BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-191B06
Chromosome13 (Build37)
Map Location 68,325,446 - 68,445,660
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC666238, EG666245
Upstream geneZfp458, Zfp457, A230042K10Rik, E130120F12Rik, Zfp456, 2810487A22Rik, Zfp459, C330011K17Rik, LOC666098, 9630025I21Rik, Zfp817, Zfp87, Zfp748, A530054K11Rik, LOC328277, 3830402I07Rik, EG666137, Zfp85-rs1, LOC674597, Zfp273, BC048507, LOC666185, LOC100042687, LOC100042692, LOC674779, LOC677603, LOC100042124, LOC666222, AA414992
Downstream geneEG666272, LOC100042223, Mtrr, LOC100042233, Fastkd3, 1700001L19Rik, Adcy2, LOC666205
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-191B06.bB6Ng01-191B06.g
ACCGA014671GA014672
length1,066977
definitionB6Ng01-191B06.b B6Ng01-191B06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,444,600 - 68,445,660)(68,325,446 - 68,326,416)
sequence
gaattccaactgtaattccaagaatgatgtcccaccctcctaaccttgca
tgatttctgggattgaactctggtcctcctgttttggccactgtgctatt
tccccagccctccccctgctttcacaggactctcattccttccacaattt
gtagcccatgtatccagaaccttttatgttctacttctcaaaggattgaa
ttctgatcatctgctgtttggagcctctgagactttcttggtgacatggg
atgaggggtgtgatgaggatagacttgcttcctgtacagacactcacctg
accccttcactgaagccccactcttgcttcctgggcctttcagtgaccct
gcgaccacttgctgctttgtctttcactgagtgaactgaatgtaagcagt
tacaggcctctaagctgattatcaacccgcccccagtttgttctttcaat
tccaacatatgtgggtgcctcctagtcagatcctctctcactgttttaaa
ataaaaaaacattatgatgagattacattacatctcctcttccatttcct
tcctccaaaccacaacatgtcctttccagccagtcctttccctcttcccc
aactatctctctaagtgtttgccccatttttgacatatatatatatatat
atatatatatatatatatatatatacatatatatatacatatatatacat
atacacatatatactcattaacatattaatacgaaccaatgagactattt
agtgttgcttgtatgatttcagggctgcccacatgacattagataacaat
taggaaggtcatctctggagagactaattctctctttctctgacttaaga
aggaatcagatttgtaagaactgaagccagtgccaaaatgacagaaatct
gaccccaagaacaaaaagactgggaggccatcactgagacatcgacacca
tgactctgacagggacacacgtaacagggaagaaactgggtataggttgc
tttcacaggaagagtgtgtcagatgaactgagttcagggttctagaatag
ataacggaaaatttta
gaattcagatgtccttttggtactctggttggagttcctttgtatctcat
ggacattctagcctgctttgtttgcttatttttgtttgtggatctctgca
ctgttttccatagccactgctccattttatatccccacattatctcagtg
tattctgtgcctgcatttccttgctgtttagtgatattggcaacatccct
gttggccattcgtatgcacttgtggaggagtgtcttgtcaagtgtcttgt
cagttgctttctctgttttccttactgatctttaggagacccttacacat
gttggaaatgaatcagctgcctgaacccacagggttaatgatgcttgtta
agtgtaaggagagaaccagattaccaaagacagactcttaaactgacagt
gtagagaagactgcactgcctcttgaaaaaaaaatcaagaaggtggatgc
acaccatgtacaaaagctgacactgttgggagctattgtcttgatctctg
aattgggcctcttcccccctcccccgagtagaaaagggggtcaaaatggg
ccacagatgcaccgttctgagaacaaccacagaatgttccagccctaagt
catcaccagatgtcctgacctcaagatgtaccctgataccagcaagttca
tgcttccctgtgtagctgtcaaaataaaaatttccacctcctcaccgctc
ctgctgagaagttcttgtacttccccttttgcttgtgcatttccactgcc
tcacagctcctgctgagaagtacatgtacttccccttttgcttgggcatt
tcagctgccccacccctcctcctgagaagtacttgttcttccccttttgc
ttgtgcatttccactgccccacccctcctgctgagaagtacccatacttc
cccttttgcttgtgcatttaagccttgagccttgctgaatacagagagac
cttgatgctactcagactccttttgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_68444600_68445660
seq2: B6Ng01-191B06.b_46_1111 (reverse)

seq1  TAAAAATTTCCCTTATCTATCCTAGACCCTTGAACTCAGTTCATACTG-C  49
      ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |
seq2  TAAAATTTTCCGTTATCTATTCTAGAACCCTGAACTCAGTTCAT-CTGAC  49

seq1  ACACTCTTCCTGTGAAAGCAACCTTAACCCAG-TTCTTCCCTGTTACGTG  98
      ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||
seq2  ACACTCTTCCTGTGAAAGCAACCTATACCCAGTTTCTTCCCTGTTACGTG  99

seq1  TGTCCCTGTCAGAGTCATGGTGTCGATGTCTCAGTGATGGCCT-CCAGTC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGTCCCTGTCAGAGTCATGGTGTCGATGTCTCAGTGATGGCCTCCCAGTC  149

seq1  TTTTTG-TCTT-GGGTCAGATTTCTGTCA-TTTGGCACTGGCTTCAGTTC  194
      |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGTTCTTGGGGTCAGATTTCTGTCATTTTGGCACTGGCTTCAGTTC  199

seq1  TTACAAATCTGATTCCTTCTTAAGTCAGAGAAAGAGAGAATTAGTCTCTC  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAATCTGATTCCTTCTTAAGTCAGAGAAAGAGAGAATTAGTCTCTC  249

seq1  CAGAGATGACCTTCCTAATTGTTATCTAATGTCATGTGGGCAGCCCTGAA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGATGACCTTCCTAATTGTTATCTAATGTCATGTGGGCAGCCCTGAA  299

seq1  ATCATACAAGCAACACTAAATAGTCTCATTGGTTCGTATTAATATGTTAA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATACAAGCAACACTAAATAGTCTCATTGGTTCGTATTAATATGTTAA  349

seq1  TGAGTATATATGTGTATATGTATATATATGTATATATATATGTATATATA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTATATATGTGTATATGTATATATATGTATATATATATGTATATATA  399

seq1  TATATATATATATATATATATATATATATATATGTCAAAAATGGGGCAAA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATATATATATATATATATGTCAAAAATGGGGCAAA  449

seq1  CACTTAGAGAGATAGTTGGGGAAGAGGGAAAGGACTGGCTGGAAAGGACA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAGAGAGATAGTTGGGGAAGAGGGAAAGGACTGGCTGGAAAGGACA  499

seq1  TGTTGTGGTTTGGAGGAAGGAAATGGAAGAGGAGATGTAATGTAATCTCA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTGGTTTGGAGGAAGGAAATGGAAGAGGAGATGTAATGTAATCTCA  549

seq1  TCATAATGTTTTTTTATTTTAAAACAGTGAGAGAGGATCTGACTAGGAGG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAATGTTTTTTTATTTTAAAACAGTGAGAGAGGATCTGACTAGGAGG  599

seq1  CACCCACATATGTTGGAATTGAAAGAACAAACTGGGGGCGGGTTGATAAT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCACATATGTTGGAATTGAAAGAACAAACTGGGGGCGGGTTGATAAT  649

seq1  CAGCTTAGAGGCCTGTAACTGCTTACATTCAGTTCACTCAGTGAAAGACA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTAGAGGCCTGTAACTGCTTACATTCAGTTCACTCAGTGAAAGACA  699

seq1  AAGCAGCAAGTGGTCGCAGGGTCACTGAAAGGCCCAGGAAGCAAGAGTGG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGCAAGTGGTCGCAGGGTCACTGAAAGGCCCAGGAAGCAAGAGTGG  749

seq1  GGCTTCAGTGAAGGGGTCAGGTGAGTGTCTGTACAGGAAGCAAGTCTATC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCAGTGAAGGGGTCAGGTGAGTGTCTGTACAGGAAGCAAGTCTATC  799

seq1  CTCATCACACCCCTCATCCCATGTCACCAAGAAAGTCTCAGAGGCTCCAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCACACCCCTCATCCCATGTCACCAAGAAAGTCTCAGAGGCTCCAA  849

seq1  ACAGCAGATGATCAGAATTCAATCCTTTGAGAAGTAGAACATAAAAGGTT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAGATGATCAGAATTCAATCCTTTGAGAAGTAGAACATAAAAGGTT  899

seq1  CTGGATACATGGGCTACAAATTGTGGAAGGAATGAGAGTCCTGTGAAAGC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATACATGGGCTACAAATTGTGGAAGGAATGAGAGTCCTGTGAAAGC  949

seq1  AGGGGGAGGGCTGGGGAAATAGCACAGTGGCCAAAACAGGAGGACCAGAG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGAGGGCTGGGGAAATAGCACAGTGGCCAAAACAGGAGGACCAGAG  999

seq1  TTCAATCCCAGAAATCATGCAAGGTTAGGAGGGTGGGACATCATTCTTGG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATCCCAGAAATCATGCAAGGTTAGGAGGGTGGGACATCATTCTTGG  1049

seq1  AATTACAGTTGGAATTC  1061
      |||||||||||||||||
seq2  AATTACAGTTGGAATTC  1066

seq1: chr13_68325446_68326416
seq2: B6Ng01-191B06.g_65_1035

seq1  GAATTCAGATGTCCTTTTGGTACTCTGGTTGGAGTTCCTTTGTATCTCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGATGTCCTTTTGGTACTCTGGTTGGAGTTCCTTTGTATCTCAT  50

seq1  GGACATTCTAGCCTGCTTTGTTTGCTTATTTTTGTTTGTGGATCTCTGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACATTCTAGCCTGCTTTGTTTGCTTATTTTTGTTTGTGGATCTCTGCA  100

seq1  CTGTTTTCCATAGCCACTGCTCCATTTTATATCCCCACATTATCTCAGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTTCCATAGCCACTGCTCCATTTTATATCCCCACATTATCTCAGTG  150

seq1  TATTCTGTGCCTGCATTTCCTTGCTGTTTAGTGATATTGGCAACATCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTGTGCCTGCATTTCCTTGCTGTTTAGTGATATTGGCAACATCCCT  200

seq1  GTTGGCCATTCGTATGCACTTGTGGAGGAGTGTCTTGTCAAGTGTCTTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGCCATTCGTATGCACTTGTGGAGGAGTGTCTTGTCAAGTGTCTTGT  250

seq1  CAGTTGCTTTCTCTGTTTTCCTTACTGATCTTTAGGAGACCCTTACACAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGCTTTCTCTGTTTTCCTTACTGATCTTTAGGAGACCCTTACACAT  300

seq1  GTTGGAAATGAATCAGCTGCCTGAACCCACAGGGTTAATGATGCTTGTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGAAATGAATCAGCTGCCTGAACCCACAGGGTTAATGATGCTTGTTA  350

seq1  AGTGTAAGGAGAGAACCAGATTACCAAAGACAGACTCTTAAACTGACAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTAAGGAGAGAACCAGATTACCAAAGACAGACTCTTAAACTGACAGT  400

seq1  GTAGAGAAGACTGCACTGCCTCTTGAAAAAAAAATCAAGAAGGTGGATGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGAAGACTGCACTGCCTCTTGAAAAAAAAATCAAGAAGGTGGATGC  450

seq1  ACACCATGTACAAAAGCTGACACTGTTGGGAGCTATTGTCTTGATCTCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCATGTACAAAAGCTGACACTGTTGGGAGCTATTGTCTTGATCTCTG  500

seq1  AATTGGGCCTCTTCCCCCCTCCCCCGAGTAGAAAAGGGGGTCAAAATGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGGCCTCTTCCCCCCTCCCCCGAGTAGAAAAGGGGGTCAAAATGGG  550

seq1  CCACAGATGCACCGTTCTGAGAACAACCACAGAATGTTCCAGCCCTAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGATGCACCGTTCTGAGAACAACCACAGAATGTTCCAGCCCTAAGT  600

seq1  CATCACCAGATGTCCTGACCTCAAGATGTACCCTGATACCAGCAAGTTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACCAGATGTCCTGACCTCAAGATGTACCCTGATACCAGCAAGTTCA  650

seq1  TGCTTCCCTGTGTAGCTGTCAAAATAAAAATTTCCACCTCCTCACCGCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCCCTGTGTAGCTGTCAAAATAAAAATTTCCACCTCCTCACCGCTC  700

seq1  CTGCTGAGAAGTTCTTGTACTTCCCCTTTTGCTTGTGCATTTCCACTGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGAGAAGTTCTTGTACTTCCCCTTTTGCTTGTGCATTTCCACTGCC  750

seq1  TCACAGCTCCTGCTGAGAAGTACATGTACTTCCCCTTTTGCTTGGGCATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGCTCCTGCTGAGAAGTACATGTACTTCCCCTTTTGCTTGGGCATT  800

seq1  TCAGCTGCCCCACCCCTCCTCCTGAGAAGTACTTGTTCTTCCCCTTTTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTGCCCCACCCCTCCTCCTGAGAAGTACTTGTTCTTCCCCTTTTGC  850

seq1  TTGTGCATTTCCACTGCCCCACCCCTCCTGCTGAGAAGTACCCATACTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGCATTTCCACTGCCCCACCCCTCCTGCTGAGAAGTACCCATACTTC  900

seq1  CCCTTTTGCTTGTGCATTTAAGCCTTGAGCCTTGCTGAATACAGAGAGAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTTGCTTGTGCATTTAAGCCTTGAGCCTTGCTGAATACAGAGAGAC  950

seq1  CTTGATGCTACTCAGACTCCT  971
      |||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATGCTACTCAGACTCCT  971