seq1: chr13_5820888_5821025
seq2: B6Ng01-225A11.b_36_173
seq1 AGGAACTCCAGATTCATTAACACATCCCATCTCAAAACATAAGGTGGAAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGAACTCCAGATTCATTAACACATCCCATCTCAAAACATAAGGTGGAAA 50
seq1 CTGACTGAGAAACATATACAAGATTGACCTTCAGCCTCCAAATGCACATA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGACTGAGAAACATATACAAGATTGACCTTCAGCCTCCAAATGCACATA 100
seq1 TACACACCTTTGGGCATGTGAGAAGCGTGTGTGTGTGT 138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACACACCTTTGGGCATGTGAGAAGCGTGTGTGTGTGT 138
| seq1: chr13_5967969_5969131
seq2: B6Ng01-225A11.g_65_1248 (reverse)
seq1 TTCTTTAA-------GCACAAG--CTCATTT-ATTGCC-AGAATTAAATG 39
|||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||| ||
seq2 TTCTTTAAAAAGGGCACACAAGGCTTCATTTAATTGCCAAGATTTAAGTG 50
seq1 AGAAAAAAAACATCATCTGACTGAACA-CCTCAAAAATTTATGAG-AATC 87
||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||
seq2 AGAAAAAGAAC-TCATCGAACTGAACACCCTCAAAATTTAATGAGAAATC 99
seq1 CAAAGGATAAGTGCG-ACTGTCCTGAAAACCC-TAAAGAACTGCTCAGC- 134
| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||
seq2 CCAAAGATAAGTGCGAACTGT-CTGAAAACCCTTAAAGAACTGCTCAGCT 148
seq1 TATGAATAATCA-CCATA-GGAAGT-AAAATTGAGTTGCAGGGGACAG-A 180
|||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
seq2 TATGAATAATCACCCATAGGGAAGTAAAAATTGAGTTGCAGGGGACAGAA 198
seq1 TTGATTCGTT-GCTTATCTCATGAGTTCAGATTTCAGTTTTTAAAA--CC 227
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2 TTGATTCGTTGGCTTATCTCATGAGTTCAGATTTCAGTTTTTAAAAACCA 248
seq1 AACATTTGAGATGTAATTATTACCCTTTCTGGTTTGAAGCATCACTGTTG 277
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2 AACATTTGAGATGTAATTATTACCCTTTCTGGTTGAAAGCATCACTGTTG 298
seq1 ACTACATTAGTTGTTTTCCTTATTGCTGTGACAAAAAACTTGTCTCACAG 327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTACATTAGTTGTTTTCCTTATTGCTGTGACAAAAAACTTGTCTCACAG 348
seq1 TTTGAAGGCACACCCCATCATGGTGGGGAAACATGGTGGCAAGAGTGAAG 377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTGAAGGCACACCCCATCATGGTGGGGAAACATGGTGGCAAGAGTGAAG 398
seq1 TGGTTGATCCTACTACATCTACAATTGGGAAAACAAAGATGAATACTGAT 427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGTTGATCCTACTACATCTACAATTGGGAAAACAAAGATGAATACTGAT 448
seq1 ATCCAACTTACTCTTCCTTTTCTCCCTTTTGTTAAGTCCAGAACTCCAGC 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATCCAACTTACTCTTCCTTTTCTCCCTTTTGTTAAGTCCAGAACTCCAGC 498
seq1 AATGGTGGTACCACAGGCACTCAGGATGCCTCTTCTTGCCTCAGCTAACC 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATGGTGGTACCACAGGCACTCAGGATGCCTCTTCTTGCCTCAGCTAACC 548
seq1 CTCTCTGGAAATCCCCTCACAAACCCACACACAGATGTTTATACAAGGTG 577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTCTGGAAATCCCCTCACAAACCCACACACAGATGTTTATACAAGGTG 598
seq1 ATAATAAATTATGACAATGAAGATTAACCATTGACCATCATACAAACGTT 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATAATAAATTATGACAATGAAGATTAACCATTGACCATCATACAAACGTT 648
seq1 CTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTGTCTGTTTCTGTTTCT 677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTGTCTGTTTCTGTTTCT 698
seq1 GTTTCTCTGTCTCTGTCTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTGTCTCTCTATCT 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTTCTCTGTCTCTGTCTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTGTCTCTCTATCT 748
seq1 CTCTCTGTCTGTCTTTCTCTGTGTGTGTGTGTGTTTTGTGTGTGTGTGTG 777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTCTGTCTGTCTTTCTCTGTGTGTGTGTGTGTTTTGTGTGTGTGTGTG 798
seq1 TGTGCATCCATGGAAGTATGAGCATGTTTTTGTCTGTGTCTTTGAGTGTG 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTGCATCCATGGAAGTATGAGCATGTTTTTGTCTGTGTCTTTGAGTGTG 848
seq1 AATGTTTGCTTGCATGTGTGTATGTGTTTTATAGGAGTTGAACTAAGATT 877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATGTTTGCTTGCATGTGTGTATGTGTTTTATAGGAGTTGAACTAAGATT 898
seq1 TGAAATGATTTGTGCAACAAATGAATTTAGAAAAGTAATATAAAGGGGGA 927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAAATGATTTGTGCAACAAATGAATTTAGAAAAGTAATATAAAGGGGGA 948
seq1 CAAAACTATGTTTAGAACATCCAGGAAACTAATCCTGTTTTGTCAGTATA 977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAAACTATGTTTAGAACATCCAGGAAACTAATCCTGTTTTGTCAGTATA 998
seq1 TAAATTTTTACCAGAGTCCTGTTTGCTCAGTACTATCCTAACCACATGGC 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAATTTTTACCAGAGTCCTGTTTGCTCAGTACTATCCTAACCACATGGC 1048
seq1 AAAATGAGGTGCTCAACAAGCCACTTCAGGTCCTCCAATACAGTCACCAT 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAAATGAGGTGCTCAACAAGCCACTTCAGGTCCTCCAATACAGTCACCAT 1098
seq1 CCATTCCCCACTTAGTATTAACAGAAAGATGTCAAAAAAATTGAATTCCA 1127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCATTCCCCACTTAGTATTAACAGAAAGATGTCAAAAAAATTGAATTCCA 1148
seq1 ATTGGCTTTCCTCAAGTTACTGCCTGCAAGGAATTC 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTGGCTTTCCTCAAGTTACTGCCTGCAAGGAATTC 1184
|
