BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-249M12
Chromosome13 (Build37)
Map Location 25,495,692 - 25,496,790
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneCmah, 5830431A10Rik, 6330500D04Rik, LOC666145, Gmnn, LOC100040800, BC005537, Them2, Ttrap, D130043K22Rik, Aldh5a1, Gpld1, Mrs2l, LOC675430, Dcdc2a, Nrsn1
Downstream geneTpi-rs8, LOC214973, LOC666221
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-249M12.bB6Ng01-249M12.g
ACCGA057511GA057512
length1,093986
definitionB6Ng01-249M12.b B6Ng01-249M12.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattctcagctgttattttgagatgggggctaactctcaccctagccta
gggttgaacatattatgtagcataagccaaccttgattgaattcaccaca
attctcctgccttgggttcctgaagattgtgttcacagataagcactact
atgttcaactagaaaaaagctttgattttcgatgtcattgagggtttgct
tggcctttcacctcattaatttatgtagttattggtaattacgtattacc
aataatatcacatagatttttgaacatggaaccaactgaaagtatgattt
ccttaaccaggtctggtgctgcatgcctgtcaccttgacattcaggagca
gagttgaggcagcgccaagaatttgaggtcagcattggctacacagcaag
attttgtattacattacatatgcaccacatgtatgtaataatcagtggag
gttagaagagacatagggtctcttgtagctggagttagagatggttggta
gccacaatgggggctggaaactgaatctcagtcctctacttaaacaacaa
gtgctcataactgttgatcccttgctcaatctccatacatagctttaaca
gtcttttaaaattttgattatgtgcatataaccatatgtgggtttgtgca
catgaatgtaactgcctgagttataggtgtagtgatggtaacctagctcc
agtgctctgcatctgtttgtgcaaaagaggacagaatgtaacttatgagt
agaggcatgcttttattcttgtacaagataaaaaatattcttgtcctcca
tacagaaaatgagaagactgattactctctgcagggactccagggaagct
ttaacatgattttccctttaagatgtgtggacaacatccctttaagaaat
gtaaggaactcttgataacactgccatgcttaatgactggggcattttca
ggatgcaaagcagtccttgcccttaactgaaattcttcacggaaatgggc
attttgctatagatatatcctaaggggggattcatagcccatagatgcct
aattcatgacaaggtctattattatgtactaggcatcatcttg
gaattctcacctgaggaataccgaatggcagagaagcacttgaaaaaatg
ttcaacatccttaatcatcagggaaatgcaaatcaaaacaaccctgagat
tccacctcacaccagtcagaatggctaagatcaaaaattcaggtgacagc
agatgctggcgaggatgtggagaaagaggaacactcctccattgttggtg
ggagtgcaggcttgtacaaccactctggaaatcagtctggcggttcctca
gaaaactggacatagtactaccggaggatccagcaatacctctcctgggc
atatatccagaagatgccccaacaggtaagaaggacacatgctccactat
gttcatagcagccttatttataatagccagaagctggaaagaacctagat
gcccctcaacagaggaatggatacagaaaatgtggtacatctacacaatg
gagtactactcagctattaaaaagaatgaatttatgaaattcctagccaa
atggatggacctggagggcatcatcctgagtgaggtaacacattcacaaa
gaaactcacacaatatgtattcactgataagtggatattagccccaaacc
taggatacccaagatataagatataatttgctaaacacatgaaactcaag
gagaatgaagactgaagtgtggacactatgcccctccttagatttgggaa
caaaacacccatggaaggagttacagagacggagtttggagctgagatga
aaggatggaccatgtagagactgccatagccagggatccaccccataatc
agcatccaaacgctgacaccattgcatacactagcaagattttattgaaa
ggacgcagatgtagctgtctcttgtgagactatgccggggcccagcaaca
cagaagtggatgctcacagtcagctaatggatggatcatagggctcccaa
tggaggagctagagaaagtagccagagctaagggat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_25495692_25496790
seq2: B6Ng01-249M12.b_48_1140

seq1  GAATTCTCAGCTGTTATTTTGAGATGGGGGCTAACTCTCACCCTAGCCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGCTGTTATTTTGAGATGGGGGCTAACTCTCACCCTAGCCTA  50

seq1  GGGTTGAACATATTATGTAGCATAAGCCAACCTTGATTGAATTCACCACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGAACATATTATGTAGCATAAGCCAACCTTGATTGAATTCACCACA  100

seq1  ATTCTCCTGCCTTGGGTTCCTGAAGATTGTGTTCACAGATAAGCACTACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTCCTGCCTTGGGTTCCTGAAGATTGTGTTCACAGATAAGCACTACT  150

seq1  ATGTTCAACTAGAAAAAAGCTTTGATTTTCGATGTCATTGAGGGTTTGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCAACTAGAAAAAAGCTTTGATTTTCGATGTCATTGAGGGTTTGCT  200

seq1  TGGCCTTTCACCTCATTAATTTATGTAGTTATTGGTAATTACGTATTACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTTTCACCTCATTAATTTATGTAGTTATTGGTAATTACGTATTACC  250

seq1  AATAATATCACATAGATTTTTGAACATGGAACCAACTGAAAGTATGATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATATCACATAGATTTTTGAACATGGAACCAACTGAAAGTATGATTT  300

seq1  CCTTAACCAGGTCTGGTGCTGCATGCCTGTCACCTTGACATTCAGGAGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAACCAGGTCTGGTGCTGCATGCCTGTCACCTTGACATTCAGGAGCA  350

seq1  GAGTTGAGGCAGCGCCAAGAATTTGAGGTCAGCATTGGCTACACAGCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTGAGGCAGCGCCAAGAATTTGAGGTCAGCATTGGCTACACAGCAAG  400

seq1  ATTTTGTATTACATTACATATGCACCACATGTATGTAATAATCAGTGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGTATTACATTACATATGCACCACATGTATGTAATAATCAGTGGAG  450

seq1  GTTAGAAGAGACATAGGGTCTCTTGTAGCTGGAGTTAGAGATGGTTGGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGAAGAGACATAGGGTCTCTTGTAGCTGGAGTTAGAGATGGTTGGTA  500

seq1  GCCACAATGGGGGCTGGAAACTGAATCTCAGTCCTCTACTTAAACAACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACAATGGGGGCTGGAAACTGAATCTCAGTCCTCTACTTAAACAACAA  550

seq1  GTGCTCATAACTGTTGATCCCTTGCTCAATCTCCATACATAGCTTTAACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCATAACTGTTGATCCCTTGCTCAATCTCCATACATAGCTTTAACA  600

seq1  GTCTTTTAAAATTTTGATTATGTGCATATAACCATATGTGGGTTTGTGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTTAAAATTTTGATTATGTGCATATAACCATATGTGGGTTTGTGCA  650

seq1  CATGAATGTAACTGCCTGAGTTATAGGTGTAGTGATGGTAACCTAGCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAATGTAACTGCCTGAGTTATAGGTGTAGTGATGGTAACCTAGCTCC  700

seq1  AGTGCTCTGCATCTGTTTGTGCAAAAGAGGACAGAATGTAACTTATGAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTCTGCATCTGTTTGTGCAAAAGAGGACAGAATGTAACTTATGAGT  750

seq1  AGAGGCATGCTTTTATTCTTGTACAAGATAAAAAATATTCTTGTCCTCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCATGCTTTTATTCTTGTACAAGATAAAAAATATTCTTGTCCTCCA  800

seq1  TACAGAAAATGAGAAGACTGATTACTCTCTGCAGGGACTCCAGGGAAGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAAAATGAGAAGACTGATTACTCTCTGCAGGGACTCCAGGGAAGCT  850

seq1  TTAACATGATTTTCCCTTTAAGATGTGTGGACAACATCCCTTTAAGAAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACATGATTTTCCCTTTAAGATGTGTGGACAACATCCCTTTAAGAAAT  900

seq1  GTAAGGAACTCTTGATAACACTGCCATGCTTAATGACTGGGGCATTTCAG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
seq2  GTAAGGAACTCTTGATAACACTGCCATGCTTAATGACTGGGGCATTTTCA  950

seq1  GGATTGCAAAGCAGTCCTTGCCCTTAACTGAAATTCTTCACGGAAATGGG  1000
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGA-TGCAAAGCAGTCCTTGCCCTTAACTGAAATTCTTCACGGAAATGGG  999

seq1  CATTTTGCTATAAGATATATCTTAA-GGGGGATTCATAGCCCAATAGGAT  1049
      ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||
seq2  CATTTTGCTAT-AGATATATCCTAAGGGGGGATTCATAGCCC-ATA-GAT  1046

seq1  GCTAAATTCAATGACAAAGTCTATTATTATGTTACTAGGCCATCATCTTG  1099
      ||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  GCCTAATTC-ATGACAAGGTCTATTATTATG-TACTAGG-CATCATCTTG  1093