seq1: chr13_9544742_9545728
seq2: B6Ng01-152E02.b_43_1025
seq1 GAATTCTTCAGTCATTAGGCTACAGGCCTCTCTAACAGCAGTTCTTCAAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCTTCAGTCATTAGGCTACAGGCCTCTCTAACAGCAGTTCTTCAAA 50
seq1 TGAAGTTCCCTCCCCCCGTGTATGATATGTTGTGTCAAGTGGATAATAAC 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAAGTTCCCTCCCCCCGTGTATGATATGTTGTGTCAAGTGGATAATAAC 100
seq1 TAACCAGCACGCATAAATCTGGAAACACTGCGAGGTTACCCAGCTGTCAC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAACCAGCACGCATAAATCTGGAAACACTGCGAGGTTACCCAGCTGTCAC 150
seq1 TGTTCCTATTGTTTTACACTATCAGATATATAGGAATCACTATTCATCCC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTTCCTATTGTTTTACACTATCAGATATATAGGAATCACTATTCATCCC 200
seq1 CTCGCGGAAGTGGGAATTCTGTTTAATGCAAACTCTGATTGAATAGCTCT 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCGCGGAAGTGGGAATTCTGTTTAATGCAAACTCTGATTGAATAGCTCT 250
seq1 AATGATATACTATGCTGAAATGCATGGCTAATGTGAATCAAACTGAACCT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATGATATACTATGCTGAAATGCATGGCTAATGTGAATCAAACTGAACCT 300
seq1 CAGGATGTTCAGACTCAGAGATTGCTATTTTACAGGATGCCTTTTGGATT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGGATGTTCAGACTCAGAGATTGCTATTTTACAGGATGCCTTTTGGATT 350
seq1 TTGTTCATTACAAGTTAGCATGCATTGTGGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGTTCATTACAAGTTAGCATGCATTGTGGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTG 400
seq1 TTTGTTTGTTTTGCAGTTGGCCATGAGGTAGTGGAGTTCTAGAGAATTAG 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTGTTTGTTTTGCAGTTGGCCATGAGGTAGTGGAGTTCTAGAGAATTAG 450
seq1 ATCATTTGGAAACATGAATGAGAGCCTATTTGGCAGAAGCACAGATGGGG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATCATTTGGAAACATGAATGAGAGCCTATTTGGCAGAAGCACAGATGGGG 500
seq1 TGTGACAAGGTTAAATACAAAGTTGTAGAAGATGAAGAGGAAACTTGGAT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTGACAAGGTTAAATACAAAGTTGTAGAAGATGAAGAGGAAACTTGGAT 550
seq1 GCTTCCCTTTTCCTACTTCTCCTCATAGGAGTAACTAGGTGGCTGTCCTT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTTCCCTTTTCCTACTTCTCCTCATAGGAGTAACTAGGTGGCTGTCCTT 600
seq1 CCTCCTGCTCCTTCCTCTAGTACTCCCATGACTATTTCTGGCAAAGGCAC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTCCTGCTCCTTCCTCTAGTACTCCCATGACTATTTCTGGCAAAGGCAC 650
seq1 ACCTTCCTGACGCTAGGATCTCAGAAATTGCTCATAAGGATGTGGAACTG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2 ACCTTCCTGACGCTAGGATCTCAGAAATTGCTCATTAGGATGTGGAACTG 700
seq1 TTTATCTGGTGGTCACAGTAAAATGCCATGGACTGTGAGACTTGATCAGG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTATCTGGTGGTCACAGTAAAATGCCATGGACTGTGAGACTTGATCAGG 750
seq1 GAGA-TTTGATCCCTCAGCTCTGGGGCCTAGAAGTTAGAGATGTGCAGGT 799
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGATTTTGATCCCTCAGCTCTGGGGCCTAGAAGTTAGAGATGTGCAGGT 800
seq1 ACAAGCAGTGTTGAGGTCTAGAGGCCTCTCTTCTAGCTCAGAGGGAGCCA 849
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACAAGCAGTGTTGAGGTCTAGTGGCCTCTCTTCTAGCTCAGAGGGAGCCA 850
seq1 TGTCTTTTGTAATCCCCATGGATTACATGGTCTTTTCTCCATCTATGTCT 899
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTCTTTTGTTATCCCCATGGATTACATGGTCTTTTCTCCATCTATGTCT 900
seq1 GTACCTCGAGTCTTCCTTCTTTCTTTAAAAATTCTTTACCTAGTTGATTG 949
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||
seq2 GTACCTCGAGTCTTCCTTCTTTCTTT-AAAATTC-TTACCTAGTTGA-TG 947
seq1 CTTGTTTGTTGGTTGGTTTGGGTATGCATGTTGAGAGA 987
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2 CTTGTTTGTTGGTTGG-TTGGGTATGCATG-TGAGAGA 983
| seq1: chr13_9785585_9785747
seq2: B6Ng01-152E02.g_74_236 (reverse)
seq1 CCTCCACCCCACCCCACCCTCAGCAAGCCATTTGGCCCAAATAGTCCCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTCCACCCCACCCCACCCTCAGCAAGCCATTTGGCCCAAATAGTCCCTT 50
seq1 TGGTGGTAAGCTCATCACACTTATGGAACTGGTGTCTCGCCTGTGTAAGT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGTGGTAAGCTCATCACACTTATGGAACTGGTGTCTCGCCTGTGTAAGT 100
seq1 GGCTGGAGTGTCTCTGGGGTCCAGGTTCCCTGTCCTAATAATGGGCACAC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCTGGAGTGTCTCTGGGGTCCAGGTTCCCTGTCCTAATAATGGGCACAC 150
seq1 AGAGAGAAAAGTA 163
|||||||||||||
seq2 AGAGAGAAAAGTA 163
|