BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-169B13
Chromosome13 (Build37)
Map Location 30,513,581 - 30,703,263
singlet/doubletdoublet
Overlap geneUqcrfs1
Upstream geneCdkal1, E2f3, Mboat1, Agtr1a
Downstream geneDusp22, LOC666443, Irf4, Exoc2, Hus1b, EG432743, LOC100041257, LOC100041266, G630018N14Rik, LOC100042491, Foxq1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-169B13.bB6Ng01-169B13.g
ACCDH960163DH960164
length9961,030
definitionDH960163|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169B13, 5' end.DH960164|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169B13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,513,581 - 30,514,381)(30,702,234 - 30,703,263)
sequence
gaattcttctgacaataaaagctgggcctgtgagtccaccagaggtctcc
attcccaaatgtggagaacctggatgcaagaaattcagttggataaatgt
cctttgattttgcatactatttgagtctggggtattgttctttggtgatt
cttagactctaacaacacatatgcatggtattcgctatttactctcaaac
gtaccaagaaagaaagttctttatcctgctcttacaattctcccagaagg
tggaaaattaattcacattaaaaataagagcctaggaagacatctcagtt
gctagtctagtttcattcagatattgccccgatgaaatgttctgacagaa
agtgtctcaaggagaaagggcttatgctagctcacagttctctgttgcac
ttcaaggtaacatgaaagtcaatgtaagaggaacttacaaccaatagtca
cattatatccacaggcaaaaccatggaagtattaatgaacacatgctcat
ttgtttatatgtttgtgcttagctagatttctttacccttacacagttca
ggaccacctgccgagggaatggggctacccatagtagacttgttcttccc
aagtgaatttacttagtaaatataatcccatatatacatgcccacagtcc
aacacaatgtaagcaaatcctcattgtaagactctctatccaggtgatta
tagattctgccaagttgacaactgactctaaccatacagttcataaaata
tttactacacaaggaggaacactagaattagatcctcaacacccacatgt
ggaaaaccagatgtggtgacatgtgcttgtaatcacaatgctgatagatc
ctgacccttgctgaccacccaacctcaccttaatcagaaggctctaggtc
acagtgagttaccctgtctcaaataacaaggtgtgcagtttactaaagaa
caatacctgaaattgatttctagcttcttcatgtaaaatggtgtgg
gaattcttttccagtaatagatacacttgagcagtttctgggcaagacca
ccagttcactgagcatacctgatcagctctatggctttggagtggctggt
tttgtgtcaacttgacacaagctggagttatcacagacaaaggagcttca
ggtgaggcaatgcctccaagagatccatctgtgaggcattttctgaatta
gtgatgaaggggagagggccccctgtggttgattccatctctgagctggt
agtcttgtgttctataagaaagcacgctgagcaagccaggagaagcaagc
cagtaagtaacatccctccatggcctctgtatcagctcctgcttcctgac
ctgcttgagttccagtcctggcttcttttggtgatgaacagcaatgtaga
actataagctgaataaagtctttccttgttacttggttgtgatgtttgtg
caggaataaaaatcctgactaagtcaggctctacattgacaaatgatctc
cccgggaccccttgtagtagcatgactctggacaatgtgttcctcatatt
cccatgttgctctcataaaaaacagcctcagagatctttctgttcactca
acaagaattgcttttctagagacaccagctccgaggggtactggttagtt
catattgttgtgccatctatagggttgcaaacccctttagctccttgggt
actttctctagctcctccattgggggccctgtgatccatccaatagctga
ctgtgagcatccacttctgtgtttgctaggcctcagcatagtctcacaag
agacagctatatctgggtcctttcagcaaaatcttgctagtgtatgcaat
ggtgtcagcgtttggaagctgattatgggatggatccccgggtatggcag
tctctagatggtccatcctttcgtctcagctccaaactttgctgcatatg
tatcagagatggcctagttggtcatcagtggtcagagaaggcccattggt
ctgcaaacttttatatgccttagtacaggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_30513581_30514381
seq2: B6Ng01-169B13.b_47_847

seq1  GAATTCTTCTGACAATAAAAGCTGGGCCTGTGAGTCCACCAGAGGTCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCTGACAATAAAAGCTGGGCCTGTGAGTCCACCAGAGGTCTCC  50

seq1  ATTCCCAAATGTGGAGAACCTGGATGCAAGAAATTCAGTTGGATAAATGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCAAATGTGGAGAACCTGGATGCAAGAAATTCAGTTGGATAAATGT  100

seq1  CCTTTGATTTTGCATACTATTTGAGTCTGGGGTATTGTTCTTTGGTGATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGATTTTGCATACTATTTGAGTCTGGGGTATTGTTCTTTGGTGATT  150

seq1  CTTAGACTCTAACAACACATATGCATGGTATTCGCTATTTACTCTCAAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGACTCTAACAACACATATGCATGGTATTCGCTATTTACTCTCAAAC  200

seq1  GTACCAAGAAAGAAAGTTCTTTATCCTGCTCTTACAATTCTCCCAGAAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCAAGAAAGAAAGTTCTTTATCCTGCTCTTACAATTCTCCCAGAAGG  250

seq1  TGGAAAATTAATTCACATTAAAAATAAGAGCCTAGGAAGACATCTCAGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAATTAATTCACATTAAAAATAAGAGCCTAGGAAGACATCTCAGTT  300

seq1  GCTAGTCTAGTTTCATTCAGATATTGCCCCGATGAAATGTTCTGACAGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGTCTAGTTTCATTCAGATATTGCCCCGATGAAATGTTCTGACAGAA  350

seq1  AGTGTCTCAAGGAGAAAGGGCTTATGCTAGCTCACAGTTCTCTGTTGCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCTCAAGGAGAAAGGGCTTATGCTAGCTCACAGTTCTCTGTTGCAC  400

seq1  TTCAAGGTAACATGAAAGTCAATGTAAGAGGAACTTACAACCAATAGTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGGTAACATGAAAGTCAATGTAAGAGGAACTTACAACCAATAGTCA  450

seq1  CATTATATCCACAGGCAAAACCATGGAAGTATTAATGAACACATGCTCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATATCCACAGGCAAAACCATGGAAGTATTAATGAACACATGCTCAT  500

seq1  TTGTTTATATGTTTGTGCTTAGCTAGATTTCTTTACCCTTACACAGTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTATATGTTTGTGCTTAGCTAGATTTCTTTACCCTTACACAGTTCA  550

seq1  GGACCACCTGCCGAGGGAATGGGGCTACCCATAGTAGACTTGTTCTTCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCACCTGCCGAGGGAATGGGGCTACCCATAGTAGACTTGTTCTTCCC  600

seq1  AAGTGAATTTACTTAGTAAATATAATCCCATATATACATGCCCACAGTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGAATTTACTTAGTAAATATAATCCCATATATACATGCCCACAGTCC  650

seq1  AACACAATGTAAGCAAATCCTCATTGTAAGACTCTCTATCCAGGTGATTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAATGTAAGCAAATCCTCATTGTAAGACTCTCTATCCAGGTGATTA  700

seq1  TAGATTCTGCCAAGTTGACAACTGACTCTAACCATACAGTTCATAAAATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTCTGCCAAGTTGACAACTGACTCTAACCATACAGTTCATAAAATA  750

seq1  TTTACTACACAAGGAGGAACACTAGAATTAGATCCTCAACACCCACATGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTACACAAGGAGGAACACTAGAATTAGATCCTCAACACCCACATGT  800

seq1  G  801
      |
seq2  G  801

seq1: chr13_30702234_30703263
seq2: B6Ng01-169B13.g_67_1096 (reverse)

seq1  CCCTGTACTTAGGCATAT-AAAGTTTGCAAGACCAATGGGCC-TCTCTTT  48
      ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  
seq2  CCCTGTACTAAGGCATATAAAAGTTTGC-AGACCAATGGGCCTTCTCTGA  49

seq1  CCACTGATGACCAACTAGGCCATCTTCTGATACATATGCAGCAAAGTTTG  98
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGATGACCAACTAGGCCATC-TCTGATACATATGCAGCAAAGTTTG  98

seq1  GAGCTGAGACGAAAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCATACCCGGGGATC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGAGACGAAAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCATACCCGGGGATC  148

seq1  CATCCCATAATCAGCTTCCAAACGCTGACACCATTGCATACACTAGCAAG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCATAATCAGCTTCCAAACGCTGACACCATTGCATACACTAGCAAG  198

seq1  ATTTTGCTGAAAGGACCCAGATATAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCTGA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGCTGAAAGGACCCAGATATAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCTGA  248

seq1  GGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATC  298

seq1  ACAGGGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGG  348

seq1  GTTTGCAACCCTATAGATGGCACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCTC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCAACCCTATAGATGGCACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCTC  398

seq1  GGAGCTGGTGTCTCTAGAAAAGCAATTCTTGTTGAGTGAACAGAAAGATC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTGGTGTCTCTAGAAAAGCAATTCTTGTTGAGTGAACAGAAAGATC  448

seq1  TCTGAGGCTGTTTTTTATGAGAGCAACATGGGAATATGAGGAACACATTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGGCTGTTTTTTATGAGAGCAACATGGGAATATGAGGAACACATTG  498

seq1  TCCAGAGTCATGCTACTACAAGGGGTCCCGGGGAGATCATTTGTCAATGT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAGTCATGCTACTACAAGGGGTCCCGGGGAGATCATTTGTCAATGT  548

seq1  AGAGCCTGACTTAGTCAGGATTTTTATTCCTGCACAAACATCACAACCAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCTGACTTAGTCAGGATTTTTATTCCTGCACAAACATCACAACCAA  598

seq1  GTAACAAGGAAAGACTTTATTCAGCTTATAGTTCTACATTGCTGTTCATC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACAAGGAAAGACTTTATTCAGCTTATAGTTCTACATTGCTGTTCATC  648

seq1  ACCAAAAGAAGCCAGGACTGGAACTCAAGCAGGTCAGGAAGCAGGAGCTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAAAGAAGCCAGGACTGGAACTCAAGCAGGTCAGGAAGCAGGAGCTG  698

seq1  ATACAGAGGCCATGGAGGGATGTTACTTACTGGCTTGCTTCTCCTGGCTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAGAGGCCATGGAGGGATGTTACTTACTGGCTTGCTTCTCCTGGCTT  748

seq1  GCTCAGCGTGCTTTCTTATAGAACACAAGACTACCAGCTCAGAGATGGAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGCGTGCTTTCTTATAGAACACAAGACTACCAGCTCAGAGATGGAA  798

seq1  TCAACCACAGGGGGCCCTCTCCCCTTCATCACTAATTCAGAAAATGCCTC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACCACAGGGGGCCCTCTCCCCTTCATCACTAATTCAGAAAATGCCTC  848

seq1  ACAGATGGATCTCTTGGAGGCATTGCCTCACCTGAAGCTCCTTTGTCTGT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATGGATCTCTTGGAGGCATTGCCTCACCTGAAGCTCCTTTGTCTGT  898

seq1  GATAACTCCAGCTTGTGTCAAGTTGACACAAAACCAGCCACTCCAAAGCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAACTCCAGCTTGTGTCAAGTTGACACAAAACCAGCCACTCCAAAGCC  948

seq1  ATAGAGCTGATCAGGTATGCTCAGTGAACTGGTGGTCTTGCCCAGAAACT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGCTGATCAGGTATGCTCAGTGAACTGGTGGTCTTGCCCAGAAACT  998

seq1  GCTCAAGTGTATCTATTACTGGAAAAGAATTC  1030
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAAGTGTATCTATTACTGGAAAAGAATTC  1030