BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168A22
Chromosome13 (Build37)
Map Location 63,234,904 - 63,356,050
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2010111I01Rik
Upstream geneEG630579, EG630594, LOC665455, LOC100041430, LOC100041962, LOC100041437, LOC100041979, LOC100041986, 8430426H19Rik, LOC100041455, 6720457D02Rik, EG665503, LOC100041493, LOC630857, EG630978, EG435366, LOC380850, LOC630951, Fbp2, Fbp1, LOC100042090, EG665524
Downstream geneFancc, Ptch1, C030010C08Rik, 0610007P08Rik, 9330134C04Rik, EG665575, Hsd17b3, Slc35d2, Zfp367, Habp4, Cdc14b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168A22.bB6Ng01-168A22.g
ACCDH959395DH959396
length1,1631,001
definitionDH959395|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168A22, 5' end.DH959396|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168A22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,354,880 - 63,356,050)(63,234,904 - 63,235,904)
sequence
gaattctgctgttttctgaagacagggtttcaggtagagcaggctggtct
caaattccttctgtggctgaggatgatgaccttgaagttctgatcatcct
gtctccactttctaagtactggagttacaggaaaagcatcgacccaggac
aacttctaagtgagactggaaagcgtgcttcttacactactctgattcat
ctagttggtacctgccagagcagtgtctgtgcagttacctgcaacttaac
actgggggcatttcagctggcttgaagacaccaagcaagtattgcaaaca
ccccagtggcctttactacagctgccattccctacctatcctcagctcta
gggctcctgtcctcttcatctaaaagacaaatgactataaggcctgaaaa
ctagaaggtcatcacttatagcattagtgccatggtttgtgagcaatgac
acacgggcagcattctgaagctgccgtaggcttgagtggccaaaagaaaa
aagtagaatgtgagatttcattccacctgtgtgattccataccccagtgt
tgaggactctaaggagggaggaaaatgctagatttcagcttaattgagct
gctgaccacagcatcactctgttctcaggaaaccacacgttctgggaaga
gaaacgaacagttcaaccacagttagcatgactaagaaaaccaaagtaaa
ataaaggagtgggaagtacaacatcctttgaaaatgggagctgtgactga
actactgttgaaacagcttctgtcttatttctggataatgccctaagata
cattatagcacgaccctaagatacattatagctggctgtctacaaaccaa
ggaaacagtgtacttgccagtaaaggttttcataacacagccccagcatc
atctgcttctcccctaatcttcatgtaaatgctataatatatgaaaccta
cacagaggttctttctgtaccagcctgtgacctcaaaatgggctctacat
aggagcagtgaggggtagtgcatctaggtcatatctgaccacaggatatc
ctggggcagtctgtggagaactgaccaggggaacagggcagttagtagcc
aagcaggggtatacatttctaggccagacagggtcccatagcatgacctg
ttccgaaaagcaa
gaattctctacagcctttaaaagggctgaagtagagcaagtgtggcggaa
gttctcagacagcgtccgccaaggaaacaagagtccatgtccactgtggg
gtggtccacatggacctggaagccagtgtctgtaatgattcacaagacgc
ttgccacagcagttaccatggagagtggcctcgctcagggaagcacagac
tcctttccattgctgactttcacatggagtcctgttgccacaggagtggt
cactaaatgatgagattcaatgagacataagagccaaatgcagatgacat
tctaaagtaagcttcagagttctaaacctcacactgcttgaattccaacc
taaccatttcctcgttaaagcaacatgttaagttgaatttagtccagagc
agagatgtggtgctctgtttaatgtatgctgcctttcttagcaagtgtgt
agatttgtgtgaactctctggaatagccagtgtggtataccatcctttgg
ctgtgagggctcagaagggctagttgatcccaaggtaggtgttcacttga
gtggctctgaccttcagatggaggcacctcttggccaccagcagtgggtc
ctttattctctctgtaaagtaagtctgttgcctcagagaaggtgatagaa
aacctttgtggcagctaaattatgtgactcctgtgaacttccagtaacac
tgaattaatagtgacaccctctttctagcacacgggagaatgaaatttgg
cttcttcacatttcaggttcagaggtcaaagcagcctaacgggagcccat
ggtacctgactgggagagatgctgagcaactgttctcttcatctctgagt
tagtgtccctctctcaggacagcagcagcagcagtttctccatcactgat
tggcccctctgcctctccttatgtgactgaaatgtttgatggtagtccaa
tagattttagcaaaactatggtcctttgttgttgtggggttttttgttgt
t
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_63354880_63356050
seq2: B6Ng01-168A22.b_43_1205 (reverse)

seq1  TTGCTTTTTTGAGACAGGGTCATGCTATGTGGCCCTGTCTGGCCTAGAAA  50
      ||||||||  || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTTTCGGA-ACA-GGTCATGCTATGGGACCCTGTCTGGCCTAGAAA  48

seq1  TGTATAACCCCCTGCCTTTGCTACT-ACTGCCCTGTTCCCCTGGTCAAGT  99
      ||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||
seq2  TGTATA--CCCCTG-CTTGGCTACTAACTGCCCTGTTCCCCTGGTC-AGT  94

seq1  TCTCCACAGACTGCCCCAGGATATTCCTGT-GTCAGATATGAACCTAGAT  148
      ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||
seq2  TCTCCACAGACTGCCCCAGGATA-TCCTGTGGTCAGATATG-ACCTAGAT  142

seq1  GCACTACCCCTCACTTGCTTCCTATGTAGAGCCCATTTTGAGGTCACAGG  198
      |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTACCCCTCAC-TGC-TCCTATGTAGAGCCCATTTTGAGGTCACAGG  190

seq1  CTGGTACAGAAAGAACCTCTGTGTAGGTTTCATATATTATAGCATTTACA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTACAGAAAGAACCTCTGTGTAGGTTTCATATATTATAGCATTTACA  240

seq1  TGAAGATTAGGGGAGAAGCAGATGATGCTGGGGCTGTGTTATGAAAACCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGATTAGGGGAGAAGCAGATGATGCTGGGGCTGTGTTATGAAAACCT  290

seq1  TTACTGGCAAGTACACTGTTTCCTTGGTTTGTAGACAGCCAGCTATAATG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGGCAAGTACACTGTTTCCTTGGTTTGTAGACAGCCAGCTATAATG  340

seq1  TATCTTAGGGTCGTGCTATAATGTATCTTAGGGCATTATCCAGAAATAAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTAGGGTCGTGCTATAATGTATCTTAGGGCATTATCCAGAAATAAG  390

seq1  ACAGAAGCTGTTTCAACAGTAGTTCAGTCACAGCTCCCATTTTCAAAGGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAGCTGTTTCAACAGTAGTTCAGTCACAGCTCCCATTTTCAAAGGA  440

seq1  TGTTGTACTTCCCACTCCTTTATTTTACTTTGGTTTTCTTAGTCATGCTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTACTTCCCACTCCTTTATTTTACTTTGGTTTTCTTAGTCATGCTA  490

seq1  ACTGTGGTTGAACTGTTCGTTTCTCTTCCCAGAACGTGTGGTTTCCTGAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGGTTGAACTGTTCGTTTCTCTTCCCAGAACGTGTGGTTTCCTGAG  540

seq1  AACAGAGTGATGCTGTGGTCAGCAGCTCAATTAAGCTGAAATCTAGCATT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAGTGATGCTGTGGTCAGCAGCTCAATTAAGCTGAAATCTAGCATT  590

seq1  TTCCTCCCTCCTTAGAGTCCTCAACACTGGGGTATGGAATCACACAGGTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCCCTCCTTAGAGTCCTCAACACTGGGGTATGGAATCACACAGGTG  640

seq1  GAATGAAATCTCACATTCTACTTTTTTCTTTTGGCCACTCAAGCCTACGG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAAATCTCACATTCTACTTTTTTCTTTTGGCCACTCAAGCCTACGG  690

seq1  CAGCTTCAGAATGCTGCCCGTGTGTCATTGCTCACAAACCATGGCACTAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTCAGAATGCTGCCCGTGTGTCATTGCTCACAAACCATGGCACTAA  740

seq1  TGCTATAAGTGATGACCTTCTAGTTTTCAGGCCTTATAGTCATTTGTCTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATAAGTGATGACCTTCTAGTTTTCAGGCCTTATAGTCATTTGTCTT  790

seq1  TTAGATGAAGAGGACAGGAGCCCTAGAGCTGAGGATAGGTAGGGAATGGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATGAAGAGGACAGGAGCCCTAGAGCTGAGGATAGGTAGGGAATGGC  840

seq1  AGCTGTAGTAAAGGCCACTGGGGTGTTTGCAATACTTGCTTGGTGTCTTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTAGTAAAGGCCACTGGGGTGTTTGCAATACTTGCTTGGTGTCTTC  890

seq1  AAGCCAGCTGAAATGCCCCCAGTGTTAAGTTGCAGGTAACTGCACAGACA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAGCTGAAATGCCCCCAGTGTTAAGTTGCAGGTAACTGCACAGACA  940

seq1  CTGCTCTGGCAGGTACCAACTAGATGAATCAGAGTAGTGTAAGAAGCACG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCTGGCAGGTACCAACTAGATGAATCAGAGTAGTGTAAGAAGCACG  990

seq1  CTTTCCAGTCTCACTTAGAAGTTGTCCTGGGTCGATGCTTTTCCTGTAAC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCAGTCTCACTTAGAAGTTGTCCTGGGTCGATGCTTTTCCTGTAAC  1040

seq1  TCCAGTACTTAGAAAGTGGAGACAGGATGATCAGAACTTCAAGGTCATCA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTACTTAGAAAGTGGAGACAGGATGATCAGAACTTCAAGGTCATCA  1090

seq1  TCCTCAGCCACAGAAGGAATTTGAGACCAGCCTGCTCTACCTGAAACCCT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCAGCCACAGAAGGAATTTGAGACCAGCCTGCTCTACCTGAAACCCT  1140

seq1  GTCTTCAGAAAACAGCAGAATTC  1171
      |||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCAGAAAACAGCAGAATTC  1163

seq1: chr13_63234904_63235904
seq2: B6Ng01-168A22.g_66_1066

seq1  GAATTCTCTACAGCCTTTAAAAGGGCTGAAGTAGAGCAAGTGTGGCGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTACAGCCTTTAAAAGGGCTGAAGTAGAGCAAGTGTGGCGGAA  50

seq1  GTTCTCAGACAGCGTCCGCCAAGGAAACAAGAGTCCATGTCCACTGTGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTCAGACAGCGTCCGCCAAGGAAACAAGAGTCCATGTCCACTGTGGG  100

seq1  GTGGTCCACATGGACCTGGAAGCCAGTGTCTGTAATGATTCACAAGACGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCCACATGGACCTGGAAGCCAGTGTCTGTAATGATTCACAAGACGC  150

seq1  TTGCCACAGCAGTTACCATGGAGAGTGGCCTCGCTCAGGGAAGCACAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCACAGCAGTTACCATGGAGAGTGGCCTCGCTCAGGGAAGCACAGAC  200

seq1  TCCTTTCCATTGCTGACTTTCACATGGAGTCCTGTTGCCACAGGAGTGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTCCATTGCTGACTTTCACATGGAGTCCTGTTGCCACAGGAGTGGT  250

seq1  CACTAAATGATGAGATTCAATGAGACATAAGAGCCAAATGCAGATGACAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAAATGATGAGATTCAATGAGACATAAGAGCCAAATGCAGATGACAT  300

seq1  TCTAAAGTAAGCTTCAGAGTTCTAAACCTCACACTGCTTGAATTCCAACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAGTAAGCTTCAGAGTTCTAAACCTCACACTGCTTGAATTCCAACC  350

seq1  TAACCATTTCCTCGTTAAAGCAACATGTTAAGTTGAATTTAGTCCAGAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCATTTCCTCGTTAAAGCAACATGTTAAGTTGAATTTAGTCCAGAGC  400

seq1  AGAGATGTGGTGCTCTGTTTAATGTATGCTGCCTTTCTTAGCAAGTGTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGTGGTGCTCTGTTTAATGTATGCTGCCTTTCTTAGCAAGTGTGT  450

seq1  AGATTTGTGTGAACTCTCTGGAATAGCCAGTGTGGTATACCATCCTTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTGTGTGAACTCTCTGGAATAGCCAGTGTGGTATACCATCCTTTGG  500

seq1  CTGTGAGGGCTCAGAAGGGCTAGTTGATCCCAAGGTAGGTGTTCACTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGGGCTCAGAAGGGCTAGTTGATCCCAAGGTAGGTGTTCACTTGA  550

seq1  GTGGCTCTGACCTTCAGATGGAGGCACCTCTTGGCCACCAGCAGTGGGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTCTGACCTTCAGATGGAGGCACCTCTTGGCCACCAGCAGTGGGTC  600

seq1  CTTTATTCTCTCTGTAAAGTAAGTCTGTTGCCTCAGAGAAGGTGATAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATTCTCTCTGTAAAGTAAGTCTGTTGCCTCAGAGAAGGTGATAGAA  650

seq1  AACCTTTGTGGCAGCTAAATTATGTGACTCCTGTGAACTTCCAGTAACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTTGTGGCAGCTAAATTATGTGACTCCTGTGAACTTCCAGTAACAC  700

seq1  TGAATTAATAGTGACACCCTCTTTCTAGCACACGGGAGAATGAAATTTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTAATAGTGACACCCTCTTTCTAGCACACGGGAGAATGAAATTTGG  750

seq1  CTTCTTCACATTTCAGGTTCAGAGGTCAAAGCAGCCTAACGGGAGCCCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTCACATTTCAGGTTCAGAGGTCAAAGCAGCCTAACGGGAGCCCAT  800

seq1  GGTACCTGACTGGGAGAGATGCTGAGCAACTGTTCTCTTCATCTCTGAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACCTGACTGGGAGAGATGCTGAGCAACTGTTCTCTTCATCTCTGAGT  850

seq1  TAGTGTCCCTCTCTCAGGACAGCAGCAGCAGCAGTTTCTCCATCACTGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTCCCTCTCTCAGGACAGCAGCAGCAGCAGTTTCTCCATCACTGAT  900

seq1  TGGCCCCTCTGCCTCTCCTTATGTGACTGAAATGTTTGATGGTAGTCCAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCCCTCTGCCTCTCCTTATGTGACTGAAATGTTTGATGGTAGTCCAA  950

seq1  TAGATTTTAGCAAAACTATGGTCCTTTGTTGTTGTGGGGTTTTTTGTTGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTTTAGCAAAACTATGGTCCTTTGTTGTTGTGGGGTTTTTTGTTGT  1000

seq1  T  1001
      |
seq2  T  1001