BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-256G17
Chromosome13 (Build37)
Map Location 60,058,771 - 60,210,234
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneNtrk2, LOC100041533, Agtpbp1, Mak10, Golph2, 4921517D22Rik, 1700013B16Rik, EG238662, 4932411G14Rik, Isca1, Zcchc6
Downstream geneLOC100041267, Gas1, EG328264, Dapk1, LOC218274, BC051665, 2310051M13Rik, 4930486L24Rik, Tpbpb, Ctla2a, Tpbpa, Ctsj, Ctsq
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-256G17.bB6Ng01-256G17.g
ACCGA062383GA062384
length1,1321,065
definitionB6Ng01-256G17.b B6Ng01-256G17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,209,101 - 60,210,234)(60,058,771 - 60,059,836)
sequence
gaattctggtcaattggggtgatttagggatcccctaaagaaggaaccct
ctgaggaacagatgttccaagcagtccttcaagaccaaagctgcatttga
agcctccccagggttgatgagggaacctgactaaaggccatgattgccag
gatggggatagcatgggacagtcggggctgggaaacgcaacactcaacct
agtggggactaagcagagaggaacggggccatcgctgcataagactatgg
taagagactcgatgcctgaaccagtcggattgggtgagcccagaagacca
cataaacatatctgctacccacttagctcaaagcatacatcctcaagcaa
tctcttccctcttcaacatagttgggaacaggctgagttatgctgcagtt
acaaacggtcttgtagattcccctcaacctgcactttcattctccttgtt
tagttaccagcaaccacagccagttctacactgttcagctgaagaattcc
ataaacaattggtaagtcctaaatcatgtgatgaatccgcgactttccgg
acctgagccgctcctttgtccagtgtataggctacccatcagtcacttag
tcatcttggttataggatcagcttctatagccatcaagtaactctatttt
aattaatcatgacccccaaagccaagaacgatgacggtggcatttgagta
tgccaaagagaagctgtaagtagcctcctgtaaacaaaggttgaaagctt
actctacatttgcatgaataggaaaaaaaaatcacagtaccagtagtatt
tgatgattaactgaagtttcagtcatcccaagggtactagaacatgtgca
catatccctgagcatcaggggcagaacagactctgctcaccactggctgc
aaggctggctcttcatcatcccagcatgcattgggggcagaacagaccgc
tcaccctggctgggaaggccagcttttcatcttcccagcatgcttgtgct
tgtccctctcctgcaaaatgtaatgtcatcataaagaaaaattgccctga
atttcacaatagtttgccttgagagaatggaggatcaacatctgcacaga
aatatcccactgtgtactatccttgatcatct
gaattcctgtgctgttttcactcctacatgtggctgaatgtaatttttat
cccccaggttcatggctcagcaaaatttctcttgatctttcatttgtgtc
tctcaatggtcttgaagctcgtgcaacagaatgtctaggtacatcctgtc
agtagactcatggtttggctgtgcactgggctgtgcactattttgcaggt
gttttcagacgcatttgtttggtttcttttttacatttatttatttgttt
gtttgtttgtttatttatttatttatttaatgtatatgagtatgctgtac
ctgtcttcagacacaccagaagagggctttagatccctttacagatggtt
gtgagccaccatgtggttgctgggatttgaactcaggacctctggaagag
cagtcagtgctcttaacccctgagccatctctcccctcctgtttggtttc
gatattgatgtaatgtgcttgttaagggctgaggttatccctcccacctc
ccaatgccctattcagagctgaacatgttgcgggtacttgcatgatcatg
gtgacacttgtaaggcaggtgtgatgtctattctgggttgtcaacttgac
tacatctggaattgaagtgaccaggcacacctgggagggatttttccccc
tttggttgaatcatttgaagctgggagacacacttttaatctggatcttt
tgaggcgggaagatccacctttaatctgcatcacatcttctgccacagcc
tatatagagggtgtgggagagaaaaggcttctcttctttgcctgcttgct
cttgctttgcttccttgggattctgacatatactgaagaccagctaagac
atccaacctcgtgtgctgaacaactactgaattcattggtagacagcatt
gtttggactagctggaccacagcctgcaagccatctaataaattctacct
ctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatca
atctatcatgcatgtatgtatatatctatgtatgatgcatgcatctatgg
tggtatacgtattat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_60209101_60210234
seq2: B6Ng01-256G17.b_45_1176 (reverse)

seq1  AGATGATCAGGGATAAGTTAACACAGTGGGATA-TTCTGTTGCAGATGTT  49
      ||||||||| |||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||
seq2  AGATGATCAAGGAT-AGT--ACACAGTGGGATATTTCTG-TGCAGATGTT  46

seq1  GAT-CTCATTTCTCTCAAGGC-AACTATTGTGAAATTCA-GGCAAATTTT  96
      ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  GATCCTCCATTCTCTCAAGGCAAACTATTGTGAAATTCAGGGCAATTTTT  96

seq1  CTTTATGATGACAATTACATTTTGCAGGAGAGGGACAAGCACAAAGCATG  146
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CTTTATGATGAC-ATTACATTTTGCAGGAGAGGGACAAGCAC-AAGCATG  144

seq1  CTGGGAAGATGAAAAGCTGGCCTT-CCAGCCAGGGTGAGCGGTCTGTTCT  195
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAAGATGAAAAGCTGGCCTTCCCAGCCAGGGTGAGCGGTCTGTTCT  194

seq1  GCCCCCAATGCATGCTGGGATGATGAAGAGCCAGCCTTGCAGCCAGTGGT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCAATGCATGCTGGGATGATGAAGAGCCAGCCTTGCAGCCAGTGGT  244

seq1  GAGCAGAGTCTGTTCTGCCCCCTGATGCTCAGGGATATGTGCACATGTTC  295
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGAGTCTGTTCTG-CCCCTGATGCTCAGGGATATGTGCACATGTTC  293

seq1  TAGTACCCTTGGGATGACTGAAACTTCAGTTAATCATCAAATACTACTGG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTACCCTTGGGATGACTGAAACTTCAGTTAATCATCAAATACTACTGG  343

seq1  TACTGTGATTTTTTTTTCCTATTCATGCAAATGTAGAGTAAGCTTTCAAC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTGATTTTTTTTTCCTATTCATGCAAATGTAGAGTAAGCTTTCAAC  393

seq1  CTTTGTTTACAGGAGGCTACTTACAGCTTCTCTTTGGCATACTCAAATGC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTTTACAGGAGGCTACTTACAGCTTCTCTTTGGCATACTCAAATGC  443

seq1  CACCGTCATCGTTCTTGGCTTTGGGGGTCATGATTAATTAAAATAGAGTT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCGTCATCGTTCTTGGCTTTGGGGGTCATGATTAATTAAAATAGAGTT  493

seq1  ACTTGATGGCTATAGAAGCTGATCCTATAACCAAGATGACTAAGTGACTG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGATGGCTATAGAAGCTGATCCTATAACCAAGATGACTAAGTGACTG  543

seq1  ATGGGTAGCCTATACACTGGACAAAGGAGCGGCTCAGGTCCGGAAAGTCG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTAGCCTATACACTGGACAAAGGAGCGGCTCAGGTCCGGAAAGTCG  593

seq1  CGGATTCATCACATGATTTAGGACTTACCAATTGTTTATGGAATTCTTCA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGATTCATCACATGATTTAGGACTTACCAATTGTTTATGGAATTCTTCA  643

seq1  GCTGAACAGTGTAGAACTGGCTGTGGTTGCTGGTAACTAAACAAGGAGAA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAACAGTGTAGAACTGGCTGTGGTTGCTGGTAACTAAACAAGGAGAA  693

seq1  TGAAAGTGCAGGTTGAGGGGAATCTACAAGACCGTTTGTAACTGCAGCAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGTGCAGGTTGAGGGGAATCTACAAGACCGTTTGTAACTGCAGCAT  743

seq1  AACTCAGCCTGTTCCCAACTATGTTGAAGAGGGAAGAGATTGCTTGAGGA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCAGCCTGTTCCCAACTATGTTGAAGAGGGAAGAGATTGCTTGAGGA  793

seq1  TGTATGCTTTGAGCTAAGTGGGTAGCAGATATGTTTATGTGGTCTTCTGG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGCTTTGAGCTAAGTGGGTAGCAGATATGTTTATGTGGTCTTCTGG  843

seq1  GCTCACCCAATCCGACTGGTTCAGGCATCGAGTCTCTTACCATAGTCTTA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACCCAATCCGACTGGTTCAGGCATCGAGTCTCTTACCATAGTCTTA  893

seq1  TGCAGCGATGGCCCCGTTCCTCTCTGCTTAGTCCCCACTAGGTTGAGTGT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGCGATGGCCCCGTTCCTCTCTGCTTAGTCCCCACTAGGTTGAGTGT  943

seq1  TGCGTTTCCCAGCCCCGACTGTCCCATGCTATCCCCATCCTGGCAATCAT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGTTTCCCAGCCCCGACTGTCCCATGCTATCCCCATCCTGGCAATCAT  993

seq1  GGCCTTTAGTCAGGTTCCCTCATCAACCCTGGGGAGGCTTCAAATGCAGC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTTAGTCAGGTTCCCTCATCAACCCTGGGGAGGCTTCAAATGCAGC  1043

seq1  TTTGGTCTTGAAGGACTGCTTGGAACATCTGTTCCTCAGAGGGTTCCTTC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTCTTGAAGGACTGCTTGGAACATCTGTTCCTCAGAGGGTTCCTTC  1093

seq1  TTTAGGGGATCCCTAAATCACCCCAATTGACCAGAATTC  1134
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGGGATCCCTAAATCACCCCAATTGACCAGAATTC  1132

seq1: chr13_60058771_60059836
seq2: B6Ng01-256G17.g_66_1130

seq1  GAATTCCTGTGCTGTTTTCACTCCTACATGTGGCTGAATGTAATTTTTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGTGCTGTTTTCACTCCTACATGTGGCTGAATGTAATTTTTAT  50

seq1  CCCCCAGGTTCATGGCTCAGCAAAATTTCTCTTGATCTTTCATTTGTGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCAGGTTCATGGCTCAGCAAAATTTCTCTTGATCTTTCATTTGTGTC  100

seq1  TCTCAATGGTCTTGAAGCTCGTGCAACAGAATGTCTAGGTACATCCTGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAATGGTCTTGAAGCTCGTGCAACAGAATGTCTAGGTACATCCTGTC  150

seq1  AGTAGACTCATGGTTTGGCTGTGCACTGGGCTGTGCACTATTTTGCAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGACTCATGGTTTGGCTGTGCACTGGGCTGTGCACTATTTTGCAGGT  200

seq1  GTTTTCAGACGCATTTGTTTGGTTTCTTTTTTACATTTATTTATTTGTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCAGACGCATTTGTTTGGTTTCTTTTTTACATTTATTTATTTGTTT  250

seq1  GTTTGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTAATGTATATGAGTATGCTGTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTAATGTATATGAGTATGCTGTAC  300

seq1  CTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGGCTTTAGATCCCTTTACAGATGGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGGCTTTAGATCCCTTTACAGATGGTT  350

seq1  GTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAG  400

seq1  CAGTCAGTGCTCTTAACCCCTGAGCCATCTCTCCCCTCCTGTTTGGTTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAGTGCTCTTAACCCCTGAGCCATCTCTCCCCTCCTGTTTGGTTTC  450

seq1  GATATTGATGTAATGTGCTTGTTAAGGGCTGAGGTTATCCCTCCCACCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTGATGTAATGTGCTTGTTAAGGGCTGAGGTTATCCCTCCCACCTC  500

seq1  CCAATGCCCTATTCAGAGCTGAACATGTTGCGGGTACTTGCATGATCATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGCCCTATTCAGAGCTGAACATGTTGCGGGTACTTGCATGATCATG  550

seq1  GTGACACTTGTAAGGCAGGTGTGATGTCTATTCTGGGTTGTCAACTTGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACACTTGTAAGGCAGGTGTGATGTCTATTCTGGGTTGTCAACTTGAC  600

seq1  TACATCTGGAATTGAAGTGACCAGGCACACCTGGGAGGGATTTTTCCCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCTGGAATTGAAGTGACCAGGCACACCTGGGAGGGATTTTTCCCCC  650

seq1  TTTGGTTGAATCATTTGAAGCTGGGAGACACACTTTTAATCTGGATCTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTTGAATCATTTGAAGCTGGGAGACACACTTTTAATCTGGATCTTT  700

seq1  TGAGGCGGGAAGATCCACCTTTAATCTGCATCACATCTTCTGCCACAGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCGGGAAGATCCACCTTTAATCTGCATCACATCTTCTGCCACAGCC  750

seq1  TATATAGAGGGTGTGGGAGAGAAAAGGCTTCTCTTCTTTGCCTGCTTGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAGAGGGTGTGGGAGAGAAAAGGCTTCTCTTCTTTGCCTGCTTGCT  800

seq1  CTTGCTTTGCTTCCTTGGGATTCTGACATATACTGAAGACCAGCTAAGAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTTTGCTTCCTTGGGATTCTGACATATACTGAAGACCAGCTAAGAC  850

seq1  ATCCAACCTCGTGTGCTGAACAACTACTGAATTCATTGGTAGACAGCATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAACCTCGTGTGCTGAACAACTACTGAATTCATTGGTAGACAGCATT  900

seq1  G-TTGGACTAGCTGGACCACAGCCTGCAAGCCATTCTAATAAATTCTACC  949
      | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GTTTGGACTAGCTGGACCACAGCCTGCAAGCCA-TCTAATAAATTCTACC  949

seq1  TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC  999

seq1  TATCTATCTATGCATGTATGTATATATCTATGTATGATGCATGCATCTAT  1049
       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTATC-ATGCATGTATGTATATATCTATGTATGATGCATGCATCTAT  1048

seq1  GTGTGTATACGTATTAT  1066
      |   |||||||||||||
seq2  GGTGGTATACGTATTAT  1065