BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-224D19
Chromosome13 (Build37)
Map Location 33,091,704 - 33,288,610
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSerpinb9, Serpinb9b, Serpinb1b, LOC628301, Serpinb9c, Serpinb9d
Upstream geneGmds, Wrnip1, Serpinb1a, Serpinb1-ps1, Serpinb1c, Serpinb6b
Downstream geneSerpinb9e, Serpinb9f, OTTMUSG00000000724, Serpinb9g, LOC100041370, EG619715, LOC382743, OTTMUSG00000000712, LOC193403, Vmn2r-ps94, OTTMUSG00000000720, Serpinb6c, Serpinb6a, Nqo2, 4930482L21Rik, Ripk1, Bphl, Tubb2a, LOC100042686, Tubb2b, 2310047M15Rik, 3110004L20Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-224D19.bB6Ng01-224D19.g
ACCGA038755GA038756
length1,1751,138
definitionB6Ng01-224D19.b B6Ng01-224D19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,287,424 - 33,288,610)(33,091,704 - 33,092,828)
sequence
gaattccttgatctctaaactgaaccatgtggtctggctagtttgcatca
atttcactgtgaaaaactgtgagatcagaccatggtggggagaagggaaa
gtaaagaggagggaaggaagaagacagaaggatgcatagaaaggacaaga
atgtgcgatgtgaaggaacttgatcttcttaccattagtctgtttggaga
cccacatgtttatgtgttgcctggactcctcggcagcttcggcaaaagag
agctgctccatctcagagtgatagaatttaagacaggactccttaaatgt
ctttggagagaaaatattcagggaggtgactttgcaaaataaaatgtcag
caagcttttccaccttctgattagcatggaattaataaaattgaatgagt
atagatatcactttatacaacaaaaatcatcaggtactaggcctttgcaa
atgggaattatgagacataaataaaactgcaagttgtcaaatttgaaaat
tttaaagacatcttaacatagctactgtctttgatgaaccttaggttggc
aagtcttactatgtggcttaggttggagcataactcatgactctgtcctt
tcccagcctttgaaatgcaggttttatatatgtatacctacacagtggct
agtacttaattctacttttatcagtttctatagggtccttttcccttgaa
tataaagcagcaagcacttgggatataagttatctttccactggtacaac
ttactggaagtaattcacaagtattttctacaaagagcctgttggccata
gtaaggcagtacttttggttgtttggcttgttcaggttatggagaagcaa
ctggaagccctgatggacatcttcatctgggtttaaatgaagtgcctaag
aaagaaaagatgaagcattttttcagaccagagatgatcctttttagttg
caaaaggaattttcaagatcacttcagcctgccagtaactggggttctga
tgcaagcagttggtgttgaaaataaagtaggattgacctaccatccagtg
atattacaaattccattcattctaaaaccagatagattgcagcaacaact
tcaaatattcaactttcctttttggccattgcaagttcttgtgccgacca
catctcaaacattaaggagaactct
gaattccacttatggacctcagagcacactgtataattagtacctctccc
ctatgtggcctcattgactaaacctcctttgtcttgtgttactatgaatt
tacctctttaaatttgcttttaaagaacaactggccaagccaggcttgtt
agggctgccagaacacaggctctaaccctaacagtttattgatatgatta
ttgttttcttttgtgtgtttgtgatagagttccactttatagtccaggct
gtctggtacttcatatgtagaccaggctacttttgaatacacagagatat
gcttgtctctatcctttgattctagcatggcaaatgtgtatcactgcatg
tggtaggattttctctgtccaattacgttaaaatattagtgcagcaggag
acctgtgattggacagagaaagagagagactaaaagtagggcgaggagaa
gccaagatggaaacagacagacaggaagaagatcctgatcccgtgtgatt
ttaatagccataggtaactatgaatatcataagggatagaatagttgggg
taacttggttgatgtaggtgggcagcttgtatcattatcaattggctctg
aaatcattgtgtgggtatcttgtgaattgaaaatttatatataaataaat
atgacttgttaattataagattctagattgttgtttctagaagggttgct
ggatgtggtggctgaccttgcggtgggcagtcattgcatggggctggcat
cacagtgaaagagaacttgggagctctggccccaaccagagagctgggta
ggcagagagtagcttggatggagcacggggaacttgggctgttgtttttt
ttattatttcccacaacaaccagcacccaactgtggacttgatttatttg
ttcacatacttttatgtctctgataattgactcttgctggggatcatagt
tcacagactgttgaactgttttcacagatcaaccacctcttgaagtttat
aaactttcctgaatgtttcttaacataccactttcttcaggtactcttct
ttcttaccaccaaatgtggagcacacttccaagtcgagctacttcttgca
ctgtgtgtgtatttccacatttctgattcttggacagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_33287424_33288610
seq2: B6Ng01-224D19.b_46_1220 (reverse)

seq1  AGAGTTCTTCCCTAAAATGTTTGAGAATGTTGGTCTGCCACAAGAAC-TG  49
      ||||||||  |||  |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||
seq2  AGAGTTCT--CCT-TAATGTTTGAG-ATG-TGGTC-GGCACAAGAACTTG  44

seq1  CAATGGGCAAAAAGG-GAGTTGAAATTATTTTAAAATTGGTTGCTGCAAT  98
      |||||| ||||||||  |||||||  |||||   || | |||||||||||
seq2  CAATGGCCAAAAAGGAAAGTTGAA--TATTT--GAAGTTGTTGCTGCAAT  90

seq1  CTATCTTGTTTTTAGATGAATGG-ATTTGTAATTATCACTGGGATGGTAG  147
      |||||| |||||   |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||
seq2  CTATCTGGTTTTAGAATGAATGGAATTTGTAA-TATCACT-GGATGGTAG  138

seq1  GTCAATTCCTACTTTTAATTTTTCAACACCAACCTGCCTTGCATCAGAAC  197
      ||||| |||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||
seq2  GTCAA-TCCTACTTT---ATTTTCAACACCAA-CTG-CTTGCATCAGAAC  182

seq1  CCCAGTTACTTGGCAGCCTG-AGTGATCTTGAAAATTCCTTTTGCAACT-  245
      ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CCCAGTTAC-TGGCAGGCTGAAGTGATCTTGAAAATTCCTTTTGCAACTA  231

seq1  AAAAGATTCATCTCTGGTCTG-AAAAATGCTTCATCTTTTCCTTCTTAGG  294
      |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AAAAGGATCATCTCTGGTCTGAAAAAATGCTTCATCTTTTCTTTCTTAGG  281

seq1  CACTTCATTTAAACCCAGATGAAGATGTCCATCAGGGCTTCCAGTTGCTT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCATTTAAACCCAGATGAAGATGTCCATCAGGGCTTCCAGTTGCTT  331

seq1  CTCCATAACCTGAACAAGCCAAACAACCAAAAGTACTGCCTTACTATGGC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATAACCTGAACAAGCCAAACAACCAAAAGTACTGCCTTACTATGGC  381

seq1  CAACAGGCTCTTTGTAGAAAATACTTGTGAATTACTTCCAGTAAGTTGTA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGGCTCTTTGTAGAAAATACTTGTGAATTACTTCCAGTAAGTTGTA  431

seq1  CCAGTGGAAAGATAACTTATATCCCAAGTGCTTGCTGCTTTATATTCAAG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGGAAAGATAACTTATATCCCAAGTGCTTGCTGCTTTATATTCAAG  481

seq1  GG-AAAGGACCCTATAGAAACTGATAAAAGTAGAATTAAGTACTAGCCAC  543
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAGGACCCTATAGAAACTGATAAAAGTAGAATTAAGTACTAGCCAC  531

seq1  TGTGTAGGTATACATATATAAAACCTGCATTTCAAAGGCTGGGAAAGGAC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAGGTATACATATATAAAACCTGCATTTCAAAGGCTGGGAAAGGAC  581

seq1  AGAGTCATGAGTTATGCTCCAACCTAAGCCACATAGTAAGACTTGCCAAC  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCATGAGTTATGCTCCAACCTAAGCCACATAGTAAGACTTGCCAAC  631

seq1  CTAAGGTTCATCAAAGACAGTAGCTATGTTAAGATGTCTTTAAAATTTTC  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGTTCATCAAAGACAGTAGCTATGTTAAGATGTCTTTAAAATTTTC  681

seq1  AAATTTGACAACTTGCAGTTTTATTTATGTCTCATAATTCCCATTTGCAA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTGACAACTTGCAGTTTTATTTATGTCTCATAATTCCCATTTGCAA  731

seq1  AGGCCTAGTACCTGATGATTTTTGTTGTATAAAGTGATATCTATACTCAT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTAGTACCTGATGATTTTTGTTGTATAAAGTGATATCTATACTCAT  781

seq1  TCAATTTTATTAATTCCATGCTAATCAGAAGGTGGAAAAGCTTGCTGACA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTTTATTAATTCCATGCTAATCAGAAGGTGGAAAAGCTTGCTGACA  831

seq1  TTTTATTTTGCAAAGTCACCTCCCTGAATATTTTCTCTCCAAAGACATTT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTTTGCAAAGTCACCTCCCTGAATATTTTCTCTCCAAAGACATTT  881

seq1  AAGGAGTCCTGTCTTAAATTCTATCACTCTGAGATGGAGCAGCTCTCTTT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGTCCTGTCTTAAATTCTATCACTCTGAGATGGAGCAGCTCTCTTT  931

seq1  TGCCGAAGCTGCCGAGGAGTCCAGGCAACACATAAACATGTGGGTCTCCA  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCGAAGCTGCCGAGGAGTCCAGGCAACACATAAACATGTGGGTCTCCA  981

seq1  AACAGACTAATGGTAAGAAGATCAAGTTCCTTCACATCGCACATTCTTGT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGACTAATGGTAAGAAGATCAAGTTCCTTCACATCGCACATTCTTGT  1031

seq1  CCTTTCTATGCATCCTTCTGTCTTCTTCCTTCCCTCCTCTTTACTTTCCC  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCTATGCATCCTTCTGTCTTCTTCCTTCCCTCCTCTTTACTTTCCC  1081

seq1  TTCTCCCCACCATGGTCTGATCTCACAGTTTTTCACAGTGAAATTGATGC  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCCCACCATGGTCTGATCTCACAGTTTTTCACAGTGAAATTGATGC  1131

seq1  AAACTAGCCAGACCACATGGTTCAGTTTAGAGATCAAGGAATTC  1187
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAGCCAGACCACATGGTTCAGTTTAGAGATCAAGGAATTC  1175

seq1: chr13_33091704_33092828
seq2: B6Ng01-224D19.g_67_1204

seq1  GAATTCCACTTATGGACCTCAGAGCACACTGTATAATTAGTACCTCTCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACTTATGGACCTCAGAGCACACTGTATAATTAGTACCTCTCCC  50

seq1  CTATGTGGCCTCATTGACTAAACCTCCTTTGTCTTGTGTTACTATGAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTGGCCTCATTGACTAAACCTCCTTTGTCTTGTGTTACTATGAATT  100

seq1  TACCTCTTTAAATTTGCTTTTAAAGAACAACTGGCCAAGCCAGGCTTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCTTTAAATTTGCTTTTAAAGAACAACTGGCCAAGCCAGGCTTGTT  150

seq1  AGGGCTGCCAGAACACAGGCTCTAACCCTAACAGTTTATTGATATGATTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTGCCAGAACACAGGCTCTAACCCTAACAGTTTATTGATATGATTA  200

seq1  TTGTTTTCTTTTGTGTGTTTGTGATAGAGTTCCACTTTATAGTCCAGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTCTTTTGTGTGTTTGTGATAGAGTTCCACTTTATAGTCCAGGCT  250

seq1  GTCTGGTACTTCATATGTAGACCAGGCTACTTTTGAATACACAGAGATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGTACTTCATATGTAGACCAGGCTACTTTTGAATACACAGAGATAT  300

seq1  GCTTGTCTCTATCCTTTGATTCTAGCATGGCAAATGTGTATCACTGCATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTCTCTATCCTTTGATTCTAGCATGGCAAATGTGTATCACTGCATG  350

seq1  TGGTAGGATTTTCTCTGTCCAATTACGTTAAAATATTAGTGCAGCAGGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGGATTTTCTCTGTCCAATTACGTTAAAATATTAGTGCAGCAGGAG  400

seq1  ACCTGTGATTGGACAGAGAAAGAGAGAGACTAAAAGTAGGGCGAGGAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTGATTGGACAGAGAAAGAGAGAGACTAAAAGTAGGGCGAGGAGAA  450

seq1  GCCAAGATGGAAACAGACAGACAGGAAGAAGATCCTGATCCCGTGTGATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAGATGGAAACAGACAGACAGGAAGAAGATCCTGATCCCGTGTGATT  500

seq1  TTAATAGCCATAGGTAACTATGAATATCATAAGGGATAGAATAGTTGGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAGCCATAGGTAACTATGAATATCATAAGGGATAGAATAGTTGGGG  550

seq1  TAACTTGGTTGATGTAGGTGGGCAGCTTGTATCATTATCAATTGGCTCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTGGTTGATGTAGGTGGGCAGCTTGTATCATTATCAATTGGCTCTG  600

seq1  AAATCATTGTGTGGGTATCTTGTGAATTGAAAATTTATATATAAATAAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCATTGTGTGGGTATCTTGTGAATTGAAAATTTATATATAAATAAAT  650

seq1  ATGACTTGTTAATTATAAGATTCTAGATTGTTGTTTCTAGAAGGGTTGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTTGTTAATTATAAGATTCTAGATTGTTGTTTCTAGAAGGGTTGCT  700

seq1  GGATGTGGTGGCTGACCTTGCGGTGGGCAGTCATTGCATGGGGCTGGCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTGGTGGCTGACCTTGCGGTGGGCAGTCATTGCATGGGGCTGGCAT  750

seq1  CACAGTG-AAGAGAACTTGGGAGCTCTGGCCCCAACCAGAGAGCT-GGTA  798
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CACAGTGAAAGAGAACTTGGGAGCTCTGGCCCCAACCAGAGAGCTGGGTA  800

seq1  GGCAGAGAGTAGC-TGGATGGAGCAC-GGGAACTT-GGCTGTTG-TTTTT  844
      ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||
seq2  GGCAGAGAGTAGCTTGGATGGAGCACGGGGAACTTGGGCTGTTGTTTTTT  850

seq1  TTAATATTTCCCACAACAACCAGCACCCAACTGT-GAC-TGATTTATTTG  892
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
seq2  TTATTATTTCCCACAACAACCAGCACCCAACTGTGGACTTGATTTATTTG  900

seq1  TTCACCATAC-TTTATGTCTCTGATAA-TGACTCTTGCTGGGGATTCATA  940
      |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
seq2  TTCA-CATACTTTTATGTCTCTGATAATTGACTCTTGCTGGGGA-TCATA  948

seq1  GTTCACAGACTGTTGAACTGTTTTCACAGATCAACCACCTCTTGAAGTTT  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCACAGACTGTTGAACTGTTTTCACAGATCAACCACCTCTTGAAGTTT  998

seq1  ATTAAACTTTCCTGTATTGTTTCTT-ACATACCACTTCTTTCAGGTACTC  1039
      | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||
seq2  A-TAAACTTTCCTG-AATGTTTCTTAACATACCACTTTCTTCAGGTACTC  1046

seq1  -TCTTTCTACCCACCAAAGGTGGAG--CACTTCCCAGCCGGAGCTACCTT  1086
       |||||||  |||||||| ||||||  ||||||| || | |||||| |||
seq2  TTCTTTCTTACCACCAAATGTGGAGCACACTTCCAAGTC-GAGCTA-CTT  1094

seq1  CCTGCCACTGTGTG-----ATCCACA-TTCTGATTCTGGGACAGG  1125
      | || |||||||||      |||||| |||||||||| |||||||
seq2  CTTG-CACTGTGTGTGTATTTCCACATTTCTGATTCTTGGACAGG  1138