BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-138K12
Chromosome13 (Build37)
Map Location 69,746,727 - 69,909,570
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSrd5a1, Nsun2, LOC100042260, 3110006E14Rik
Upstream gene1700001L19Rik, Adcy2, LOC666205, LOC218332, Pols, A530095I07Rik
Downstream gene4930547H16Rik, Med10, EG620143, LOC100042291, 4930520P13Rik, EG633042, BC018507, EG620473, Adamts16
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-138K12.bB6Ng01-138K12.g
ACCDH937855DH937856
length1,094938
definitionDH937855|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-138K12, 5' end.DH937856|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-138K12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,746,727 - 69,747,816)(69,908,631 - 69,909,570)
sequence
gaattcaaccttggccacttttgtcttcacccactctgtgtcactaagtg
tcacatatacagagcacaagaaaaaaaatcaaactgaagggtttggggct
gggtaggaaaatgagaagaacacaagatgtgttcttttagtgcgaagtgg
actgctttttgtctatctcggagggtttaacaaataagattattcacaag
ctacgaagataaagagggaaatataagcaaggtggaaagggaccgtcaaa
tagaagaggtagccctgaagaggatgatagttataaggctgagttttggg
taagaaaacttaaacagaacaatgggttattttggtatgagaaagaattc
tgtgagatagaatgattccctgtccccactcccccagttgaatagctggg
ttgctccagactgggaagaaagaaataaagtagaactaatgatgaatcag
gctaccagggggctgagcaggtagcaggtttgtgaagcacgctaggaaaa
cacccgtgctgcacatgtttgggatacatgtattctcactgctagacgtt
agtgctggcactaatgtcacatgttacgcttgtatgaagctctggggaaa
ctgagaccccagtccgtgaattgagaggtcaagtttaatggttacaactg
gtctcagctcaaccccactggtcctctgacttatctgattgcttatctct
aaggcacggatcccggtacagatctgaatttgcctctgtgcctcattctg
aactctgtaactactgtatgataagcgtctgcaaacgcatggatttgaat
aagacagtgatgtttagtgcctatgaaacagtgaaaagagcctcgcagtg
ggctcattgaaaactgctccttcttccttctaagtttctcatttatgtgc
ctgaaataagggcgcttgtgaacactgatctccagttaccatccttcgtt
cataggaccagattaggcagacttcagagaagtatctccattcaaggacg
gaaaaggtgacagctgttcaaatagaatcactttcgtccaagtactaatg
acagataaagtcaatgaaccagtcgaagggcttgcacgatatgt
gaattctttcctgttgagtcacttgaaggggtcagtctatggtcgcttgg
tgactcccgctcccactgtgcaggagaacattgtggaagctgaagtgtgg
agggagtttcatggcagacaggaagccaaagctataggtatgtgaagagg
ccacagtaagccatagcatgctcctacatcgtccatacaactgggccgct
gcctctcactaatgccatcataaggaatctgccaaaacattaagcccttc
actgggcagagctctcaggatctgatcagtcctggagatgccctcacaga
cacatcagagacgaggctgggtgctttgtgccctccatctctctggcctg
gtactctctgggtaggtagcttagggcagctttgagccctcaaccagtcc
tcctgcctcagcctcctgagtggtgagtggggcttagaacctgggtctaa
cagttctaagcaaaacttggatcctccccagtcccacctgccgctccctg
ctgcttctctttatccctgtaactaaagcaattctgtcttaatttagctc
tctgcataccacagagccctccagctcctctggagaaaaccagaccctgg
tgtgtcgtgaacgtgctgttgggaaactcacttcttacaactttatattt
ttaacttaggcagcaaaagtaacccttctgctttgtagttattttccaaa
tccagctattatgctgttcgaaattcaacctctggtagtgtggtttctat
ttctgttaatgtcaagctttcttgccgttggagcgggaggaagaactatg
tgacgccaggtagcacactccctctgactctaatgagggtgactctcgga
cagtgggcattcagacagcttgggtccccaaggggcaagaagctggtctg
atttgaagtgtgtgtcagagtcaaaactccagatgaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_69746727_69747816
seq2: B6Ng01-138K12.b_43_1136

seq1  GAATTCAACCTTGGCCACTTTTGTCTTCACCCACTCTGTGTCACTAAGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACCTTGGCCACTTTTGTCTTCACCCACTCTGTGTCACTAAGTG  50

seq1  TCACATATACAGAGCACAAGAAAAAAAATCAAACTGAAGGGTTTGGGGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATATACAGAGCACAAGAAAAAAAATCAAACTGAAGGGTTTGGGGCT  100

seq1  GGGTAGGAAAATGAGAAGAACACAAGATGTGTTCTTTTAGTGCGAAGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGGAAAATGAGAAGAACACAAGATGTGTTCTTTTAGTGCGAAGTGG  150

seq1  ACTGCTTTTTGTCTATCTCGGAGGGTTTAACAAATAAGATTATTCACAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTTTTTGTCTATCTCGGAGGGTTTAACAAATAAGATTATTCACAAG  200

seq1  CTACGAAGATAAAGAGGGAAATATAAGCAAGGTGGAAAGGGACCGTCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACGAAGATAAAGAGGGAAATATAAGCAAGGTGGAAAGGGACCGTCAAA  250

seq1  TAGAAGAGGTAGCCCTGAAGAGGATGATAGTTATAAGGCTGAGTTTTGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGAGGTAGCCCTGAAGAGGATGATAGTTATAAGGCTGAGTTTTGGG  300

seq1  TAAGAAAACTTAAACAGAACAATGGGTTATTTTGGTATGAGAAAGAATTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAAACTTAAACAGAACAATGGGTTATTTTGGTATGAGAAAGAATTC  350

seq1  TGTGAGATAGAATGATTCCCTGTCCCCACTCCCCCAGTTGAATAGCTGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGATAGAATGATTCCCTGTCCCCACTCCCCCAGTTGAATAGCTGGG  400

seq1  TTGCTCCAGACTGGGAAGAAAGAAATAAAGTAGAACTAATGATGAATCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCCAGACTGGGAAGAAAGAAATAAAGTAGAACTAATGATGAATCAG  450

seq1  GCTACCAGGGGGCTGAGCAGGTAGCAGGTTTGTGAAGCACGCTAGGAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACCAGGGGGCTGAGCAGGTAGCAGGTTTGTGAAGCACGCTAGGAAAA  500

seq1  CACCCGTGCTGCACATGTTTGGGATACATGTATTCTCACTGCTAGACGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCGTGCTGCACATGTTTGGGATACATGTATTCTCACTGCTAGACGTT  550

seq1  AGTGCTGGCACTAATGTCACATGTTACGCTTGTATGAAGCTCTGGGGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTGGCACTAATGTCACATGTTACGCTTGTATGAAGCTCTGGGGAAA  600

seq1  CTGAGACCCCAGTCCGTGAATTGAGAGGTCAAGTTTAATGGTTACAACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGACCCCAGTCCGTGAATTGAGAGGTCAAGTTTAATGGTTACAACTG  650

seq1  GTCTCAGCTCAACCCCACTGGTCCTCTGACTTATCTGATTGCTTATCTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAGCTCAACCCCACTGGTCCTCTGACTTATCTGATTGCTTATCTCT  700

seq1  AAGGCACGGATCCCGGTACAGATCTGAATTTGCCTCTGTGCCTCATTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCACGGATCCCGGTACAGATCTGAATTTGCCTCTGTGCCTCATTCTG  750

seq1  AACTCTGTAACTACTGTATGATAAGCGTCTGCAAACGCATGGATTTGAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTGTAACTACTGTATGATAAGCGTCTGCAAACGCATGGATTTGAAT  800

seq1  AAGACAGTGATGTTTAGTGCCTATGAAACAGTGAAAAGAGCCTCGCAGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAGTGATGTTTAGTGCCTATGAAACAGTGAAAAGAGCCTCGCAGTG  850

seq1  GGCTCA-TGAAAACTGCTCCTTC-TCCTTCTAAGTTTCCCATTTATGTGC  898
      |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
seq2  GGCTCATTGAAAACTGCTCCTTCTTCCTTCTAAGTTTCTCATTTATGTGC  900

seq1  CTGAGATAAGGGCGCTTGTGAACACTGATCTCCAGTTACCATCCCTCGTT  948
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CTGAAATAAGGGCGCTTGTGAACACTGATCTCCAGTTACCATCCTTCGTT  950

seq1  CATAGGACCAGATCAGGCAGACTTCAGAGGAAGTA-CTCCA-TCAAAGAC  996
      ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||
seq2  CATAGGACCAGATTAGGCAGACTTCAGA-GAAGTATCTCCATTCAAGGAC  999

seq1  GGAAAAGGTGACAGCTGTTCAAATAAGAATCACTTTCGT-CAAGTACTAA  1045
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
seq2  GGAAAAGGTGACAGCTGTTCAAAT-AGAATCACTTTCGTCCAAGTACTAA  1048

seq1  TGACAGATAAAGCCAATG-AGCAGTCAGAGAGGCTTGCACG-TATGT  1090
      |||||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||||| |||||
seq2  TGACAGATAAAGTCAATGAACCAGTC-GAAGGGCTTGCACGATATGT  1094

seq1: chr13_69908631_69909570
seq2: B6Ng01-138K12.g_66_1002 (reverse)

seq1  TTCATCTGGAGTTTTTGACTTCTGACACACACTTCAAAGTCAGA-CAGCT  49
      ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||
seq2  TTCATCTGGAG-TTTTGAC-TCTGACACACACTTCAAA-TCAGACCAGCT  47

seq1  TCTTGCCCCTTGGGGACCC-AGCTGTCTGAATGCCCACTGTCCCGAGAGT  98
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TCTTGCCCCTTGGGGACCCAAGCTGTCTGAATGCCCACTGT-CCGAGAGT  96

seq1  CACCCTCATTGAGAGTCAGAGGGAGTGTGCTACCTGGCGTCACATAGTTC  148
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTCATT-AGAGTCAGAGGGAGTGTGCTACCTGGCGTCACATAGTTC  145

seq1  TTCCTCCCGCTCCAACGGCAAG-AAGCTTGACATTAAACAGAAATAGAAA  197
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTCCTCCCGCTCCAACGGCAAGAAAGCTTGACATT-AACAGAAATAGAAA  194

seq1  CCACACTACCAGAGGTTGAATTTCGAACAGCATAATAGCTGGATTTGGAA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACTACCAGAGGTTGAATTTCGAACAGCATAATAGCTGGATTTGGAA  244

seq1  AATAACTACAAAGCAGAAGGGTTACTTTTGCTGCCTAAGTTAAAAATATA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACTACAAAGCAGAAGGGTTACTTTTGCTGCCTAAGTTAAAAATATA  294

seq1  AAGTTGTAAGAAGTGAGTTTCCCAACAGCACGTTCACGACACACCAGGGT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGTAAGAAGTGAGTTTCCCAACAGCACGTTCACGACACACCAGGGT  344

seq1  CTGGTTTTCTCCAGAGGAGCTGGAGGGCTCTGTGGTATGCAGAGAGCTAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTTTCTCCAGAGGAGCTGGAGGGCTCTGTGGTATGCAGAGAGCTAA  394

seq1  ATTAAGACAGAATTGCTTTAGTTACAGGGATAAAGAGAAGCAGCAGGGAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGACAGAATTGCTTTAGTTACAGGGATAAAGAGAAGCAGCAGGGAG  444

seq1  CGGCAGGTGGGACTGGGGAGGATCCAAGTTTTGCTTAGAACTGTTAGACC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCAGGTGGGACTGGGGAGGATCCAAGTTTTGCTTAGAACTGTTAGACC  494

seq1  CAGGTTCTAAGCCCCACTCACCACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGACTGG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTCTAAGCCCCACTCACCACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGACTGG  544

seq1  TTGAGGGCTCAAAGCTGCCCTAAGCTACCTACCCAGAGAGTACCAGGCCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGGCTCAAAGCTGCCCTAAGCTACCTACCCAGAGAGTACCAGGCCA  594

seq1  GAGAGATGGAGGGCACAAAGCACCCAGCCTCGTCTCTGATGTGTCTGTGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGATGGAGGGCACAAAGCACCCAGCCTCGTCTCTGATGTGTCTGTGA  644

seq1  GGGCATCTCCAGGACTGATCAGATCCTGAGAGCTCTGCCCAGTGAAGGGC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATCTCCAGGACTGATCAGATCCTGAGAGCTCTGCCCAGTGAAGGGC  694

seq1  TTAATGTTTTGGCAGATTCCTTATGATGGCATTAGTGAGAGGCAGCGGCC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGTTTTGGCAGATTCCTTATGATGGCATTAGTGAGAGGCAGCGGCC  744

seq1  CAGTTGTATGGACGATGTAGGAGCATGCTATGGCTTACTGTGGCCTCTTC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGTATGGACGATGTAGGAGCATGCTATGGCTTACTGTGGCCTCTTC  794

seq1  ACATACCTATAGCTTTGGCTTCCTGTCTGCCATGAAACTCCCTCCACACT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACCTATAGCTTTGGCTTCCTGTCTGCCATGAAACTCCCTCCACACT  844

seq1  TCAGCTTCCACAATGTTCTCCTGCACAGTGGGAGCGGGAGTCACCAAGCG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTTCCACAATGTTCTCCTGCACAGTGGGAGCGGGAGTCACCAAGCG  894

seq1  ACCATAGACTGACCCCTTCAAGTGACTCAACAGGAAAGAATTC  940
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATAGACTGACCCCTTCAAGTGACTCAACAGGAAAGAATTC  937