGTAGTTTTCATTCTTTGGCAAGCATATTTGGAAAATGCACAGATT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGTAGTTTTCATTCTTTGGCAAGCATATTTGGAAAATGCACAGATT  1031

seq1  GGACACCATTGTGGGTGGAATTC  1069
      |||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACCATTGTGGGTGGAATTC  1054