BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-247M19
Chromosome13 (Build37)
Map Location 112,034,618 - 112,196,738
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4732495G21Rik, LOC100040640, EG621953
Upstream geneRab3c, EG432803, 9830130M13Rik, Plk2, LOC100040614, LOC668159
Downstream geneGpbp1, LOC100040666, Mier3, Map3k1, LOC668181, LOC100040716, LOC100041161, LOC100041175, Ankrd55
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-247M19.bB6Ng01-247M19.g
ACCGA056041GA056042
length1,1271,033
definitionB6Ng01-247M19.b B6Ng01-247M19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(112,034,618 - 112,035,745)(112,195,728 - 112,196,738)
sequence
gaattcaaaccctcaagtgaagtaaggacacatttgctgcagggcctttc
atcagtttccatccctgtctcatcattccactttgtattgctactcagag
actcttgcctcacgcacagggtctgctcagtccccatcagttcctcccaa
gggtgtgtgctctccgaatttgacctggcactgtgaggagactcgattag
cacactgatcaggtcccttagtgaataatgggaaaaaattaagagtgcta
acgtttaatgaactcctgttcttaccatccactttgacagacactttata
ggcatctcatgtcaacccaagacaactttatgagcagaaatggttattat
cttccttttatggcatcagaagctgagactttgaaaagttctggatgact
caatttgcaagtataacaagtaggagacagacctaatttttccaaattca
aaagttgtatccctaaccactgtgattactatcaaaccaaaccaaagtga
agaagcttcgatttatgtgagggaaaattaggggcccaagatattttaag
atgtatgacttaaaagtccaatgacaatggtcttcagagtttaagactga
aaaaggaaatgcttgtcaaagtgcagtggaatgtagctgcgaagagatga
gagtctcatttaaggccaaacaaacaggaggcaaaacagcaaagcttata
agaagtgtctccaaaactatctaataaaatttggcattatatctaagtaa
attaaattccaaagtgatactcaattcagaaattgactgactttgacatg
atggagatgagttacataaacaacatgtaagagaagccaatggatttggt
cttcagtgtgttaaattagaggggacattggaatgttaacacagcccaaa
caatcaactatttgtttcaaaataatattggaggtacagtcaacaatcaa
tatctgaaccactggagttttaagattgttgttataggcaatgtcagaaa
taatatgtgaggataatagaaagattctagtgatggaaacaccatggtgc
ataaatattacagattggagacgaagtatattaaagatattgactgggtg
cttcgagagactttccagatgtagtcc
gaattctagaacgcatattcactttgagccctctccagacctgagctggg
gctcacacacaagaaacagacactctcacactgcctcgtgctacagctca
tgcatgcgtgggtgggtgcgtgcgtgcgtgttgaatggtcacacgtgttt
cttccactggctttcaaatgtttgcatgccactgggttagagcagagtgt
gttccagtatagagtgccgatcccaccgagagtttctgattcagaacatc
tgggctggaacctagaatgcgcatttcatacaaactctcaggtgatgctg
tggggtggagggccacacctagagaatctccagtcttctgagggtgggaa
attgtaatccacccaccttgggttttcacattaaccagatgctcaactca
gttcagtgagtcacacttatgtaatattcatggttctaataatgtagctc
ctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtaatgagga
ttgagccccaaggcttcacacacaccaggtctctctgcctctgagctaca
tccctagctcttaactgttttgatatgttaacttttgatatgttgattaa
cattgctttctttctttctttctcccgttgctgctgcattgttgtgtttg
atattggaagttcctatagggcactgcaaagggtttttattctactcaca
gttttcatataacagtttattagaaaaaagcagtaagggcaggaactcaa
agcagggctgggcaccttggaggccggagctgatgaagaggccatactta
ctggcatgctccccggtaagtatgctgggggatgccttgctcagccctgc
ttttcctataagaatccagaccaccctgcccaggggatgggtcccccttc
cacaatgggctgcttcgctcctcatcactaaattatgaaaatattcccac
agtttgcatcatagccaagatttcctcagtggaagctccctcctctccac
tgttctctaagttggtgtcaggttgtcataaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_112034618_112035745
seq2: B6Ng01-247M19.b_47_1173

seq1  GAATTCAAACCCTCAAGTGAAGTAAGGACACATTTGCTGCAGGGCCTTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAACCCTCAAGTGAAGTAAGGACACATTTGCTGCAGGGCCTTTC  50

seq1  ATCAGTTTCCATCCCTGTCTCATCATTCCACTTTGTATTGCTACTCAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGTTTCCATCCCTGTCTCATCATTCCACTTTGTATTGCTACTCAGAG  100

seq1  ACTCTTGCCTCACGCACAGGGTCTGCTCAGTCCCCATCAGTTCCTCCCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTGCCTCACGCACAGGGTCTGCTCAGTCCCCATCAGTTCCTCCCAA  150

seq1  GGGTGTGTGCTCTCCGAATTTGACCTGGCACTGTGAGGAGACTCGATTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTGTGCTCTCCGAATTTGACCTGGCACTGTGAGGAGACTCGATTAG  200

seq1  CACACTGATCAGGTCCCTTAGTGAATAATGGGAAAAAATTAAGAGTGCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTGATCAGGTCCCTTAGTGAATAATGGGAAAAAATTAAGAGTGCTA  250

seq1  ACGTTTAATGAACTCCTGTTCTTACCATCCACTTTGACAGACACTTTATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTTAATGAACTCCTGTTCTTACCATCCACTTTGACAGACACTTTATA  300

seq1  GGCATCTCATGTCAACCCAAGACAACTTTATGAGCAGAAATGGTTATTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATCTCATGTCAACCCAAGACAACTTTATGAGCAGAAATGGTTATTAT  350

seq1  CTTCCTTTTATGGCATCAGAAGCTGAGACTTTGAAAAGTTCTGGATGACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTTTATGGCATCAGAAGCTGAGACTTTGAAAAGTTCTGGATGACT  400

seq1  CAATTTGCAAGTATAACAAGTAGGAGACAGACCTAATTTTTCCAAATTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTGCAAGTATAACAAGTAGGAGACAGACCTAATTTTTCCAAATTCA  450

seq1  AAAGTTGTATCCCTAACCACTGTGATTACTATCAAACCAAACCAAAGTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTGTATCCCTAACCACTGTGATTACTATCAAACCAAACCAAAGTGA  500

seq1  AGAAGCTTCGATTTATGTGAGGGAAAATTAGGGGCCCAAGATATTTTAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCTTCGATTTATGTGAGGGAAAATTAGGGGCCCAAGATATTTTAAG  550

seq1  ATGTATGACTTAAAAGTCCAATGACAATGGTCTTCAGAGTTTAAGACTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGACTTAAAAGTCCAATGACAATGGTCTTCAGAGTTTAAGACTGA  600

seq1  AAAAGGAAATGCTTGTCAAAGTGCAGTGGAATGTAGCTGCGAAGAGATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGAAATGCTTGTCAAAGTGCAGTGGAATGTAGCTGCGAAGAGATGA  650

seq1  GAGTCTCATTTAAGGCCAAACAAACAGGAGGCAAAACAGCAAAGCTTATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTCATTTAAGGCCAAACAAACAGGAGGCAAAACAGCAAAGCTTATA  700

seq1  AGAAGTGTCTCCAAAACTATCTAATAAAATTTGGCATTATATCTAAGTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTGTCTCCAAAACTATCTAATAAAATTTGGCATTATATCTAAGTAA  750

seq1  ATTAAATTCCAAAGTGATACTCAATTCAGAAATTGACTGACTTTGACATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAATTCCAAAGTGATACTCAATTCAGAAATTGACTGACTTTGACATG  800

seq1  ATGGAGATGAGTTACATAAACAACATGTAAGAGAAGCCAATGGATTTGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGATGAGTTACATAAACAACATGTAAGAGAAGCCAATGGATTTGGT  850

seq1  CTTCAGTGTGTTAAATTAGAGGGGACATTGGAATGTTAACACAGCCCAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGTGTGTTAAATTAGAGGGGACATTGGAATGTTAACACAGCCCAAA  900

seq1  CAATCAACTATTTGTTTCAAAATAAATATTGGAGGTACAAGTCAACAATC  950
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
seq2  CAATCAACTATTTGTTTCAAAAT-AATATTGGAGGTAC-AGTCAACAATC  948

seq1  AATATCTGAACCACTGGAGTTTTAAGA-TGTTGTTATAGGCAATGTCAGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCTGAACCACTGGAGTTTTAAGATTGTTGTTATAGGCAATGTCAGA  998

seq1  AATAATATGTGAGGATAATAGAAAGATTCTAGTGATGGAAACAACCAT-G  1048
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
seq2  AATAATATGTGAGGATAATAGAAAGATTCTAGTGATGGAAAC-ACCATGG  1047

seq1  TGCATAAATAATACAGAATGGAGGAAGGAAGTATAATAAAGATATGAGCT  1098
      |||||||||| |||||| |||||  | |||||||| |||||||||   ||
seq2  TGCATAAATATTACAGATTGGAG--ACGAAGTATATTAAAGATATTGACT  1095

seq1  GGGTGCTCC--GAGACTTTCAAGATGTAGTCC  1128
      ||||||| |  ||||||||| |||||||||||
seq2  GGGTGCTTCGAGAGACTTTCCAGATGTAGTCC  1127

seq1: chr13_112195728_112196738
seq2: B6Ng01-247M19.g_71_1103 (reverse)

seq1  TTTTATGACAACTTGACACAAAC-TAGAG-ACAGTGGAGAGGAGGGAGCC  48
      |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| 
seq2  TTTTATGACAACCTGACACCAACTTAGAGAACAGTGGAGAGGAGGGAGCT  50

seq1  TCCACTGA-GAAATC-TGGCTATGAGCCAAACTGTGGG-ATATTTTCATA  95
      |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||
seq2  TCCACTGAGGAAATCTTGGCTATGATGCAAACTGTGGGAATATTTTCATA  100

seq1  A-TTAGTGATGA-GAGCGGAGCAGCCCATTGTGGA--GGGGA-CCAT-CC  139
      | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| ||
seq2  ATTTAGTGATGAGGAGCGAAGCAGCCCATTGTGGAAGGGGGACCCATCCC  150

seq1  CTGGGCA-GGTGGTCCTGGATTC-TATAGG-AAAGCA-GGCTGAGCAA-G  184
      ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| |
seq2  CTGGGCAGGGTGGT-CTGGATTCTTATAGGAAAAGCAGGGCTGAGCAAGG  199

seq1  CAT-CCCCAGCATACTTACCGGGGAGCATGCCAGTAAGTATGGCCTCTTC  233
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCCCAGCATACTTACCGGGGAGCATGCCAGTAAGTATGGCCTCTTC  249

seq1  ATCAGCTCCGGCCTCC-AGGTG-CCAGCCCTGC-TTGAGTTCCTGCCCTT  280
      |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ATCAGCTCCGGCCTCCAAGGTGCCCAGCCCTGCTTTGAGTTCCTGCCCTT  299

seq1  ACTGC-TTTTTCTAATAAACTGTTATATG-AAACTGTGAGTAGAAT-AAA  327
      ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
seq2  ACTGCTTTTTTCTAATAAACTGTTATATGAAAACTGTGAGTAGAATAAAA  349

seq1  ACCCTTTGCAGTGCCCTATAGGAACTTCCAATATCAAACACAACAATGCA  377
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTTGCAGTGCCCTATAGGAACTTCCAATATCAAACACAACAATGCA  399

seq1  GCAGCAACGGGAGAAAGAAAGAAAGAAAGCAATGTTAATCAACATATCAA  427
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAACGGGAGAAAGAAAGAAAGAAAGCAATGTTAATCAACATATCAA  449

seq1  AAGTTAACATATCAAAACAGTTAAGAGCTAGGGATGTAGCTCAGAGGCAG  477
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTAACATATCAAAACAGTTAAGAGCTAGGGATGTAGCTCAGAGGCAG  499

seq1  AGAGACCTGGTGTGTGTGAAGCCTTGGGGCTCAATCCTCATTACAGAGAG  527
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACCTGGTGTGTGTGAAGCCTTGGGGCTCAATCCTCATTACAGAGAG  549

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGCTACATTATTAGA  577
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGCTACATTATTAGA  599

seq1  ACCATGAATATTACATAAGTGTGACTCACTGAACTGAGTTGAGCATCTGG  627
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGAATATTACATAAGTGTGACTCACTGAACTGAGTTGAGCATCTGG  649

seq1  TTAATGTGAAAACCCAAGGTGGGTGGATTACAATTTCCCACCCTCAGAAG  677
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGTGAAAACCCAAGGTGGGTGGATTACAATTTCCCACCCTCAGAAG  699

seq1  ACTGGAGATTCTCTAGGTGTGGCCCTCCACCCCACAGCATCACCTGAGAG  727
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAGATTCTCTAGGTGTGGCCCTCCACCCCACAGCATCACCTGAGAG  749

seq1  TTTGTATGAAATGCGCATTCTAGGTTCCAGCCCAGATGTTCTGAATCAGA  777
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTATGAAATGCGCATTCTAGGTTCCAGCCCAGATGTTCTGAATCAGA  799

seq1  AACTCTCGGTGGGATCGGCACTCTATACTGGAACACACTCTGCTCTAACC  827
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTCGGTGGGATCGGCACTCTATACTGGAACACACTCTGCTCTAACC  849

seq1  CAGTGGCATGCAAACATTTGAAAGCCAGTGGAAGAAACACGTGTGACCAT  877
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGCATGCAAACATTTGAAAGCCAGTGGAAGAAACACGTGTGACCAT  899

seq1  TCAACACGCACGCACGCACCCACCCACGCATGCATGAGCTGTAGCACGAG  927
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACACGCACGCACGCACCCACCCACGCATGCATGAGCTGTAGCACGAG  949

seq1  GCAGTGTGAGAGTGTCTGTTTCTTGTGTGTGAGCCCCAGCTCAGGTCTGG  977
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGTGAGAGTGTCTGTTTCTTGTGTGTGAGCCCCAGCTCAGGTCTGG  999

seq1  AGAGGGCTCAAAGTGAATATGCGTTCTAGAATTC  1011
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGCTCAAAGTGAATATGCGTTCTAGAATTC  1033