BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-161A09
Chromosome13 (Build37)
Map Location 68,884,204 - 68,981,648
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdcy2
Upstream geneLOC674597, Zfp273, BC048507, LOC666185, LOC100042687, LOC100042692, LOC674779, LOC677603, LOC100042124, LOC666222, AA414992, LOC666238, EG666245, EG666272, LOC100042223, Mtrr, LOC100042233, Fastkd3, 1700001L19Rik
Downstream geneLOC666205, LOC218332, Pols, A530095I07Rik, Srd5a1, Nsun2, LOC100042260, 3110006E14Rik, 4930547H16Rik, Med10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-161A09.bB6Ng01-161A09.g
ACCDH954250DH954251
length1,0141,034
definitionDH954250|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-161A09, 5' end.DH954251|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-161A09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,980,617 - 68,981,648)(68,884,204 - 68,885,257)
sequence
gaattctttcaagccatgtaaagtcagggtatcataagttgaagaccttt
tggactatatgaattctgtgtttgtgagggttacccaggtgaaacacaac
tgatggcatgccgtcatggaacacttcacagggattcgttcagagaaaca
ttgtggtgatgctggatttgctgtatgggcatcacgaagttgttttgcag
aaatctccagaggcttcctctgatctccagtgtgacatctgacaccacag
agatgtgggaaatgaaaccatgaggttgctgctgtgaaacacagggtacc
gcgtgtttttgtttgtttggttggttgttgttgttttgtttggcttgttt
tggtttttgctgttggcaggcagtttttaaataagtagaaggcatacacc
ataaattaacaaaaagtataaggtctgaggatatgacacaagaggtgtct
ggggatcaattttagactcagcagtacccatcttcccaatgtttggcaga
aataccaggactatggaaactgtggcccaagtgatagtctggatccaatg
gtttatatggaggcagtaacctcagacaagacatctctgtatcaaagatt
cccccaaatcaaagacctggtctttgttcagagggggctagttctggtgc
agccatgactcagcagagaaagcccagagggtcctggacctgaagaagca
gtatctggggatagatactcaataaatccaaatactcaataaatccaaag
aaattaagtttctagcagagaaatatagagggagagagaagtggtcccca
cacagccagaaaagacccaggccactggctggggtctcaacttcttctgg
gtttggcactatctgataagttatttctctgcccactaaatgagctaatt
cagccaattagtatattaaatgcagtttatggagctgcttcatacaagtc
actagctccaggagatccagggaagtcaccatggtagggatagagagaga
gaggaagtaaggga
gaattcactcagcagatatctgcagttgttgattaaagaaaagactacta
ttttcagagatacaagctctgtagttcatggtgattttctggtccatatt
tcttgagtccagttgctgtactcttgattcacgattctttcctccattcc
acaacaattacggaggctttccatggaccacttacaggtccatggacctt
tataagtctcagcccatttaattagccccacagcccagtgaagcagacac
tgctgtctgtcccatgtctaataagaggagaatgaaaagctgagacatca
tcacaacttactctccgaatttacagtgacagttaacggttaacggcttc
taaccagtgtccagaaaacaatgacagcaggagtgggcacaggagtggct
gacacaaccttagatagagacctgattgtcccatacaaaagccttgggta
tggtggaactttattttaaactctattttcagtgggagatggaactttcc
ataaagtatgctgaagtcagagactggaatactgcactgagcaaagctgc
ttctgtgtgagcaccagcagcttcaggaacatttccgtctccagttgttt
cttagcaagccagcccagctcaggctagcagctcttctgccttgagactg
caccatccttcatgtaaacctgctttgggacaccacatcgtactatgagt
atgtgcaactttcactttccaatcaatgtgagataaaaaacattgcatgc
agagcatgataccagaatgatttctttggaaagattgggattctggaaga
gagagtttcatgctccactcatgagcacatagatgactcctgaagcagca
catgtattttcctttatggatgcagaacagagttgctggtcacagaggtg
agcaggcatcttcagtactgagcaagtttccaaatctttgtcatctgtcc
catagaggtgtctcatgcatcctccaggacagcctagcagacagcttcag
tgctgcactgtactcagagcagattagtgtgcac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_68980617_68981648
seq2: B6Ng01-161A09.b_48_1060 (reverse)

seq1  CCCTTCCTTCCTCTTCTCTTCTCTGTCCCTTCCCATGGTGACTTCCCTGG  50
      ||||| ||||||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||
seq2  CCCTTACTTCCTC-TCTC-TCTCTATCCC-TACCATGGTGACTTCCCTGG  47

seq1  AATCCTTCCCTGGGGCTAGTGAACTTGTATGAAAGCAGCTTCCCAATAAA  100
      |    |  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||   | |||||
seq2  A----TCTCCTGGAGCTAGTG-ACTTGTATG-AAGCAGCT---CCATAAA  88

seq1  CTTGCATTTAATATAACCTAATTTGGCTTGAATTAGCTCATTTTAGTGGG  150
      | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||||
seq2  C-TGCATTTAATATA--CTAA-TTGGC-TGAATTAGCTCA-TTTAGTGGG  132

seq1  CAGAGAAATAACTTATCAGATAGTGCCAAAACCCAGAAGAAGTTGAGACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAAATAACTTATCAGATAGTGCC-AAACCCAGAAGAAGTTGAGACC  181

seq1  CCAGCCAGTGGCCTGGGTCTTTTCTGGCTGTGTGGGGACCACTTCTCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCAGTGGCCTGGGTCTTTTCTGGCTGTGTGGGGACCACTTCTCTCT  231

seq1  CCCTCTATATTTCTCTGCTAGAAACTTAATTTCTTTGGATTTATTGAGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTATATTTCTCTGCTAGAAACTTAATTTCTTTGGATTTATTGAGTA  281

seq1  TTTGGATTTATTGAGTATCTATCCCCAGATACTGCTTCTTCAGGTCCAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGATTTATTGAGTATCTATCCCCAGATACTGCTTCTTCAGGTCCAGG  331

seq1  ACCCTCTGGGCTTTCTCTGCTGAGTCATGGCTGCACCAGAACTAGCCCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTCTGGGCTTTCTCTGCTGAGTCATGGCTGCACCAGAACTAGCCCCC  381

seq1  TCTGAACAAAGACCAGGTCTTTGATTTGGGGGAATCTTTGATACAGAGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAACAAAGACCAGGTCTTTGATTTGGGGGAATCTTTGATACAGAGAT  431

seq1  GTCTTGTCTGAGGTTACTGCCTCCATATAAACCATTGGATCCAGACTATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGTCTGAGGTTACTGCCTCCATATAAACCATTGGATCCAGACTATC  481

seq1  ACTTGGGCCACAGTTTCCATAGTCCTGGTATTTCTGCCAAACATTGGGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGGCCACAGTTTCCATAGTCCTGGTATTTCTGCCAAACATTGGGAA  531

seq1  GATGGGTACTGCTGAGTCTAAAATTGATCCCCAGACACCTCTTGTGTCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGTACTGCTGAGTCTAAAATTGATCCCCAGACACCTCTTGTGTCAT  581

seq1  ATCCTCAGACCTTATACTTTTTGTTAATTTATGGTGTATGCCTTCTACTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTCAGACCTTATACTTTTTGTTAATTTATGGTGTATGCCTTCTACTT  631

seq1  ATTTAAAAACTGCCTGCCAACAGCAAAAACCAAAACAAGCCAAACAAAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAAAACTGCCTGCCAACAGCAAAAACCAAAACAAGCCAAACAAAAC  681

seq1  AACAACAACCAACCAAACAAACAAAAACACGCGGTACCCTGTGTTTCACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAACCAACCAAACAAACAAAAACACGCGGTACCCTGTGTTTCACA  731

seq1  GCAGCAACCTCATGGTTTCATTTCCCACATCTCTGTGGTGTCAGATGTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAACCTCATGGTTTCATTTCCCACATCTCTGTGGTGTCAGATGTCA  781

seq1  CACTGGAGATCAGAGGAAGCCTCTGGAGATTTCTGCAAAACAACTTCGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGAGATCAGAGGAAGCCTCTGGAGATTTCTGCAAAACAACTTCGTG  831

seq1  ATGCCCATACAGCAAATCCAGCATCACCACAATGTTTCTCTGAACGAATC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCATACAGCAAATCCAGCATCACCACAATGTTTCTCTGAACGAATC  881

seq1  CCTGTGAAGTGTTCCATGACGGCATGCCATCAGTTGTGTTTCACCTGGGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGAAGTGTTCCATGACGGCATGCCATCAGTTGTGTTTCACCTGGGT  931

seq1  AACCCTCACAAACACAGAATTCATATAGTCCAAAAGGTCTTCAACTTATG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTCACAAACACAGAATTCATATAGTCCAAAAGGTCTTCAACTTATG  981

seq1  ATACCCTGACTTTACATGGCTTGAAAGAATTC  1032
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCTGACTTTACATGGCTTGAAAGAATTC  1013

seq1: chr13_68884204_68885257
seq2: B6Ng01-161A09.g_66_1099

seq1  GAATTCACTCAGCAGATATCTGCAGTTGTTGATTAAAGAAAAGACTACTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCAGCAGATATCTGCAGTTGTTGATTAAAGAAAAGACTACTA  50

seq1  TTTTCAGAGATACAAGCTCTGTAGTTCATGGTGATTTTCTGGTCCATATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAGAGATACAAGCTCTGTAGTTCATGGTGATTTTCTGGTCCATATT  100

seq1  TCTTGAGTCCAGTTGCTGTACTCTTGATTCACGATTCTTTCCTCCATTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGAGTCCAGTTGCTGTACTCTTGATTCACGATTCTTTCCTCCATTCC  150

seq1  ACAACAATTACGGAGGCTTTCCATGGACCACTTACAGGTCCATGGACCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAATTACGGAGGCTTTCCATGGACCACTTACAGGTCCATGGACCTT  200

seq1  TATAAGTCTCAGCCCATTTAATTAGCCCCACAGCCCAGTGAAGCAGACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGTCTCAGCCCATTTAATTAGCCCCACAGCCCAGTGAAGCAGACAC  250

seq1  TGCTGTCTGTCCCATGTCTAATAAGAGGAGAATGAAAAGCTGAGACATCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTCTGTCCCATGTCTAATAAGAGGAGAATGAAAAGCTGAGACATCA  300

seq1  TCACAACTTACTCTCCGAATTTACAGTGACAGTTAACGGTTAACGGCTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAACTTACTCTCCGAATTTACAGTGACAGTTAACGGTTAACGGCTTC  350

seq1  TAACCAGTGTCCAGAAAACAATGACAGCAGGAGTGGGCACAGGAGTGGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCAGTGTCCAGAAAACAATGACAGCAGGAGTGGGCACAGGAGTGGCT  400

seq1  GACACAACCTTAGATAGAGACCTGATTGTCCCATACAAAAGCCTTGGGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACAACCTTAGATAGAGACCTGATTGTCCCATACAAAAGCCTTGGGTA  450

seq1  TGGTGGAACTTTATTTTAAACTCTATTTTCAGTGGGAGATGGAACTTTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGAACTTTATTTTAAACTCTATTTTCAGTGGGAGATGGAACTTTCC  500

seq1  ATAAAGTATGCTGAAGTCAGAGACTGGAATACTGCACTGAGCAAAGCTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGTATGCTGAAGTCAGAGACTGGAATACTGCACTGAGCAAAGCTGC  550

seq1  TTCTGTGTGAGCACCAGCAGCTTCAGGAACATTTCCGTCTCCAGTTGTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTGTGAGCACCAGCAGCTTCAGGAACATTTCCGTCTCCAGTTGTTT  600

seq1  CTTAGCAAGCCAGCCCAGCTCAGGCTAGCAGCTCTTCTGCCTTGAGACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCAAGCCAGCCCAGCTCAGGCTAGCAGCTCTTCTGCCTTGAGACTG  650

seq1  CACCATCCTTCATGTAAACCTGCTTTGGGACACCACATCGTACTATGAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATCCTTCATGTAAACCTGCTTTGGGACACCACATCGTACTATGAGT  700

seq1  ATGTGCAACTTTCACTTTCCAATCAATGTGAGATAAAAAACATTGCATGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCAACTTTCACTTTCCAATCAATGTGAGATAAAAAACATTGCATGC  750

seq1  AGAGCATGATACCAGAATGATTTCTTTGGAAAGATTGGGATTCTGGAAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCATGATACCAGAATGATTTCTTTGGAAAGATTGGGATTCTGGAAGA  800

seq1  GAGAGTTTCATGCTCCACTCATGAGCACATAGATGACTCCTGAAGCAGGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GAGAGTTTCATGCTCCACTCATGAGCACATAGATGACTCCTGAAGCA-GC  849

seq1  ACATGTATTTTCCTTTATGGATGCAGAACAGAGTTGCTGGTCACAGAGGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTATTTTCCTTTATGGATGCAGAACAGAGTTGCTGGTCACAGAGGT  899

seq1  GAGCAGGGCATCTTCAGTACTGAGGCAAGTTTCCAAATCTTTGTTCATCT  950
      ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GAGCA-GGCATCTTCAGTACTGA-GCAAGTTTCCAAATCTTTG-TCATCT  946

seq1  GTCCCCATAGAAGGTGTCTCATGCCATCCTCCCGGGACAGCCTAGCAGGG  1000
      || ||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  
seq2  GT-CCCATAG-AGGTGTCTCATG-CATCCT-CCAGGACAGCCTAGCAG--  990

seq1  AACCAGCCTTCCAGTGCTGCACTTGTACTCAGGGAGCAGGATTTAGTGTT  1050
         ||||  | ||||||||||| ||||||||  ||||||   |||||| |
seq2  --ACAGC--TTCAGTGCTGCAC-TGTACTCA--GAGCAG--ATTAGTG-T  1030

seq1  GCAC  1054
      ||||
seq2  GCAC  1034