BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-251I24
Chromosome13 (Build37)
Map Location 50,894,919 - 51,036,024
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG667712, LOC676997
Upstream geneEG638833, Gm272, EG667503, EG667507, LOC100040099, LOC625110, LOC676907, LOC667546, LOC667552, LOC100040085, LOC100040159, LOC100040176, LOC100040118, Gm906, 2310081J21Rik, LOC676954, LOC667625, LOC667632, EG667637, Fbxw17, Gm806, EG639044, Gm904, LOC100040315, EG667693, LOC100040161, LOC100040190
Downstream geneEG667717, Spin1, 4930519N16Rik, EG667728, LOC667733, Ppia-ps13_636.1, LOC625524, Edg3, Shc3, Cks2, Secisbp2, Sema4d, Gadd45g
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-251I24.bB6Ng01-251I24.g
ACCGA058791GA058792
length1,136849
definitionB6Ng01-251I24.b B6Ng01-251I24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(50,894,919 - 50,896,054)(51,035,179 - 51,036,024)
sequence
gaattccttctggacatgacctaattgaagaagatcatgagattcatgct
ttctggacatgagattcagaagtccaagaaaaagagatagctgcattgaa
ggaattcagggacaggaaatccccaggttttgtgacaccacaaagctgtg
gtgggcctggatgtgtgctacacttgtgtagttggagcactggagggata
ctgtgcctctgtatggggattcccaggtccacctgccagcatggagcttc
aagtctcccaggtgcaaatctatctttcagatagcatgtcctgtggcact
tgctgtaatataaggggaatgacaggactggatggaggggcaaggagagt
gtacatggagagataacctacctccattccccttgctcacattcagtgct
tgagcattagagtcctagcatgcgtggggagttacaagaggatgcctcac
tcctgtgtgttcttatttcttgaccttatcctacataaatatctccagga
agtaaatatggcagaaaaaaatgtggatgacaccaagactccatcacaaa
atatgaaaatgtaagaaatccatctgtcttgtgaaattttttccctaaaa
aatgtgaggtcacctcctgaggtacttcatattgcagatgctatgcaggg
tgaatttggaacacatcctggttgaatgcaacactaagggatatgggata
tggaggtaatggacaaacattatggcaacaggtgccatattttacagact
gatgggcctcttgatcctcttcttgaggctgaagttttcacctccctctc
ttttgcagtcacaccaagcaacattcctaaactcccacaccacaaccttt
tgaaaccctgataagagaatggatcacgggtcctttctctcaactactgt
ctcaactcaagatctctgaggagagagcacacctgttaggaggccagagt
gcatgtgccttacctcttctggaggcaacagctcagaacgcattagatgt
gctaacaaacatgattttactttggaattttcttgagatgtagtaaaata
cagacttgagtcttattgaaaagatccttgaaaaaacatagttcagtgcc
acagaagcaccaatctgattctagctgtgaggaccc
gaattccagccagccttcccttcagtgaagagggtcatgatgatagccat
gctccctgaggacatcagatacaggaaggaagatgcttcccagcatctcc
atgctgggaagaaaatcagaatctaggaatctgcaggttgtgtgatagaa
agaagctgttgttggctgggctgggtgctacacaagggagtgtgattcaa
ggcactggactgatgctgtgtccatgtatggcagaacaaaggtccacgtg
atgtcaggtagcttcaattacctctgctgcatttctctttgagatacctg
atcctgtgtcccttgcagtcttgtaaggggaatgatttgagtggagggag
gagcaaagagcgtgtacatggagagatgaggcccttccattccccttgct
cacgttcagtgctctgtccttacactatgctggttgagcgttagagaccc
tgcatgggcagtcacaagagggatgcctcctaactgtgttcttattctgc
atccttatcctacataactatctccaggtggcagagatggcagaaaaaaa
tgtggaagagactaacttatgaaaatgagagacatctcttgtggatttct
tcataccagaatgtgagctcagggtcttgagatattcatactgaagatgc
tatccagactggaattagaagacagccctgttggatgtggcacaaagggg
tttggaatatggaggtagtgtgtgtgtgagactataatgatacaggtgcc
atatttacacagacggatggtctgcttggatttctgcttgggggttgatg
ctttatgcctcttgtcttttggcagtcccaaaaagcaactttacctggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_50894919_50896054
seq2: B6Ng01-251I24.b_51_1186

seq1  GAATTCCTTCTGGACATGACCTAATTGAAGAAGATCATGAGATTCATGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCTGGACATGACCTAATTGAAGAAGATCATGAGATTCATGCT  50

seq1  TTCTGGACATGAGATTCAGAAGTCCAAGAAAAAGAGATAGCTGCATTGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGACATGAGATTCAGAAGTCCAAGAAAAAGAGATAGCTGCATTGAA  100

seq1  GGAATTCAGGGACAGGAAATCCCCAGGTTTTGTGACACCACAAAGCTGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTCAGGGACAGGAAATCCCCAGGTTTTGTGACACCACAAAGCTGTG  150

seq1  GTGGGCCTGGATGTGTGCTACACTTGTGTAGTTGGAGCACTGGAGGGATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGCCTGGATGTGTGCTACACTTGTGTAGTTGGAGCACTGGAGGGATA  200

seq1  CTGTGCCTCTGTATGGGGATTCCCAGGTCCACCTGCCAGCATGGAGCTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCCTCTGTATGGGGATTCCCAGGTCCACCTGCCAGCATGGAGCTTC  250

seq1  AAGTCTCCCAGGTGCAAATCTATCTTTCAGATAGCATGTCCTGTGGCACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTCCCAGGTGCAAATCTATCTTTCAGATAGCATGTCCTGTGGCACT  300

seq1  TGCTGTAATATAAGGGGAATGACAGGACTGGATGGAGGGGCAAGGAGAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTAATATAAGGGGAATGACAGGACTGGATGGAGGGGCAAGGAGAGT  350

seq1  GTACATGGAGAGATAACCTACCTCCATTCCCCTTGCTCACATTCAGTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATGGAGAGATAACCTACCTCCATTCCCCTTGCTCACATTCAGTGCT  400

seq1  TGAGCATTAGAGTCCTAGCATGCGTGGGGAGTTACAAGAGGATGCCTCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATTAGAGTCCTAGCATGCGTGGGGAGTTACAAGAGGATGCCTCAC  450

seq1  TCCTGTGTGTTCTTATTTCTTGACCTTATCCTACATAAATATCTCCAGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTGTGTTCTTATTTCTTGACCTTATCCTACATAAATATCTCCAGGA  500

seq1  AGTAAATATGGCAGAAAAAAATGTGGATGACACCAAGACTCCATCACAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAATATGGCAGAAAAAAATGTGGATGACACCAAGACTCCATCACAAA  550

seq1  ATATGAAAATGTAAGAAATCCATCTGTCTTGTGAAATTTTTTCCCTAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAAAATGTAAGAAATCCATCTGTCTTGTGAAATTTTTTCCCTAAAA  600

seq1  AATGTGAGGTCACCTCCTGAGGTACTTCATATTGCAGATGCTATGCAGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGAGGTCACCTCCTGAGGTACTTCATATTGCAGATGCTATGCAGGG  650

seq1  TGAATTTGGAACACATCCTGGTTGAATGCAACACTAAGGGATATGGGATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTTGGAACACATCCTGGTTGAATGCAACACTAAGGGATATGGGATA  700

seq1  TGGAGGTAATGGACAAACATTATGGCAACAGGTGCCATA-TTTACAGACT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TGGAGGTAATGGACAAACATTATGGCAACAGGTGCCATATTTTACAGACT  750

seq1  GATGGGCCTCTTGATCCTCTTCTTGAGGCTGAAGTTTTCACCT-CCTCTC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GATGGGCCTCTTGATCCTCTTCTTGAGGCTGAAGTTTTCACCTCCCTCTC  800

seq1  TTTTGCAGTCACACCAAGCAACATTCCTAAACT-CCACACCACAACCTTT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TTTTGCAGTCACACCAAGCAACATTCCTAAACTCCCACACCACAACCTTT  850

seq1  TGAAACCCTGATAAGAGAATGGATCAC-GGTCCTTTCTCTCAACTACTGT  896
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACCCTGATAAGAGAATGGATCACGGGTCCTTTCTCTCAACTACTGT  900

seq1  CTCAACTCAAGATCTCTGAGGAGAGAGCACACCTGTTAGGAGGCCAGAGT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACTCAAGATCTCTGAGGAGAGAGCACACCTGTTAGGAGGCCAGAGT  950

seq1  GCATGTGCCTTACCTCTTCTGGAGGC-ACAGCTCAGAAGGCATTAGATGT  995
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
seq2  GCATGTGCCTTACCTCTTCTGGAGGCAACAGCTCAGAACGCATTAGATGT  1000

seq1  GCTAACAAACATGATTTTACTTT-GAATTTTCTTGAGAATGTAGTAAAAA  1044
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| 
seq2  GCTAACAAACATGATTTTACTTTGGAATTTTCTTGAG-ATGTAGTAAAA-  1048

seq1  TAACAGGACTTGAGTCTTATTTGAAAGATCC-TGACAAACAATAGTTTCA  1093
        ||| |||||||||||||||  |||||||| ||| |||  |||| ||||
seq2  -TACA-GACTTGAGTCTTATTGAAAAGATCCTTGAAAAAACATAG-TTCA  1095

seq1  GTGGCACCAAGAGCAACAGTTCTGTTTCTAGCTGTGAGGACCC  1136
      ||| || ||  |||| ||  |||| ||||||||||||||||||
seq2  GTGCCA-CAGAAGCACCA-ATCTGATTCTAGCTGTGAGGACCC  1136

seq1: chr13_51035179_51036024
seq2: B6Ng01-251I24.g_68_916 (reverse)

seq1  CCCAGGTAAAGTTGCTTTGTGGGACTG-CAAAAGACAGGAGGCA-AAAGC  48
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||
seq2  CCCAGGTAAAGTTGCTTTTTGGGACTGCCAAAAGACAAGAGGCATAAAGC  50

seq1  ATC-AGCCCCAAGCAGAGAATCAAGCAGGCCATCCGTCTGTGTAAATATG  97
      ||| | ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ATCAACCCCCAAGCAGAAATCCAAGCAGACCATCCGTCTGTGTAAATATG  100

seq1  GCACCTGTATCATTATAGTCTCACACACACACTACCTCCATATTCCAAAC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTGTATCATTATAGTCTCACACACACACTACCTCCATATTCCAAAC  150

seq1  CCCTTTGTGCCACATCCAACAGGGCTGTCTTCTAATTCCAGTCTGGATAG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTGTGCCACATCCAACAGGGCTGTCTTCTAATTCCAGTCTGGATAG  200

seq1  CATCTTCAGTATGAATATCTCAAGACCCTGAGCTCACATTCTGGTATGAA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTCAGTATGAATATCTCAAGACCCTGAGCTCACATTCTGGTATGAA  250

seq1  GAAATCCACAAGAGATGTCTCTCATTTTCATAAGTTAGTCTCTTCCACAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCCACAAGAGATGTCTCTCATTTTCATAAGTTAGTCTCTTCCACAT  300

seq1  TTTTTTCTGCCATCTCTGCCACCTGGAGATAGTTATGTAGGATAAGGATG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTCTGCCATCTCTGCCACCTGGAGATAGTTATGTAGGATAAGGATG  350

seq1  CAGAATAAGAACACAGTTAGGAGGCATCCCTCTTGTGACTGCCCATGCAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATAAGAACACAGTTAGGAGGCATCCCTCTTGTGACTGCCCATGCAG  400

seq1  GGTCTCTAACGCTCAACCAGCATAGTGTAAGGACAGAGCACTGAACGTGA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCTAACGCTCAACCAGCATAGTGTAAGGACAGAGCACTGAACGTGA  450

seq1  GCAAGGGGAATGGAAGGGCCTCATCTCTCCATGTACACGCTCTTTGCTCC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGGGAATGGAAGGGCCTCATCTCTCCATGTACACGCTCTTTGCTCC  500

seq1  TCCCTCCACTCAAATCATTCCCCTTACAAGACTGCAAGGGACACAGGATC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCACTCAAATCATTCCCCTTACAAGACTGCAAGGGACACAGGATC  550

seq1  AGGTATCTCAAAGAGAAATGCAGCAGAGGTAATTGAAGCTACCTGACATC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTATCTCAAAGAGAAATGCAGCAGAGGTAATTGAAGCTACCTGACATC  600

seq1  ACGTGGACCTTTGTTCTGCCATACATGGACACAGCATCAGTCCAGTGCCT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGGACCTTTGTTCTGCCATACATGGACACAGCATCAGTCCAGTGCCT  650

seq1  TGAATCACACTCCCTTGTGTAGCACCCAGCCCAGCCAACAACAGCTTCTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATCACACTCCCTTGTGTAGCACCCAGCCCAGCCAACAACAGCTTCTT  700

seq1  TCTATCACACAACCTGCAGATTCCTAGATTCTGATTTTCTTCCCAGCATG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCACACAACCTGCAGATTCCTAGATTCTGATTTTCTTCCCAGCATG  750

seq1  GAGATGCTGGGAAGCATCTTCCTTCCTGTATCTGATGTCCTCAGGGAGCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGCTGGGAAGCATCTTCCTTCCTGTATCTGATGTCCTCAGGGAGCA  800

seq1  TGGCTATCATCATGACCCTCTTCACTGAAGGGAAGGCTGGCTGGAATTC  846
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTATCATCATGACCCTCTTCACTGAAGGGAAGGCTGGCTGGAATTC  849