BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-265H09
Chromosome13 (Build37)
Map Location 32,154,775 - 32,313,200
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGmds
Upstream geneLOC100041266, G630018N14Rik, LOC100042491, Foxq1, LOC100041312, Foxf2, Foxc1, 4930548F15Rik, LOC666212
Downstream geneWrnip1, Serpinb1a, Serpinb1-ps1, Serpinb1c, Serpinb6b, Serpinb9, Serpinb9b, Serpinb1b, LOC628301, Serpinb9c, Serpinb9d
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-265H09.bB6Ng01-265H09.g
ACCGA069103GA069104
length1,1721,139
definitionB6Ng01-265H09.b B6Ng01-265H09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,312,024 - 32,313,200)(32,154,775 - 32,155,926)
sequence
gaattcttctcaaggaatttcctgttggaaggaagagagaacaacatagt
aaagcttagatcagtgtcccctcaaaattgctaggcctctttcccagact
ctgatttctcaagtccagggtaagggtgagaacttggagttttaggaagt
ttccagttggcccttaagcttagtctggtagccacattttaggaaacatt
tctctagtatttcaggttgtcttggttcattcagacagtcactttaaatg
cattcatcttagactttgtcctttcaatgtaccagcttctgagtcagata
aaaattagtcctactaatcaccagttcatggcagtgtgagattttaaatc
acaaacgacacctgtaaccaagaattgtgagagtggagaaagtctggagt
gagtcttgtatacctcacttcttcacactctcttttgtcaggtagtctgt
agcctatgagaattgataccttaaaaaaaaaatccttctgtctcaagaca
aagcatgagtacgatatgtgtcttttaaaacacacatttcatatctctgt
gcagtaagctaaagacaagttgatgcttagatgtgggtagttgacaccaa
gaagaggattggccagggctgtagtgtcctcacggctctcctggcttact
gcccgacagtgagtttacagccctctgatcactctaagctgcagttatgg
cctcagattttggtctgttttgatattatcaagggattaaaatattagct
ctaaatgttaatatctttaaggaatttactctgttcatacaaaaattaaa
taaaaatttgtttctgactggtgtaatgtgttcagtaagattaacataaa
ataacatgctattttataatattttgaaagatggtctaatattagcacat
tttgtgtttaattttgaattctttgacttcgcgactgggcattgtttgtg
ttggcctcatgttgtgcagcataaactctctatcactcaccacttccagt
ttaatctgatgtgggccttggtattgctaaaagtaggaaaaataaaataa
tagaagctgtctgcctcctgtaggaaaccaatgagatgaaatgcttctga
tggagccatagcagtctgggtaaatagtgactgaagaccctttttgaatc
ataaacaggtaaattatgactc
gaattctttgtagcctttggtccctcagtggttatgttttcatttaatat
tttccaagaagctcttactctgcagcttaaacatacacctggaacctgtg
attatcttatctctgcctctttttatcctttagaaccgaacacagaaaga
actcatgcacaggtgcttcagacacaggttcacagtgttttttaactact
ttttaaaaaatggaaataaaagcatatttcttaataatagcaacattggt
gatatttagtatatacaaggatatttacacatgttcatacacacttaaat
acttgatatacattcaagtatgaagaaaagactgaaaattaaaaaaaaaa
agtccctgccatcagaggtgatcttaggtataacaagacaattaaatatt
tttacaagtagaatgaatattacaaagaatccattaaaaataagagagcc
gtgaaatgatggacttcatacacaaacttatgaggagaactaaaagttct
gtcctaagaagcgtagctccattagcaacacttagcagagagctattgac
cacgtgccagcatgattcaaatcctccttgtcctcccttcctcttttatt
tctttaccctcttgtttggagcaatattcaaatcacagcacgtttagcca
gctaattatggaccgggttggactataaaggttggactgagtttaccaaa
tagacataggtatacatagcctgaacactgtagaatcatgtctaccaact
gtcatttattaggtcccaaagtagatccacaatatcctttcagctaacaa
gttcttaatccaggttcataagcactactttaacccaaagcaaatttaaa
ttctctctggcattttcttaaaggatttaagaaatgaattcataaggcta
tagcataggataaaacagaaaatcacaggtcacccacactttctatcttt
tttaggattagctcctgttttttctacatataaatctaggtttatgaatg
cctatcatgacagacaggtaaggaattgatggtccttaagggtcagagta
gctattctccttgagaggataatcacactagagaaaagattatgtgttat
catatgcagcataccagctgaatggtacatttaagatct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_32312024_32313200
seq2: B6Ng01-265H09.b_49_1220 (reverse)

seq1  GAGTCATAATTTTACTGTTTATGATTCAGAAAAATGTCTTCAGTCACTAT  50
      ||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||
seq2  GAGTCATAATTTACCTGTTTATGATTCA-AAAAGGGTCTTCAGTCACTAT  49

seq1  TT-CCCAGACTGCTATGGGCTCATTCCAAGAAGCAATTTCATCTTCATTG  99
      || ||||||||||||| |||||  ||  |||||| |||||||| ||||||
seq2  TTACCCAGACTGCTAT-GGCTCCATC--AGAAGC-ATTTCATC-TCATTG  94

seq1  GTTTCCTACAGGAAGCCAGACCAGCTTCCTATTATTTTATTTTCCTTACT  149
      |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||
seq2  GTTTCCTACAGG-AGGCAGA-CAGCTT-CTATTATTTTATTTTTCCTACT  141

seq1  TTTAGCAATACCAAGGCCCACATCAGATT-AACTGGAAGT-GTGAGTGAT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
seq2  TTTAGCAATACCAAGGCCCACATCAGATTAAACTGGAAGTGGTGAGTGAT  191

seq1  AGAGAGTTTATGCTGCACAACATGAGGCCAACACAAACAATGCCCAGTCG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGTTTATGCTGCACAACATGAGGCCAACACAAACAATGCCCAGTCG  241

seq1  CGAAGTC-AAGAATTCAAAATTAAACACAAAATGTGCTAATATTAGACCA  296
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAGTCAAAGAATTCAAAATTAAACACAAAATGTGCTAATATTAGACCA  291

seq1  TCTTTCAAAATATTATAAAATAGCATGTTATTTTATGTTAATCTTACTGA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCAAAATATTATAAAATAGCATGTTATTTTATGTTAATCTTACTGA  341

seq1  ACACATTACACCAGTCAGAAACAAATTTTTATTTAATTTTTGTATGAACA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATTACACCAGTCAGAAACAAATTTTTATTTAATTTTTGTATGAACA  391

seq1  GAGTAAATTCCTTAAAGATATTAACATTTAGAGCTAATATTTTAATCCCT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAAATTCCTTAAAGATATTAACATTTAGAGCTAATATTTTAATCCCT  441

seq1  TGATAATATCAAAACAGACCAAAATCTGAGGCCATAACTGCAGCTTAGAG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAATATCAAAACAGACCAAAATCTGAGGCCATAACTGCAGCTTAGAG  491

seq1  TGATCAGAGGGCTGTAAACTCACTGTCGGGCAGTAAGCCAGGAGAGCCGT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCAGAGGGCTGTAAACTCACTGTCGGGCAGTAAGCCAGGAGAGCCGT  541

seq1  GAGGACACTACAGCCCTGGCCAATCCTCTTCTTGGTGTCAACTACCCACA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACACTACAGCCCTGGCCAATCCTCTTCTTGGTGTCAACTACCCACA  591

seq1  TCTAAGCATCAACTTGTCTTTAGCTTACTGCACAGAGATATGAAATGTGT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGCATCAACTTGTCTTTAGCTTACTGCACAGAGATATGAAATGTGT  641

seq1  GTTTTAAAAGACACATATCGTACTCATGCTTTGTCTTGAGACAGAAGGAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTAAAAGACACATATCGTACTCATGCTTTGTCTTGAGACAGAAGGAT  691

seq1  TTTTTTTTTAAGGTATCAATTCTCATAGGCTACAGACTACCTGACAAAAG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTAAGGTATCAATTCTCATAGGCTACAGACTACCTGACAAAAG  741

seq1  AGAGTGTGAAGAAGTGAGGTATACAAGACTCACTCCAGACTTTCTCCACT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGTGAAGAAGTGAGGTATACAAGACTCACTCCAGACTTTCTCCACT  791

seq1  CTCACAATTCTTGGTTACAGGTGTCGTTTGTGATTTAAAATCTCACACTG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAATTCTTGGTTACAGGTGTCGTTTGTGATTTAAAATCTCACACTG  841

seq1  CCATGAACTGGTGATTAGTAGGACTAATTTTTATCTGACTCAGAAGCTGG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAACTGGTGATTAGTAGGACTAATTTTTATCTGACTCAGAAGCTGG  891

seq1  TACATTGAAAGGACAAAGTCTAAGATGAATGCATTTAAAGTGACTGTCTG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTGAAAGGACAAAGTCTAAGATGAATGCATTTAAAGTGACTGTCTG  941

seq1  AATGAACCAAGACAACCTGAAATACTAGAGAAATGTTTCCTAAAATGTGG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAACCAAGACAACCTGAAATACTAGAGAAATGTTTCCTAAAATGTGG  991

seq1  CTACCAGACTAAGCTTAAGGGCCAACTGGAAACTTCCTAAAACTCCAAGT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCAGACTAAGCTTAAGGGCCAACTGGAAACTTCCTAAAACTCCAAGT  1041

seq1  TCTCACCCTTACCCTGGACTTGAGAAATCAGAGTCTGGGAAAGAGGCCTA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACCCTTACCCTGGACTTGAGAAATCAGAGTCTGGGAAAGAGGCCTA  1091

seq1  GCAATTTTGAGGGGACACTGATCTAAGCTTTACTATGTTGTTCTCTCTTC  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTTTGAGGGGACACTGATCTAAGCTTTACTATGTTGTTCTCTCTTC  1141

seq1  CTTCCAACAGGAAATTCCTTGAGAAGAATTC  1177
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAACAGGAAATTCCTTGAGAAGAATTC  1172

seq1: chr13_32154775_32155926
seq2: B6Ng01-265H09.g_68_1206

seq1  GAATTCTTTGTAGCCTTTGGTCCCTCAGTGGTTATGTTTTCATTTAATAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGTAGCCTTTGGTCCCTCAGTGGTTATGTTTTCATTTAATAT  50

seq1  TTTCCAAGAAGCTCTTACTCTGCAGCTTAAACATACACCTGGAACCTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAAGAAGCTCTTACTCTGCAGCTTAAACATACACCTGGAACCTGTG  100

seq1  ATTATCTTATCTCTGCCTCTTTTTATCCTTTAGAACCGAACACAGAAAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCTTATCTCTGCCTCTTTTTATCCTTTAGAACCGAACACAGAAAGA  150

seq1  ACTCATGCACAGGTGCTTCAGACACAGGTTCACAGTGTTTTTTAACTACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATGCACAGGTGCTTCAGACACAGGTTCACAGTGTTTTTTAACTACT  200

seq1  TTTTAAAAAATGGAAATAAAAGCATATTTCTTAATAATAGCAACATTGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAAAATGGAAATAAAAGCATATTTCTTAATAATAGCAACATTGGT  250

seq1  GATATTTAGTATATACAAGGATATTTACACATGTTCATACACACTTAAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTTAGTATATACAAGGATATTTACACATGTTCATACACACTTAAAT  300

seq1  ACTTGATATACATTCAAGTATGAAGAAAAGACTGAAAATTAAAAAAAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGATATACATTCAAGTATGAAGAAAAGACTGAAAATTAAAAAAAAAA  350

seq1  AGTCCCTGCCATCAGAGGTGATCTTAGGTATAACAAGACAATTAAATATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCCTGCCATCAGAGGTGATCTTAGGTATAACAAGACAATTAAATATT  400

seq1  TTTACAAGTAGAATGAATATTACAAAGAATCCATTAAAAATAAGAGAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAAGTAGAATGAATATTACAAAGAATCCATTAAAAATAAGAGAGCC  450

seq1  GTGAAATGATGGACTTCATACACAAACTTATGAGGAGAACTAAAAGTTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAATGATGGACTTCATACACAAACTTATGAGGAGAACTAAAAGTTCT  500

seq1  GTCCTAAGAAGCGTAGCTCCATTAGCAACACTTAGCAGAGAGCTATTGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTAAGAAGCGTAGCTCCATTAGCAACACTTAGCAGAGAGCTATTGAC  550

seq1  CACGTGCCAGCATGATTCAAATCCTCCTTGTCCTCCCTTCCTCTTTTATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTGCCAGCATGATTCAAATCCTCCTTGTCCTCCCTTCCTCTTTTATT  600

seq1  TCTTTACCCTCTTGTTTGGAGCAATATTCAAATCACAGCACGTTTAGCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTACCCTCTTGTTTGGAGCAATATTCAAATCACAGCACGTTTAGCCA  650

seq1  GCTAATTATGGACCGGGTTGGACTATAAAGGTTGGACTGAGTTTACCAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAATTATGGACCGGGTTGGACTATAAAGGTTGGACTGAGTTTACCAAA  700

seq1  TAGACATAGGTATACATAGCCTGAACACTGTAGAATCATGTCTACCAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACATAGGTATACATAGCCTGAACACTGTAGAATCATGTCTACCAACT  750

seq1  GTCATTTATTAGGTCCCAAAGTAGATCCACAATATCCTTTCAGCTAACAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTTATTAGGTCCCAAAGTAGATCCACAATATCCTTTCAGCTAACAA  800

seq1  GTTCTTAATCCAGGTTCATAAGCACTACTTTAACCCAAAGCAAATTTAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTAATCCAGGTTCATAAGCACTACTTTAACCCAAAGCAAATTTAAA  850

seq1  TTCTCTCTGGCATTTTCTTAAA-GATTTAAGAAATGAATTCATAAGGCTA  899
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCTGGCATTTTCTTAAAGGATTTAAGAAATGAATTCATAAGGCTA  900

seq1  TAGCAATAGGATAAAACAGAAAAATCACAGGTCACCCACACTTTCTATCT  949
      |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGC-ATAGGATAAAACAG-AAAATCACAGGTCACCCACACTTTCTATCT  948

seq1  TTTT--AGATTAGCTCCTGTTTTTTCTACATATAAATCTAAGTTTATGAA  997
      ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTTTTAGGATTAGCTCCTGTTTTTTCTACATATAAATCTAGGTTTATGAA  998

seq1  TGCCTATCATGACAGACAGGTAAGGATTTGATGGTCTTTAAGGGTCCAGA  1047
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| 
seq2  TGCCTATCATGACAGACAGGTAAGGAATTGATGGTCCTTAAGGGT-CAG-  1046

seq1  AGTAGCTATTCTCTTGGAAGGAAGATAAATCACAACTAGAGAAAAAGAAT  1097
      ||||||||||||| | ||  || ||| |||||| ||||||| |||||| |
seq2  AGTAGCTATTCTCCTTGA--GAGGAT-AATCAC-ACTAGAG-AAAAGATT  1091

seq1  ATGTGTTATACATATGCAGCATACAAAGCTGAAAATGTGTACATATTTAA  1147
      ||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||| ||||  ||||||
seq2  ATGTGTTAT-CATATGCAGCATAC-CAGCTG--AATG-GTAC--ATTTAA  1134

seq1  GATCT  1152
      |||||
seq2  GATCT  1139